Pseudoalteromonas sp. MM1: PspMM1_08880
Help
Entry
PspMM1_08880 CDS
T09926
Symbol
mocR
Name
(GenBank) GntR family transcriptional regulator
KO
K00375
GntR family transcriptional regulator / MocR family aminotransferase
Organism
psmm
Pseudoalteromonas sp. MM1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psmm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
psmm03000
]
PspMM1_08880 (mocR)
Transcription factors [BR:
psmm03000
]
Prokaryotic type
Helix-turn-helix
GntR family
PspMM1_08880 (mocR)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_1_2
GntR
Asp_aminotransf
HTH_41
MarR_2
HTH_29
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BED88420
LinkDB
All DBs
Position
1:1007611..1009071
Genome browser
AA seq
486 aa
AA seq
DB search
MQPINIEFNEQRKAKYLQLAQALRSAIIKGDIAVGAKLSSAREMAQTYQLNRHTIMNALQ
LLVAEGWLESHERSGYKVTQTLPIQGSANTKQVPALTPKAYKFAKELAVPAPAMNLNNYK
YNFAGGLPDLNCFPYKEFKRSLSHVFNHVDTSKFHYGDISGVSELKVQISNYLYKARNLK
TNDLLVCNGSQEALFLISKAFISTNDFVAVETLGYPPARKAFAACGAQIVDIKQDEYGLC
IDDLKAQLSRFSIKMLYLTPLHQYPTTVTLSPTRRMQIYQLCYQHGVMIIEDDYDHEFHY
QCHPLQPMAADDPAGIVIYLSTFSKIMFSAARIGYICAAPDVIAQLNAWKQLMNHKNDVV
MQLALAHFMKEGAFERHLKRMTKLYKQRYEAMDNSLRALQAKGLPLEFKKPDGGMAMWIN
LNIDTANIKKHLHMHSIYLQTEAEFYFCDSYRSLKPKHFSYLRLGFAGQSEEVMQEGINI
IAEYAY
NT seq
1461 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagccgattaatattgagtttaatgagcaacgcaaagcaaagtatttgcagctagcg
caagcacttcgtagcgcaattattaaaggcgatattgcggtaggcgctaagttaagctca
gccagagaaatggcgcaaacttaccagttaaaccgtcatacaataatgaatgctttacaa
ctattagtggctgagggatggttagagtctcatgagcgtagcggttataaggtaacgcaa
actttacctatccaaggcagcgctaatactaagcaagtgccagccttaacacctaaagcc
tataaatttgctaaagagctagcagttccagctcctgcaatgaatttaaataattataag
tataattttgcaggtggcctcccagatcttaattgcttcccatataaagaatttaaacgc
tccttaagccatgtttttaaccatgtagataccagtaaatttcattatggtgatataagc
ggtgtgagtgagttaaaagtgcaaataagcaattacttatataaagcgcgtaacttaaaa
acaaacgacttacttgtgtgtaatggctcacaagaagcactatttttaatctcgaaagca
tttattagcactaacgattttgttgctgtagaaacgttagggtatccaccagcccgtaaa
gcttttgcggcatgtggcgcacaaatagtagatataaaacaagatgaatacggtttatgt
attgatgatttgaaagcgcaacttagccgcttctcaattaaaatgttgtacttaacaccg
ctgcatcagtacccgacaactgttactttatcgcctacacggcgtatgcaaatttatcag
ttatgttaccaacatggcgtaatgattatagaggatgactatgaccatgagtttcattac
caatgtcacccgttacaaccaatggcggcggatgaccctgcgggtatagttatttacctt
tctacattctctaaaattatgttttccgcagccagaatcggttacatttgcgctgcccct
gatgttatcgcacagcttaatgcgtggaagcagttaatgaatcataaaaatgatgtggtt
atgcaattagctttagcgcactttatgaaagaaggcgcatttgaacgtcatttaaaacgc
atgacaaagctttataaacagcgatatgaagcaatggataactcattaagagcactgcag
gctaaaggattacctcttgagtttaaaaagcccgatggtgggatggcaatgtggattaac
ttaaacatagatacggctaatattaaaaagcacctgcacatgcacagtatttatttacaa
acagaagcagagttttatttttgcgactcttatagaagcttaaaacctaaacactttagc
tacttgcgtctaggctttgctggccagtcagaggaagtcatgcaagaaggtataaacata
attgctgagtatgcttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
