Pseudoalteromonas sp. MM1: PspMM1_11570
Help
Entry
PspMM1_11570 CDS
T09926
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
psmm
Pseudoalteromonas sp. MM1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psmm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psmm02000
]
PspMM1_11570
Transporters [BR:
psmm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PspMM1_11570
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BED88689
LinkDB
All DBs
Position
1:1294940..1297777
Genome browser
AA seq
945 aa
AA seq
DB search
MLNNQVSKAVRLAIAFGTASTAVFSASSIAAEEGVEKVERIEVTGSRIKRADLESASPVS
IITTEDMKVQGISNISDALQNLTAQSGGLTAAVNNGGNGNATVNLRGMGSSRTLVLVNGR
RMIASGTGASSTVDLNAIPFSAVKRIEVLKDGASAVYGSDALAGVVNIIMRDDFEGFELD
ASYAETGEGDGEEASLSSTFGVSSDKGNVVVNVGFYDRGTVRASDRDYSACPYAESGGER
FCAGSGNSLGMNAILDDGRRVQFEPGGNGSSTDTGYHTYVGSGEGNDTYNYSSASYLSTP
ATRYNVSVLGNYELADNLNFFAEAYYTNRTSTQQMAPAPINYTYSVDGRSWVLSQNPEVY
PFSGLYDFATPGDNVDMLPLRRMSEMGGRVFEQEVNTAQFTTGLEGFIADQYAWNVFYTY
GRNSAIDRSKNYINVDKMIASVNENCEGVSVTGSPSDYTVTGNDASAPCINYFGEGALSP
SDADYLRYTDQGTSGTEMHHLGASISGDLFEMPSGVVGFAFGLEHREESAFNQPDAFSSS
GIGSGNAVQPTSGGYKVDEAYVELVVPLLNDLPLVQSLDLEAALRYFDYDTFGSDTTYKL
GLTWRMTDEVMLRSVLSTAFRAPSVSELYGGQSDSFTNYTDPCTGFGGAGFDSRYQTACA
SDAAAGLIPSDGTFAQNSGQLRAVVGGNPDLGPETADTFTVGLVVEPIEGLSFTVDYYDI
EVDNVISSVGITTKLDKCYSAGEEGGQGGSFALCEGVVRDATGNFDGTPSLDQNLSTWNL
SGVDFNAQYSFDAAGLAWRADWEASYISKWEVQEFAGEPIQDYVGVASSGSGSIPEWKHN
VSLRAAGDDWTVSYKVMYVDSLVTESVALFDGDPADYYSPEADSFVSHTLSGTYQLNEHV
SLRGGIDNLTDEEPPYYSDYDDANTDTTLYKYIGRNFFVGTTISF
NT seq
2838 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaataaccaagtttcaaaagcggtgcgcttagcgattgcttttggtacggcatct
acagctgtattttcagcaagttcaattgctgctgaagagggagttgaaaaggtagagcgt
atagaggttaccggttcacgaattaaacgtgcagatcttgaaagcgcttcaccagtgagc
attattactactgaagatatgaaagttcagggtatttcaaatatttccgatgcgttacag
aaccttaccgctcagtcgggcggattaactgctgctgtaaataatggcggtaatggtaat
gcaactgttaacttaagaggtatgggttcatcacgtacattggtacttgttaatggacgc
cgtatgattgcctcaggtactggtgcatcttctaccgtggatcttaatgccattcctttt
agcgctgtaaaacgcatagaagttttaaaagacggtgcatcagctgtttacggctctgat
gctcttgctggtgtggttaatattatcatgcgcgatgactttgaaggctttgagctagat
gccagctatgcagagacaggtgaaggtgacggtgaagaagctagcttaagtagcaccttt
ggtgtgagcagtgataaaggtaatgttgttgtaaacgttggtttttacgaccgaggtact
gtacgtgctagcgaccgagattattcagcatgtccatacgctgaaagtggcggtgagcgt
ttttgtgccggttctggtaactctttaggtatgaatgcaatcttagatgatggtagaaga
gttcagtttgagcctggcggtaacggttcatcaactgatactggctatcacacatatgtg
ggtagtggcgaaggcaacgatacctataactactcttctgcttcatacttatctacgcct
gcaactcgttataatgtgagcgtgttaggtaattatgaattagcagataacttaaacttt
tttgcagaagcgtactacacaaaccgtacctcaacgcaacaaatggcaccagcacctatc
aactacacatacagtgttgatggtcgtagttgggtattaagtcaaaatccagaagtttac
ccattctcaggcttgtatgattttgcaactcctggcgacaatgtagacatgttaccactg
cgtcgtatgtcagaaatgggtggccgtgtatttgagcaagaagtaaatacagcacaattt
acaactggcttagagggctttatcgctgatcaatacgcttggaatgtgttctatacatat
ggtcgaaatagcgctattgaccgttctaaaaactacatcaacgtagacaaaatgatagcg
tcagtaaatgaaaactgtgagggtgtctcggttacaggttcgcctagtgactacacggtt
acaggcaacgatgcatctgctccatgtattaactacttcggtgaaggcgcgctttcaccg
tcagatgccgattacttgcgttacaccgatcagggtacttcaggtacagaaatgcaccac
ttaggcgcttcaatttcgggtgatttatttgaaatgccttctggtgttgttggctttgca
tttggtctagagcaccgtgaagaatcagcatttaatcaaccagatgcattctcttcatca
ggtatcggttcaggtaatgccgtacagccaacttctggtggctataaagttgacgaagca
tatgtagagcttgttgttccactattgaatgatttgccactggttcagtctttagattta
gaagctgcgcttcgctactttgactacgatacgtttggatcagatactacttataagtta
ggtctaacttggcgtatgacagacgaagttatgcttcgctctgtattatcaacagcattt
cgcgcaccaagtgtaagtgagctttacggtggtcagtcagatagcttcaccaattataca
gacccttgtactggttttggtggtgctggctttgattcgagataccaaacagcctgtgct
tctgatgcagcagccggcctaattccttcagatggtacgtttgcacaaaacagcggtcaa
cttcgtgcggttgtgggcggtaacccagacctaggtcctgaaactgctgatacatttaca
gttggtcttgttgttgagccaattgaagggctaagctttactgttgattactacgatatt
gaagtagataacgtaataagctctgttggtattacgactaagctagataagtgttatagc
gcgggtgaagaaggtggacaaggtggttcttttgcactttgtgaaggtgttgtacgtgat
gcaacgggtaactttgatggtactccatcacttgatcaaaacctttctacttggaaccta
tcgggcgtagatttcaacgctcaatatagctttgacgctgctggcttagcgtggagagct
gattgggaagcttcttatatctctaaatgggaagtacaagagtttgctggtgagcctatt
caagattacgtaggtgttgcatcaagtggttctggctcaattcctgagtggaaacataat
gtaagcttacgtgcagccggtgatgattggactgtttcatacaaagtgatgtatgtagat
tcgcttgttacggaatcagttgcattatttgatggagaccctgcggattactattcacca
gaagctgactcgtttgtatcacatacactaagtggtacttaccaacttaacgagcatgtt
tcgttacgtggtggcatagataacctaacagatgaagagcctccatattacagcgattat
gatgatgccaatacagatactacgttgtataagtacatcggtcgtaacttctttgtaggt
acaactatttcattctaa
DBGET
integrated database retrieval system