Pseudoalteromonas sp. MM1: PspMM1_12450 Help Entry PspMM1_12450      CDS       T09926                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K03658   DNA helicase IV [EC:5.6.2.4] Organism psmm  Pseudoalteromonas sp. MM1 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:psmm00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:psmm03400]     PspMM1_12450 Enzymes [BR:psmm01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase      PspMM1_12450 DNA repair and recombination proteins [BR:psmm03400]  Prokaryotic type   Other factors with a suspected DNA repair function    DNA helicases     PspMM1_12450 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  UvrD-helicase AAA_19 UvrD_C UvrD_C_2 AAA_12 AAA_30 DEAD Helicase_IV_N malic ResIII PhoH Sep15_SelM Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  BED88777 LinkDB All DBs Position 1:1402686..1405187 Genome browser AA seq 833 aa AA seqDB search MAQFIATPSWLGRFFTRISTVTIKQNSLVIHCKNNTSRAYLISDFTNFTQFKKGLFSGKI TLNHSTKTVISLLNKQQAQTLSEQLNSEFANHLEEKVNTAKTLVKRYATNEYLRDSNVPL LKSAVFSLAHRYNALPALWQQHLSAINIKFLTILSSSPTVAHATEQLRKSYEQKTLTARA DFYNVVESNPLTREQRLGVIRNNDKNLVLAAAGTGKTSVMVAKALDLIVHEGVKPEQILI LAYNKNAANELTERFNLRAQHANLKVTPPTILTFHALGLKLLKSDNKALSLSPFANDAME LNKWFTQWLSNTLKTDSCFCKTFVETLYEPTDSLNTETKTATKTAIKAQTYYTLSGLKVS SYHHLLIANWLYMYGIEHTYQNDDTADFFLPQYNIYLVHFVTDRQGNSAQHIIKSHNSGH IKSVRTHHKKHGQTLVQTFHYNWQNGQLEQRLKAQLQKHKVNINPLDNHAVYERLSATGL LKQNVNKYLNCLSAIRGEQLSDSQIAARIAKSGIINHKRYTTLLVAMQRAYNEKLKEQDA IDFDGMIASAAQAIKLGEVSVPWRHILVDEFQDISCARMAFLNTLIHYGPQPCFTAVGDD WQAIYRFSGGNLALTTQFNDLIGSHTLTVLQKTFRYNNSISEVAGRFVMQNPEQYKKHIT THTQVSTPQVVLMDDLHQGKKSVALKVQQTIATINKNNSTASIAVLSRYRFMLNEVEQHL ADNNYANPLHFWTLHGSKGLEADYCIIIGFEQGKLGFPSNNPGNLLVEALLPAQDTFIHS EERRLLYVGITRAKHKSYLIAPPSGCSEFISELINDNYPIHVASSSFAKQSKQ NT seq 2502 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggcgcagtttattgccactccaagttggttaggacgtttttttacgcgtattagcacc gttactattaagcaaaattcactcgttatacattgtaaaaataatacctcacgcgcctat ttaattagcgactttactaattttacccaatttaaaaaaggcctatttagcgggaaaata accctcaaccatagtacaaaaacggtaattagccttttaaataaacagcaggctcaaacg cttagtgagcagctaaacagcgagtttgccaatcacctagaagaaaaagtgaatacagca aaaacgcttgtaaaacgttatgcaacaaatgagtatcttcgtgactcaaatgtgccgtta cttaaatcggcggtgttttcattggcacaccggtacaacgctttgccagcactgtggcag cagcatttatcggccattaatattaaatttttaacgattttaagtagctcaccaacagta gcgcacgccacagagcagttgcgtaaaagttatgagcaaaaaacacttacggcaagagcc gatttttataatgtggttgaatcaaatccgctcacacgcgagcagcgccttggcgttata cgcaataacgataaaaatttggtgttagcggccgcaggcacaggtaaaacatcggtaatg gttgcaaaggctctagatttaatagttcatgaaggtgtaaagcccgagcaaatactgata ctcgcttataataaaaatgcggcaaacgagttaactgagcgctttaatttaagggcgcag cacgcaaatttaaaggttacgccgcctactattttaacctttcatgcgctggggcttaag ctacttaaaagcgacaataaagcacttagcttatcgccttttgcaaacgatgcaatggag cttaataaatggtttacacagtggcttagtaataccctaaaaacagactcatgtttttgt aaaacctttgttgagaccctgtatgaacctactgatagcctcaataccgaaactaaaacc gcaactaaaaccgcaataaaagcacaaacctattacaccctatcggggttaaaagtaagc agttatcatcacttattaattgctaattggctttatatgtatggtattgaacacacttac caaaatgatgacaccgccgattttttcttgcctcagtacaacatttatttggtacatttt gtgacagataggcaaggaaattcagctcagcacattattaaatcgcacaatagtgggcat attaaatcagtacggacgcaccataaaaaacatggtcaaaccttggtgcaaacatttcat tataactggcaaaatggtcagcttgagcagcgcttaaaagcacaactacaaaaacataaa gtgaacattaaccctttagacaaccacgcagtgtacgagcgtttatctgcaacagggctg ttaaagcaaaatgtaaataagtacttaaactgcctaagcgcaataaggggggagcaacta tctgactctcaaatagcagcgcgaatagctaaaagtggcattataaatcataaacgttat acaacattgctggtggcaatgcagcgtgcatacaatgaaaaattaaaagagcaagatgct atagattttgacggcatgattgcaagcgcagctcaggcgattaaattgggggaggtaagt gtaccttggcgccatattttagttgatgaatttcaagatatttcatgcgcacgcatggcg tttttaaatacgttaatacattatggcccgcaaccttgttttactgcggttggcgatgat tggcaggctatttatcggttttcaggcggtaatttggcgctcaccacgcagtttaacgat ttaataggcagtcacacactcacggtattacaaaaaacgtttagatataacaacagtatt agtgaggtagcggggcgctttgtgatgcaaaaccctgaacaatataaaaagcacatcact acgcatacgcaagtaagtacccctcaagttgtgcttatggacgatttacaccaaggtaaa aagtcagtagcgctaaaagtgcagcaaaccatagccacaattaataaaaataatagcacg gccagtattgccgtattgagccgttatcggtttatgcttaatgaggtagagcagcactta gcagataataactacgctaacccactacatttttggacactgcatggttcaaaaggtctc gaagccgattactgtattataataggttttgagcaaggaaagttaggttttccaagcaat aaccctggtaatttacttgttgaagcattgttgcccgcacaagatacctttatccattca gaggagcgacgtttattatacgtagggatcacgcgcgcaaagcataaaagctatttaatt gctccgccatctgggtgttctgaattcattagcgagctaataaatgacaattaccctatt catgtagcctctagttcgtttgcaaaacagagtaaacagtaa

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