Pseudoalteromonas sp. MM1: PspMM1_13210
Help
Entry
PspMM1_13210 CDS
T09926
Symbol
bfeA
Name
(GenBank) ligand-gated channel
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
psmm
Pseudoalteromonas sp. MM1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psmm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psmm02000
]
PspMM1_13210 (bfeA)
Transporters [BR:
psmm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PspMM1_13210 (bfeA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
STN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BED88853
LinkDB
All DBs
Position
1:1489023..1492058
Genome browser
AA seq
1011 aa
AA seq
DB search
MHIKQMLGEVASLNVIGKKNFKKKIKNYRGILFVSCLYKLRSNQTHLFSGLSLLAPAIFS
MSVQGATQTTGQMVQFDIQAQRADKALIEFAKQTEQTVMFSYELAKNYQANSVYGFYTQL
DALQALLTGTELDAVVDQNGLLSIKLKQINRKDNNMMKLSGVSAAVLPALLAANSHGVNA
AEDVAQEKIEKIAIVGSRVAGRSVEDLPVPVDILSAEALENTGQTEVGRMLQSIAPSFNF
SSSSISDGTDALRPATLRGLGPDQTLVLINGKRRHQASIIHINTSVGRGTAGTDMNAIPA
SAIKRIEVLRDGAAAQYGSDAIAGVINIVLKDGSEGGKAAINYGEYSEGDGETVNVDFNK
GFALGDSGYLNATLNYRDRSPTNRAGLHGSCQFYGCTELSDGTLLAGDPRELTADRDTFR
IGDADSQQFGLTVNTGYELGDGELYGFITYSTRDNESAAFFRHNANAGGNPVLQDNDATI
PLGFLPKINTTIDDISYNFGYKTDFDNDASLDVSYTYGENSIDYTTSDTINASYANFLRY
EQGLSAADIRSTIPREAYAYGMELSLQTINIDFTQNFDDYSLAMGAEIRTDEYRILEGSE
YAYRDYDTLDGVSIYSGLSGGVGSEDASGGTQGFGGSSPASSVDESRDVISFYLDAETYL
IEDVILSGALRYDNYKGFGDTVNFKLAGNWAITDDVSLRGALSSGFRAPSMQQLYFNNIS
TQFVVAEDGSLVAEEVGTFRNDSTLAQSLGIPKLKEEKSQNRSLGIVYNVTDNINVTVDY
YSIDIDDRIVISNRLGKGLSSSLDAALISSGAGAGQFFLNGADTETSGIDFVATWNTEGL
GGTLDFTLAANFTETEVVSLFTPSGSGLETVPVEDVFSDQEISIIEEWQPEDRINLSALY
QRGDWTVNLSLNRFGEYTVEDGGRQTYGAEILTDVKVNYFVTEDLSVNIGANNLFDVYPD
KNTIGNSRSGTIVDANGNTIVSSDGVFEYSRRSAPFGFNGAYYYVGAEYRF
NT seq
3036 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatatcaaacaaatgttaggtgaagttgcatctttaaatgttataggtaaaaaaaac
tttaaaaaaaagataaaaaactatagaggaattttgtttgtcagctgtttatataaattg
cgcagtaaccaaacgcacttatttagtggtttaagtttacttgctccggctatttttagc
atgagtgtgcaaggggcaacacagaccactgggcaaatggtgcaatttgatattcaagcg
cagcgagcagacaaagccttaatagaatttgctaaacaaacagagcaaaccgtgatgttt
tcttatgagttggcaaaaaattaccaagcaaattcggtttatggtttttatacccaacta
gatgcactgcaagcattattaactgggaccgagctcgatgcggttgttgatcaaaatggt
ttactgagtataaaactcaaacaaatcaataggaaagataacaacatgatgaagctttca
ggggttagtgcagctgtattaccagcattacttgcagcaaattcacacggtgtgaatgca
gcagaggatgttgcacaagagaaaatagaaaaaattgctattgtaggtagccgcgtagca
gggcgctcagtagaagacttacccgtacccgttgatattttaagtgctgaagcacttgaa
aacacaggccagactgaagttggccgtatgttgcaatctattgcgccttcatttaacttt
tcaagctcgtcaatcagtgatggcactgatgccttacgacctgcaacactgcgtggctta
gggcctgaccaaacattggtgctaattaatggtaagcgccgccatcaggcaagtattatt
catattaatacctcagtagggcgtggtaccgcaggtaccgatatgaacgctattccagcc
tctgctattaaacgtatagaagtattacgagacggtgcagcagcgcaatacggctcagat
gcaattgccggtgttattaatattgtactaaaagatggcagcgaaggcggcaaggctgca
attaattacggcgagtactcagagggcgatggcgaaaccgtaaatgtagattttaataaa
ggatttgccctaggcgatagcggctacttaaatgccacacttaactaccgcgaccgctcg
cctactaaccgcgcaggtttgcacggctcgtgtcagttttatggctgtacggagcttagc
gacggtactttattggcaggcgatccacgtgaactgaccgcagatagagatacctttaga
attggtgatgctgactcgcagcagtttggcttaactgttaataccggttatgaattgggt
gatggcgagctttacggctttattacgtattcaacgcgcgataacgaatcagcagcgttt
ttccgccataatgcaaatgcaggtggtaacccggttttacaagataacgatgcaactatc
ccgctgggctttttacctaaaattaatactaccattgatgatatttcttacaactttggc
tacaaaaccgattttgataacgacgcgagcttagatgtatcgtacacctacggtgaaaac
agcattgattacacaacaagcgatactattaacgcctcgtacgctaactttttacgttac
gagcaaggtttaagtgccgctgatattcgcagcactatcccgcgtgaagcttatgcctat
ggcatggagctatcactgcaaaccataaatatagattttacacaaaactttgatgactac
tcactggctatgggcgccgaaattcgtaccgatgaataccgcattttagagggcagcgaa
tatgcttatcgtgattacgacacccttgatggggtaagtatttatagtggtttaagtggc
ggtgtaggctctgaagatgcttccggcggcacacaaggttttggtggttcttcaccggcg
tcatcggttgatgagtcgcgcgatgtaatttcgttttaccttgatgcagaaacctaccta
attgaagatgtcattttatcaggcgcactgcgttacgataattacaaaggctttggcgac
acggtaaactttaagcttgcgggtaactgggcaataactgatgatgtgtcactgcgtggt
gcattaagctcaggctttagagcaccttctatgcagcaactatactttaacaacattagt
acgcagttcgttgtagctgaagacggctcgcttgttgccgaagaggtaggcacattcaga
aacgattcaacccttgcgcaaagtttaggtattccaaaacttaaagaagaaaaatctcaa
aaccgcagcttaggtattgtctacaacgtaacagacaacattaatgttactgtagattac
tactcaattgatattgacgaccgcatagtaattagtaaccgtttaggcaaagggctttct
tcaagcctagatgcggcattaatcagctcaggcgctggtgctggtcagtttttcttaaat
ggtgctgacaccgaaacttcaggtattgattttgtagcgacttggaataccgagggctta
ggcggcacgcttgattttactttagcggctaactttacagaaactgaggtggtgtcgtta
tttacgccatcgggctcagggcttgaaaccgtgccggtagaagatgttttttctgatcaa
gaaatttcaattattgaagagtggcaaccagaagatcgtattaatttaagtgccctttac
cagcgtggtgactggactgtaaacctttcacttaaccgctttggtgaatacacagtagaa
gatggtggccgccaaacttacggagcagaaattttaactgacgttaaggttaactatttt
gtgaccgaagatttatctgtaaacattggtgcaaacaacttatttgacgtatacccagat
aaaaacaccattggtaactcacgttcgggcactattgtagatgctaacggtaatacaatt
gtaagcagcgatggtgtatttgaatactctcgccgctctgcaccatttggttttaacggt
gcatactactacgtaggtgcagaatatcgcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system