Pseudoalteromonas sp. MM1: PspMM1_13610
Help
Entry
PspMM1_13610 CDS
T09926
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20948
polysaccharide biosynthesis protein VpsJ
Organism
psmm
Pseudoalteromonas sp. MM1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_88
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BED88893
LinkDB
All DBs
Position
1:1535592..1536788
Genome browser
AA seq
398 aa
AA seq
DB search
MNSQIGLITKQMFSAAKQDKYAGQDPFDGLNSKLFDIFPSFKKGLVGLAWIQLHKRLAIN
LRPLCAVPKKRNPKGIGLFILGLLEDYKATNDQIYLGEAIKLADWLLTQQSDKTIWQHSC
WGYHFDWNARAFFVPKGKPNVITTIYVAQALYALSEITKDKKYSEPAIDSAHFIVKTLYK
ECDGRQFFGYIPGETAFVHNASLWGAAWVAKVAVLTNNQHYKQLALNAAKQSVSEQGTDG
SWVYGARHHHQFIDGFHTGYNLEALRLLSDELQTDEFEDAIAKGLTYYKTHLFEQDGTAK
YYNNSRYPLDMHSVSQAVFTLLKVGKAPDDFTMAEKVINRAIQTLYMPKKQRFIYQKNKY
FTNKVDYVRWTQAWVYYSFAYFNRQKMNSTKNAVIEQL
NT seq
1197 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaatagtcaaattggcttaataacaaaacagatgttttctgctgcaaaacaggataaa
tatgcaggccaagacccgtttgatggccttaatagtaagctattcgacatttttccctcg
tttaaaaaaggtttagttggtttagcgtggatacaacttcataaacgtttagcaattaac
ttgcggccattatgtgctgttcccaaaaagcgcaacccaaaaggtattggcttatttatt
ttaggtttattagaagactataaagcaaccaatgatcaaatttatttaggtgaagcaata
aagctagcggattggttactaacacagcaaagtgataaaactatttggcagcatagctgc
tggggctaccactttgactggaatgcacgcgccttttttgtacctaaaggtaagccaaac
gtaattactactatttatgttgctcaggctttatatgcattaagtgaaatcaccaaagac
aaaaaatacagcgaacctgcaattgatagtgcgcattttattgtaaaaacattatataaa
gaatgtgatggcaggcagttttttggttacataccgggtgaaacggcctttgtacataat
gctagcctttggggcgctgcttgggttgcaaaagttgctgtactaactaacaaccaacat
tacaaacagcttgctttaaatgctgcaaagcagtcggtaagcgaacagggaactgatggc
tcatgggtatatggtgcgcgccaccatcatcaatttattgatggttttcataccggttat
aaccttgaggcattacgcttactaagcgatgagttacaaacggatgagtttgaggatgca
attgcaaaaggtcttacttattataaaacgcatttgtttgagcaagacggcactgcaaaa
tattacaataatagtcgttacccactcgatatgcacagtgtatcgcaagctgtttttaca
ttattaaaagtaggtaaagcgccagatgactttactatggccgaaaaagtaataaaccgt
gcaattcaaaccttatatatgccaaaaaagcagcgttttatttatcaaaaaaataagtat
tttaccaataaggttgattatgtgcgttggacacaagcatgggtatattattcgtttgct
tattttaatcgacaaaaaatgaatagcaccaaaaatgcagttattgaacaactttaa
DBGET
integrated database retrieval system