Pseudoalteromonas sp. MM1: PspMM1_38030
Help
Entry
PspMM1_38030 CDS
T09926
Name
(GenBank) helicase/SNF2 family domain protein
Organism
psmm
Pseudoalteromonas sp. MM1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWIM
AAA_22
ERCC3_RAD25_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BED91335
LinkDB
All DBs
Position
2:631609..634752
Genome browser
AA seq
1047 aa
AA seq
DB search
MSANLSKNDLLAIFEEIKNEQATLFPLSERFIKKLFRPNVLEKGKEYYKNGQISWLEHSS
DFAVIDSTVQGDTGSAFNQRIEISKVPTGYSVDTHCTCNAKIKCRHLAAVLFKLKIEHSG
EYGEDYFINDWFSELTALKSVDAKAPSQVLLFVLDIENNKVFLTPKIANYDKNNNYTLGR
NLTEQQLNSFVTPNDLLESDFRLFSWIRSQNAVGNLELKGQWGFSALQQLIATDRLFLQR
SRVAIKAQTGQSLNFNWQQQNELSQLIIELEHSKNWALIKTTPPAYLDLDHFIVGRIRTQ
LSADEIAHLQSIPALHDANFDRIYKQLADNFGAGVIPHPNNEQVNVKQLGNAVLKATMNE
QGLKVSLLFKYKNKNYLAGTAPASLINSAFENTVTNELVNLGFDFCKGGLQSEFIFNKQS
PIHLHWLVYEVFPGFKKRGWQVTQTKVNVADPKGHVTLDVNRAAGHQMHCKVQLSDAKAA
VLFNADDAMYQSLNRQSELFYYYPVGRQFGVISKAAINLLTEFKQRFEFVKTRDEFNIPL
SYLPELVKHTAVTIDLHDDSLERYLDELNNTEQAMPVVPLHGLNESVTLREYQQQGVDWL
SFLKRHQLGGILADDMGLGKTLQVIAFLASSFNRPQAGPTLIVCPTSLVSNWQNEITKFA
KSLKVTTIFGSQRNEPLQHLAQAQCILTTYPLLKRDIAYYSPLYFENIILDEAQYIKNDT
AQVSRLVKRLNADFKLCLSGTPIENNLFELKSLLDFAMPSLLGSQAHFKQHFQTPIEREA
DSERAEQLKALIMPFILRRTKAQVAQELPQKTELLKEFEFEPKQKDMYQGITRALEEKLI
DLFAEQGAQKSKLAFLEALLKLRQICCHPKLIEPETQAGSAKLEWLTTHLPLMLSLGRKV
IIFSQFTSALDLIAERLNDININFSMLTGQTRHRDKVINEFTSGKTSVFLISLKAGGTGL
NLTQADTVIHFDPWWNPAVEKQATDRAYRIGQTNPVFVYKLIMSNSIEQKVFKMQQDKQA
LVDALFTDKSMSFTSFDEQQMLSLIKS
NT seq
3144 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgctaacttatcaaaaaatgatttactggctatttttgaagaaataaaaaatgag
caggcaaccttgttccctctatctgagcgctttataaaaaagctgtttaggcctaacgta
ctcgagaaaggcaaagagtattataaaaatggccaaattagttggttagaacatagcagt
gactttgctgttattgattcaacggtacaaggcgacaccggatcagcatttaaccaacga
attgagatcagtaaagtacctactggttactctgttgatacgcattgtacctgtaatgct
aaaatcaaatgtaggcacttagccgctgtattatttaaacttaaaatagagcattcaggt
gaatacggtgaagattactttattaacgattggtttagtgagctgacagcacttaaaagt
gtcgatgctaaagccccttcgcaagttcttttatttgtattagatattgaaaacaataaa
gtatttttaacgccaaaaattgccaattacgacaaaaataataattacacgcttgggcgc
aatttaactgagcaacaattaaatagctttgtaacgccaaacgatttgctcgaaagtgac
tttaggctgtttagttggattcgctcacaaaatgctgtgggtaatttagagctaaaaggt
caatggggttttagcgctttacaacaattaattgccaccgaccgactatttttacaacgc
tctcgagtggctattaaagcccaaactgggcaatcccttaactttaattggcagcaacaa
aacgagttatcgcaattaattattgagcttgaacacagtaaaaattgggctctaataaaa
accacgccgcctgcttatttagatctcgatcattttatagtaggccggatcagaacacag
cttagcgctgacgaaatagcacatttgcaatctattcctgcactgcacgatgctaatttt
gatcgcatttataaacaacttgccgacaattttggggccggtgttattccgcatccgaat
aacgaacaagttaacgttaagcaacttggtaatgctgttttaaaagccactatgaatgag
caagggcttaaagtttcgctattatttaaatataaaaataaaaattatttagcgggaaca
gcacctgcgagtttaataaacagtgcatttgaaaacacagtaacaaatgagttagtaaat
ttaggttttgatttttgtaaagggggtttacaaagtgagtttatatttaataaacaatca
cctatacatttacattggcttgtttacgaagtattccctggctttaaaaagcgtggctgg
caggtaactcaaactaaagtaaatgtagccgatcccaaagggcacgttacactcgatgta
aaccgtgctgcagggcaccaaatgcattgtaaagtgcaattaagcgatgctaaagccgct
gtactttttaatgccgatgatgccatgtatcaatcgttaaaccgccaaagtgagctgttt
tattactaccctgtcgggcgtcaatttggtgttattagtaaagcagccattaatttactg
accgaatttaagcaacgctttgaatttgtaaaaacacgcgatgaatttaatatcccgctt
tcttatttacctgagctggtaaagcataccgcagttactatagaccttcatgatgactca
ttggagcgttatcttgatgagttaaacaacaccgagcaggcaatgccagtggtgccctta
cacggtttaaatgagtcggtaacactacgtgaataccagcaacaaggcgttgattggctt
agctttttaaagcgccaccaattaggtggcatacttgctgatgacatggggcttggcaaa
acgctacaagttattgcctttttagccagcagttttaatcgcccgcaagcggggcctact
cttatcgtgtgccctacaagtttggtcagtaattggcaaaacgaaataaccaaatttgct
aaaagccttaaggtaaccactatttttggctcgcaacgtaatgagcctttacaacattta
gcgcaagcgcaatgtattttaactacttacccattattaaagcgtgatattgcttattac
tcgccactttattttgaaaatattattttagatgaagcgcaatatattaaaaacgatact
gcacaagtctcgcgcttagttaagcgtttaaatgccgactttaagttatgtttaagcggt
acgcctatcgaaaataatttgtttgagcttaagtcgttactcgactttgccatgccttca
ttacttggctcgcaagctcactttaaacagcactttcaaactcctattgaacgcgaagcc
gattcagagcgagctgagcaactaaaagcgcttattatgccgtttatattacgccgtaca
aaagcgcaggtagcgcaagagttgccacaaaaaacagagctgttaaaagagtttgagttt
gaacctaagcaaaaagatatgtaccaaggtattacacgcgccctagaagaaaagctcatc
gacttatttgctgagcaaggcgcacaaaaaagtaagctcgcatttttagaggcgctacta
aaactaaggcaaatttgttgtcatccaaaattaattgagccagaaacacaagcaggttca
gcaaaattagaatggctaactacgcatttgccgttaatgctaagccttggtcgtaaagtg
attatttttagtcaatttacctctgcgctcgatttaattgcagagcgtttaaacgacata
aatattaattttagtatgctaactgggcaaacgcgtcatcgcgacaaagttattaacgag
tttaccagtggcaaaacctcggtgtttttaatcagtttaaaagcaggcggtactgggctt
aacttaacgcaagccgatacggttattcattttgatccgtggtggaacccagctgtagaa
aaacaagccaccgatcgtgcttatcgcattggccaaacaaatccagtgtttgtttataag
ttaattatgagcaactcaattgagcaaaaggtatttaaaatgcagcaagataagcaagcg
cttgttgatgcattatttaccgataaatcaatgagctttacttcgtttgatgagcagcaa
atgttatcacttataaaaagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
