Pseudopedobacter saltans: Pedsa_1517
Help
Entry
Pedsa_1517 CDS
T01430
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
psn
Pseudopedobacter saltans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psn02000
]
Pedsa_1517
Transporters [BR:
psn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Pedsa_1517
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
STN
RsgI_M
CooC_C
Big_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADY52078
UniProt:
F0S5D3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1784576..1787953)
Genome browser
AA seq
1125 aa
AA seq
DB search
MKLIFCGKIPIRKVDPSNFFLVMKLTAFLITLGILQVSAKSYSQKVSFSGESIRVEKVLK
AIEKQTGYYLFYKYNEIRDAKIINNLDLKNVELKQALSEIFKDQPFEYFLKENTIIINKK
TNTKPAETPLQQTLINVKGVVVDEKGEPLPGATVRTKAGNMGTITDVDGIFIIRNIVEGT
VLSVTFTGFETKEVEAKSNTDLRISLKTAQSELNEIVVVGYGSQRRELVTSAIGSVKFKD
EDVRQVSSPARMLEGRIAGVNLSIGSGNLASGERISIRGSSSISAGNNPLYVVDGVPINN
SNMSIYDFGETYSPLAAFNHADIESIEVLKDAASAAIYGSRASNGVILITTKSGKNGKNI
VKVDVTTGFSEFADKEKLKIANSNLYILQFNEGQENYNKQYGLKPGDANYKIPISNPFGN
MPDTDWLGLILQKGYFKNINTNFSGGTTKTQYYVGLGFTDQEGVVHNNSIKKYNLNTKFS
HKFNDWLEIGFNNMGNYIRNNQVPGANLGSTILARAIEQRPFDRPYKPNGDYYVGGTDEL
MRHNPVQILNEQIAYVDNFRYLGTYYGKINFNENISFKSSFSADIGYTYDYTYYNERHPY
GTGVGRLLDDNRMIQNYLTENILNYTNTFGKYTVSGLLGHSFQKLHSRNSNIDARGFPTP
SLGVVSVASEITSASGAPSEYALESYFGRATMSYDDKYIFTGTLRADGSSKFRADHRWGI
FPSLSFGWNVSKEDFMDGTNLDLKLRTSYGKTGNQEGIGNYAYQPLIAGGQNYGGLSGIS
VSTFGNEDLTWEKADQYDFGFDISLFKRRVNLSVDAYYKKTTDLLYSMPIQATSGMTSII
SNIGSMENRGIEFSANTHFKLGPVAWNSNFNIAHNKNKILSLIDNDNKPISIGDNRALVV
GRDIGSYYLFESRGIYQYDGEVPQAQFDLGVRAGDVRWTDLDGNNIINDNDRVVVGSSNP
KFSGGWSNSFKYKKLQLDVLTTYSYGANIYAAWKPNGLGRIGYRFAQLEEYVDNRWTGPG
TTNVYPRAIASETFNTRNSTRFLEDASFIRLRALTLGYLLPELTVKKFKVSQIRLFAQVD
NLFLWTKYSGWDPEVNTNLDPRFSGIDNLNNPQPRTYSIGANISF
NT seq
3378 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaatcttttgcgggaaaataccaatccgtaaagtggacccatcaaattttttt
ttggtaatgaaactcaccgcttttttaatcacgctaggcatacttcaggtaagtgctaaa
agctactcgcagaaagtcagtttttcgggcgagagtatacgcgtagagaaagttctgaag
gcaatagaaaaacaaacaggctactatcttttctataagtacaacgagattagggatgca
aaaattatcaataatcttgacttaaaaaatgtagaattgaaacaggccttgtctgaaatc
tttaaggaccagcctttcgagtattttttaaaagaaaatacaattattatcaataaaaag
acaaatacaaagcccgccgaaactccattacagcaaacattaattaatgtaaaaggtgta
gtggtagacgaaaaaggtgaaccattaccgggagctactgtcagaacgaaggctggaaac
atggggacaataactgatgttgacggtatttttataattagaaatattgttgagggaacg
gtgttatcggtaactttcaccggtttcgaaactaaagaagtagaagctaagagcaataca
gacttacgcatatcgttgaaaaccgctcaatctgagctgaatgagattgttgttgttggt
tatggaagccaaagaagggaattggttacaagtgctattggtagtgtaaagtttaaggat
gaggatgtaagacaagtttcgtctcctgccaggatgctggaaggacggattgcaggggta
aacttatcgatcggttcgggtaatcttgcctcaggggaacgaatttctataagaggaagt
tcttctatcagtgctggtaacaatcctttgtatgtggtagatggtgtgcctattaataat
tccaatatgtctatttatgattttggagaaacttatagtccgcttgctgcgttcaatcat
gccgacatagaatctatagaagtattaaaagatgctgcttctgctgcaatatacggttcc
agagccagtaatggtgttatcttaattaccacaaaatctggaaagaatggaaaaaacatt
gtaaaagtagatgtaactaccggcttttctgaattcgctgataaagaaaaactgaaaata
gccaattcgaatctttatatattacaatttaacgaagggcaggaaaactataataaacaa
tatggtttaaaacccggagacgccaactataaaattcctatttccaatccgtttggaaat
atgcctgataccgattggttgggtttaattctgcaaaaaggttactttaagaatatcaat
accaatttctcaggaggcaccacaaaaactcaatattatgtaggcttaggctttacggat
caggaaggggttgtgcataacaattctattaaaaagtataatctgaataccaaattcagt
cacaagtttaatgattggttagagataggtttcaataatatgggaaattatatccgaaac
aatcaggttccgggagcgaatctgggttctactattctggcaagggctattgaacaaaga
ccttttgacaggccttataaacctaacggagattattatgttggcggaacagacgaattg
atgcgtcataatccagttcagattctaaatgagcagatagcttacgtagacaatttcagg
tatttgggaacttattatggtaagataaattttaacgagaatatatctttcaaatcatca
tttagtgctgatattggttatacctacgattacacttactataatgaaagacatccttac
ggtaccggagtgggtagattactggatgataatcgtatgatacagaattacctgacggag
aatatccttaattataccaacactttcggaaaatacaccgtaagcggtttgttagggcat
tcttttcagaaattacatagcaggaattcaaatatagatgcccgtggatttccaacgcct
tctttaggagtagtgtctgttgcatctgaaataaccagcgcaagtggagcaccaagcgag
tacgctttagagtcctattttggtcgggcaacaatgtcttacgatgataaatatatattt
accggaacattgcgggcagacggttcttctaaattcagggctgatcacagatggggcata
tttccttcattatcttttggttggaatgtttcgaaggaagattttatggatggaacaaat
ctggatttaaaactaagaacgagttacgggaaaacaggaaatcaggaaggaattggaaat
tatgcatatcagcccttaatcgctggcgggcaaaattatggtggccttagcggaatatct
gtttctacttttggtaacgaagacctgacctgggaaaaggcagatcagtatgactttggc
tttgatatttctttgtttaaaagaagggttaatttgtctgttgatgcctattataagaaa
actacagacttgttatatagtatgcctatccaggcaaccagtggtatgacaagtatcata
tcgaatatcgggtcgatggaaaacagaggtatagagttttctgcgaatacacattttaaa
ttagggcctgtagcctggaattctaatttcaatattgcgcacaacaagaataaaatctta
tctcttatagataatgataataagccgatttctattggcgacaatagggcgcttgtagta
ggcagagatattggttcttattatttgttcgaatcgcgaggaatttatcaatacgacgga
gaagttccacaagctcagtttgatttaggtgtgagggcaggagatgttagatggacggat
ttagatggtaataatattatcaatgataacgatcgtgttgttgtaggatcgtcgaatccc
aaattttctggaggttggagcaacagtttcaaatataaaaagctgcagttggatgtattg
actacttacagctatggcgcaaatatttatgctgcatggaaaccaaacggattgggtcgt
ataggttacagatttgcccagttggaagagtatgtagacaatcgttggaccggaccgggt
acgactaatgtttatccacgggcaatagccagtgaaacattcaatacgcgtaattctaca
agatttctggaagatgcctcatttatcaggttgcgggcacttacgttgggatatctcttg
ccggagctgacagtgaaaaaatttaaagtaagtcagatccgactttttgcacaagtagac
aacctgtttttatggacaaaatactcaggttgggatccggaagttaatacaaatctggac
ccaagattttcaggtatcgataacctaaacaatccacagccaagaacctatagcattgga
gcaaacatcagtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
