KEGG   Candidatus Phytoplasma solani: S284_00770
Entry
S284_00770        CDS       T02881                                 
Symbol
polC2
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha subunit, partial CDS
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
psol  Candidatus Phytoplasma solani
Pathway
psol03030  DNA replication
psol03430  Mismatch repair
psol03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:psol00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    S284_00770 (polC2)
   03430 Mismatch repair
    S284_00770 (polC2)
   03440 Homologous recombination
    S284_00770 (polC2)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:psol03032]
    S284_00770 (polC2)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:psol03400]
    S284_00770 (polC2)
Enzymes [BR:psol01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     S284_00770 (polC2)
DNA replication proteins [BR:psol03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     S284_00770 (polC2)
DNA repair and recombination proteins [BR:psol03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     S284_00770 (polC2)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T PHP DNA_pol3_finger Rv2179c-like RNase_H_2 DEDDh_C Auto_anti-p27
Other DBs
NCBI-ProteinID: CCP88014
LinkDB
Position
complement(<85346..89542)
AA seq 1399 aa
MVFYLFYLFCKQNVLYFNKISLGGICVSIDLFQQFIKENSFDQNHFQNPQLTKVSIVSRE
DKWILHISFQNLPLISDLSIFLQKLKLFITTKYQNHISAEYQNIISIDYCLDFKNFDYLD
SLAESYYRFILLQAKLKQKYLDLEFFENDNYQIQFQNEKFVIFVDTEMFSVLKKKLPLLK
EFFSSFYGLKNDFILIKDNKIKTAQKQATIKPPNTYQTFVKNDFNFKDEQKMLKIKDIPK
SKEEFNDFDYKYPKQTFIIEGLLSQLISESNFRKYNWKEFYFSCVLEENNGFSIEDRDAI
LIKSRVTKEKKEELLNYNIKMHQKIQIKAKVQYSVWDDVHLFFHQKDITILDESSLFPVR
KDHGFAGKKRIEFHTHTKMSNLDAINSAKEYLQTAVAWGHKAIAFTDHDGIYSYPEIYEF
TKDKKIKPIYGVELDFVSEKPIYITNQIEDNLTQDFNLKEATYVVFDLETTGLSGVRDKI
IEIAGVKIKKGKKIDEFQVLINPQEKLTSTIINITNITDEMLVGKKTIDQVLPTFLEFIK
DCVLVAHNANFDITFLKEKIKELNLEYMPQPIIDTLPLSQRYFSEFLKYFSLKRITSVFK
VKMESHHRALSDSNATAEVFIKMIDQLSDPKKDPKNLIITNFSELKEPIDLKYQRPYHIN
ILAANQKGYRNLFELLSMALTNGFYKTPRVLKTSLIKYRKGLLIGSGCYNSDIFDIALNG
NNQKLEEAISFYDYIEVQPPQAYKHLIFELGVKGEQIIQSTLIKIIEEAKRQNKIVIATG
DVHYIHPWEKDYRQIYISAKQVGGGLHRLSKYSNHNLPDNYLLTTQEMLDAFSFLKDDVL
AQEIVIDNTHLLNNKIKRIKAFNEELFSLKDDAFKKTLHIPSIKKELKRLIDIKVKNLYG
SNPHPLIQERLKQELQNIIGDVNDTKSNQEIAPIYYLSHLLVKKSLDDGYLVGSRGSIGS
SLVATMLEITEVNPLKPHYRCPNCKHTIVKLNPEEKIKYGLLEEQSYNEALDKVFSGYDL
ENKDCPKCQTPLKKDGHDIPFETFLGFEGNKTPDIDLNFAGDYQMQAHNYIKSLMGENNA
FRAGTIQTIAKRNAYGYVMGFIEETQRNWRKQKILQITSKIEGVKRSTGQHPGGIVIVPP
NHNIYEITPIQFPANDVNSQWKTTHFDYHSFENNLFKLDILGHDDPMMIKFLMDYVKLNP
NKFPFDKAQDIPLDDRQIYKLFSEDLKITSYQNEIITIDSLGIPEFGTIFVKQMLKDIKK
NHKNFINFADLVKISGLSHGTDVWNQNAKDIISQTGDFEKYKNKKISFDNIIGCRDDIML
HLQEKGIEPLKAFDIMEFIRKGKPQSDVEKWQNYKSLMQGKVEDWYIDSAEKIKYLFPKA
HATAYVIMALRIAWFKVHA
NT seq 4197 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtggttttttatttattttatcttttttgcaagcaaaatgttttatattttaacaaaatt
agcctaggtggtatttgcgtgtctattgatttatttcaacaattcatcaaagaaaatagc
tttgatcaaaaccattttcaaaatccgcaattaacaaaagtttcaattgtgagtcgcgaa
gataaatggattttacatattagttttcaaaacttacctttgatctctgatttatcgatt
tttttacaaaaattaaaactttttattacaaccaaatatcaaaatcatatttcagcagaa
taccaaaacattatttcaattgattattgtctcgattttaaaaattttgattatttagat
tctttggccgaaagttattatcgtttcattcttctgcaagctaaattgaaacaaaaatat
ttggatttagagttttttgaaaatgataattatcagattcaatttcaaaacgaaaaattt
gtcatttttgttgatactgaaatgttttcggttttaaaaaagaaactcccccttttaaaa
gaattttttagttctttttatggtttaaaaaacgattttattttaataaaagataataaa
atcaaaactgctcaaaaacaagcaacaataaaaccaccaaacacctaccaaacatttgtt
aaaaacgattttaattttaaagatgaacaaaaaatgctaaagattaaagatattcctaaa
tctaaagaagaatttaacgattttgactacaaatacccaaaacaaacttttataattgaa
ggacttttatcacaactaatttcagaaagtaatttccgtaaatacaattggaaagaattt
tattttagttgtgttttggaagaaaataatggcttttcgatcgaagacagagatgctatt
ttaattaaatctagagtgacaaaagaaaaaaaagaagaattattaaattacaatattaaa
atgcatcaaaaaattcaaattaaagccaaagttcaatatagcgtttgggacgatgtccat
ttgtttttccatcaaaaagatatcactattttagatgaatcttctttgtttccagttaga
aaagatcatgggtttgcaggtaaaaaaagaattgaatttcacactcacaccaaaatgtcg
aatctagatgcaattaatagcgctaaagaatatttacaaacagcagttgcatggggtcat
aaagctattgcttttaccgatcatgatggtatttattcttatcccgaaatttacgaattt
accaaagataagaagatcaaaccgatttatggggttgaacttgattttgtttcagaaaaa
ccgatttatattactaatcaaatcgaagataatttaacacaagattttaatttaaaagaa
gcaacctatgttgtatttgatttagaaacaacaggtcttagtggtgttcgtgacaaaatt
attgaaattgcaggagtcaaaattaaaaaaggtaaaaaaattgacgaatttcaagtttta
attaatccacaagaaaaattaacttccactattattaatatcaccaatattacagatgaa
atgttggtaggcaaaaaaacaatcgatcaagtgctgcctacttttctagaatttattaaa
gattgtgtgttagtggctcataatgctaattttgatataacttttttgaaagaaaaaatc
aaagaacttaatttagagtatatgccacaaccaattatcgacacattaccactatcgcaa
cgatattttagtgaatttttaaaatatttttctttaaaaaggataactagtgtttttaaa
gtcaaaatggaaagccaccaccgtgctttaagtgattctaacgcaacggctgaagttttt
atcaaaatgatagatcaattatcagaccctaaaaaagatcctaaaaatttaatcattact
aatttttcggagttaaaagagccaattgaccttaaatatcaaagaccctatcatatcaac
attttagcagctaatcaaaaaggttatcgcaatctttttgaacttttaagtatggctttg
acaaatggattttataaaactccaagagttttaaaaacgagtttgataaaatatagaaaa
ggacttctgattggaagtggctgttacaatagtgatatttttgatatagctttaaatggt
aataaccaaaaattagaagaagccatctctttttatgattatattgaagttcaaccgcct
caagcctataaacatttaatttttgaattaggtgttaaaggggaacaaattattcaatca
actttgattaaaataattgaagaagcaaaaagacaaaataaaattgttattgcaaccgga
gatgttcattatattcacccttgggaaaaagattatcgtcaaatttatatcagtgctaaa
caagtaggaggcggtctgcaccgattatctaaatacagcaatcataatttgcctgataac
tatcttttaactactcaagaaatgcttgatgcttttagttttttaaaagatgatgttttg
gcgcaagaaattgtaatcgataacacccatttacttaataataaaattaaaagaattaaa
gccttcaatgaagagttattttcgctaaaagatgatgcttttaaaaaaaccttgcatata
ccgagtattaaaaaagaacttaaacgtttgattgatataaaagttaaaaatttatacggt
tctaacccgcaccctttgattcaagaaagattaaaacaagaattacaaaacattattggt
gacgtaaacgacacaaaaagtaatcaagaaattgctcctatttattatttatcgcattta
ttagttaaaaaatctttagatgatggttatttggtaggttctagaggttctatcggttct
tctttggtggctaccatgttagagattactgaagttaaccccttaaaaccgcattatcgt
tgtcctaattgtaaacacaccattgttaagttaaacccagaagaaaaaattaaatatggc
cttttggaagaacaaagttacaacgaagccttagataaagttttttcaggctatgatttg
gaaaataaagattgtcctaaatgtcaaactcctttgaaaaaagatggtcatgatattcct
tttgaaacctttttagggtttgaaggcaacaaaactcccgatattgatcttaattttgca
ggtgattatcaaatgcaagcccataattatatcaagagtttgatgggtgaaaataatgct
tttcgagctggaaccattcaaacaatcgcaaaaagaaatgcttatggttatgtcatgggt
tttattgaagaaacccaaagaaattggcgaaaacaaaaaatattgcaaatcacaagcaag
attgaaggggtaaaacgttctactgggcaacatccaggcggaattgtcatcgttccacct
aatcacaatatttatgaaatcactccaattcaatttccagctaatgatgttaattcccaa
tggaaaactactcattttgactatcattcatttgagaataatttatttaaattagatatt
ttaggccatgatgatcctatgatgattaagtttttgatggattatgtaaaattaaatcca
aataaattcccttttgataaagctcaagatattcctttagatgatcgtcaaatttataaa
ttattttccgaagatcttaaaataacttcttatcaaaatgaaataattacgattgattct
ttagggattccagaatttggaactatttttgtcaagcaaatgttaaaagatatcaaaaaa
aatcataaaaattttattaattttgctgatttagttaaaatttctggtctttctcatgga
actgatgtttggaatcaaaacgctaaagatattattagtcagactggtgattttgagaaa
tacaaaaataaaaaaatatcttttgataatattattgggtgtcgtgatgatattatgttg
catttacaagaaaaaggcatcgaacctttaaaagcctttgacattatggaattcattcgt
aaaggtaaaccgcaaagtgatgtcgaaaaatggcaaaactataaatcactgatgcaagga
aaagttgaagattggtatattgattcagctgaaaaaatcaaatatttattcccgaaagct
catgcgactgcttatgtgattatggctttaagaattgcttggttcaaagtgcatgcg

DBGET integrated database retrieval system