Papaver somniferum (opium poppy): 113318014
Help
Entry
113318014 CDS
T05758
Name
(RefSeq) callose synthase 12-like isoform X1
KO
K11000
callose synthase [EC:2.4.1.-]
Organism
psom
Papaver somniferum (opium poppy)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psom00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
psom01003
]
113318014
Glycosyltransferases [BR:
psom01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
113318014
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Glucan_synthase
FKS1_dom1
CALS1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113318014
NCBI-ProteinID:
XP_026421926
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(67480760..67487600)
Genome browser
AA seq
1793 aa
AA seq
DB search
MSSHQRSPPPLPRDRGGGGGGRNTTAPPPPEEEAEEVYNIIPIHNLLDDHPSLRYPEVRA
ATAALRAVGDLRKPPFRPWRNDMDLLDWLGIFFGFQIDNVRNQREHIILHLANAQMRSQP
PPDNIDALDPTVLRRFRKKLLQNYTSWCGYLGHKSNVWISDRRGSGISSSDHRRELLYTS
LYLLIWGESANLRFVPECLCYIFHNMAMELNKILEDYIDENTGRPVLPSISGENAFLNRV
VTPLYQTIKAEVENSRNGTAPHSVWRNYDDINEYFWSKRCFQRLKWPIDVGSNFFVTSGK
NKRVGKTGFVEQRSFWNLFRSFDRLWIMHILFLQAAIIVAWDSNSTYPWEALKKRNMQVK
CLTVFITWGGLRFIQSLLDVGTQYTLISRETLGVGVRMLMKSIVAAAWTIAFGAMYGRIW
NQRNRENQGLQWSREANRLVMNFLYAALVFIVPELLALSFFILPWIRNFIEGTNWSVFYV
LTWWFQSRTFVGRGLREGIWDNIKYTLFWILVLATKFCFSYFLQIKPLIEPTKAVLRLRD
VQLNWPQFFNDGNRLAVGLLWLPVVLIYLMDIQIWYSIYSSFVGAMVGLFAHLGEIRNIQ
QLTLRFQFFASAMQFNLMPEEQLFRTRGSLKNRFNDAVRRLKLRYGLGSPYKKLESNQVE
AHKFALIWNEIISTFREEDIVSDQEVELLELPANTWNIRVIRWPCLLLCNELLLALSQAK
ELVDAPDRWLWKKICKSEYRRCAVIEAYDSIKRMLLEIVKDRTEENSIIRTLFREIDHAV
EIEKFTKTYDMTALPQIHAKLITLVELLNKPKKDVSKLVNTIQALYEILIRDFPKEKRTS
EQLREDGLAIQNPDENKVLPFENVVEVPAAENTSFYRQVRRLQTILTSRDSMHKVPINLE
ARRRIAFFSNSLFMNMPHAPQVEKMMAFSVLTPYYTEEVIYSKEQLEKKNEDGISTLYYL
QKIYDDEWKNFKERMRRDGMVDEEEMWTTRVRELRLWASYRGQTLSRTVRGMMYYYKALK
MLAFLDSASEMDIREGSQELSSVRQDDRVIDGSDSGREPSSRNLSRASSGVNVLFKGHEY
GTALMKYTYVVACQVYGSQKAKKDPRAEEILYLMKNNEALRVAYVDEVYTGREEVEYYSV
LVKYDQNLQKEVEIYRIRLPGPLKIGEGKPENQNHALIFTRGDAVQTIDMNQDNYFEEAL
KMRNLLEEYRKYYGIRKPTILGVREHIFTGSVSSLAWFMSAQEMSFVTLGQRVLANPLKV
RMHYGHPDVFDRFWFLTRGGISKASRVINISEDIFAGFNCTLRGGNVTHHEYIQVGKGRD
VGLNQISMFEAKVASGNGEQILSRDVYRLGHRLDFFRMLSFFYTTVGFFFNTMMVILTVY
AFVWGRLYLALSGIEKGMKTSTNNKAFGAILNQQFIIQLGLFTALPMIVENSLEHGFLNA
IWDFLTMQLQLSSVFYSFSMGTRTHYFGRTVLHGGAKYRATGRGFVVEHKSFAENYRLYA
RSHFVKAVELGLILILYAAYSPLAKDTFVYIAMTISSWFLVISWILAPFVFNPSGFDWLK
TVYDFDNFMTWIWCRGGVFTKAEQTWETWWNEEQDHLRMTGLWGKLLEIILDLRYFFFQF
GVVYQLGIANGSTHIAVYLLSWIYVVVFVGIYVIMAYARDKYAAKEHIYYRMVQFLVVIL
AVLVIVLLLEFTKFKFIDIFTGFLAFIPTGWGLISIAQVFKPFLQSTMLWGTVVSMARMY
DILFGVIVMVPVATLSWLPGFQSMQTRILFNEAFSRGLQISRILEGKKSTKDL
NT seq
5382 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttctcatcaacgatctccgccaccgttaccaagagacagaggaggtggaggagga
ggtcgtaacaccaccgcaccaccaccaccggaagaagaagcagaagaagtttacaatatt
attccaatccataacctgttagatgaccatccatctctacgttacccagaagttcgtgct
gctacagctgctcttcgtgctgttggtgaccttcgtaaaccaccgttcagaccatggagg
aatgatatggaccttctcgattggcttggtattttctttggctttcaaattgataatgtt
agaaatcaaagagaacacattattcttcatttagctaatgctcagatgcgttcacaacct
cctcctgataatattgatgccctagatcctactgtgttgaggagatttcgtaagaaattg
ttgcagaattatacttcttggtgtggttatttagggcataagtctaatgtctggatttca
gatcgacgtggtagtggtatatctagttctgatcatcgccgtgagttgctttatacgtct
ctatatttgttgatttggggtgaatcagctaatcttaggtttgtgcctgaatgtctgtgt
tatatctttcataatatggctatggaacttaataaaattttagaagattatattgatgaa
aatactggtcgtcctgtacttccgtccatatctggtgaaaatgctttcttaaatcgtgtg
gttactccactttatcaaacgattaaagctgaagttgagaatagtcggaatggtactgct
cctcattctgtttggaggaattatgatgatattaatgaatatttttggagtaaacgttgt
tttcagcgtctgaaatggccaattgatgttgggagtaatttttttgttacctctggtaaa
aataagagagttggaaagactgggtttgttgagcaacgatctttctggaatttatttcga
agttttgatcgactttggataatgcatatattgtttctgcaagctgctatcattgtagct
tgggacagtaactccacttatccttgggaagcgttgaaaaagagaaatatgcaagttaag
tgtctcacggtattcataacgtggggaggtcttcgctttattcaatcattacttgatgta
gggacacagtatacgttgatatctagggaaactttgggggttggggtgagaatgttgatg
aagagcattgttgcggcagcgtggactattgcttttggtgctatgtatggaagaatttgg
aaccagaggaatcgtgagaatcagggccttcaatggtcacgtgaagcaaatcggctagtg
atgaatttcttgtacgcagctttggtgtttattgtaccagaactattagcactgtctttc
ttcattcttccttggatcaggaactttattgaaggaaccaattggagtgtcttctatgtg
ttgacttggtggtttcaaagtcgaacttttgttgggcgtggtctgagagaaggtatttgg
gataacatcaagtacacactcttctggattttggttttagcaacaaaattctgctttagt
tacttcctccaaatcaagccattgattgagccgacaaaggcagttttaagactcagggat
gttcagttgaattggcctcagttcttcaatgacggtaacagattagcagttggtttgtta
tggcttccggtggttttaatttatcttatggatatacaaatatggtattctatatactct
tcttttgttggggcaatggtcggattgttcgcacatctgggtgagattcgaaatatccaa
caactaacccttaggtttcagttctttgcgagcgcaatgcagtttaatctcatgccggag
gagcaattattcaggactagagggtcactgaagaacaggttcaatgatgcagttcgcagg
ttgaagctacggtatggactgggttcaccttacaagaagcttgagtcgaatcaggtggag
gcacacaagttcgctttgatatggaatgagattatttcgacgttcagggaagaagatata
gtcagtgaccaggaggttgagctacttgaactgccggcaaacacgtggaacattagagtt
atcagatggccatgtttactcctttgcaatgagcttctgctagctctcagccaagcaaaa
gaattggtggatgcacctgacaggtggctctggaagaagatatgcaagagtgagtacagg
aggtgtgctgtaattgaagcttacgatagtatcaagcgcatgctgcttgaaatagtcaag
gatcgcacggaagagaactccatcataaggactttgttcagggagattgatcatgcagtc
gagattgagaagttcacaaaaacatacgacatgactgcactgcctcagatccatgccaag
ttgataactctagttgaactcctaaataagccaaagaaggatgtgagtaagttggtaaat
acaatacaggctctgtatgaaatcttgattcgagattttccaaaggagaagaggacatcg
gagcagttaagggaagatgggttggccattcagaatccagacgaaaacaaagttctgccg
tttgagaatgttgttgaggttcctgctgccgagaacacatccttctaccgtcaggtgcgt
cgtttgcagacaattctaacatccagagactcaatgcacaaagtccccataaatctcgag
gcaagacgccgtatagccttctttagcaactcactctttatgaacatgccacatgctccc
caagttgaaaaaatgatggcttttagtgttctgactccttactataccgaagaggtcatc
tacagcaaagaacaacttgaaaaaaagaatgaagatggaatctctaccctttattatttg
cagaagatttatgatgacgagtggaagaactttaaggagaggatgcgtagagatgggatg
gtcgatgaggaagagatgtggacaaccagggtgagagagctgcggctttgggcatcatat
cgaggccaaactctatctcgcactgtcaggggaatgatgtactactacaaggctctcaaa
atgctggcattccttgattctgcatcagagatggacatcagggaaggatcacaggaactt
tcttcggtgagacaggacgacagagttattgatggttcggattctggcagggaaccttct
tcgagaaatctcagcagggcaagtagtggagtcaatgtgttattcaaaggtcacgagtat
ggaactgctttaatgaaatacacatatgtggtcgcctgccaggtctacgggtctcagaag
gcaaagaaagatccacgtgcagaggagatcttatacctaatgaagaacaatgaggccctt
cgagttgcctatgttgatgaggtctacacagggagggaagaggtggaatattattccgtt
ctagtaaaatatgaccagaacctgcagaaggaagttgagatctacaggattaggttgcct
ggtcccttgaaaatcggggaaggtaaaccagagaatcaaaatcatgctctcatattcacc
cgtggcgatgcagtgcaaaccattgacatgaaccaagacaactattttgaggaggctctc
aaaatgcggaatctattggaagaatataggaagtattacggcatcaggaagcccaccata
ttaggagtccgggagcacatcttcacaggttctgtttcatctcttgcttggttcatgtct
gctcaagagatgagctttgtcaccttggggcagcgtgttctagcaaaccccctaaaggta
cgaatgcattatggccaccctgatgtgtttgataggttctggttcttgactcggggtggt
ataagtaaggcgtctcgagttatcaatattagtgaagacatttttgctggtttcaattgt
acattgcgaggtggcaatgttacacaccatgagtacattcaggttggtaagggaagggat
gttggtttgaatcagatatccatgtttgaggccaaggttgccagtggcaatggtgagcag
attcttagcagggatgtgtatcgcttgggtcatagacttgatttctttcggatgctgtca
ttcttttataccacggtggggttcttttttaacactatgatggtgatcctcactgtttat
gcgtttgtatggggtcgactttatcttgctctcagtggaattgagaaagggatgaaaact
tctactaacaacaaagcatttggtgccatactgaatcagcagttcataatccagcttggt
ctcttcaccgctctcccgatgattgtggagaactctctcgagcatggattcctgaatgca
atttgggatttcctgacaatgcagctgcagctttcatctgttttttactcattttcaatg
ggaacacgtactcattattttggccggaccgttcttcatgggggtgctaaataccgtgct
accggccgtggttttgttgtggaacacaagagttttgctgagaactatagactatatgcg
cgtagccattttgtgaaagcagttgagctcgggctgatattgatattgtatgctgcatac
agccccttggcgaaggatacttttgtgtacatagccatgacgatctcgagttggtttctg
gtaatatcatggatcctggctccctttgtgtttaatccctctggctttgactggttgaaa
actgtctatgacttcgacaattttatgacctggatatggtgtcgtggtggggttttcact
aaagcagagcagacctgggaaacttggtggaatgaagaacaggatcatctcagaatgaca
ggtctctgggggaagctgttagaaataattctagacctgcgttatttctttttccagttt
ggtgtcgtatatcagctggggattgccaatggaagcacccatattgcagtatatttactt
tcgtggatttacgtggtcgtgtttgttgggatttacgtgatcatggcatatgcccgtgat
aagtatgctgcaaaggaacacatttactacaggatggttcagttccttgtcgtcatcctt
gctgtgcttgtgattgtcctcttgctggaattcacaaaattcaaatttatcgatatcttt
acagggttcttagcattcattccaacgggatggggtttgatatccattgcccaagtattt
aaaccctttctccagtccacaatgctgtggggaactgttgtgtctatggcacggatgtac
gatatccttttcggagtgattgtcatggtccctgttgcaacgttatcttggttgcctggg
ttccagtctatgcagacaaggatcctcttcaatgaagcatttagcagagggctccagata
tctcgtattttagaaggcaaaaaatctaccaaggacttatga
DBGET
integrated database retrieval system
