Paraclostridium sordellii: RSJ16_09795
Help
Entry
RSJ16_09795 CDS
T05252
Name
(GenBank) 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase
Organism
psor
Paraclostridium sordellii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF2229
BcrAD_BadFG
DEDD_Tnp_IS110
FGGY_N
Hydant_A_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUN14492
LinkDB
All DBs
Position
complement(1944417..1948700)
Genome browser
AA seq
1427 aa
AA seq
DB search
MMDTFNIGIDVGSTTVKVVVLDKNKKIIFKEYERHLSDIKNAVTKVLEDTYKLIGDENVS
IVITGSGGMNLANELKVEFIQEVIASTKAIEYFNPETDVVIELGGEDAKITYLTNGIEQR
MNGICAGGTGSFIDQMATLLKTDAQGLNELAKGYKNIYSIAARCGVFAKTDIQPLINEGA
RKEDIAMSIFHAVVVQTISVLACGRKIQGKVAFLGGPLYFLSQLRKAFINVLKLDKDDIV
FPEDAQLYIAMGAALSCKEKTVTLGNLIDNLKHLKLKEVMDNSGLRPLFKTEKEYIDFRN
RHDKDIVKTKELLNYSGNCFLGIDAGSTTTKVALVDDEGNLLYSDYRSNEGSPLDSTIHI
LNNIYDILPKGAKIVNSAVTGYGEALLQKALKIDVGEIETIAHYKGAKFFSPNVDFILDI
GGQDMKCLKINNGVIETIILNEACSSGCGSFLETFAKSLQLDIKDFSKKALYSKNPVDLG
SRCTVFMNSRVKQAQKEGNSVSDISAGLSYSVIKNALYKVIKVKSKEDIGNFPVVQGGTF
YNDAVLRVFEILTEREVVRPNIAGIMGAFGASIIAKEKYNKNHKTSLLDKKGINSINLNI
TTARCGKCSNNCLLTINSFGNGEKFISGNRCEKGIGLNRNENKNINLFEYKYKRVFDYES
LDINKAKRKEIGLPRVLNMYEDYPLWHTIFTNLGFKVVLSSESSKELYESGMDSIASESV
CYPAKMVHGHINDLIKKGIKNIFYPCIRHEHKEFKNVDNHFNCPVVMSYSEVIKNNISEI
KENNINFINPFLPMNSKNALKKKLYEELNKIKDYDNEFIEISKDEINKSVELGFKEYEKF
KEDIRNKGELALNYIKENNLKGIILAGRPYHIDPEINHGIPEMINSLDMAVLTEDSICHL
GKLDESLRVVDQWAYHSRLYRAANFVSSRDDLSLVQLNSFGCGLDSVTTDQVQEILSGEG
KIYTCIKIDEGNNLGAARIRLRSLKAALQERENNNIQGIKVKKTYTKGSLSKSIKENYTI
LVPQMSPIHFDLVEHSVRSCGYNMVLLKDYEGAIEEGLKYVNNDACYPAIIVIGQLIKAL
KSGKYDLNKTAVAITQTGGVCRATNYIGFLRKGLSDAGYGNIPVVSLSVNGDEKGNLYSV
FSLGLINRVIMAAIYGDLLMKVLYKVRPYELEKGSANKLYKKYIEICKKSLEKGNLSKFK
ENIYNIVKDFDELPITDEKKPKVGLVGEILVKFHPLANNNIVDILEEEGAEAVVPELLNF
FLSCAFNTYYKADNYLDKKYKKLGGKLVINSIAMYQKHYMKALEESKRFSKPKYIQDLGE
TASKVISLGNQAGEGWLLTAEMMELIESDVKNIICMQPFACLPNHITGKGVIKELKRVYS
NTNIIPIDYDPGASEVNQLNRIKLMLSTSFKNLNSEFEEEILATSTV
NT seq
4284 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggacactttcaatataggaattgatgtgggatcaactacagtaaaagtcgtagta
ttagataaaaataaaaagataatttttaaagaatacgaaagacatttatcagatattaaa
aatgctgtcactaaagtattagaagatacttataaacttattggtgatgaaaatgtatct
atagttataacgggttcaggtggaatgaatttagcaaatgaattaaaagttgaatttatt
caagaagtaattgctagtacaaaagctattgagtattttaatcctgaaactgatgttgta
atagaacttggtggggaagatgctaaaataacctatttaacaaatggaatagaacaaagg
atgaatgggatatgtgcaggtggaacagggtcttttattgatcaaatggcaactctttta
aaaacagatgctcagggattaaatgaattagcaaaaggttataaaaatatatatagtata
gctgcaagatgtggagtatttgcaaaaacagatatacaaccccttataaatgaaggagct
agaaaagaagatatagcaatgagtatttttcatgcggtagtagttcaaacaattagcgtt
ttagcttgtggaagaaagattcaaggaaaggtagcctttttagggggaccattatacttc
ttatctcaactaagaaaagcttttattaatgttcttaagttagataaagatgatattgta
tttcctgaagatgcacaattatacatagctatgggtgccgcattatcatgtaaggagaaa
actgttactttaggtaatttaatagataatttaaaacatttaaaattaaaagaagttatg
gataacagtggacttagacctttatttaagacagagaaagaatatatagattttagaaat
agacatgataaagatattgttaaaactaaagaattattaaactatagtggaaattgtttt
ttaggtatagatgcggggtcaactactacaaaagtagcattagttgatgatgaaggtaat
ttattatattcagattatagaagcaatgaaggaagcccattagactcaacaatacatatt
ttaaacaatatatatgatatattacctaaaggggctaaaattgtaaattcagctgttaca
gggtatggagaagcattacttcaaaaagctttaaaaatagatgtgggagaaattgaaaca
atagcacactacaaaggagcaaagtttttttcacctaatgtagattttatattagatata
ggcggtcaagatatgaaatgccttaaaataaataatggagtaatagaaactatcatatta
aatgaggcttgttcttctggatgtgggtcttttttagaaacatttgcaaagtcgttacaa
ttagatattaaagatttttctaaaaaagctctatactctaaaaatccagtagatttaggt
tcaagatgtacggtatttatgaactcaagagtaaaacaagcacaaaaagaaggaaattca
gtaagtgatataagtgcagggctttcttattctgttataaaaaatgccttatacaaagtt
ataaaagtaaaatcaaaagaagatataggcaattttccagtagttcaaggaggaactttt
tacaacgatgctgtcttaagggtttttgaaattttaacagaacgagaagttgtaagacct
aatatagctggaataatgggagcttttggagcaagtattattgctaaagaaaaatataat
aaaaatcataaaacctctcttttagataaaaaaggtatcaattcaataaacttaaatata
actactgcaagatgtggtaaatgttctaataattgtttgttaactataaatagttttgga
aatggagaaaaatttatttcaggaaatagatgtgaaaaaggaataggactaaatagaaat
gaaaataagaatataaatctatttgagtataagtataaaagagtatttgattatgaaagc
ttagatataaataaagcaaagcgaaaggaaataggattacctagagttttaaatatgtat
gaagactatcctctatggcatacaatatttacaaatttaggatttaaagtcgtgctttct
agtgagtcttcaaaagagttatatgaaagtgggatggattcaattgcatcagagtcagtt
tgttatccagcaaaaatggtacatggacatataaatgatttaataaaaaaaggtataaaa
aatatattctatccatgtataagacatgaacacaaagaatttaaaaatgtagataatcat
tttaattgtccagttgttatgtcctattcagaggtaataaaaaataatataagtgaaata
aaagaaaataatatcaattttataaatccatttttaccaatgaatagcaaaaacgcctta
aagaaaaagctttatgaagagctaaataaaattaaagattatgataatgaattcatagaa
ataagtaaagatgaaataaataaaagtgttgaacttggatttaaagaatatgaaaaattc
aaagaggatataagaaataaaggagaactagctttaaactatattaaagaaaacaatctt
aagggaattatactagcaggtagaccatatcatattgatccagaaataaaccatggaata
ccggagatgataaattctttagatatggcagttctaacagaagatagtatatgtcattta
ggaaaattagatgaatctttaagagttgtagatcaatgggcatatcattcaagattatat
agagcagctaattttgtaagttctagagatgatttatctcttgttcagctaaattctttt
gggtgtggattagattcagttacaaccgatcaagtccaagaaattctaagtggagaaggg
aaaatttacacttgtataaaaattgatgaaggaaataatcttggagctgcgagaataaga
ttaagatctttaaaagcagcattacaggaaagggaaaataataatatacaaggaataaaa
gttaagaaaacatatacaaaaggaagtttaagtaaatcaataaaagaaaattatactatt
ttagtgccccaaatgtctccaatacactttgatttagttgaacatagtgtaagaagttgt
ggatataatatggttttactaaaagactatgaaggagccatagaagaaggattaaaatat
gtaaataatgatgcttgctatccagcaataattgttataggccagttaattaaagcactt
aaaagtgggaaatacgatttaaataaaactgctgtagctataactcaaacaggtggtgta
tgtagagctacaaattatataggatttttaagaaaaggattaagtgatgctggatatgga
aatattcctgttgtgtccttatcagtaaatggagatgaaaaaggaaatctatatagtgta
ttttctttaggattaataaatagagttataatggctgctatatatggagatttactaatg
aaagttttatataaagttagaccttatgaactagaaaagggaagtgcaaataaactttat
aaaaaatatatagaaatatgcaaaaagagtttagaaaaaggtaatttatctaaatttaaa
gaaaacatatataatatagttaaggattttgatgaactgcctataactgatgagaaaaag
cctaaagtgggattagtgggtgaaatattagtaaagtttcatccattagctaataacaat
atagtagatattttagaagaagagggtgcagaagctgttgtaccagagcttttaaatttc
ttcttaagttgtgcatttaatacttactataaggctgataactatctagataaaaaatat
aaaaaattaggtgggaaattagttataaattcaatagcaatgtatcaaaaacactatatg
aaagccttagaggagagtaaaagatttagtaaaccaaaatacattcaagatttaggagag
actgcatcaaaggttatatcacttggaaatcaagcaggagaagggtggcttttaactgct
gaaatgatggaacttatagaaagtgatgttaaaaatattatatgtatgcaaccttttgca
tgtttgccaaatcacataaccggaaaaggtgtaataaaagaattaaaaagagtttattca
aatactaatataattcctatagattatgatccaggagctagtgaagttaatcaattaaat
agaattaaattgatgttatcaacatcatttaaaaatttaaatagtgaatttgaagaggaa
attttagcaactagtacagtttag
DBGET
integrated database retrieval system