KEGG   Paraclostridium sordellii: RSJ16_09795
Entry
RSJ16_09795       CDS       T05252                                 
Name
(GenBank) 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase
Organism
psor  Paraclostridium sordellii
SSDB
Motif
Pfam: DUF2229 BcrAD_BadFG DEDD_Tnp_IS110 FGGY_N Hydant_A_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: AUN14492
LinkDB
Position
complement(1944417..1948700)
AA seq 1427 aa
MMDTFNIGIDVGSTTVKVVVLDKNKKIIFKEYERHLSDIKNAVTKVLEDTYKLIGDENVS
IVITGSGGMNLANELKVEFIQEVIASTKAIEYFNPETDVVIELGGEDAKITYLTNGIEQR
MNGICAGGTGSFIDQMATLLKTDAQGLNELAKGYKNIYSIAARCGVFAKTDIQPLINEGA
RKEDIAMSIFHAVVVQTISVLACGRKIQGKVAFLGGPLYFLSQLRKAFINVLKLDKDDIV
FPEDAQLYIAMGAALSCKEKTVTLGNLIDNLKHLKLKEVMDNSGLRPLFKTEKEYIDFRN
RHDKDIVKTKELLNYSGNCFLGIDAGSTTTKVALVDDEGNLLYSDYRSNEGSPLDSTIHI
LNNIYDILPKGAKIVNSAVTGYGEALLQKALKIDVGEIETIAHYKGAKFFSPNVDFILDI
GGQDMKCLKINNGVIETIILNEACSSGCGSFLETFAKSLQLDIKDFSKKALYSKNPVDLG
SRCTVFMNSRVKQAQKEGNSVSDISAGLSYSVIKNALYKVIKVKSKEDIGNFPVVQGGTF
YNDAVLRVFEILTEREVVRPNIAGIMGAFGASIIAKEKYNKNHKTSLLDKKGINSINLNI
TTARCGKCSNNCLLTINSFGNGEKFISGNRCEKGIGLNRNENKNINLFEYKYKRVFDYES
LDINKAKRKEIGLPRVLNMYEDYPLWHTIFTNLGFKVVLSSESSKELYESGMDSIASESV
CYPAKMVHGHINDLIKKGIKNIFYPCIRHEHKEFKNVDNHFNCPVVMSYSEVIKNNISEI
KENNINFINPFLPMNSKNALKKKLYEELNKIKDYDNEFIEISKDEINKSVELGFKEYEKF
KEDIRNKGELALNYIKENNLKGIILAGRPYHIDPEINHGIPEMINSLDMAVLTEDSICHL
GKLDESLRVVDQWAYHSRLYRAANFVSSRDDLSLVQLNSFGCGLDSVTTDQVQEILSGEG
KIYTCIKIDEGNNLGAARIRLRSLKAALQERENNNIQGIKVKKTYTKGSLSKSIKENYTI
LVPQMSPIHFDLVEHSVRSCGYNMVLLKDYEGAIEEGLKYVNNDACYPAIIVIGQLIKAL
KSGKYDLNKTAVAITQTGGVCRATNYIGFLRKGLSDAGYGNIPVVSLSVNGDEKGNLYSV
FSLGLINRVIMAAIYGDLLMKVLYKVRPYELEKGSANKLYKKYIEICKKSLEKGNLSKFK
ENIYNIVKDFDELPITDEKKPKVGLVGEILVKFHPLANNNIVDILEEEGAEAVVPELLNF
FLSCAFNTYYKADNYLDKKYKKLGGKLVINSIAMYQKHYMKALEESKRFSKPKYIQDLGE
TASKVISLGNQAGEGWLLTAEMMELIESDVKNIICMQPFACLPNHITGKGVIKELKRVYS
NTNIIPIDYDPGASEVNQLNRIKLMLSTSFKNLNSEFEEEILATSTV
NT seq 4284 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatggacactttcaatataggaattgatgtgggatcaactacagtaaaagtcgtagta
ttagataaaaataaaaagataatttttaaagaatacgaaagacatttatcagatattaaa
aatgctgtcactaaagtattagaagatacttataaacttattggtgatgaaaatgtatct
atagttataacgggttcaggtggaatgaatttagcaaatgaattaaaagttgaatttatt
caagaagtaattgctagtacaaaagctattgagtattttaatcctgaaactgatgttgta
atagaacttggtggggaagatgctaaaataacctatttaacaaatggaatagaacaaagg
atgaatgggatatgtgcaggtggaacagggtcttttattgatcaaatggcaactctttta
aaaacagatgctcagggattaaatgaattagcaaaaggttataaaaatatatatagtata
gctgcaagatgtggagtatttgcaaaaacagatatacaaccccttataaatgaaggagct
agaaaagaagatatagcaatgagtatttttcatgcggtagtagttcaaacaattagcgtt
ttagcttgtggaagaaagattcaaggaaaggtagcctttttagggggaccattatacttc
ttatctcaactaagaaaagcttttattaatgttcttaagttagataaagatgatattgta
tttcctgaagatgcacaattatacatagctatgggtgccgcattatcatgtaaggagaaa
actgttactttaggtaatttaatagataatttaaaacatttaaaattaaaagaagttatg
gataacagtggacttagacctttatttaagacagagaaagaatatatagattttagaaat
agacatgataaagatattgttaaaactaaagaattattaaactatagtggaaattgtttt
ttaggtatagatgcggggtcaactactacaaaagtagcattagttgatgatgaaggtaat
ttattatattcagattatagaagcaatgaaggaagcccattagactcaacaatacatatt
ttaaacaatatatatgatatattacctaaaggggctaaaattgtaaattcagctgttaca
gggtatggagaagcattacttcaaaaagctttaaaaatagatgtgggagaaattgaaaca
atagcacactacaaaggagcaaagtttttttcacctaatgtagattttatattagatata
ggcggtcaagatatgaaatgccttaaaataaataatggagtaatagaaactatcatatta
aatgaggcttgttcttctggatgtgggtcttttttagaaacatttgcaaagtcgttacaa
ttagatattaaagatttttctaaaaaagctctatactctaaaaatccagtagatttaggt
tcaagatgtacggtatttatgaactcaagagtaaaacaagcacaaaaagaaggaaattca
gtaagtgatataagtgcagggctttcttattctgttataaaaaatgccttatacaaagtt
ataaaagtaaaatcaaaagaagatataggcaattttccagtagttcaaggaggaactttt
tacaacgatgctgtcttaagggtttttgaaattttaacagaacgagaagttgtaagacct
aatatagctggaataatgggagcttttggagcaagtattattgctaaagaaaaatataat
aaaaatcataaaacctctcttttagataaaaaaggtatcaattcaataaacttaaatata
actactgcaagatgtggtaaatgttctaataattgtttgttaactataaatagttttgga
aatggagaaaaatttatttcaggaaatagatgtgaaaaaggaataggactaaatagaaat
gaaaataagaatataaatctatttgagtataagtataaaagagtatttgattatgaaagc
ttagatataaataaagcaaagcgaaaggaaataggattacctagagttttaaatatgtat
gaagactatcctctatggcatacaatatttacaaatttaggatttaaagtcgtgctttct
agtgagtcttcaaaagagttatatgaaagtgggatggattcaattgcatcagagtcagtt
tgttatccagcaaaaatggtacatggacatataaatgatttaataaaaaaaggtataaaa
aatatattctatccatgtataagacatgaacacaaagaatttaaaaatgtagataatcat
tttaattgtccagttgttatgtcctattcagaggtaataaaaaataatataagtgaaata
aaagaaaataatatcaattttataaatccatttttaccaatgaatagcaaaaacgcctta
aagaaaaagctttatgaagagctaaataaaattaaagattatgataatgaattcatagaa
ataagtaaagatgaaataaataaaagtgttgaacttggatttaaagaatatgaaaaattc
aaagaggatataagaaataaaggagaactagctttaaactatattaaagaaaacaatctt
aagggaattatactagcaggtagaccatatcatattgatccagaaataaaccatggaata
ccggagatgataaattctttagatatggcagttctaacagaagatagtatatgtcattta
ggaaaattagatgaatctttaagagttgtagatcaatgggcatatcattcaagattatat
agagcagctaattttgtaagttctagagatgatttatctcttgttcagctaaattctttt
gggtgtggattagattcagttacaaccgatcaagtccaagaaattctaagtggagaaggg
aaaatttacacttgtataaaaattgatgaaggaaataatcttggagctgcgagaataaga
ttaagatctttaaaagcagcattacaggaaagggaaaataataatatacaaggaataaaa
gttaagaaaacatatacaaaaggaagtttaagtaaatcaataaaagaaaattatactatt
ttagtgccccaaatgtctccaatacactttgatttagttgaacatagtgtaagaagttgt
ggatataatatggttttactaaaagactatgaaggagccatagaagaaggattaaaatat
gtaaataatgatgcttgctatccagcaataattgttataggccagttaattaaagcactt
aaaagtgggaaatacgatttaaataaaactgctgtagctataactcaaacaggtggtgta
tgtagagctacaaattatataggatttttaagaaaaggattaagtgatgctggatatgga
aatattcctgttgtgtccttatcagtaaatggagatgaaaaaggaaatctatatagtgta
ttttctttaggattaataaatagagttataatggctgctatatatggagatttactaatg
aaagttttatataaagttagaccttatgaactagaaaagggaagtgcaaataaactttat
aaaaaatatatagaaatatgcaaaaagagtttagaaaaaggtaatttatctaaatttaaa
gaaaacatatataatatagttaaggattttgatgaactgcctataactgatgagaaaaag
cctaaagtgggattagtgggtgaaatattagtaaagtttcatccattagctaataacaat
atagtagatattttagaagaagagggtgcagaagctgttgtaccagagcttttaaatttc
ttcttaagttgtgcatttaatacttactataaggctgataactatctagataaaaaatat
aaaaaattaggtgggaaattagttataaattcaatagcaatgtatcaaaaacactatatg
aaagccttagaggagagtaaaagatttagtaaaccaaaatacattcaagatttaggagag
actgcatcaaaggttatatcacttggaaatcaagcaggagaagggtggcttttaactgct
gaaatgatggaacttatagaaagtgatgttaaaaatattatatgtatgcaaccttttgca
tgtttgccaaatcacataaccggaaaaggtgtaataaaagaattaaaaagagtttattca
aatactaatataattcctatagattatgatccaggagctagtgaagttaatcaattaaat
agaattaaattgatgttatcaacatcatttaaaaatttaaatagtgaatttgaagaggaa
attttagcaactagtacagtttag

DBGET integrated database retrieval system