Polyodon spathula (Mississippi paddlefish): 121323372
Help
Entry
121323372 CDS
T07273
Name
(RefSeq) multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
KO
K24333
multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
Organism
pspa
Polyodon spathula (Mississippi paddlefish)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pspa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
pspa04990
]
121323372
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
pspa04990
]
Laminin domain-containing proteins
Laminin EGF-like domain-containing proteins
121323372
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FXa_inhibition
EGF_laminin
EGF_CA
cEGF
hEGF
EGF_2
EGF_3
EGF
EGF_Teneurin
DSL
EGF_TEN
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121323372
NCBI-ProteinID:
XP_041120337
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(36289014..36375031)
Genome browser
AA seq
1604 aa
AA seq
DB search
MTLDVLLLCIISLSATELASSLELKPDMPNVCRAQELAMIGHRQPCVQAFTRMVKVWKQG
CTGQRWCVGYERRTGYYTAYRQVYSMERQTVYKCCPGWTQQEDEVGCLHSVCSAGTCFNG
GKCSDGGSQVCQCSKGFQGSHCQYDVNECTTENGGCQDQCCNTIGSYYCKCPSGQKLRED
GQSCEDDDECAVVNGGCQQTCVNTQGSFSCECDTGYRLHTDGLTCITVNSCSLNNGGCEH
ECVDIAEDHYKCQCHPNYQLKRDGKHCELRDPCTDRNGGCAHICTSEDGLAECECRPGYH
LSADGKGCEDTDECSSGTDMCAHRCVNMLGSFTCVCNPGFELGADGKQCYRIEMEIVNSC
ENNNGGCSHHCEHTTSGPLCSCNQGYHIDVERKSCIDTDECDLGEACCSQFCNNYPGGYE
CSCKAGFRLNIEGCGCDDVDECLTNNADCDHECVNMLGSFECSCQKGFRLDFDRKTCIPL
YDDDGLYEEEDELEVVRLPDLLFRRPPQLLHYPTALQSAYDEEEYEEDIRGEHTLLHKII
CLDNTFGNDCSLSCEDCKNGGVCNPERDGCDCPAGWSGIVCNETCPQGTFGKECNSICEC
QNGGTCDPVTGRCRCPSGINGQFCEHGCPKGFFGKSCDRKCNCPNNGYCHRLYGACQCDP
GLYGLFCHLTCPKWVFGAGCSEECQCEAANSLECDAKNGTCICKSGYHGDGCQKKCGPGF
HGAGCKMKCNCPFGVPCDHQTGECKRQCSPGFHGERCQLSCSPGKFGVNCLQTCDCGGAP
CDSRTGQCICPTGRTGPACEKACPEGLWGINCQFTCGMCANQAICNKETGNCDCPPGFVG
KSCEKACPSGYYGQGCLLLCNCNSKAQCDHVTGECVCPPGWTGHHCTRVCDAGRWGRLCA
NKCECDNSDGSCDPVTGLCLCEAGYTGKRCEQKCSENTYGLACKFSCQCENEATCDHVSG
ACNCSAGWTGTFCERPCPDGFYGLDCHQMCNCRNGARCNHITGACHCPPGWVGTKCNQAC
QKDRYGEDCSQICNCHNGATCDHVTGQCHCAAGWTEASCQQACPAGLYGVDCRQHCICRN
GGTCDPMTGQCTCPKGWTGVACELECEDGLFGAGCKQTCSCKNSGTCNRLTGECTCSPGW
TGNQCEIACADGYHGKHCEEKCMCDHGSTCHHVTGLCHCDQGWRGRRCDKPCLPGYYGDN
CALRCECLPGVSCNHVTGECGCPIGFTGNGCEETCPSGTYGQNCNQLCQCSAQNEQCHTA
TGKCTCLPGYYGNHCDLKCPAGTYGPYCSESCKCQNGGYCDSVTGTCECPPGFVGADCSK
SCPKDRFGKDCAQVCSCGKEGRCDSVTGRCTCPPGRIGQRCQQACPRGRYGQNCQHTCTC
QNDGICNQVDGMCTCGLGWTGSHCEKECPAGKYGANCQLNCLCQNNGTCDRFSGCCQCID
GYYGQACEHSCPPGFYGLFCTRTCDCKNDATCDPVTGQCICPAGYHGFQCEKGCERGRYG
ETCQQQCDCEGAGPCHPVTGKCFCPPGRSGDRCENECRSNQYGPGCSLSCQCASQAFCNT
QNGNCVCPFQWMGPTCAEGGPPKPTSNQDYTSQAHRTSRHFSQS
NT seq
4815 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacccttgatgttttattgctatgtataatctcattgagtgctacagaactagcgtca
tccttggaacttaaacctgacatgcctaacgtgtgtagagcgcaggagctggcgatgatc
gggcacagacagccatgtgtccaggccttcactcgcatggtcaaagtgtggaaacaaggc
tgcactggacagaggtggtgcgttgggtatgaaagaaggactgggtattacacagcttac
agacaggtatacagcatggagcgccaaacagtttacaagtgctgcccaggctggactcag
caggaagatgaagtgggctgtctgcactctgtgtgctctgctggtacttgtttcaatgga
gggaaatgttctgatggaggctcccaggtatgtcagtgttcaaaaggcttccaaggatcc
cactgtcagtatgacgttaatgaatgtaccactgagaatggaggttgtcaggaccagtgc
tgcaacaccattgggagctactattgcaagtgcccttcaggccagaaactcagggaggat
gggcagtcatgtgaggatgacgatgagtgtgctgttgtgaatggaggctgccagcagacc
tgcgtgaacactcaaggatccttctcctgtgaatgtgatacaggatacaggctgcacact
gatggtctcacttgtatcactgtgaactcctgctctttgaacaatggtggttgtgagcat
gagtgtgtagatattgctgaagatcattacaagtgccagtgtcatccaaactaccagtta
aaaagagatggcaaacactgtgaattgagagacccgtgcactgacaggaacggaggatgt
gctcacatctgtacaagtgaagatgggttagcggaatgtgaatgcaggcctgggtaccac
ctgtctgctgatggtaaaggttgtgaagacactgatgagtgcagttcagggactgacatg
tgcgctcatcgctgtgtcaacatgctgggatcctttacctgtgtctgtaacccaggattt
gagctgggtgctgatgggaaacagtgttaccggattgaaatggagattgtaaacagctgt
gaaaacaacaatggaggatgttctcatcattgtgaacataccaccagtgggcctctctgt
tcatgtaaccaaggttaccacatagatgtggagaggaagagttgcatagacactgatgag
tgtgatttgggagaggcctgctgcagtcagttctgtaataattacccaggaggctatgag
tgcagctgtaaggctggcttcagactcaacattgaaggctgtggctgtgacgatgtagat
gaatgtttgactaacaatgctgactgtgatcatgaatgtgtcaacatgctgggatcattc
gaatgctcctgtcaaaaagggtttaggctggattttgacagaaagacatgcattcccctg
tatgacgatgatggcctgtatgaagaggaagatgaattggaggtggtccggcttcctgac
ctcctgttccgaagacccccacagctccttcactaccccaccgctttacagtctgcctac
gatgaggaagagtacgaggaagatatcagaggagaacacactctcctgcacaaaattatc
tgtctggataacacctttgggaacgactgcagtttgagctgtgaggactgtaagaatggt
ggcgtgtgtaatcctgagagggatggatgtgactgcccagcaggatggtctggaattgtc
tgcaatgaaacatgtcctcagggaacttttgggaaggaatgcaacagtatctgtgagtgt
cagaatggaggcacctgtgacccggtgacagggagatgccgctgtccatctggaattaat
ggacagttctgtgaacacggttgccctaagggattctttgggaagagctgcgacagaaaa
tgtaactgcccgaacaatggctattgtcacagactgtatggagcgtgtcagtgcgaccca
ggcctttatgggctcttctgtcatttaacctgtccaaaatgggtctttggagctggatgc
tctgaagaatgccagtgcgaagcagcaaactctctggaatgcgatgctaaaaatggcacc
tgcatttgcaagtctggttaccatggcgacgggtgtcaaaaaaagtgtggaccagggttc
catggagctggctgtaagatgaaatgtaactgtcccttcggtgtgccctgtgaccatcag
actggagagtgcaagcgacagtgttctccagggttccatggagagagatgccagctttct
tgcagccctgggaagtttggtgttaactgcctccagacttgtgactgtggaggggcaccc
tgtgactcccggactggtcagtgcatctgtcctactggtagaactggcccagcctgtgag
aaagcctgcccggaaggtctgtggggtataaactgtcagttcacatgtgggatgtgtgca
aatcaagccatttgtaacaaagaaactggcaactgtgactgtcctccggggtttgttgga
aaatcctgtgaaaaagcttgccccagcgggtattatgggcaaggctgcctgcttctctgt
aactgtaacagcaaggcccagtgtgaccatgtgactggtgagtgtgtgtgcccaccggga
tggactggccatcactgtacgagggtctgtgatgccggtcgctggggcagactgtgtgct
aataagtgtgagtgtgataacagtgatggaagctgtgaccctgtgactggactttgtctg
tgtgaagcaggctacactggaaaacgctgtgagcaaaagtgttctgagaacacttatggt
cttgcctgcaagttcagctgtcagtgtgagaatgaagccacctgtgatcatgtcagtgga
gcctgtaactgttcagctgggtggactgggactttctgtgaaaggccgtgcccggatgga
ttttatggtcttgactgtcaccagatgtgtaactgcagaaatggtgcccgctgtaaccac
atcacaggggcatgccactgccctcctggctgggtgggaaccaagtgtaaccaggcatgc
caaaaggataggtacggcgaggactgcagccagatctgtaattgtcacaatggggcaaca
tgtgatcatgtgactggccagtgtcactgtgctgcgggatggacagaagcttcctgtcag
caggcttgccctgctggactctatggtgttgactgccgtcaacactgcatttgcagaaac
ggaggcacatgtgatccgatgactggccagtgcacttgtcctaaaggctggactggagtc
gcctgtgaactcgaatgtgaagatggcttatttggagcaggatgcaagcagacttgtagc
tgcaagaacagtggaacctgtaacagactcactggggaatgtacctgtagccctggttgg
actggcaatcaatgtgaaatagcttgcgctgatggttaccatggcaagcactgtgaggag
aagtgtatgtgtgatcatggctctacttgtcaccatgtgacaggattgtgtcattgtgac
caaggttggagagggaggaggtgtgataaaccttgtctgcccggttactacggtgataac
tgtgccctgcgctgtgaatgcctgcctggtgtgtcatgtaaccatgtgactggagaatgt
ggctgcccaataggatttactggaaatggctgtgaagaaacttgcccttcaggcacatat
ggacaaaactgtaaccagctgtgtcaatgctcggctcagaatgaacaatgtcacactgcc
actgggaaatgtacctgcctacctggttactacgggaaccattgtgacctcaagtgccca
gctggtacctacggcccatattgcagtgaaagctgtaaatgtcagaatggaggatactgt
gactcagtgacagggacctgtgaatgccctccggggttcgtcggagctgactgtagtaag
agctgcccaaaagatcgctttgggaaggactgtgcccaggtgtgttcttgtggtaaagaa
ggccggtgtgactcagtgacaggcagatgcacgtgtcctcctggccgaattggacaacgc
tgtcagcaagcttgccccagaggaaggtatgggcaaaattgccagcacacttgcacttgt
caaaatgatggcatctgtaaccaagtcgatgggatgtgtacttgtggactgggatggact
gggtctcattgcgaaaaagaatgccctgctggtaaatacggggcaaactgccagctgaat
tgcctgtgtcagaacaatgggacttgtgatcggttttcaggctgctgccaatgcattgat
ggttactatggacaagcctgtgaacacagctgccctcctggattttatggtctgttctgt
acacgcacatgcgattgtaaaaatgatgctacatgtgaccctgtgactggacagtgtatt
tgcccagcaggttatcatggattccagtgtgagaaagggtgcgagcgagggaggtatgga
gagacatgccagcagcaatgtgattgtgaaggagcagggccctgtcacccagtgactgga
aaatgcttttgccctcctggcagaagtggagaccggtgtgagaatgaatgtagaagtaat
caatatggacctgggtgctctctgtcttgccagtgtgcaagtcaagcattctgtaacact
caaaatggaaactgtgtctgtccttttcagtggatggggcccacgtgtgctgaaggagga
cccccaaaacccacttcaaaccaggactacacttcacaagcacatagaacctcaaggcat
ttttcacaatcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
