Pseudoalteromonas spongiae: PSPO_a0454
Help
Entry
PSPO_a0454 CDS
T05098
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pspo
Pseudoalteromonas spongiae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pspo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pspo02000
]
PSPO_a0454
Transporters [BR:
pspo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PSPO_a0454
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATC97669
LinkDB
All DBs
Position
I:439074..441209
Genome browser
AA seq
711 aa
AA seq
DB search
MYQRWDAKVKTSLKLVSAAILASISATSVANQEPDNIEVITVTGDFKKESIQTLSASVHV
LGEQDIAMRNAVHLDEMLNTAANVNYTSGASRGRFIQIRGIGLRSQFVDPINPSVGLLID
GINYSGLGGAALLFDTQQAEIYRGPQGTRFGADALAGMIHIDTSEATTDGRAKLQLGAGN
YNSYNLGIAAGGGIDDVVGMRASVYQNSSDGYVDNIYLNESTQDQDELVARFKAKTDFSD
VFVSELNLHYIDIENGYDAFTLDNSRKSVADQPGQDNQESYGVSWRNNFSGFDSFDINFN
VNALNADLLYSYDEDWVCNDPEEAELCSAGLHPWGYSSTDAYDRDRKDRSVELNVQSKEG
TWIGGVYYQSKDVDLTRVYTWQAQDFESNYQIDNIAVFGQLETRIDDRTVLITGVRAENY
QGDYFDNNGFSESVDDSMVGGKLALEHQVNQQAMIYTSLTSGYKVGGINGEALAKARDEG
VDQSFFETIKYFDPEYLWSGEFGVKGMSKDKRLVLRLAAFYMYRDNMQVKAYKEYKANEA
SEPVFVGYFDNAASGRNYGIEIDGRYQLTDRISLNGAVGYLRTRMDDFVNADGESKDGRE
QAQAPRYNYAFSARFDATDNLYVNLGIEGKDDYYFSDSHDSKAESVNLVNAKIGYSRNGW
EVSAWVRNMFNQDYATRGFEFGNDPRDFYETHTYVQFAEPRMAGVSFTYQY
NT seq
2136 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatcaaagatgggatgccaaagtgaaaaccagcttaaaactcgtttctgcagctatt
ctcgcgtcaatttcagcaaccagtgttgctaatcaagaaccagacaatattgaagttatt
actgttactggtgactttaaaaaagaaagtattcaaacgttaagcgcaagtgtgcatgta
cttggtgagcaagatattgcaatgcgtaatgccgtgcatttggatgaaatgttaaacacg
gctgctaacgttaattatacgtctggcgcatcgcgcggacgttttattcaaattcgtggt
atcggtttacgttcgcaatttgttgatccgattaatccatcagtagggttattaattgat
ggtattaattactctggtttaggcggagcagcgttgttgtttgatacacagcaagctgag
atttaccgtggtcctcagggaacgcgttttggcgcagacgctctggcaggcatgatccac
attgatacaagtgaagctacaacagatgggcgcgccaagttgcagctcggcgccggaaat
tacaattcctataacctaggtattgctgctggtggcggtattgatgatgttgttggtatg
cgtgctagcgtgtaccaaaatagctcagatggttatgttgataacatttacttaaatgag
tctacccaagatcaagatgaactggttgcacgctttaaagcaaaaacagatttcagcgat
gtgtttgtcagcgaattgaacttacattatatcgatattgaaaatggttatgatgccttt
accctcgataattcacgtaaatcagtagctgatcagccagggcaagataaccaagaaagt
tacggcgttagctggcgtaataatttttcaggttttgatagttttgatatcaatttcaat
gttaacgcgctcaatgctgatttattgtatagctacgatgaagattgggtatgtaatgac
ccagaagaagctgagttatgcagtgctggtcttcacccttggggctatagttcgaccgat
gcgtatgatcgagaccgtaaagaccgttccgttgaattaaacgtgcaaagcaaagaaggg
acttggattggcggcgtatattatcaaagcaaagacgttgacttaacacgcgtttataca
tggcaagcacaagactttgagtcaaattatcaaatagataatattgctgtatttggtcaa
ttagaaacacgcattgatgatcgtacggttttgattacgggcgtgcgtgcagaaaattac
caaggtgattattttgataacaatggtttttcagaatcagttgatgattcaatggtaggc
ggaaaacttgcacttgagcaccaagtaaaccagcaagcgatgatctataccagcctcaca
agtggttacaaagtggggggcattaatggtgaagcactagcaaaagctcgagatgaaggc
gtagatcaaagtttctttgaaaccattaaatattttgaccccgagtatttatggagtggc
gagtttggcgttaaaggcatgtctaaagataagcgacttgtacttcgtttagctgcgttt
tatatgtaccgcgataatatgcaagttaaagcgtacaaagaatacaaagcaaatgaggct
tcagaacctgtgtttgtgggctatttcgataacgcagctagtggccgtaactacggtatt
gaaatcgatggacgttatcaattaaccgaccgcattagtttaaacggtgcggtaggttat
ttacgtacgcgtatggatgactttgttaatgcagatggcgagagcaaagatggccgcgaa
caagcacaagcaccgcgctacaactatgccttctcggcgcgtttcgatgcaaccgataac
ctgtatgttaatttaggcattgaaggcaaagatgactactacttctcagatagtcacgac
tcaaaggctgaaagcgtaaatctggttaatgctaagattggttatagccgcaatggatgg
gaagtaagtgcttgggtacgtaatatgttcaatcaagattacgcaactcgaggttttgag
tttggtaatgacccacgagatttttacgagacgcacacttatgtgcaatttgctgagccg
cgtatggcaggtgtaagttttacctatcagtattaa
DBGET
integrated database retrieval system