Pseudoalteromonas spongiae: PSPO_a2998
Help
Entry
PSPO_a2998 CDS
T05098
Name
(GenBank) iron complex outermembrane recepter protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pspo
Pseudoalteromonas spongiae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pspo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pspo02000
]
PSPO_a2998
Transporters [BR:
pspo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PSPO_a2998
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATC99861
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2877462..2880629)
Genome browser
AA seq
1055 aa
AA seq
DB search
MKKLNLLALSVKSALFAGAITSFAGVAAEEEKNNAEDEEIEKVVVTGSRIRKAEFSNASP
IQVISGDLSREMGLFEAGEMLQSTNQAAGVQIDNTFGGYVLDNGPGAATIGFRGLGAERT
LVVINGRRMAPAGVGGAPTSPDLNLIPGVMIDRVENLFDGASTVYGSDAVAGVANVVLKS
DIEGFEVQGSYQAPQSGGGEQSNLSVMWGDTYDNGFITVGLEYADSKAQSYSETAFAKGC
EERIFESEEGDIITRFSGIGPTAGGEDTCDIFPLTNRVFVPAFWGSLYVTPGYTNTGIPN
LSETTVPSQYAGLFPEWVLADFNGDGIIDDLDGAIVDGNGDGLRDVDFQDPLYAFQQSDY
YKSGDYRSRNERLSFMVNGEHNFADDNDTTFYYEGLYAQRNSPVFSPGAQLFETVPASNP
YNPCGVNGEVDCFGVLGFGDAGPLDVDPIINIRGDRDRFEVDVAQYRLVTGVTGNLPGLE
SINLNNWYYDAYVSYSASKGTDVRNGFNEQRLLHSLNTSVLNADGTVTCGDGTDGCVPVN
LFADNIYQPGGGTLTDAEYNYLFDQRKIETKVNQLVVNGFLGGDLYTLPWNNETVSGIFG
AEYRRDEIESDPNAVAAQGLLWGYFSDQGADGSRSLREVFTEIDLPLVKGVTGVEEFTLT
VSGRISDESYYDPESTYSVKAVYRPVEWITLRGTQGTSFRAPNLRERFLNGTSGFLTVSD
PCVVPSDARISDPINPDAIPTYDAANDPRDDVTLARCVSDGLDPTSLGLDPTFTESTSTE
VISGGTTELSPETSLAKTYGFVIEQPFIEDVDITLSVTRFDIEVTNSIAEPSAFYSINQC
YGADGNAAFCSRISRDEGGQISLVDQSFINVGLLTSQGYDYNIYYNQDFVISEQNLGVTV
DLQATKMTEALYDVLGVVDDNVGEPDYPEWRGTARLMLSYDDFRFNWMARYISGGKEDDL
GEFEEDTTGCTGLFNSAGERLKCRPVGFTEDYWKHDVSVSWSSDEYLISAGVRNVFNEAP
PKVDPSGSFSNTNVPLGVGYDMYGRMPYINFSVNF
NT seq
3168 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaaaaattaaacttattagcacttagcgttaagtctgcgctatttgcaggtgcaata
accagctttgcaggtgttgccgcagaagaagaaaaaaataatgcggaagacgaggaaatt
gaaaaggttgtagtgactggctctcgaattcgtaaagctgaattttcgaacgcatcacca
attcaagtcattagcggcgacctttctcgagagatgggcttattcgaagctggtgaaatg
cttcaatcaaccaaccaagcagctggtgttcagattgataacacgtttggtggttatgta
ttagataacggaccaggagcggcgacaattggtttccgtggtttaggtgctgagcgtaca
cttgttgtcattaatggtcgtcgtatggctcctgcaggggttggaggcgcgcctacttca
ccagatctcaatttgattccaggcgtaatgattgatcgtgtagagaatttatttgatggc
gcttcaacggtttatggttctgacgcagtagctggcgtagcgaacgtagtattaaagtca
gatattgaaggttttgaagttcaaggttcttatcaagcgccgcaaagtggtggcggtgaa
caatcaaatctttctgttatgtggggtgacacttacgacaatggtttcattactgttggt
ctagaatacgctgattcaaaagcacaatcatactcagaaactgcttttgcaaaaggttgt
gaagagcgtatttttgaatctgaagaaggtgatatcattacacgatttagcggtattggt
cctacagctggtggtgaagatacctgtgatatttttccgctaacaaaccgtgttttcgtt
ccagctttctggggtagtctatatgtaactcctggatatactaacacaggcattccaaat
ttaagtgaaacgacagttccttcacaatatgctggtttattccctgagtgggttttagca
gacttcaatggcgatggtattattgacgaccttgacggcgctattgtagacggtaatgga
gatggtttgcgtgatgttgacttccaagatccattatatgcattccagcagtctgattat
tataagagtggtgattaccgcagccgcaatgaacgtctttcattcatggtaaatggtgag
cataactttgccgatgacaatgatacaactttttattacgaaggtttgtatgcgcaacgt
aactctccagtattcagtcctggtgctcagttatttgaaactgttccggcttcaaaccca
tataatccatgtggtgtaaatggtgaggtagattgttttggtgtactaggctttggtgat
gctggtccattagatgttgatcctattattaatattcgtggtgaccgtgatcgttttgaa
gttgatgttgcccaataccgattagtaacaggtgttacaggtaatttaccaggcctagag
tcgattaacttaaataattggtattatgatgcgtatgtttcttacagtgcatcaaaaggt
actgatgtccgtaatggttttaacgaacaacgactactacattcattgaacacgtctgtt
ctaaatgctgatggtactgtaacgtgtggtgatggcactgatggctgtgttccagttaac
ctgtttgcggataatatttatcaaccaggtggtggtacgttgacagacgcagaatacaat
tatctgttcgatcaacgtaaaattgaaacgaaagttaatcaattagttgttaatggattc
ttaggtggcgatctgtatactttgccttggaacaatgaaacagtatcaggtatttttggt
gctgaatatcgtcgtgacgagattgaatcagatcctaacgcagtagctgcacaaggcttg
ctatggggttatttctcagaccaaggtgcggatggctctcgtagtcttcgtgaagtattt
actgaaattgacctaccacttgttaaaggtgtaacaggtgttgaagagtttacattgact
gtatctggtcgtatttctgacgaaagctactatgacccagaaagtacatactctgtaaaa
gctgtttatcgtccggttgaatggattacgcttcgtggtactcaaggtacatcattccgc
gcacctaacttacgtgagcgtttcttaaacggtacttcaggcttcttgactgtgagtgac
ccgtgtgttgttccaagtgatgctcgtatctcagatccaatcaacccagatgcaattcca
acatatgatgcagctaatgacccgcgtgatgatgtaactctagctcgttgtgtttctgat
ggtttagatccaacttcattaggtttggatcctaccttcactgaatcaacaagtactgaa
gttatcagcggcggtacaacagagttgagccctgaaacgtcactagctaagacatatggc
tttgttattgagcagccatttattgaagacgtagatataacgctttctgtaactcgattc
gatattgaagtaactaatagtattgctgaaccatcagctttctatagcattaaccaatgt
tatggtgcagatggtaatgcagctttctgtagccgtattagtcgtgatgaaggcggtcaa
attagtctagttgaccaatcattcatcaacgtaggtttattaacgtctcaaggttatgac
tataatatttactataatcaagattttgttatttcagaacaaaacttgggtgtaacagtt
gaccttcaagcaaccaagatgactgaagccctgtacgatgtgttaggtgttgtcgatgat
aatgtgggtgaaccagattatcctgaatggcgtggtacagctcgtctaatgctttcttat
gacgacttccgctttaactggatggctcgttacatctcaggcggtaaagaagacgattta
ggagagtttgaggaagatacaaccggttgtacaggcttgtttaatagcgctggtgagcgc
cttaaatgtcgccctgtaggctttactgaagactattggaagcatgatgtatcagtttca
tggtcttctgatgaatatctaatctctgcgggtgttcgtaatgtatttaatgaagctcca
cctaaagttgatccaagtggttcattctctaatactaacgtacctctaggtgttggttat
gacatgtatggccgcatgccttatatcaacttctcagttaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
