Pseudoalteromonas spongiae: PSPO_b0067
Help
Entry
PSPO_b0067 CDS
T05098
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pspo
Pseudoalteromonas spongiae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_3
PAS
PAS_9
PAS_4
PAS_8
PAS_11
PAS_PdeA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATD00171
LinkDB
All DBs
Position
II:complement(59884..62013)
Genome browser
AA seq
709 aa
AA seq
DB search
MVRKLSKGFAFNTQAVLQHVPIGLFVAKPTGECMFANNALYRVLSLTNTDIVGSSYINAM
HPDDRQKAIKHWYACTAKGANFQFTFRSAAKTKNKLLSIHAEPLIENKVITAYIGIVEDV
TTINETERKLYLSQQRYELAAKGASAGVWDWDISNNEVFYSTKFTELLGFDNLAFGCDFA
SFTKQIHPDDIKQFKASLEVHLADPFEAFDIEVRMYSAKQQELWFHIVGEAMRDEKGNPY
RMVGSMSDITEKKQSQQVIWHQANFDALTQLPNRNMFTDRLNQEIAKSKRSGDKFALLFI
DLDHFKEVNDTMGHNAGDLLLVEVSERLKIILRETDTVARIGGDEFTALLCNIHNLADVE
NIASKLIQAIEMPFYINNESIFISASIGITLFPDHSEKMEELLRFADQAMYLSKEEGRKQ
YRHFNKTLQEKSEKAHLLTQELRLAVINQQLEVLYQPILSISDLKIHKAEALLRWHHPEL
GMVSPADFIPLAETSGMIIDIGNWVFQQAAEQVKKWQSNYDQHFQISVNRSPAQFQSSLS
KHDVIWLNTLLQLSLKHGICIEITEGLLLDDNEEIKETLKKFRSAGVAISLDDFGTGYAA
LSYLTKFELDFLKIDRAFVMNLESSAQNQALCEAIIVMAHKLGLKVIAEGVETQEQLFIL
EAAGCDYAQGYFVSKPISHLLFERELASQDPFAMQQKLKQNSFKKTSAI
NT seq
2130 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggtcaggaagttaagcaaaggttttgcatttaacacacaagcggtgctgcagcacgtc
ccgattggtttgtttgtcgccaagccaactggcgaatgcatgtttgcaaataatgcgctg
tatcgagtgttaagcttaaccaatactgatatcgtcggcagcagctacattaacgcaatg
cacccagatgatcggcaaaaagccattaaacactggtatgcctgtactgccaaaggtgct
aattttcaatttacattccgatctgctgcaaaaacaaaaaataagctgttatcgattcac
gctgaaccgctcattgaaaacaaagtaatcaccgcctatatcggcattgttgaagacgta
acaaccatcaatgaaacagagcgtaagctttatttaagccaacaacgttacgaattagct
gcaaaaggtgccagcgctggggtgtgggactgggatatttcaaataacgaagtattttac
tctactaaatttaccgagctacttggctttgacaatctagcgtttggttgtgattttgct
tcctttactaaacaaatccaccctgatgatattaaacagtttaaagcaagccttgaggtg
cacctagccgacccatttgaagcatttgatattgaagtgcgtatgtacagcgccaaacaa
caagagttatggttccatattgttggtgaagccatgcgcgatgaaaaaggcaatccgtat
cgcatggttggttcaatgtctgatatcactgagaaaaagcaatctcagcaagttatttgg
caccaagctaactttgatgcactcacccagttacctaaccgtaatatgtttaccgacagg
cttaaccaagaaatcgccaaaagtaagcgctcaggcgataaatttgcactgttatttatt
gatttagaccattttaaagaagttaacgataccatgggtcacaatgcgggcgacctattg
ttagttgaggtatctgagcgcctaaaaataattttacgcgaaaccgatacggtagcgcgc
attggtggcgatgagtttactgcgctgctgtgcaatattcacaacctagctgatgttgaa
aacattgcttcaaagttgattcaagcgattgagatgccgttctatattaataatgaatca
atatttatttcggccagtattggtattactttgtttcctgatcacagtgaaaaaatggaa
gagttactgcgttttgccgatcaagcaatgtatttatcgaaagaagaagggcgcaaacaa
taccgtcatttcaacaaaaccttgcaagaaaaatccgaaaaagcccatttactcacgcaa
gaactgcgtctggctgtcattaatcaacagctcgaagtgctctatcaacccattttatca
atctctgatttaaaaattcataaagcagaagcgctactgcgctggcatcatccagaactt
ggcatggtgagccctgctgactttattcctctcgctgaaacatcaggaatgattattgat
attggtaactgggtgtttcaacaggccgcagagcaagtaaaaaaatggcaatcaaactat
gatcaacacttccaaattagtgttaaccgctcccctgcgcaatttcaatcaagcttgagt
aagcacgatgttatttggcttaataccttactacaactgagtcttaagcacggtatttgt
atcgagattaccgaaggtttattacttgatgacaatgaagaaataaaagaaacacttaag
aagtttcgctcagcaggcgtcgcaatatctcttgatgactttggtactgggtacgccgcg
ctatcttaccttaccaagtttgaactcgactttttaaaaatcgatcgcgcctttgtcatg
aatcttgaaagttcggcacaaaaccaagcgctgtgtgaagcaattatcgtaatggcgcat
aaattgggtttaaaagtaatcgcggaaggtgttgaaacacaagaacagttattcatatta
gaggcagctggatgcgactatgctcaaggctactttgtctctaagccaattagccatcta
ttgtttgagcgtgaacttgccagccaagatccctttgcgatgcagcaaaagttaaagcaa
aattcatttaaaaaaacgtctgctatttag
DBGET
integrated database retrieval system