Pseudoalteromonas sp. PS1M3: PS1M3_05570
Help
Entry
PS1M3_05570 CDS
T11044
Name
(GenBank) hybrid sensor histidine kinase/response regulator
Organism
psps Pseudoalteromonas sp. PS1M3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
Response_reg
PAS_9
PAS
PAS_8
PAS_4
THF_DHG_CYH_C
Diguanyl_cycl_sensor
HATPase_c_3
FleQ
Polbeta
HATPase_c_2
PTS_IIB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBW90470
LinkDB
All DBs
Position
1:606105..608078
Genome browser
AA seq
657 aa
AA seq
DB search
MARKILIIDSSTIIAMRVKVLLELIGCNVELIHFSMLEMFTHAENYDLVVIAHGVPVAPI
KPLIDKLSHGRLLLLAPKTENTEQLTAFAGLNKIVPDATVVYPFFSNKEITSLLESLLEL
DSNHMMQLPTILLVDHIQNRLDNMKSNLIGAHIKTLTASSLNDALTIAKSNKIDILISDF
SLGEATGLQIFSKLKVSQPNARCLLFTSRPDQVSMIEAIRQGVEDVLIKPLNENILLQSV
HKLWQTELLKRRNAELVERLQETVDALIEKDSLLQVIYKHTPDAIMLFKRNGQIIEANDA
CLRLLDLPFSGLSGKSLFDFLDNDSIAGIKEKISTLNSNRQFSYDLRLPIKSGGTVPLFG
SFNEIDHHGEIALAVIFKNVTHLKQKEELLQEAKGLLEEEVKARTSQLEHAKNVAEAANL
SKSDFLANMSHELRTPMHSILSFARFGLDKLEAGDFAREKLLKYLSRIECSGDRLLSLLN
NLLDLSKLDVGKFPFNPRPHNLESIIKTSIDDVSGTAMEKQINIIFPAPDSPVIVQCDEE
QINQLLRNVLGNALKFSEPKSNITLKLASDGQFADIEVIDSGIGIPEDELDHIFTKFVQS
SKTNSGAGGTGLGLALCREFVSLHQGQISACNNTNGGATVHIKLPLEINLDEHLVDE
NT seq
1974 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctagaaaaatattaatcatagacagcagcaccatcatagcaatgagagtaaaagta
ctcttagagctcattgggtgtaatgttgagctgattcatttctctatgcttgagatgttt
actcacgccgaaaattacgatttagttgttatagctcacggcgtgccggttgcccctatt
aagccgctaattgataaactatctcatgggcgtttattattacttgcccctaaaaccgaa
aatacagagcagttaaccgcatttgctggcctaaataaaatagtacctgatgctacggtt
gtttatcctttcttctctaataaagagatcacctctcttttagagagcttgttagagcta
gactctaaccatatgatgcaactgcccactatattgttggtcgatcatatccaaaatcgc
cttgataatatgaagagcaatttaattggcgcacatattaaaacccttacggcaagcagc
ttaaatgacgcactcactattgcaaaaagtaataaaatcgatattttaattagcgatttt
agcctcggtgaagcgactggtcttcaaatattttcaaaattaaaagtgtcgcaaccaaat
gcacggtgcttgcttttcacttcccgccctgaccaagtttcaatgattgaagctattcgc
caaggtgttgaagacgtactgattaaaccgctcaatgaaaatattttactgcaatcagtg
cataagctttggcaaactgaattattaaaacgccgcaatgccgagttagttgagcgcctt
caagaaactgtcgatgcactaatagaaaaagacagcttgctacaagttatttataaacac
acccctgacgctatcatgctatttaaacgcaacggtcaaattattgaagcaaatgacgct
tgcttaagacttttagatctaccgtttagcgggctttctggtaaatcgttatttgatttt
ttagataacgattcgattgctggaatcaaagaaaaaatttcaacattaaacagcaatcgt
cagttcagttacgatttacgtctacccattaaaagcggtggcacagtgcctttgtttggc
tcttttaacgaaatagatcaccatggtgagattgcactggctgtaattttcaaaaatgta
actcacttaaaacaaaaagaagagctacttcaagaagctaaagggttactagaagaagag
gtcaaagcccgtacatcgcagttagagcatgctaaaaatgtagccgaagcggcaaattta
agtaaatcagacttcttagcaaatatgtcacatgagctgcgaacccccatgcactcaatt
ttaagttttgcacgctttggactcgataagctagaagctggcgactttgctagagaaaag
ttactaaaatacttatctcgtatcgagtgtagtggcgataggctgctatctttgttaaat
aaccttcttgatttatcaaagcttgatgtaggtaaatttccgtttaacccgcgccctcat
aatttagaaagcattattaaaacaagcattgacgatgtgtcgggcacggcgatggaaaaa
caaattaatattatttttcctgcgccagattcaccggtcattgtgcaatgcgatgaagag
caaataaatcagttgttgcgcaacgtattaggcaatgcattaaagtttagtgagcccaaa
agtaacatcacgcttaaattagcatcggatggccaatttgctgatattgaagtcattgat
agcggtataggtattcctgaagatgagcttgatcatattttcacaaagtttgtgcaaagc
agtaaaacaaacagtggtgcaggtggtacggggctaggtttagcactttgccgagaattt
gtatcgttgcatcaaggtcaaattagcgcgtgtaataataccaatggtggtgccacagta
catataaaattaccacttgaaataaatttagacgaacacctagtcgatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
