Pseudoalteromonas sp. PS1M3: PS1M3_06730
Help
Entry
PS1M3_06730 CDS
T11044
Name
(GenBank) GGDEF domain-containing protein
Organism
psps Pseudoalteromonas sp. PS1M3
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBW90586
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(738877..740760)
Genome browser
AA seq
627 aa
AA seq
DB search
MLKGRVKVSWLVAGFALFLVSLVVYIYYTYHTTRAEIMESVDARLLNAAASVKHILGDDY
LNTMNQNGQINFFDYEVKSRQLSEFAQALDVAYVYAMILKNNRVYFTASSYTQDDMNNGK
ITQYLDIYPEATDLNISAFYSTEPVFEVSADQWGHFKTIFIPFVDDKTGKTYLTGADITI
LDLNQKLSESVSKAAAMASFFFFIAILVAAIYVYLLKRSLATDSSTGFENHIALEYLLKK
SNSHHMQLAVVWVNEIEDINSFYGTEIGDKVMKNLLMHFKSRCSANCHLYRLATNKLVLL
SPKETPYEELSDLIETYNANTPLLTDPFIYITLCAGIATGNKSLLLENAHIAALQAKQGR
HTVINYSKALHDVKTQYQYNVEMAKEVHDAFDNNRIVPYFQPIIDTKTNQIVQYECLARM
VTASGEILKPDAFLNVVTRSRMDGLLTRTIFSQCISRFRKTNICWSLNITAQDMLDPSLN
EFITNELKRYPHPSNITLELIETQAIANYSEVKAFISMVKSKGVKVIIDDFGSGYSNISN
VLKLEVDGIKLDGGLIKQIIHDNDIYLFIEHIAAFANQLDLLLIAESVENAAIVNALEKA
NVTLMQGNHFAQPAPQFATPENADLIS
NT seq
1884 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaagggaagagtgaaagtgagctggttagtggctggttttgctttatttttagtc
agcttagtggtctatatttactacacctaccacacaacccgcgctgaaattatggaatct
gttgatgcgcgccttcttaatgccgcagccagtgttaagcatatactcggtgatgactac
ctaaataccatgaatcaaaacggtcaaattaatttttttgactatgaagtcaaaagcagg
caactttctgagtttgcacaagcgcttgatgtggcatatgtatatgcaatgatattaaaa
aacaaccgcgtatactttactgcatcaagctatacgcaagacgatatgaacaatggcaaa
ataacgcaatatttagatatatacccagaagcaactgatctcaacataagcgctttttac
tccactgagccggtatttgaagtgtcggccgatcaatggggacactttaaaactatattt
atcccttttgttgacgataaaactggtaaaacttaccttactggcgctgatataacgatt
cttgatcttaaccaaaagctaagcgaaagcgtctccaaagcagcagctatggcaagcttc
ttcttttttatagctatccttgttgccgctatttatgtttacttacttaagcgctcatta
gcaaccgactccagtactgggtttgaaaaccacattgcgttggagtacttacttaaaaaa
agtaacagtcatcatatgcagttagctgttgtctgggttaatgaaattgaagatataaat
agcttttacggcaccgaaattggcgataaagtaatgaaaaacttgcttatgcattttaag
agccgctgctctgccaactgtcatttataccgcttagccaccaataaattggtgctgcta
tcacctaaagaaacaccttatgaagagctgagcgatttaatcgaaacctataatgccaat
acgcctttattaactgatccatttatatacattacattgtgtgctggtattgcgacgggt
aataaatcgctattacttgaaaatgctcatattgctgcactacaagcaaagcaaggtagg
cacacagttattaattattctaaagcacttcacgatgttaaaactcaatatcaatataat
gtagaaatggccaaagaagtgcatgatgcatttgataacaaccgtattgtgccttacttt
cagccaataatagataccaaaacaaatcagatagttcagtacgaatgtttggcgcgaatg
gttactgcaagcggagaaattttaaaacccgatgcgtttttaaatgtagttactcgctcc
agaatggacgggttattaacccgcactatattttcacagtgcattagccgctttagaaaa
acaaacatttgttggagcttaaatataacagcgcaagacatgttagacccaagcttgaat
gaattcatcacaaacgagcttaagcgctatccgcacccaagcaatatcactttagagtta
atagaaacccaagcgattgcaaattattctgaagttaaagcatttatttctatggttaaa
agtaaaggcgttaaggtaataattgatgactttggtagcggttattcaaatatttcaaat
gtcctaaaacttgaagttgacggtattaagttagatggcggattgataaaacagataata
cacgataacgacatttacttgtttattgagcatatagcggcatttgctaaccaattagat
ttactgcttatagctgaatctgtcgaaaatgcagccattgtaaatgcgttagaaaaagca
aatgtgacgctcatgcagggtaaccattttgcccaacctgcgccacaatttgctacacca
gaaaatgctgacttaatcagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
