Pseudoalteromonas sp. SD03: ABZP26_10405
Help
Entry
ABZP26_10405 CDS
T11365
Name
(GenBank) aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme
Organism
pssd Pseudoalteromonas sp. SD03
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
OKR_DC_1
OKR_DC_1_C
Beta_elim_lyase
Cys_Met_Meta_PP
OKR_DC_1_N
Aminotran_5
Aminotran_1_2
DegT_DnrJ_EryC1
Pyridoxal_deC
Thioredoxin_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XDH86498
LinkDB
All DBs
Position
1:2240924..2242834
Genome browser
AA seq
636 aa
AA seq
DB search
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NT seq
1911 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system