KEGG   Pseudoalteromonas sp. SD03: ABZP26_18310
Entry
ABZP26_18310      CDS       T11365                                 
Symbol
tssM
Name
(GenBank) type VI secretion system membrane subunit TssM
Organism
pssd  Pseudoalteromonas sp. SD03
SSDB
Other DBs
NCBI-ProteinID: XDH89230
UniProt: A0AB39AVB4
LinkDB
Position
2:complement(422158..425667)
AA seq 1169 aa
MSFSQKFKKITYALTSRTAILIIGFLALSLLIWFGGPLIAVADYVPLAGVASRLLTILLV
LLVFSVTKIYRLMQQNKRDEKMADELIDNNDANSSEVNEEITTLKTRMNEAIDLLKDVKL
FKGKNIYQLPWYIMIGPPGAGKTTVIHNSGLDYPLKDKLGVDLVHGVGGTRNCDWWFTNK
AVLIDTAGRYTTQSSHAKHDSRAWEGFLGLLRKHRPLRPINGVMISMGISELMSQTKTER
NLHARAIKQRLQELQNQLGMTFPVYVIFSKVDLIEGFREFFAELTEEECEQVWGITFELD
LDKDTQVDAFNKEFHALISKLTEMLNRRLINERNEAIRAKIFEFPRQLRVLQGVGDDFLK
EIFTPNAYEELPMFRGVYLTSATQEGTPSSFLNDASAGKTDYINQSKSFFIKNVLESVIF
PEQNLASTNKHHDKQNKWLRVASISAACVALLGFSVSWYFSFAWNSNLIDATDEAITTYQ
ELDASSFDRNNLLVLNDRLNALRNLPATNPELINPEDASSVGFNKLTEIKESSTNAYKRS
LQTYLEPFVANTLIKEMEAHPEHLSYLYETLKCYLMLFKPEYFESEDIVVWFSAYLDRNL
PGDLNMQTRGELMNHISALLNEGITQTEIDNQAVRVARAELTKLPIAERAYQRLQADFLD
SSIPPFRLTDIISFESAQKFTFRNNGDLTRSIPGLYTFNGFHGIFNIEKGKMLGNLMASS
WVYGQEASGTYDISKAEIEKKLEQRYFQDYIYYWQSFLDDLSLNQYSSPAEGVNITDVLA
GSEAPIKNIINAVKKNVQLTKLPVSENQKVAGDVAANAAKVAMQTKANRIKRFLPDEAPK
FEIDLPGYQVEEAFEDIIDIDVQQLDNIQKNLRELNIYLTKLDRGDQLKYSIKDQISGKS
KPSFIRQLEYQSSDLPYPFNSWLLDISRDTSNITKNSANRHLNEIWKSKVLREYNAAIVG
RYPFAPQAEKEVSIKDFTRFFGPNGTIDNFFNSYVAPSVDMSSTPWKFEKDIGISNNTLK
MFEHAYKIQTAFFDRGSNTPRIEFGLRTFKLDKTVSSFMIEIDGQSMIYRHGPLKVTNFV
WPGASGQSKTRVVFTPPNGGRSINTTYQGEWSLYRMLDELSEKRSKTREDLELHFSLMGN
NAKVELLPSSIRHPFWNSSVEKFSCPTRL
NT seq 3510 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagtttctcacaaaaatttaaaaaaataacctacgcactaacatcacgaaccgctata
ttaattatcggctttttagccttatcattattaatttggtttggtggccctttaatcgca
gtggcagactatgtaccgcttgcaggtgtagcatcacgattattaactattttattggta
ttattagttttttcagtgaccaaaatttatcgtcttatgcagcaaaataagcgcgatgaa
aaaatggcagatgagttaattgataacaatgatgctaatagtagtgaagtaaacgaagaa
attactactcttaaaacgagaatgaatgaagctatagatctactaaaagatgtaaagcta
tttaaaggtaaaaatatataccagttaccttggtatattatgattggccctccgggtgca
ggtaaaacaacggttattcataactcaggcctcgattatccattaaaagataagctaggc
gttgacttagttcatggtgtaggcggtacgcgtaattgtgactggtggtttaccaataaa
gcggtattaattgataccgcagggcgttacacaacacaaagtagccacgcaaaacatgac
tcaagagcatgggaaggttttttagggttattaagaaagcatcgtccgttacgtcctatt
aatggcgtgatgatcagcatgggtatttctgagctaatgagccagaccaaaactgagcga
aacctacatgctcgtgctataaaacagcgtcttcaagaattacaaaaccaactagggatg
acatttcctgtttatgttattttttctaaagttgatttaattgaaggctttagagagttt
tttgctgagctaactgaagaagaatgtgagcaggtttggggaattacctttgaacttgat
ttagataaagatactcaggtagatgcgttcaataaagagttccatgctttaatttctaag
cttacagagatgttaaatcgtcggcttatcaatgagcgaaatgaagctattcgtgccaag
atttttgaattccctcgacagttacgggtattgcagggcgtaggtgatgactttttaaaa
gaaattttcacccccaatgcctatgaagaattacccatgttcagaggggtgtacttaacc
agtgcgacgcaagaagggacaccgtcaagctttttaaatgatgcgagcgcagggaaaaca
gattacataaatcaatctaaaagtttctttattaagaatgttttagaaagtgttattttt
cctgagcaaaacttagcaagcactaacaaacatcatgataagcaaaataaatggcttcgc
gttgcaagtatttcagctgcgtgtgttgctttattaggtttttcagtttcgtggtacttt
agttttgcatggaatagcaacttaatagacgccaccgatgaggcaattactacttaccaa
gagctcgatgcctcttcgtttgatagaaataatttattggtgttgaacgacagactaaat
gcactgagaaatctacctgctactaaccctgagctcattaaccctgaggatgcttcatca
gttggttttaataagttaaccgaaattaaagaatcttctactaatgcttacaagcgttct
ttacaaacgtatttagagccatttgttgctaatactttaattaaggaaatggaagcgcat
ccagaacacttaagctatttatatgaaacgctaaagtgttacttaatgttgtttaaacct
gaatactttgaaagtgaagatattgtggtgtggttcagtgcttatttagacagaaactta
cccggtgatttgaatatgcaaacgcgtggtgagttaatgaatcatatttcagctttactc
aatgagggaatcacgcaaaccgaaatagataaccaagctgtgcgagttgcacgtgcagag
ttaactaaactaccgattgcggaaagagcataccagcgtcttcaagctgattttcttgat
agtagtattccgcctttcagactaaccgatattattagctttgaaagtgcacaaaagttt
acttttcgtaataacggcgacttaacgcgaagcattccagggttatacacttttaatggt
tttcatggcatttttaatattgaaaaaggaaaaatgcttggtaacttaatggctagtagc
tgggtttacgggcaagaagcctcaggaacttacgatatttctaaagcggagatagagaag
aaactagagcagcgctatttccaagattatatttattattggcagtcatttttagatgac
ttgagtcttaatcaatacagctcacccgctgaaggcgtcaatattactgatgtattagca
ggctctgaagcgccgattaaaaatatcattaatgcggtgaaaaagaatgttcagcttact
aaactaccagtatctgaaaatcaaaaagtagccggtgatgtggcagccaatgctgctaaa
gtcgctatgcaaactaaagcaaatcgaattaagcgctttttacctgatgaagctccaaaa
tttgaaattgatctaccaggttaccaagtagaagaagcctttgaagatattattgatatt
gatgttcagcaacttgataatattcagaaaaatttaagagagttaaatatttatttaacc
aagcttgatagaggcgatcagcttaagtactccattaaagatcaaataagcggtaagagt
aaacctagctttattcgccaattagagtatcaaagcagcgacttaccttatccatttaat
agttggttactggatattagtagagatactagcaacataaccaaaaatagtgctaacagg
catctaaatgaaatttggaaaagtaaagttttacgcgagtataacgcggcgattgtgggc
cgttacccatttgctccgcaggctgaaaaagaagtcagcattaaagactttacccgcttc
tttggtcctaatggcaccatagacaactttttcaatagctacgtagccccgagtgtggac
atgagctcaaccccttggaagtttgaaaaagatattggtattagcaacaacacgttaaaa
atgttcgagcatgcttacaaaattcaaaccgcattttttgaccgtggtagtaatactcca
agaattgagtttggcttgcgtacctttaaattagacaaaacggtctcaagcttcatgatt
gaaattgatggccaatctatgatttatcgtcatggtccgcttaaggtgaccaattttgtt
tggcctggtgcaagtggtcaaagcaaaactcgagtggtgtttactccaccaaatggtggg
cgttcaattaacaccacctaccaaggtgagtggtcactatacagaatgttagatgaactg
agtgaaaagcgaagtaaaacgcgagaagacttagagctgcatttctcactaatgggtaac
aatgcaaaagtagaattattgccgagttcaatcaggcatcctttttggaatagcagtgta
gagaagttctcatgtccgacccgattgtag

DBGET integrated database retrieval system