Pedobacter steynii: BFS30_12455
Help
Entry
BFS30_12455 CDS
T04469
Name
(GenBank) SusC/RagA family protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
psty
Pedobacter steynii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psty00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psty02000
]
BFS30_12455
Transporters [BR:
psty02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BFS30_12455
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarboxypepD_reg
Big_1
SpaA
SdrD_B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOM77915
UniProt:
A0A1D7QGY7
LinkDB
All DBs
Position
2989080..2992058
Genome browser
AA seq
992 aa
AA seq
DB search
MKVFYLLKPCLLLLIILATLTVQAQTGSVTGTVLDETGLPLPGASVQIKSINKSATTDAS
GKYRLTGLSNGTFILTISYIGYTSISQNVNISGNVSADFSLKPDAQNLSEVVVIGYGTAQ
KKDLTGSIATVSAKDFQKGAITTPEQLIQGKVAGVNIVSNGGQPGVGSVIRIRGGASLNA
SNDPLIVIDGVPFSGNTISNAPNPLALVNPNDIETFTVLKDANATAIYGSRASNGVILIT
TKKGSSGAPVINFNTNNSYETIAKKVNILSADQIRDYVNQYGNKSYDENPAHTYKSLMGN
ANTDWQDEIYKNAFSTDNSLSLSGTFKGVPYRVSAGYLDKRGLLLTDKLERATGGFGISP
KLFGDHLKIDLNLKGSLTEARFANDAARGAALQFDPTQSIYADNQFGGYFEWIQGQVPNP
NAPRNPLALIRLRSNIGKTERSFGNARFDYAFHFLPELHANLNLGYDISKGYGTIRVPEY
AAQNASTKGFEKQSLDTQNNKVAEFYLNYKKDITSLRSNIDVTAGYGYYDNSTTNNNFSE
YRANGSLIKAPQFPFNVEREKLLSYYGRLIYTFADNYILSGTMRADGSSRFAEDHRWGYF
PSVGFTWRAIGEDFLKDSKVFSDLKLRLSYGETGNKDGIGNYNYMSKYFSNNNQGQYQLG
DKFYDYYTPAAYEPDLRWETTTTYNAGLDYGFLKGRIYGSVDVYYKKTKDLLSTVDISSG
TNFNNRLLTNVGNMDVRGIEANVNVSLIRSEDVNWDFGVNMAYNKREVTNLSLNPDPNFI
IDAGGITGGTGINIKYNAINQVPGSFYVRKQIYDEKGMPLEGVYADLDGNGVINDKDQYF
YKSPDPKIILGFNTAFSYKKWTLSTVLRANLGNYVYDNVSSNFGVRSNILSPSGLINNAN
ADIYNTNFTNNQYLSDYYVKNASFLKMDNAGLAFNAGRISKNGNTTLRVSANVQNVFVIT
NYKGLDPELSSGIDFNLYPRPRTYTLGLNVGF
NT seq
2979 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtattttacctgctaaagccttgtttattgttgctgattattcttgcaacattg
accgttcaggcgcaaaccggttcagtaaccggaacagttttagacgagaccggattgcca
cttcccggagcctctgtccagattaaaagtatcaacaagagtgcgactactgacgcaagt
ggaaagtatcgtttgacggggttatccaatggtacgtttatacttacgatcagttatatc
gggtatacttccattagccagaatgttaacatttcaggaaatgtgtcagctgatttttct
ttgaaacccgatgcacagaatttatcagaggttgtcgtgattggctatggtactgctcaa
aagaaagacctgaccgggtctattgcaacagtaagtgccaaagattttcaaaagggggcg
attactacaccggaacaactgattcaaggtaaagttgcaggagtaaacattgtttccaat
ggcggacaaccgggtgtgggaagtgtgatccgtattcgtggaggtgcatcacttaatgcg
agtaatgatcctttgattgttattgatggggtgccatttagtggaaataccattagcaat
gcaccaaatccgcttgcattggttaatccaaatgatattgaaacttttactgtattgaaa
gatgctaatgcgacggcaatttatggatcgagagcttcaaatggggtaatcctgattaca
acaaaaaagggaagttcgggagcacctgtaattaattttaacacgaacaactcttatgaa
acgattgccaagaaagtaaatatcctttcagcagatcagatccgtgattatgtaaatcaa
tatggaaataagagctacgatgaaaaccctgcacatacttacaaatctctgatgggaaat
gcaaatacagactggcaggatgagatctataaaaatgctttttctactgataatagtttg
agtctttcgggaacgtttaaaggagttccttatcgtgtatctgcaggatacctggataaa
agaggattgttattgaccgataagctggagcgtgcgaccggtggatttggaatctcgccg
aaattatttggagatcatttgaaaattgatctgaatcttaagggatctttaactgaagcg
cgttttgctaatgatgctgccagaggtgctgcattacagtttgatccaacacaaagtatc
tatgcagacaatcaatttggtggatattttgagtggattcaaggtcaggttcctaatcca
aatgctccgagaaatccattggcgttgattcgtttacgcagtaatattggaaagactgag
cggagttttggaaacgccaggtttgactacgcctttcatttcctaccggaattacatgcc
aacttaaatcttggatacgatatatctaaaggatacggtacgattcgggtacctgagtat
gcagcacagaatgcatctaccaaaggttttgaaaagcagtctctggatactcagaacaat
aaagttgctgaattttatttgaactataaaaaggacattacatcattgagaagtaacatt
gatgtaactgcaggttacggttattatgataattcgaccactaacaataatttttcagaa
tacagagcgaacggatcgttaattaaagctcctcagtttcctttcaatgtggaaagagaa
aagttgctttcttactatggtcgtttaatttacactttcgcagataattatattctttcc
ggaacgatgcgtgcagatggatcttcccgttttgctgaagatcatcgttggggatatttt
ccttctgtaggttttacctggagagcgatcggtgaggatttcctgaaagacagcaaggtt
ttttcagatctgaaactgaggttgagctatggtgaaacaggaaataaagatggaatagga
aattataactatatgtcaaaatacttctcaaataataatcagggacagtatcagctgggt
gataaattctatgattattatactcctgcggcttatgaacctgacctgagatgggaaact
acaacgacctataatgccggtttggattacggctttttaaaaggacgtatttatggaagc
gtggatgtgtattacaaaaagacaaaagacttattgtcaactgttgatatttcttccgga
acgaatttcaataaccgactacttactaacgtaggaaacatggatgtaagagggatcgag
gcaaacgtaaatgtttccctgatcaggtctgaagatgtgaattgggattttggagtgaat
atggcttataacaaaagggaagtaaccaacctttctctgaatcctgatccgaactttatc
attgatgccggaggaattacaggaggtactggaattaatattaaatacaatgccattaat
caggttccgggatctttttatgtcagaaagcagatctatgatgaaaaaggaatgccgctt
gaaggggtatatgcagatcttgacggaaatggggtgatcaatgataaagatcagtatttc
tataaatctcctgatccaaaaattattcttgggtttaatacggcatttagttacaaaaaa
tggactttaagtaccgtattaagagcgaatcttgggaactatgtgtacgataacgtttct
tcaaactttggggtaagaagtaatatacttagtccaagtggtttgattaacaatgcgaat
gcggatatctataataccaacttcaccaacaatcagtacctgagtgactattatgtgaaa
aacgcttctttcctgaagatggataacgcaggtctggctttcaatgcaggtagaatttct
aaaaatggaaatacaaccctcagggtatctgcgaatgttcagaatgtatttgtaatcacc
aattataaaggactggatccggagttaagttcaggtatagattttaacctttatccaaga
ccaagaacttatacacttggcttaaacgttggcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
