KEGG   Pedobacter steynii: BFS30_20190
Entry
BFS30_20190       CDS       T04469                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
psty  Pedobacter steynii
Pathway
psty02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:psty00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    BFS30_20190
SSDB
Motif
Pfam: Ig_7 DUF11 FlgD_ig
Other DBs
NCBI-ProteinID: AOM79281
UniProt: A0A1D7QKT2
LinkDB
Position
4858881..4864571
AA seq 1896 aa
MINIMLKMRSRIAPSLFKKLHFLFIFCLLINFSAAYAEGSKDLYPSGAKGNRAFLYCNTS
SDASESWPFKTPGTHYIYVKAGEVIAAGSSAQGYSNGIIRFIAPNGDIFTSTRGERTIGR
IKTRTEELAGAKIGSAGNPTGYTPFEMDVPAGGEGVWKVEFISPLGTGDSDTNVPDILAD
ASWTQPNSNNSLNRNLIAAWDVSVRKKTATEWLSGRLFANVLNLHLSANFLEERSYFAKH
YVLTKDGRAYRVQTNGSNGVGFTFFSNSNGFAKNSVPTYKSLNKSAYADILEYTHNPTSP
DQGTNVTHKIFYNKPNPDLPAKAFIAGSTGQETWLKNQAELPKISNLMVIGVEGTTGIAG
RNGAYIKFKSSAAGTYRITIPVLTPSGPADRVIIGLAKEGDNSVLWDGKDGNGAFLKEGT
LISKLKTKLLSAEVHFPYIDMEVNPLGLIIELTDNTTDYNLLDQSKDESVYSDRIYWDDS
DVTGAGVYDESSDPFYNAINGRSSKENGHKWGRYKPTGGSGNSGTGLNSFGNVKSMDTWA
YIQGSEEDTPVDLTIKVADLKIESIVPDVTTLLSNRQITYTIRVKNSGPSSVIGSIFAFK
APPGFEITGESYTVVSEVGVVRNIQKTAGDFNAVLDMNNDAVIEFKIIVKSSSSSLTYPL
AVEASILRPADVTDPDATNPILNPDPNHIQAPSDPHLECLNGTLNESCNNIKYNGVIVQE
LCAGAELTPVEFIAAAGGQVEIIGTLPAGLSTVFSSGNSVLKIIGTPQTSGVFTLGTLGN
ERERTTYLIRINPIPELVVPLDKVNACEGKNISVAVSSTTEGNTFQWQYFDNSTSAWTDF
VAGGSISGENTSTLNITSVPLSFSNTKLRVLATSSSGCVGTSSEITLIVNKLPDKAVVTP
SKPAFCVGFSVKLVSSVAHGNQWYKDNQILEGKTEQSYEASEEGEYYVIITNDQGCESEP
SAKRKVTVYPIPPTPVIKIEGGTSTCVGTPVKLTSDALTGNQWYKDNDIIEGEEGPTYWV
TETGKYRVMVTNENKCEKLSDEIYITVNPIPEKPTISASTSTEFCFGGSVLLTSSAATGN
QWYKDEELIEGATNPTYLADANGKYKVIVTLIGCSSPASLETEVKVNPIPEKPTITASTS
TEFCFGGSVLLTSSALNGNQWYKDEELIQGATNPTYLADASGKYKVIVTLIGCSSPASLE
TEVKVNPIPEKPTITASTSTEFCFGGSVLLTSSALNGNQWYKDEELIRGATNPTYLADAS
GKYKVIVTLVGCSSPASLETEVKVNPIPEKPTISASTSTEFCFGGSVLLTSSAAAGNQWY
KDEELIQGATNPTYLAEASGKYKVIVTLISCSSPASLDTEVKVNSIPEKPTITTSTSTEF
CFGGSVLLTSSAATGNQWYKNGSLIPGATNPTYLANISGKYKVIVTLNTCISPASLETEV
TVNPIPETPTITASTSTEFCFGGSVLLTSSSATGNQWYKDGNLIPGATNLIYLANVSGKY
KVIVTLNSCISPASLETEVTVNPIPEKPIITASTSTEFCFGGNVLLTSSAATGNQWYKDG
NLIPGATNPIYLANTSGKYKVIVTLVGCSSPASLETEVKVNPIPEKPTISASTSTEFCFG
GSVLLSSSALNGNQWYKDEELIQGATNPTYLADASGKYKVIVTLVGCSGPASLDTELKVN
PIPEKPTITASTSTEFCFGGSVLLTSSALNGNQWYKDEELIQGATNPTYLADASGKYKVI
VTLVGCSGPASLETEVKVNPIPEKPTITTSTSTEFCFGGSVLLTSSAATGNQWYKDEELI
QGATNPTYLADASGKYKVIVTLVGCSSPASLETEVKVNPIPEKPTITASTSTEFCFGGSV
LLTSSAATGNQWYKDEELIQGAINSTYLADASGNIK
NT seq 5691 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatcaacattatgctaaaaatgcgctcacgtattgctccatcattatttaagaaatta
cactttctgtttatattttgtttattgattaatttttctgccgcgtatgcggagggaagt
aaggatttatacccttcaggagcgaaaggaaacagggcttttctatattgtaatacgagc
tcagacgcttctgaatcctggcctttcaaaactcccggaacacattatatttacgttaaa
gcgggagaagtgattgcagccggatcgagtgcgcaggggtatagtaacggaattattcgt
tttattgctccaaatggtgatatttttacttcgaccagaggagagcgcactattggcaga
atcaaaacccggactgaggagctggctggtgctaaaattggaagtgccggaaatccaact
ggttatactccttttgaaatggatgtgcctgccggtggggaaggtgtttggaaagttgaa
tttatttctccattgggcaccggagacagtgatacgaatgttcctgatatattggcagat
gcttcctggactcaaccaaattccaataatagcttaaaccggaacttaattgcagcatgg
gatgtttcagtaaggaaaaagacggctacagaatggttatcaggaaggttgttcgccaac
gtcctgaacctgcatttaagcgcgaactttttagaagaacgttcttactttgctaagcat
tatgtgctgactaaagatgggcgggcttaccgcgtgcaaaccaatggaagtaatggagtt
ggttttacttttttttccaatagcaatggtttcgctaagaattctgtccctacctataaa
agtttaaataaatcggcttatgcggatattctggaatacacgcataatccaaccagtccg
gatcagggaacaaatgtaacccataaaatcttttataataaaccaaacccggacttacct
gcaaaggcctttatagctgggtcaacaggacaggagacctggttgaaaaatcaggccgaa
ttgccgaaaatcagcaatctgatggtaattggtgtagaaggaactaccggaatagcaggt
agaaatggggcatacattaagtttaagtccagcgcagcaggtacttatcggattaccata
cctgttttaaccccatccggccctgcagaccgggtcattattggtctggctaaagaggga
gataatagcgtgctttgggatggcaaggatggcaatggtgcatttttgaaggaaggtacg
ctgatcagtaagcttaaaaccaaattgctgtctgccgaagtgcatttcccatacattgat
atggaggtcaaccccttaggtttaattattgaacttacagacaatacgactgattataat
ttacttgatcagtctaaagatgagtctgtatacagcgaccggatttattgggatgattca
gatgtcacgggagcaggagtttatgacgaatcttccgacccattttacaatgcgattaat
ggacgctccagtaaagaaaatggtcataaatggggacgctacaagcctactggtggttca
ggtaattcaggtacaggcttaaacagttttggaaatgtcaagtccatggatacctgggcg
tatatacaaggaagtgaggaagataccccggtggacctgaccataaaggtcgccgatttg
aaaatagaaagtattgttccggatgtgaccacattactttcaaatcgtcaaatcacttat
accatcagggtaaaaaacagcggtcccagttctgtaatagggtccatttttgcctttaaa
gctcctcctggatttgaaatcacaggggaaagctatacggttgttagtgaggtaggggtg
gttcgtaatatccaaaagacggcaggtgattttaatgcggttctggatatgaataatgat
gctgtgattgaatttaaaatcatagttaaatccagcagctcatcattaacctatccattg
gcggtggaggcaagtattcttcgcccggcggatgtaaccgatccggatgctacaaaccca
attttaaatcccgatccaaatcatattcaggccccatcggaccctcatttggaatgcctt
aacgggactttaaatgagtcctgtaataacattaaatacaatggtgtcattgttcaggag
ctttgtgctggtgctgaacttacaccagttgagtttattgccgctgctggtgggcaggtt
gaaattattggaactcttcctgctggtttaagcacagttttcagttcgggcaatagtgtc
ctgaaaattataggtaccccgcagacttctggtgtttttacattgggtacattaggtaat
gaaagagaaaggaccacttatcttattcgtataaatcctattccggaactcgttgttccc
ctggataaagtaaatgcctgtgaaggaaaaaacatctctgttgccgtgagttccactaca
gaaggaaatacctttcaatggcaatattttgataacagtacttcagcatggactgatttt
gtagcaggtggtagcatttccggagagaatacatcaaccctaaatattacgagcgttcca
ttaagctttagtaatacaaaattaagggtgcttgcaacctcttcatctggttgtgttgga
acttcttccgaaatcaccttaatcgtaaataaattgcctgataaagcggttgttacaccg
tctaaaccggcattttgcgttggtttttcggtgaaactggtatcgagcgttgctcatgga
aaccagtggtataaagacaatcaaatcctggaaggaaaaacggagcagtcttatgaggcc
tcggaagaaggggagtactacgtgattatcaccaatgatcagggttgtgaaagcgaacca
tccgcaaaaagaaaagtcacggtttacccgataccaccaacccctgttattaaaattgaa
ggagggacttctacatgcgttggaacaccagtaaaattgacttcagatgcgctaacgggc
aatcaatggtataaggataatgatatcattgagggagaagaaggacctacctactgggtt
actgaaactggtaagtacagggtcatggtaactaatgaaaataaatgcgaaaagttatct
gacgagatttacataactgtaaatccgattccggaaaagccaactatcagcgccagtact
tctactgaattctgttttggcggtagcgtgctgctgacttcttctgcagctaccggcaac
cagtggtacaaagatgaagagctgatcgagggagccacgaacccaacttatcttgctgat
gcgaacggaaaatataaggtgattgtgacacttataggttgcagtagtcctgcatcttta
gaaacagaagtaaaggttaacccgattccggaaaaaccaaccatcactgccagcacctct
acggagttctgttttggcggtagtgtgttgttgacttcctcagctttgaatggaaatcaa
tggtacaaagatgaagagttgattcagggtgcaaccaatccgacataccttgctgatgcg
agcggaaaatataaggtgattgtgacacttataggttgcagtagtcctgcatctttagaa
acagaagtaaaggttaacccgattccggaaaaaccaaccatcactgccagcacctctacg
gagttctgttttggcggtagtgtgttgttgacttcctcagctttgaatggaaatcaatgg
tacaaagatgaagagttgattcggggcgcaaccaatccaacctatttagcagatgcgagt
ggaaagtataaagtgatcgttacccttgttggttgcagcagtcctgcatctttggaaacg
gaagtaaaagttaatccgattccagaaaaaccaactatcagcgccagtacttctacagag
ttttgttttggaggcagcgtgctgctgacttcttcagcagctgccggcaaccaatggtac
aaagatgaagagttgattcagggtgcgacaaacccaacttaccttgcagaagccagcgga
aaatataaagtaattgtgacccttattagttgtagcagtcctgcatctttagacacggaa
gtgaaggttaactcgatccctgaaaaaccaaccattacaactagcacttctacagaattc
tgttttggtggtagcgtgctattaacttcttcagcggctaccggcaaccagtggtataaa
aacgggagcctaattccaggtgcaacgaacccaacttaccttgccaatatcagcggaaaa
tataaggtaattgttacgctaaatacttgtattagtccagcctctttagaaacagaagta
accgttaacccaattccggaaactccaaccattactgccagcacttctacagagttctgt
tttggaggtagtgtgctattaacttcttcatcagccaccggcaatcagtggtacaaagac
gggaacttaattccaggtgcaacgaacctaatttaccttgcaaatgttagtggaaaatat
aaggtgattgttacactaaacagctgcattagtcccgcatctttagaaacagaagtaaca
gtaaacccgatccctgaaaaaccaatcattactgccagtacttctacagagttttgtttt
ggtggtaatgtgctgctgacttcttcagcggctaccggcaaccagtggtacaaagacggg
aacctaattccaggtgcaacgaacccaatttaccttgctaacaccagcggaaagtataaa
gtgatcgttacccttgttggttgcagcagtcctgcatctttggaaacggaagtaaaagtt
aatccgattccagaaaaaccaactatcagcgccagtacttctacagagttttgttttgga
ggcagcgtactgctgagttcttcagctttgaatggcaaccaatggtataaagatgaagag
ttgattcagggtgcaaccaatccaacttacctggctgatgcgagcggaaaatataaggtc
atcgttacccttgttggttgcagtggccctgcatccttagacacagaactaaaggttaat
ccgattcctgaaaaaccaactattactgccagtacttctacagagttttgttttggaggc
agcgtgctgctgacttcttcagctttgaatggcaaccaatggtataaagatgaagagttg
attcagggtgcaaccaatccaacttacctggctgatgcgagcggaaaatataaagtaatt
gtgacccttgttggttgcagtggccctgcatccttagaaacagaagtaaaggttaatccg
attcctgaaaaaccaaccattactaccagcacgtctacagagttctgttttggtggtagc
gtgttactgacttcttcggcagctaccggtaaccagtggtacaaagatgaagagttgatc
cagggtgcaaccaatccaacttacctggctgatgcgagcggaaaatataaagtaattgtt
acccttgttggttgtagcagtcctgcatctttggaaacggaagtaaaagtaaacccgatt
ccagaaaaaccaactatcacggccagcacttctacagaattctgttttggtggtagcgtg
ctgctgacttcttctgcagctaccggtaaccaatggtacaaagatgaagagttgattcag
ggagccatcaattcgacttacctggctgatgcgagtggaaatataaagtga

DBGET integrated database retrieval system