Pseudoliparis swirei (Mariana hadal snailfish): 130212936
Help
Entry
130212936 CDS
T09868
Name
(RefSeq) fibroin heavy chain-like
Organism
pswi
Pseudoliparis swirei (Mariana hadal snailfish)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
130212936
NCBI-ProteinID:
XP_056300238
LinkDB
All DBs
Position
3:7210137..7234534
Genome browser
AA seq
2203 aa
AA seq
DB search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NT seq
6612 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgagagggatggcggccacgtacctacatgggatctttctcttggctctgtggaaa
ccctcgctacaaggaggtgtttatatacctgctggtggaggagcaggaggcgctggagcc
ggcatagaagccggtgcaggaactggatatggccctggaggcactgggactggataccag
cccggtggaggcgctgggactggataccagcctgctggaggtgctgggactggtccggga
agctatggaccggtagcaactggagggggatatggtggtcaaggacaaggaggatttggc
ccgggagttgctgcacaaggaggagtcggaccgggaggtgccggacaaggaggatttggc
ccgggagttgctgcacaaggaggagtcggaccaggaggtgctggacaaggaagatttggc
ccgggaggtgctgcacaaggaggagtcggaccgggaggtgccggacaaggaggatttggc
ccaggaggtgccggacaaggacctggtggagctggtgctggaggctatggacctggacct
ggaggagctggtccaggaggctacggacctggagctggaggtgctggtcctggaggagct
ggtccaggaggctatggacctggaggagctggtcctggaggagctggtgctggaggctat
ggacctggacgagctggtcctgggggctatggacagggtggccgaggcacaggccttggg
gccgggggtttgggtggaggagggactggcagaggtcagggagctggaacaggaacagga
tacgtacccggaggtggctatggaggctacggaggcggtcaaggaccaggtgctggtcaa
tacccaggagctggtggagctggtcccaaacctcctaaaatgggttatggtcctggtggt
gctggcgctgggcctggtggtgccggatttggacctggtggtgccggatttgggcccggg
ggtgcaggggttggacctggtggtgccagatttggacctgatggtgccggatttgggccc
gggggtgcaggggttggacctggtggtaacggatttggacctggtggtaacggatttggg
cctggtggtgccggatttgggcctaatggtgcaggggctagagctggtggtgcaggggtt
gggcctggtggtgccggttttgggcctggtggtgcaggggctggacctggtggagccgga
tttgggcctggtggtactggatttggacctggtggtgccggagttgggcctggaggtgca
ggaggagttggccctgggggagccgctgtgccaggtgcagttccaatgctgccacagatg
ggcacagctggacaaggagctggaggaaggagcgggaaaaaagcatcaaatcaaattcca
ggagttggagtgcctggactctatcaaggtggatatgttccaggccaaggttttggaggc
cgcggtattctccctggagtggccaccggatctggagttgggcctcagactggggccgga
gtcctcggtcaggggggtgctggagcaagaggagcaggaggagcaggaggagcaggagga
gcaggcaatggtcgtggacagcagttacctggagtttttcgtggttaccctctcataatg
ccaaagacagggtcgggcaaatcaaagaatccggctaaaaacgcagctaaaaatggtggc
gctggagctggaggaggtgcacttggtcaaggaggtgctttggggcttgggaatggaaga
ctcccaggaggagcagcgggagccacacctggatttggacctggatttggaggtcttcag
ggtggtgctggtaccggtactgctggaggccttggaagaggaggaccaggtggaggagcc
gggggtaattttggcaatggagtagtgaatggtgggatgggtggacgctatggtcctggt
cctggcggtgcaggcactggtgcggctggaggaatcggcacgggagcgggacctgggtca
ggtcttggttatggtcccagtggtgctggcactggccctggacaagcaggtgtcgggcca
ggtagaaccggctacggtccaggtggaacaggaactggattaggaggagcaggaacagga
cctggagggtatgatgccaatgccaaagctcataaatacggcatgttaagtggagcactt
ggaggtctgggaacaaatactggagcagtcagacctggtggtgctggtactggttatgga
ccaggaagagtaggaccaggtggtaatggctatggaccaggtggtgctggcacaggctac
agaccaggaggagtaggaccaggcaacgctggtactggctacggaccaggaggagttgca
ccaggtggtgctggcacaggctacagaccaggaggagttgcaccaggtggtgctggcaca
ggctatggaccaggaggagttgcaccaggtggtgctggcacaggctatggaccaggtgga
gttgcaccaggtggtgctggcacaggctatggaccaggaggagttgcaccaggtggtgct
ggcacaggctacggaccaggaggagttggacgtggtggtgctggcacaggttatggacca
ggaggagttgcaccaggtggtgctggcacaggctacggaccaggaggagttgcaccaggt
ggtgctggcacaggctatggaccaggtggagttggaccaggtggtgctggcacaggctac
ggaccaggaggagttggacgtggtggtgctggcacaggttatggaccaggtggagttgga
ccaggcggtgctgggacaggctatggaccaggtggagttggacaaggcggcactggctat
ttacctggaggtcaggctggtgccaaggcccgcaaatatgggagtgcaggaacaggaaga
atcggatatggacctggtggatatgggcctggagctggaactgtgcctgggacaggttat
ggaccaggtggaggctatggtgcaggaccaggggctggatatggaacaggctatggagct
gggtcacaaccttctagatacggtcaagttggaaatggtgttggtggggtacttggaggt
ggagcaggacgagctggtggttatggaccaggaagctttggagcaggtcctgcaggtcaa
ggctacgctggatccaaagctgctaagtacgggcaaccagctggagtggtacctggggca
ggagcagggccggctcaagcagcacctattacagggacagtaccagcagcacccattaca
gggaccggaccagcagcacctgttacagggactggaccagcagcacctgttacagggacc
ggaccagcagcacctgttacagagactggaccagcagcacctggtacagggactggcact
gcaggacctgacactgtgaccggcactggtgtgccagtaaatggcacagacacaagcagt
ggtgcagggccaataggtggactcagtggaacaggacttggagccgctggaagcacacca
gccccagcaccagaaggtgatggtggggatggcattgggatagaggggtctggaagttct
ggaggagaagtaggtactggtgtagctggcaaagcagtgggtgtaggagatgatggaaat
ggcttggatggaacaggactccccatcattggaccaaagccaggactcaatgggacccaa
gttcaagcttctgctggtgatcttttaagtgggatactaccaggagccacacctatcaaa
cctccaggagttccccgaggggacacgccaggtgaaggagatggagaaggaggtcctgat
ggcgagactggtggcataggaggcacaggggggagtcctaccagtgcaggagcagcagga
ggtgtttcagggggcgtcacaggagtggcaagaggagacagtcccgctactggcactgaa
gttggagcacaagttgcagctggcgtagttggaggaacacccaaaccgtccacagcagga
gctggtgcacctgttggagcaggtggggtggcaggagcaggtcctggcatggcacctttc
gctggtgggcatggtggagcaggaacaggagccccgaaacctccaaaaagctatggggct
ggtggatatttaccaggtggaggcttacgttacccgactggagccggcgtaggacacgga
gcagggaaatccggcaaattatacgggtctcttggagcaggaggccggggtggggttggc
cctggtggttatggagctggtcctggtggttatggagctggtcctggtggctatggtgct
ggtccaggaggttacggggttggcccaagtggctacggtgccgggcctggtcaatatgga
gttggaaatggaggtttaggaggaggagccggtggtggacaggccggatatggtggtggt
gtagctcctggtggttcaagatatggcgcaggtccaggcctgggccccggcgccggtaaa
gccaataaacgttatggggcaggtgctggtggaactggtggctatgggactggaccagct
ggagttggtcctgctggggctggtggttatgggactggaccaactggagttggtcctgct
ggggctggtggctatgggactagaccagctggagttggtcctgctggggctggtggctat
gggactggaccagctggagttggtcctgctggggctggtgactatgggactagaccagct
ggagttggtcctgctggggctggtggttatgggactggaccagctggagttggtcctgct
ggggctggtggctatgggactagaccagctggagttggtcctgctggggctggtggttat
ggacctgctggcactggatatgggcccaacaatgccgggacaggactgggtggtgcaggg
accaggcaagctggttatggaccaggtggagttggcacaggaccaggcagccatgtagct
ggtggagcaggggtcaatcctggtgtttatggtgctgcaggtcaaggactgggtgcaaga
aaaccgtccaaaacaggggctggagttgtacctggtggaacaggtactggacctggccga
tatggacctgggggcgttggaccaggcggtgctggcacaggaggcttcggtccaggcggt
gctggcacaggaggctttggaccaggcggtgctgggacaggaggcttcggtccaggcggt
gctgggacaggaggctatagaccaggcggtgctgggacaggaggctttggaccaggcggt
gctgggacaggaggctttggaccaggcggtgctgggacaggaggctatggaccaggcggt
gctggcacaggaggcttcgggccaggcggtgctgggacaggaggctttggaccaggcggt
gctgggacaggaggcttcgggccaggcagtgctgggacaggaggtggttttggacaagcg
ggccaaggattaggaaaccgaaaatcagctaaatctggaggctttggaccaggcggtgct
gggacaggagcgggaggcttcggtccaggcggtgctggtacaggaggcttcggaccacgc
ggtgctggcacaggaggcttcggtccagccggtgctggcacaggaggctatggaccaggc
ggtgctggcacaggaggtgttggaccaggcggtgctgggacaggaggctatggaccaggc
ggtgctggtacaagagcgggaggctttggaccaggcggtgctgggacaggaggtggtttt
ggacaaggtggccaaggattaggaaaccgaaaaccagctcaatctggaggtttcggacaa
ggcggtgctgtgacaggagcgggtggttttggaccaggtggtgctggaacaggaggtttc
ggaccaggcggtgctgggacaggagcgggtggttttggaccaggtggtgctggaacagga
ggtttcagaccaggcggtgctgggacaggagcgggtggttttggaccaggtggtgctgga
acaggaggtttcggatcaggcggtgctgggacaggagcgggtggttttggaccaggaggt
gctgggacaggaggtttcgggccaggtggtgctaggacaggaactggttttggaccaggg
ggccaaggatttggaaaccgaaaactttctaaatctggttatgaaggagctagacgtgga
tcaggaggaggtggaacaggaagtgttcctgggggagctgttcccggtagctatggccca
ggagggtatggtccaactggaactggaacagcgccttttggctatgggcctggaggtgct
ggaactagaccaggaggtgttagacctggtggtgatggtggctatggacctagtggccaa
gctctaggaagagcaaatcctcctcaatcaggttacggcccgtcgttgggtggaaatggc
tatggaccaggtgctggaggaggagggcttcctagtggaggaacaggaggtgccactgga
ggctcagcagggggtgctgtccctggttacggtggaggggctggtggaaactatccagga
tatacgggagccggacaaaaatcccagtctcagatagctgccaaatatgcagccatgagg
gcgtttctgggagctgagggctacagaggcactggctgtcagggtaaacactgcggccga
aggaggaagtga
DBGET
integrated database retrieval system
