Pseudoliparis swirei (Mariana hadal snailfish): 130213120
Help
Entry
130213120 CDS
T09868
Symbol
zgc:172323
Name
(RefSeq) WAG22 antigen isoform X1
Organism
pswi
Pseudoliparis swirei (Mariana hadal snailfish)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Filament
Filament_head
Phage_GP20
TPR_MLP1_2
Gp-FAR-1
DUF7491
Phasin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130213120
NCBI-ProteinID:
XP_056300539
LinkDB
All DBs
Position
22:19475959..19482811
Genome browser
AA seq
1126 aa
AA seq
DB search
MIALCFAERLLSDAVSHYNSHALLLTSCWQISERQVGPDLEQRLDIPQQTRGNTVTPAAM
SRSPERISSYRRHFEDSSSSSYQVRVSSPSPTRKDTRHASAGYSCRAGASGMRMKSVGRR
TASAARRTRMAGAGVSAGAMVCVGPGGEVPMDLDVAAAENQEFLSTRTTERQEMVVLNDR
LAVYIDKVRSLEQQNKLLESEIEAYQNRFQSPSGLRLLYEEQLRELKKIADQMRVQRDIS
LAATKSTAALLEVIKIRYQEAVELRRKAELDIEIFRPDVDKATSSRIALEKKLEQMEVEI
EFLKRVHQQEIEELMNRIYSAHASAHSVFALPDLAAALKQIQTQYDDIAAKNLQEMDSWY
KNKFEDLTSKTTRHVDKVRSVREEIAGAKKDIQSKDRDLDAMKSKNDALEAKIRETQVKY
KKELEDLQAWIEALHLELKTTKTKIALHLREYQELLNVKMSLEIEITTYRKLIEGEDLRL
SDMMQTLSLTSCSMGAIGGGMSFSGGGRGGMGGGMGHEMMAGSGGVVGGMGIGAGMGGGM
AQGSGAGGMGVRMGAGGPDDKTTGRTGGADISGVHGLGAGVGGLGAGAGGVSMGGMGGMG
AEGMNGVGASADIRGLGTGAGGVGTGAGGMGTSAGRMGNGAGGIGTGAGGMGTGAGGMRS
GAGGVGNNDGGMAIGAGGVGNGAGGMRSGAGGMRSGAGGVGNDDGGMAIGAGGVDNGAGG
MDTGARGVGNGARGLSTGVGGVDTRAGGVGTGAGGVDTRAGGVGTGVGGVDTRAGGVGTG
GGGVDTRAGGVGTGGGGVDTRAGGVGTGGGGVDTRAGGVGTGGGGVDTRAGGVGTGAGGV
DTRAGGVGTGGGVVDTRAGGVGTGVGGVDTRAGGVGTGTGGVDTWAGGVGTGAGGVDTRA
GGVGTGAGGVDTRAGGVGTGAGGVDTRAGGVGTGAGGVDTRAGGVGTGAGGVDTWAGGVG
VDGNLGFKGEYGVGMGADGGTAGLGGMSGTGMGFSVGNGGVSGGTGDGNGRGRDGGKDRG
MGSHGMAGGIGGNRGAEDVGAGVALSGLGGMGKKGGGMGDNARAGMGCGPDGYDGNNEPY
TEQAVELTERRTVLIRTVKNEDQVLEIDHQEQTYIISGAADDSDEE
NT seq
3381 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgctctgtgttttgcagaaagactcctgtccgatgccgtcagccactataacagc
cacgctctgctcctcacaagctgctggcagatatctgagcgacaggtcgggcctgatttg
gagcagaggctcgacattccccagcaaaccagaggaaacacggtcactcccgccgccatg
agccgcagcccggagaggatctcgtcctaccgccgtcactttgaggacagcagcagctcg
tcctaccaggtcagggtgtccagcccatcccccaccaggaaagacacccgtcatgcctcc
gccggttactcctgcagagccggggccagcggcatgcgcatgaagtcagtgggtcggagg
accgcctcggctgcacgcaggactcgcatggcgggagcaggggtgagtgcgggcgccatg
gtctgtgttgggccgggtggagaagttcctatggatctggatgtggctgcagccgaaaac
caagaattcctcagcacccgcacaactgaaagacaggagatggtcgtcctcaacgacaga
ctggctgtatacattgacaaggttcgctctctcgagcagcagaataagcttctggaatct
gagatcgaggcctaccagaaccgcttccagagtccatcgggtctgcgcctcttgtatgag
gagcagctgagggagctgaaaaagatcgccgaccagatgagagttcagcgggacatttcc
ttggcggctacgaagtccacagctgctctactggaggtgatcaaaatcagataccaggag
gcagtggagctgaggaggaaagctgagttagacattgaaatcttccgtccagatgttgac
aaagccacctcctcgcgcatcgccttggagaagaagctggagcagatggaagttgaaatt
gaattcctcaaacgggtccatcaacaggaaattgaggagctgatgaatcggatctactcg
gctcacgcgtcggctcacagtgtgttcgccctccctgacctggcagctgcgttgaaacaa
atccaaacgcagtacgacgacatcgcagccaaaaatctccaggagatggattcatggtac
aaaaacaagtttgaagatctgaccagtaagacaacaaggcacgtggacaaggttcgaagc
gttagagaggaaatagcaggtgccaaaaaggacatccaaagcaaagaccgtgacttggat
gccatgaaaagcaagaatgatgctctggaggccaagatccgagagacacaagtaaagtac
aagaaggagctggaagacctgcaggcatggattgaggccctgcaccttgagctgaaaacc
acaaagactaaaattgcactgcacctgcgcgagtaccaggagcttctgaatgtcaagatg
tctcttgagattgagattacaacatacagaaaacttattgaaggagaggatctgcgactc
tctgacatgatgcaaaccctgtcccttaccagctgtagcatgggtgccattggtggtggg
atgagcttcagtggaggaggaagaggaggcatggggggtggaatgggtcacgagatgatg
gcaggtagtggtggtgttgttggagggatggggattggagcgggaatgggtgggggcatg
gctcaaggcagtggggctggaggaatgggtgtaagaatgggtgctggtggtccagatgac
aagactactggaaggacaggaggggcagacattagtggtgttcatggattgggagctggg
gttggaggtttaggagcaggtgctgggggtgtcagtatgggaggcatgggaggaatgggt
gccgaaggaatgaatggtgttggcgcaagtgctgacattagggggttgggcactggtgct
ggaggtgtgggcactggggctggaggaatgggcactagtgctggaagaatgggcaatggt
gctggaggaattggaactggtgctggaggaatgggcactggtgctggaggaatgcgcagt
ggtgctgggggtgtgggcaataatgatggaggtatggccattggtgctggaggtgtgggc
aatggtgctggaggaatgcgcagtggtgctggaggaatgcgcagtggtgctgggggtgtg
ggcaatgatgatggaggtatggccattggtgctggaggtgtggacaatggagctggagga
atggacactggtgccagaggtgtgggtaatggggccagaggtttaagcactggtgttggt
ggtgtggacactagggctggaggtgtaggcactggtgctggaggtgtggacactagggct
ggaggtgtaggcactggtgttggtggtgtggacacgagggctggaggtgtaggcactggt
ggtggaggtgtggacactagggctggaggtgtaggcactggtggtggaggtgtggacact
agggctggaggtgtaggcactggtggtggaggtgtggacactagggctggaggtgtaggc
actggtggtggaggtgtggacactagggctggaggtgtaggcactggtgctggaggtgtg
gacactagggctggaggtgtaggcactggtggtggagttgtggacactagggctggaggt
gtaggcactggtgttggtggtgtggacacgagggctggaggtgtaggcactggtactgga
ggtgtggacacgtgggctggaggtgtaggcactggtgctggaggtgtggacacgagggct
ggaggtgtaggcactggtgctggaggtgtggacacgagggctggaggtgtaggcactggt
gctggaggtgtggacacgagggctggaggtgtaggcactggtgctggaggtgtggacacg
agggctggaggtgtaggcactggtgctggaggtgtggacacgtgggctggaggtgtgggt
gttgatggaaatttgggattcaaaggtgaatatggtgttggaatgggtgctgatggtggc
actgcaggtttgggtggcatgagcggcactggcatggggttcagtgtaggaaatggcggt
gttagtggagggacgggtgatgggaatggcagaggcagagatggaggtaaagatcgtgga
atgggttctcatgggatggctggcggaatcggaggcaatagaggagctgaagatgtgggg
gcaggtgttgcactgtcaggccttggtggaatggggaagaaaggtggaggaatgggtgac
aatgccagggccggcatgggatgtggacccgatggttacgacggcaacaatgagccctac
acagagcaggctgtggagctgacggagaggaggactgtactcatcagaacggttaaaaat
gaagatcaggtgctggagatagaccaccaggaacagacctacattatctccggtgcagcc
gacgactccgacgaggaatga
DBGET
integrated database retrieval system
