Psychromonas sp. CNPT3: PCNPT3_06385
Help
Entry
PCNPT3_06385 CDS
T02515
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
psy
Psychromonas sp. CNPT3
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psy02000
]
PCNPT3_06385
Transporters [BR:
psy02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PCNPT3_06385
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Glyco_hydro_64
Ybfg_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGH81217
UniProt:
M4U7T2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1505682..1509635)
Genome browser
AA seq
1317 aa
AA seq
DB search
MISIMRCNLKMCKKITKCLLILLAGLSVILALLLLTHPGNKVIISVIESIEPRLSLPLTQ
GSVFFSPTFENISWQDDSTTLNIEKLNYVFGYSCLVQEICMQQVNIIGVNLHLPVNDSVP
VAQEETHEPMALLSLPIKIHLSNIHLKDINVTQGDFAFSFDDLALDVRAQKSNVYISSTL
RKVFVQLPKPTIIAPILLKAGKKKLVFTEVAPLIAKNQLTPIRLPFNLYLDPIAIFDLKV
VQEDKNIFNLQRFETQLSFIDTHLEVKALAFETPETSFDLQGKIDFNNNYPLALEIKGKV
KTIEMQNTHALLKGQKYQLNVSGDLSALKSKLLLTKKMRLELSSEVDLLTENMPYSLQLK
WTHLYWPLTDTPKFQSKFGKLESQGALNDYTLLFNADYQGQDIAPGKVQLKVQGDLKKLN
LESLTLKTLQGIARFSGDLSWSDKLYWQGDLNLDNLALKAFIKGDESIVSGSIKQTMQTQ
FYYDRAPNWSVSIPKLQLEGKYLQRDFSVDAKLSANKDTGANIETFNIINEKNKISIKGR
LGEKNNLSIKVDIQDMKNLLADAKGKINAKFKVTGSPSDIKIKAHLNARKLAYQQSKLQS
LRLDGEVTVADTMGLNLDLKAIGFVFEDQKIRSVRLHIKNTKIAKHDIKIKIKAPKFSSQ
AQLNIIQSAKNWSANLQKMTIKIVQAQQKINLVTPIHVQLKNKNIQLSEHCWQSTDAKNN
KMGRLCFQKIDAGESGEVQLSLDNIKLQALDPYLEPKARFFGALFAQSKILWYKNGPPKI
DVDMHLENASIKVEAKPGVYNKGLYAIDTFRLQLNSKNKKSPFLLQIDSPHLVNLMLKGS
LAHSQDKPKINATIALSMPNLSVFKTFIPDLEQLNGAIKADVNIQGALDFPNVQGLIVLQ
DTDITSSLLPIKLNALNTIIRLDNKKAEIQGSFKSSEKVAKKGLLSLPFKVLKKTFSVID
APFKRLGDKINKEKSQLAIRELPSGQAYFKGDLNWQHRFQGALHFYAHKLFFYDHKKINM
LLSPDIYLTFDKTLNVKGNVLLNRAKIRVKELPKGAVSASKDVVFVDEIDIKETDTLPLA
LNLEVDLGNDFHLIAMGLDSFIKGELLVKKEITSDLLVHGKLKFERGSYRSFGQQLELQD
SSILFQGPPESPYIDIEAIRDPQKTQDNVISGIRLNGSPDALTLTIFSKPEMAQQEALSY
LTRGKSINAGSDKGSNNQLAAWLIAFGASQSDSVMSDIGDTLGLKDLSLSTQGSGDQQSV
GISAEIAPGVEISYGIGVFESFSILALRYELFNRFYIEASSGLYQAIDAYYEFDWDP
NT seq
3954 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatatctattatgcgatgtaaccttaaaatgtgtaaaaaaataacaaaatgcttattg
atattactagcggggctgagcgttatattggctctgttattattaacgcatcccggtaat
aaagttatcatcagtgttatcgagtcgatagagccgaggctctcactgccattaacacaa
ggtagcgtgttcttttctcctacctttgaaaatatttcttggcaagatgattcgaccact
ctaaatattgaaaaactcaattatgtctttggttattcttgcttggtacaagaaatttgt
atgcagcaagttaatattattggggttaacttacatttaccggtcaatgatagtgtcccc
gtcgcgcaggaagaaacgcatgaacccatggccttgttgtctcttccgattaaaatacat
ttatctaatatccacttaaaagatattaatgtaacccaaggcgactttgctttttcattt
gacgatctcgctttagatgtacgcgctcaaaaaagtaatgtttatatcagtagcacatta
cgtaaggtatttgtgcaactaccaaagccaacgatcattgcacctatattgctcaaagca
ggcaaaaagaaattggtctttactgaggtcgccccgctgattgccaaaaaccaattaacc
cccattcgtttaccttttaacttatatcttgatcccattgctatttttgatcttaaggtg
gtccaagaagataaaaacatattcaatttgcagcgttttgagacgcagttaagttttatt
gatacgcatttagaggtgaaggctttagcctttgagacgcccgagacaagctttgactta
caaggtaaaattgattttaataataactatcctttagcgttagaaataaagggcaaggta
aaaacaatagagatgcaaaatacgcatgcgctattgaaagggcaaaagtatcaactcaac
gtgagtggcgatcttagtgcgctaaaaagcaaattgctcttaactaaaaagatgcgctta
gagttatcttctgaagttgatttgttaactgaaaatatgccttattctctgcaactaaaa
tggacacatttgtattggccattaacagacacacctaaatttcaatctaaatttggaaag
ctagagtcgcagggcgccctgaatgattatacgttattgtttaatgcggattatcaaggg
caggatattgcgcccggtaaagtgcaattaaaagtgcaaggtgatctcaaaaaattaaac
ttggaaagtttaacgcttaagacgctccaaggcattgcacgcttttcgggtgatttatct
tggtcggataaattgtattggcaaggtgatttaaacttagataacttagcattaaaagcc
tttattaaaggcgacgagagtattgtttctggctcgataaaacaaacaatgcaaacgcag
ttttattatgatcgcgcaccgaactggtctgtttctattcctaaactacagcttgaaggt
aaatatctacaacgtgatttttcagtagacgcaaaattatcggcgaataaggacactggc
gctaatattgaaacctttaatattattaatgaaaaaaataaaatctcgataaaaggccga
ctcggcgaaaaaaacaatttaagcattaaagtcgacatacaagacatgaaaaacttgttg
gcagacgcaaaaggcaaaataaacgctaagtttaaggtaactggctcgcctagcgacatt
aaaattaaagcgcaccttaacgcgcgtaaattggcctaccaacaatcaaaattacaaagt
ctaaggcttgatggtgaggtcactgtagcggacacgatgggattaaatttagatttaaag
gcgataggctttgtttttgaagatcaaaaaatcagatcggtgcgtttacacattaaaaac
acaaaaatcgcgaagcatgatattaagataaaaataaaggcgccaaaatttagctctcag
gcgcagttaaatatcattcaaagtgcaaaaaattggtctgctaatttacaaaaaatgacg
ataaagatagtgcaggcacaacaaaaaataaatttagtaacgcctatccatgtgcagctt
aaaaacaaaaatatacaactcagtgagcattgttggcaaagtaccgatgctaaaaataac
aagatgggccgtttatgctttcaaaaaatagatgcaggtgaaagtggagaggttcaactt
tcgttagataatatcaagttacaagcattggatccctatttagaacctaaagcgcgcttc
tttggggctctttttgcacaatcaaagatcctatggtataaaaacggcccccccaaaatt
gatgtcgacatgcatttagagaacgcttcgataaaagtagaagcaaagcctggtgtctat
aataaagggctttacgcgattgatacttttcgattgcaattaaactcaaaaaacaaaaaa
agtccttttttattacaaatagactcacctcatctagttaacttaatgttgaaaggtagc
ctagcgcactcccaagacaaacctaaaataaatgcgacgattgcgctttcaatgcctaat
ttatctgtctttaaaacgtttattcctgatctcgagcaattaaatggcgccattaaagca
gatgtaaatattcaaggtgcacttgatttcccgaatgtacagggccttatcgtattgcaa
gataccgatatcacatcgtctttactacctatcaagcttaatgcacttaataccattatt
cgtttagataataaaaaagcagaaatacaagggagctttaaaagcagtgaaaaagtagca
aaaaaaggcttgttaagtttaccttttaaagtgcttaaaaagacatttagcgtgattgat
gctccttttaaacgcttgggtgacaaaataaataaagagaagtcgcaactagctatccga
gagttaccttcgggacaagcctattttaagggggatttaaattggcaacatcgttttcaa
ggcgccttacatttttatgcgcataaattatttttttatgatcataaaaaaataaacatg
ttactcagtcctgatatttatttaacgtttgataaaacattaaatgttaaaggaaatgtt
ttactcaatagagcaaagatccgcgttaaagaattacctaagggtgccgtttctgcatct
aaagatgtggtgtttgtcgatgaaatagacattaaggaaacggatactttaccattagca
ttaaatttagaagtggatctaggtaatgattttcacctcatcgcaatggggttagatagt
tttattaaaggcgagttattagttaaaaaagagataacgagtgatctgttagtgcatgga
aaattaaaatttgagcgtggtagctatcgctcatttggtcaacaactcgagttgcaagac
agtagcatattatttcaagggccgcccgagtccccatatattgatatagaggctattcgt
gatcctcaaaaaacgcaagataatgtcatttcaggaatacgtttaaatggctctcccgat
gcattaacgttaaccattttttcaaaaccagaaatggcgcaacaagaagcattatcgtat
ttaacccgcggtaaatctataaatgcaggtagtgataaaggctcaaataatcaattagca
gcctggttaattgcatttggcgcctcacaatcagactctgtcatgagtgatatcggcgat
acgttaggattaaaagatctgtcgttgtctacgcagggcagtggtgatcaacaatctgtc
ggtattagcgctgaaattgcgccgggtgttgaaataagttatgggattggcgtttttgaa
agcttttcaatattagctttacgttatgagctgtttaatcgtttttatattgaagcgtct
agtggattatatcaagctatcgatgcttactatgaatttgattgggatccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
