Psychromonas sp. CNPT3: PCNPT3_09495
Help
Entry
PCNPT3_09495 CDS
T02515
Name
(GenBank) CzcA family heavy metal efflux pump
KO
K07787
copper/silver efflux system protein
Organism
psy
Psychromonas sp. CNPT3
Pathway
psy02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psy00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
PCNPT3_09495
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psy02000
]
PCNPT3_09495
Transporters [BR:
psy02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
PCNPT3_09495
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGH81837
LinkDB
All DBs
Position
complement(2232370..2235507)
Genome browser
AA seq
1045 aa
AA seq
DB search
MIAKIINWSIKNRILVLLCAVVIVAYGLFSLQKTAIDAIPDLSDVQVIIKTTYPGQSPQV
VEDQVTYPLTTAMLSVPGAKVVRGYSFLGDSYVYIIFEDGTDMYWARSRVLEYLSQVTTS
LPAQAKSALGPDATGVGWIFSYALVDKTGKHDLSELRSLQDWYLKYELQTVPGVSEVASV
GGMVKQYQVRVDPNKLRAYNLSLIQVKQAIKNGNQESGASVLELGEGEYMLRISGYVSSL
DDLKLIPLKMNVKGTPLLLRDVADIRLGPQMRRGITELNGEGEVVSGIIVMRFGENAQGV
IQALKAKLKELQKGLPKGVEIVPTYDRSELINAAVDNLYYKLLEEFIVVILVCAAFLFHF
RSALVVLVSLPIGIFCAFIIMSWQGISANIMSLGGIAIAIGAMVDGAIVMIENVHKHIEK
TPLTDENRWQVISKAAIEVGPALFFSLLIITFSFLPVFALEGQSGKMFSPLAFTKTYAMA
ASAGLAITLIPVLMGYFIRGKVLPEHKNPLNRGVVALYKPVLTFSLKYPKSIIIFAFLLL
MVGFYPLNKIGSEFIPPLDEGDLMYMPSTYPGISIGKARQLLQQTNKLIKTVPEVKTVWG
KIGRADTATDPAPLTMIETVIQFNPQSTWRPGMTKDKLKKEFDALIQFPGVRNAWVMPIK
TRIDMLATGIKTPLGVKISGSNLAEIEKIGKQLERILTKVPGTSSVYAERVSAGRYIKVD
IDRTKAARYGLNIAEIQELIGIAIGGQNVGQSVEGLERYPINLRYINAYRDSLSALRNLP
IVTQKNITVSLQDIAKVYVQSGPAMIKTENARLNGWVFVDIENRDLGSYVQDAKARVDKE
LSLPAGYTLIWSGQYEYMQKANARLAKVIPVTVIIIILLLYMAFRRVGEVLLILATLPFA
LMGGIWLMFLLNFNFSIAVGVGFIALAGVSIEIGVIMLLYLNQSLEAKKLQRMDKFNVQD
LRDAVMQGAGLRVRPVMMTVATVVMGLVPIMFAQGAGSEVMQRIAAPMIGGMLSAITLTL
LILPSVYFQWKKRAIIKANKKMINK
NT seq
3138 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgctaaaataataaattggtcgataaaaaataggatcttagttctcttatgcgcc
gttgttattgtcgcttacggactttttagtttacaaaaaacagcaatagatgcgatcccc
gacttgtctgatgtgcaagtgatcattaaaacaacctatccgggtcaatctccacaagtt
gttgaagatcaagtgacttacccgttgacgacagccatgctgagcgttcccggtgccaaa
gtggtacgaggctattcttttttaggggactcttatgtgtatatcatatttgaagatggt
acggatatgtattgggcgcgatctcgcgttttagaatatttatcgcaagtcaccaccagt
ttgcctgcgcaggcaaaatctgctctgggccctgatgcaacgggtgtcggttggattttt
agttatgccttagtggataaaacgggtaagcatgatttaagtgaattacgcagtttacaa
gattggtatttgaaatatgaactgcaaacggtgccgggtgtatcagaggttgccagtgta
ggagggatggtaaagcaataccaagtacgcgttgatcctaataaattacgtgcctataac
ctgtctttaatacaagtaaagcaagcgattaaaaatggtaaccaagagtctggagccagt
gtattagagttaggtgaaggagaatatatgctgcgtatttcgggttatgtttcgtctctc
gatgatttgaaattgatcccgttaaaaatgaatgttaaaggcacacctttattgttgagg
gatgtcgctgatattcgcttaggaccgcaaatgcgccgtggtattactgagcttaatggt
gagggagaagtggtcagtggcattattgtcatgcgtttcggtgagaatgcgcagggcgtg
atccaagcgttaaaagcaaaattaaaagagttacaaaaaggtttgccaaaaggcgttgaa
attgtacccacgtatgatcgctctgaactaattaatgctgccgttgataatttatattat
aaattattagaagaatttattgtggttattttagtgtgtgctgcttttttattccatttt
agatcggctttggtggtgttagttagtttacccattgggattttttgtgcctttatcatt
atgtcatggcaagggatcagcgccaatattatgtcattagggggaattgcaatcgcgatt
ggcgcaatggtcgatggcgcgatagtaatgattgaaaatgtgcataagcatatagagaaa
acgcctctcaccgatgagaatcgttggcaagtaataagtaaggctgcgattgaagtgggt
cctgctttatttttctctttgcttattattacttttagttttttacccgtctttgcttta
gaggggcaatcggggaaaatgttttctcctctggcctttactaaaacttatgcgatggca
gcatccgcgggccttgctatcactcttatccccgttttaatgggatattttattcgcgga
aaagtattacctgagcataaaaacccattaaatagaggcgtagttgccttatataaaccg
gtacttacgtttagtttaaagtatccaaaatcgataattatttttgcttttttattatta
atggtcggattttatccactgaataaaattggcagtgagtttattcctcctcttgatgag
ggtgatttaatgtatatgccaagtacttatccagggatatccattggtaaagcaaggcaa
cttctacagcaaactaataagctcatcaaaacagtgccggaagtaaaaacagtttggggg
aaaattggacgggcagatactgctaccgatccggcgcctttaacgatgatagaaacagtg
atccaattcaatcctcaaagtacatggcgaccggggatgacaaaagataaattaaaaaaa
gagtttgatgcattaattcaatttccaggcgtaaggaatgcttgggtaatgccgataaaa
acgcgaattgatatgttggcgacaggcataaaaaccccattaggcgttaaaatttccgga
tctaatttggctgaaatagaaaaaatcggtaaacaattagagcggatattaacgaaagtg
ccgggcactagttctgtttatgctgagcgcgtgagtgcaggacgttatattaaagttgat
atcgatcgcacaaaagctgcgcgttatgggcttaatattgccgaaatacaggagctcatc
ggtatcgctattggcggtcaaaatgtgggacagagtgtggaaggtttagagcgttatccc
attaatttacgctatattaatgcttatcgagattcactgagtgcactaagaaacttaccc
atagtgacccagaaaaatataactgtcagtttacaagacattgctaaagtatatgtgcag
tcaggacctgcaatgataaaaacagaaaatgcacgccttaacggctgggtttttgtagat
attgaaaatcgagatttaggctcatatgtgcaagatgcgaaggcgcgggttgataaggaa
ttaagtttacctgcaggttatactttaatatggtctgggcaatatgagtacatgcaaaag
gccaatgcacggttagcgaaagttatcccggtgacggtgatcattattatcttgctgcta
tatatggcgtttcgccgtgtgggtgaagtgttattgattttagccaccttaccgtttgct
ttaatgggcggcatttggttaatgtttttacttaattttaatttctctattgcggtcggt
gttggttttatcgcgcttgctggggtatcaattgaaattggggtgatcatgctattgtat
ttaaaccagtcattagaggctaaaaaattacaacgtatggataagtttaatgtgcaagac
ctacgtgatgcggtaatgcaaggggcggggctgcgcgtgcgtcctgttatgatgaccgtt
gcgaccgtggtaatggggcttgttcctattatgttcgcacaaggggccggctctgaagtt
atgcaacgtattgcagcgccaatgataggcggaatgctgagcgcgataaccttaacctta
cttattttacccagtgtttatttccaatggaaaaaaagagccattattaaggcaaacaaa
aaaatgattaataagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
