Psychrobacter sp. AntiMn-1: AOT82_2403
Help
Entry
AOT82_2403 CDS
T04964
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K13735
adhesin/invasin
Organism
psya
Psychrobacter sp. AntiMn-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psya00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
AOT82_2403
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
MG4
bMG3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOY44782
UniProt:
A0A1D9D1Y3
LinkDB
All DBs
Position
2663966..2669602
Genome browser
AA seq
1878 aa
AA seq
DB search
MSYHLLPTSKLFQLTALTLSLALAGCGGGGTDTVAPEPDLGPEQPDENNGSDSGGEQTPE
VEPDFFLQKLSTSPTIIELSDEQAIFNVTVKAAEVGSGGAMIGKAVTLKVVNSETNGITI
EGQSTQVTDSNGNAVYTLKLNPQAVLDKEMLIANGFTLIATANKADGTAVAPQELKVSVS
REGSGDGTQVTESKLSVTQSLDTSSVSNNKLNPYGDTAVISVQLKNEKGALAPDVEVGLG
LAQIEGVSVDTASQMTDAKGVATFNLKIDSNLPAATRNKLLQGIVYAINIKENSGATKLI
SGKLPVALPVSDYDLKVSGNSTQLSAYGDTQQLTITASPKNTNVSTQINGAKATIKLNDA
FEGVSLANEQLVLDANGQATVALTISSALSADERQELAEKGISYTVVLTEPNRSTATVSS
SSVVIVPTAKYKINFNESSKKELSSSGGSAVISFRVNDSRGGVVEGQKVIASLPKILADA
GLLTLENNSEQTTNAKGEVSYTVRVPNNLTVSQKAQLEKAGSFVLSANITEASGVPSTAS
SESIRIGADIGQSDITLTAQSVPAIANILDEQFKLQILGKRKDGSAAVGRTVKLVINEGF
TTGITIQGNEQTTNSNGVAEFTVRISQNLTQAQRDQLIKTGIAYTAVLTDEDGTQSKIIQ
KVNVEQPATSIQFASITTPEISELGGSGNIGVRLTSKENTAQPVRDKTVTIQLGAKALEY
GVTVTQTTATTDFNGEAIFAVNVPKGLTAVQRADLKNTGINYQLTYAENNVSYNSEIQKV
KITTPSVSLNILNATNNIDNQAGYILNNVGSTAIIQAQLNNQSSGEQVANQTVKLVFDNP
QLASLLTVNGQLGSSNITASTNANGLVSFNVVVPNNLNDEQKEALSKQVLTATLTETLTG
KQQQVNVKVQSMTAAISLLGNSVSALNLNGGETQVEVIAKDNKGNVISGQKVFLALPASI
ASKGVTLATGGSQTTDDSGKAVFTLAVPNNLTEDQKTALGTSFIVALSAADSSGNIVTQT
STVRTNIPTGTTESLTVGANKVVDTKGDTFKVFVRVAKDDKSIAGRSVTLNVNDPIGTGV
TVSQGTAVTNSDGVATFDLTLENGANVNQATLESGIRLTATTTTAENVKLEQNYIVAVDT
STIESYQLIASSDKPTLTTGGDQTQASFIVTDNNGGILTGVPVQLSIENLESSGAALTTS
STVVSDSSGRVDVGVLLAANSINARLNHSVVINAKIVTPQYDIDGTVNMQVREQKSLSLS
AIGTTLTLTASEKNLKDNSTTSLSSTLTDGTGLAIANAKVELIDTDGNLIASDATATTDS
EGKASFTVNESDLSFDSNGNLRVFVRAVGERELTTQRSTSSIDLVKVSQAGISFIDIEDV
YDVNMAQNINIQIRTNSVAEANALIGKLLEVQTTIGTFANNDVISTQAITAANIQGNIIT
VPVVLNSALAGTAVLQATVLGEMNNGQLKYQTTVDTRFRATTPAKILFQAVRSVITPGSS
TELVATVKDKNDVPVEGQTVVFSRASDSSAGRLSAATAITDSKGQARVVYLANASSPING
VTLNARLLNDPNNIGSKSTTITVSKDAVYTTLTFANKISSDDIYYTVRGSISVMDGSGQA
VANKEVSIKSYAVEYAQGRVCLLDSSTSYQGANTVDGEGNISTPEPKTFSEKSAILLRSN
WITSEDSPEYNYILDNDDDVNNNGVLDTINPVAIIGGTFADDGYSFITDAEGRADFQVRY
PIRYSNWVKVRFDASTFLNGSENTQSLNYSLPYLDGDLDIVGDTLFSPWIADASPFGPGN
ATCVNSLSVNIDAEKDTTKVILSPYQPSYAVSINGVGPNTQSQGYNSYIVDFNQAFELGA
TLGIVSNGAGFTRTIKVE
NT seq
5637 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcatatcatttgctacctacttctaaattgtttcaactgacagcgctaaccttatca
ttggccttggcgggttgtggtggtgggggcacggatacggttgcgccagagcctgatttg
ggccctgagcagcctgacgaaaataatggtagtgatagtggcggtgagcagacaccagaa
gttgaacctgatttctttttacagaagcttagcacatcgcctactatcatcgagctatct
gatgagcaggctatttttaatgtaacagtaaaagctgctgaggtgggctcaggtggtgca
atgatcggcaaagcagttacattgaaagtagtgaattctgaaactaatggtatcactatt
gaaggtcaaagtactcaagtgactgatagcaatggtaatgctgtatatacactaaagctg
aatccgcaggcagtcttagataaagagatgttaattgcaaacggctttacattaatagct
actgctaataaagccgatggcacagctgttgcaccgcaggagttaaaagtttctgttagt
agagagggaagtggagatggtactcaggtcactgaaagtaaactgagtgttactcaaagt
cttgataccagctctgtctctaataataagctgaacccttatggcgacacagcagtaatc
agtgtgcagctgaaaaatgaaaaaggagcgctggctcctgatgttgaggttggtctcgga
ctcgctcagatagagggtgtctctgtcgatactgctagccaaatgactgatgccaaaggt
gttgctacttttaatcttaagatcgatagcaatttgcctgcagcgactcgtaataaactg
cttcaaggtatcgtatatgctatcaatatcaaagaaaatagtggggccactaagctcata
tctggcaagctccctgttgcattacctgtttcagactatgatttaaaagtttcaggaaat
tcaacgcagcttagcgcttatggtgatacacagcagcttactatcactgcctcacctaaa
aatacaaatgtgtcgactcaaattaatggtgcaaaggcaacaatcaagctaaatgatgcc
tttgaaggtgtcagcctagcaaatgaacagttagtattagatgccaatggtcaagcgaca
gtagcattaaccatatcatcggcgttgagtgccgatgaacgtcaagagcttgcagaaaag
ggtattagctacactgtcgtgctcacagaaccaaaccgttcgacagcaacagtaagctct
tctagcgtagttattgttccaactgcgaaatacaaaattaactttaacgaaagcagcaaa
aaagagctatcgagttcaggtggcagtgcagtgatcagcttccgtgtcaatgatagccgc
ggtggtgtagttgaagggcaaaaagtaatagcaagtttaccaaaaatcctagctgatgca
ggtctactaactctagagaacaactcagaacagacaaccaatgctaaaggtgaagttagc
tatacggtacgggtgcctaataacttgactgtgtcacaaaaagcccagcttgaaaaggca
ggtagttttgtattgtctgcaaatataacagaagcgtcgggagtaccaagtactgccagc
agtgaaagtatccgtataggggcagatatcggacaaagcgatattacattgactgcgcaa
agcgtacctgcaattgcgaatatactagatgagcagtttaagttgcaaattctaggtaag
cgtaaagatggcagcgctgctgtaggacgcacagtcaagcttgttattaacgaaggcttt
acgacaggtattaccattcaaggtaacgaacaaaccacaaatagcaatggcgtggcagag
tttaccgttcgtattagtcaaaacctaacccaagcacagcgtgatcaattaattaaaaca
ggtattgcctacactgcagtactgactgatgaagatggtactcagtccaaaattattcag
aaagtaaacgttgagcagccagcaaccagtatacagttcgcttctatcacaacgccagaa
attagtgagttgggcggtagcggtaatattggtgtgagattgacctctaaagagaatact
gctcagccggtcagagacaaaacagtcactatccagctaggtgcaaaagcactagagtac
ggtgttacagtcactcaaactacagcgactacagattttaatggtgaggcgatttttgct
gttaacgtacctaaaggtttaacagctgtacagcgagcggatttaaagaacactggtatc
aactatcagctaacgtatgctgaaaacaacgtttcttataattcagaaatacagaaagta
aaaatcactacgcctagcgttagtttaaatatcttgaacgccaccaataatattgataat
caagcaggatatatcctaaacaatgtgggtagtactgccattatccaagcacagctaaat
aatcagtcatctggcgagcaagtcgctaatcagacagtgaagttggtatttgataatcca
caattagcaagcctgctcacagtaaatggtcagcttgggtcatcaaatatcactgctagt
acaaatgctaatggtttggttagcttcaatgttgtagttccaaataacttgaatgatgag
caaaaagaagcgcttagcaagcaagtattgaccgccactttgacagagacattgactggc
aagcaacaacaagtcaatgtcaaagttcagtctatgacagcagccatctctttactgggt
aattcagtaagtgctttaaacctaaatggtggtgaaacacaggttgaagtgatagcaaaa
gataacaaaggcaatgtgattagcggacaaaaagtattcctcgcactgccagcctctatt
gcaagtaagggcgttacactggctacaggtggcagtcagactactgatgattcaggtaag
gctgtatttactctagcagtaccaaacaacttaaccgaagaccaaaagactgcattaggt
acaagttttattgtggcattatctgcagctgatagtagtgggaatattgtgacgcagacg
agtactgtccgtaccaatataccaacaggtacaactgaaagtctcactgttggcgcaaat
aaagttgttgacaccaaaggggataccttcaaagtattcgtacgcgttgctaaagacgac
aagagtattgcaggtcgttccgtcactctaaatgtcaacgaccctattggtacaggcgtg
acagtcagccaaggcacagccgtcactaacagcgatggtgtagcgacttttgatttgact
cttgaaaatggtgccaatgttaaccaagcgacgctagagtcaggtattcgattaactgcg
actactactacagctgaaaatgttaaattggagcaaaactacattgtagcagtggatacg
tctacaattgagagctaccagctaatcgcgtcatctgataagccaacattgactacaggt
ggcgaccagacccaagcttcattcatcgtaacagataataacggtgggattctcacaggt
gtgccagtacagttaagcatcgaaaacctagagtcaagcggagcagcattgaccacatcg
agcacagttgtaagcgatagtagtggtcgggttgatgtgggtgtattgttagcagctaat
agtatcaatgctcgccttaatcatagtgtagtgattaatgccaaaatcgtcacgccgcaa
tatgatatagatggtactgtcaatatgcaggtgcgtgaacaaaagtctctgagcttatct
gcaattggcacaacactcacccttacagcatctgaaaaaaatctcaaagataatagtaca
acctccctgtcttctactttaactgatgggacgggacttgcgattgcaaatgctaaagta
gagcttattgatactgacggcaaccttatcgctagtgatgcaaccgcgaccaccgattca
gagggtaaagctagctttacagttaacgaaagtgatttgagctttgatagcaatggtaac
ttacgtgtttttgtgagagcagtgggtgagcgagagctgaccacgcagcgtagtaccagt
agcattgatttggttaaggtgtcgcaagcgggtattagcttcatcgatattgaagatgtt
tacgatgttaatatggctcagaatattaatatacagattcgcactaactctgtagctgag
gcgaatgcacttattggtaagctcttagaagtacaaacaacgattggaacgtttgcgaac
aatgatgtcatctcgacccaagcgataacggctgccaatattcaaggtaatattattaca
gtcccagtcgtactgaactctgcacttgctggcacagcagtattgcaggcgacggtactt
ggtgagatgaataacggtcagctcaagtatcaaacaaccgtagacacgcgttttagagcc
actacaccagctaagatactgttccaagcggtaagatcagtgattacgccaggtagcagt
accgagcttgtagcaactgtcaaagataaaaatgatgtaccagtcgaaggccagacagtc
gtctttagccgtgcttctgattcttcagcaggacgattgtctgctgcaactgctatcact
gatagtaaaggtcaagcacgtgtagtgtatttggcaaatgctagctcaccgatcaatggt
gtgactctcaacgctcgactattgaatgaccctaacaatattggtagcaagtccactact
attaccgtgtcaaaagatgctgtttatacgacattgacgtttgctaataaaatatcttct
gacgacatctactacacagttcgtggctcgatatcggttatggatggctcaggacaggcc
gttgctaacaaagaggtatccatcaagtcttatgcagtggagtacgcacaaggtcgcgtg
tgtctgctagatagtagcacttcgtatcaaggggctaatacagtagatggagaaggtaac
atcagtacgccagaacctaaaacattctctgaaaaatctgccattttgttacggtctaac
tggattacgagtgaagacagtccagagtataattacatcttggataacgacgatgatgta
aataacaatggtgtactggataccattaacccagttgctattattggtggaacatttgct
gatgacggctattcttttatcactgacgcagaaggacgtgctgatttccaagttcgctat
cctatccgctattcaaactgggtaaaagtcagattcgatgcatcaaccttcttaaatggt
agtgaaaatacccaaagcctgaactattcgctaccatacttggatggtgacttggatatc
gttggtgataccttattcagcccttggatcgcagatgctagcccgtttggtccaggtaat
gcaacctgtgtgaatagcttgagcgtgaatatcgatgctgaaaaagatactacgaaagtg
atactttcaccatatcagccaagctatgcagtatcgattaatggtgtcggaccaaataca
caatcgcaaggttataacagttatattgtagacttcaatcaagcctttgaattaggggcc
acgttaggaatcgttagcaacggagcaggttttactagaactataaaggttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system