Psychrobacter sp. P11G5: AK825_03215
Help
Entry
AK825_03215 CDS
T04411
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
psyg
Psychrobacter sp. P11G5
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psyg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psyg02000
]
AK825_03215
Transporters [BR:
psyg02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AK825_03215
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_head
YadA_stalk
Collagen
ESPR
YadA_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMN66855
LinkDB
All DBs
Position
740190..743471
Genome browser
AA seq
1093 aa
AA seq
DB search
MLNHVYRVVFNRSTGCYTAVSEISKSGGKSSNGSGHIGTIGALPSATLGTLLRRSAIGIA
IAGVLGLTAMSSQAEVCWTDGPVAESSSAPLPDSIACGFLNKASGDRSTAIGFNNTSSGF
SSSAMGHKNEASNLYSSAVGNTNTASGESSSAMGAGNSALGNASSAIGSQNTVDKLGSSA
LGILNHVNNTYSTAVGSSNTVNGQMALGAGHNNIASGRFSSAIGYFNTSAGDYSLAIGSD
NSTAQERSTAVGSLNVASKLHSSAVGSENTASGDRSSAMGNQNTASNSFSNALGIGSQAT
GAGATAIGSGKANGMVARVGTTIQQAFTEATTQIETDTYGRRFKKDGSGVAIYEFVLTDY
ESLGLGATASGIRAVAIGGSSTASGNSSLALGTGNRALGNDSSAMGRANFASGVNSSASG
YLNQASGNNSSAVGYSNIASGYTSSALGGYSRATASGATAIGSGSTFAVAAVENATVQAE
FTAAAAPIETDARGHRFKADGSGGAIYEFAPTDYEALGIGATASGIRAVALGTNAVADKR
DSIALGSKSVTTVGAGVAGYSANGDTNPIWQSTLGAVSVGDTSNANSSQWQTRQITGVAA
GTSDTDAVNIAQLKKVETTGLSHFSSVATALGGGAQLNGMGVFQAPKYRINNADYSNVGA
AFNAVDGKLTDLQTQIDTIELTPGSKGDQGEKGETGSQGPAGQNGTDGLNGINGTDGADG
AQGPVGLQGQVGPQGSAGQDGTDGLNGLNGLNGLNGLNGTDGLNGTDGAKGDKGDSGISE
EARVELENKIEESKERFVSINTSGTKIEVDYNNEGATGNGSIAVGVNAKSAGQDSIAVGT
DSKVTGNQSLSVGVGNIVSGDKSGAIGDPSIIGGDSSYSLGNDNIIGDTSNNVSVIGSNI
KVGATSASIVDGNPVFTGVTDASNSVAIGESVNVQATDAVAIGANSSVTHSNAVALGANS
QSTADNTVSVGNANTQRRITNVAAGINPNDAVNVSQLNQNRAEAMGYTDRRINDLEGETH
SAVAGALAFGALRYPNVPGKVSVGLGGGTWEGETGYALGVGYTTSNGLFSISSAFGGSGS
QQGGNVGVSYTFD
NT seq
3282 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaccatgtctaccgcgttgtctttaatcgttctacaggttgctatacagccgtt
agtgaaatcagcaagtcaggtggaaaatccagcaatggttcaggtcacattggtacaata
ggtgcgttgccatccgcgaccttaggtacgttactacgtcgaagtgctataggtattgcc
attgctggagtgctgggactgacggcgatgagtagtcaggcagaagtgtgttggacagat
ggtcctgtagcagagagtagttcagctccattacctgattctatagcttgtggttttttg
aacaaagcatcaggcgaccgcagtactgcgataggctttaataatacatcttcaggtttt
tctagctcagcaatgggccataaaaacgaagcatcaaatctatatagctcagcggtaggc
aacactaatactgcttctggtgaaagcagctcagccatgggtgctggcaatagcgcctta
ggtaatgctagttcggctatagggtcgcaaaacactgttgataagttaggaagttcagca
ttgggcatactaaaccatgtgaacaatacttatagtacggcagtaggttctagtaataca
gtaaatgggcaaatggctttgggagcggggcataataacatagcttctggccgattcagt
tcagcaataggttacttcaatacctctgcaggtgattatagtttagcaataggtagtgac
aactcaactgctcaggagcgtagtacagcagtaggtagtctaaacgtagcctctaagctg
catagctcggcagtaggtagcgaaaatacagcctctggagatcgtagctcagccatgggt
aatcagaacacagcatcaaactcctttagcaacgcattaggtattggcagtcaagccaca
ggcgctggtgcaacggcgataggtagcggtaaagcaaatggtatggttgccagagttggc
actaccatccaacaagcctttacagaagcaaccacgcagattgaaacagacacttatggt
cgtcgatttaaaaaagacggttctggtgttgcaatctatgaatttgtacttacagactat
gaatctctaggattaggggctacagcaagtggtatccgagctgttgctattggtggaagc
agtacagcttcaggtaattcaagcttagcattgggtactggaaacagagctttaggtaat
gacagctcagcaatgggtcgtgccaacttcgcttcaggtgttaacagctcagcgtcaggc
taccttaaccaagcttctggtaacaacagctcagctgtaggttatagcaatatagcatca
ggctataccagctcagcactaggtggttatagtagagccactgctagtggggctactgca
ataggtagtggcagtacatttgcagtagctgctgttgaaaatgccactgtgcaagcagaa
tttacggctgcagctgcaccgattgagacagatgctcgaggccatagatttaaagcagat
ggctctggtggggcaatctatgaatttgcacccacagactatgaagcattaggtattggt
gctacggcaagtggcattcgagcagttgcgcttggtactaatgcagtggctgataagcgt
gatagcatcgctttgggtagtaaaagtgtcactaccgttggtgctggcgtggcaggttat
tcagctaatggcgataccaatcccatttggcaatctactcttggtgccgttagtgttggt
gatacgagcaatgctaactctagccaatggcagacccgtcaaattacaggcgttgctgca
ggtacatccgatactgacgctgtcaacattgctcagctaaagaaggtcgaaacaacaggt
ttgtctcatttcagtagtgtagcaactgctctaggtgggggtgcgcagcttaacggtatg
ggtgtatttcaagcacctaaatatcgaataaataatgcagactacagcaatgtgggtgca
gcgtttaatgcggttgacggtaagctgactgacttgcaaacacagatagatactattgaa
ttaacacccggatctaaaggtgatcagggtgagaagggagagactggttcacaaggccca
gcaggccaaaacggtactgatggtttaaatggtatcaacggtacagacggagctgatggt
gctcaaggtccagttggtctacaaggtcaagttggtccgcaaggctcggcaggtcaggac
ggtacagacggtttaaacggtttaaacggtttaaacggtttaaacggtttaaacggtact
gatggtttaaatggtactgatggtgctaagggagacaaaggtgattcaggtatcagcgaa
gaagctagagttgaattagaaaacaaaattgaagaaagcaaagagcgctttgtcagtatc
aacacttctggtactaagatagaagttgactacaataatgaaggagctacaggcaacggt
tcaatagcagttggtgtcaatgccaaatctgctggtcaggatagtattgcagttggtaca
gattctaaggtaacaggcaatcagtctcttagtgttggcgtaggtaatatcgtttcaggc
gacaagtcaggtgcaattggtgatccaagtattatcggtggcgatagcagttattcattg
ggcaacgacaatattattggcgatacttctaacaacgtttctgtaataggtagcaacata
aaagtaggtgcaacatctgctagtatcgtagatggcaatccagtcttcactggagtaact
gatgcttcaaactctgtcgctatcggtgagtcagtgaacgttcaagccacagacgcagta
gctatcggtgctaatagcagtgtaactcatagcaatgccgttgcattaggagcaaactca
caatcaacagcagacaatacggtatcggtaggcaatgcaaacactcaacgccgaatcacc
aatgtcgccgctggtatcaacccaaatgatgcggtgaatgtatctcagctcaaccaaaat
cgtgctgaagcaatgggctatacagacagaagaataaatgatctcgaaggagagactcat
tcagcagttgcaggtgcactcgcattcggtgctctacgttatcctaatgttcctggcaaa
gttagcgtaggtcttggtggaggcacgtgggaaggcgaaacaggatatgctctaggcgta
ggctacaccacatcaaacggacttttctctatcagtagtgctttcggtggtagcggcagt
caacaaggtggaaatgtcggagtaagctatacctttgattaa
DBGET
integrated database retrieval system