Psychrobacter sp. P11G5: AK825_11175
Help
Entry
AK825_11175 CDS
T04411
Name
(GenBank) diguanylate phosphodiesterase
KO
K21025
multidomain signaling protein FimX
Organism
psyg
Psychrobacter sp. P11G5
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMN68189
LinkDB
All DBs
Position
complement(2752583..2754667)
Genome browser
AA seq
694 aa
AA seq
DB search
MRTKSILNLLVIDEDQLYAERLVSLLSAYYDEVNLGFLDDKEELLKSLRHQWDVLVFGRA
YDLSFTDVVGIVQEQNLDLPIIGLMSDEMAGTGRNDDGLPAVIDGVMVKALLAEKEVQVV
MAICLQHANLRSLRQLNTLRYVLSEAEQRANILIKNSKSAVAYIDQGIHIFANDPYLQLF
NFESMDDIIGLPVIDFIAGKDNVKGFKEFLRQFDKGNREQVEFNFESKRMDGSTFEAKLQ
LAAATLDGEPVTQIIIQQNNNNSAEIAKRLAVAERQDSLTGLNNRRGFEERFEALHQSVL
EGKVRAGLLYIQLDNIGKISSSLGLQGVDATVQQVARMLEQTVADGHISRFSDTAFTVLV
EGLSSQALIELAESVRQHISDMLIEVDERTTNTTVSIGIVKMDANAAEPQILLERAIDAI
NHIRIETANHGNAYHLYDPSEHANSDDSALAEYLVSAITHNRFELFFQPIYDINQDRSDF
FEVYLRLPLADADNTVLTPDKFMTVAKTHHLREKIDRWILINACKQLNEVRKTHPEARIL
VQLTSASLIDKKLPSVASQLIKAVGGVSGALTLQFNEQDVANHLTIAKSQFAALSDISCQ
VGIHNFGTSAKSIEIAEFVQPDMTRLAREYVNEISKPDNLDAIKSLIVRTNELNIDVLMP
YIEEAATMSVSWSVGARYLQGYYLEMPNKTMNVV
NT seq
2085 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaccaaatctatcttaaatctgttggttatagacgaagatcagctgtacgctgag
cgtttagtcagtttattatctgcttattatgatgaggttaatctaggattcctagacgat
aaagaagagctgctaaagtcactgcgccaccagtgggatgttttagtgtttgggcgtgcc
tatgatttgagcttcactgatgtggtcggtattgtgcaggaacaaaaccttgatttgcct
ataattgggcttatgagtgatgagatggcaggcactggccgcaacgatgatggtttgcca
gcagtcattgatggggtgatggtaaaggcactgttagcagaaaaagaagtgcaagtggta
atggccatctgcctgcaacatgctaacttacgtagtctgcgacagctgaataccttgcgc
tatgtactctctgaagctgagcagcgtgccaatattttgattaagaactctaaaagtgcc
gttgcctacattgatcaagggatccatatctttgccaatgacccttatctacaattattc
aattttgaatcgatggatgatattatcggtttgccagtcattgattttatcgcaggaaaa
gacaatgttaaaggctttaaagagtttttacgtcagttcgataaaggtaatcgcgagcaa
gttgaattcaattttgaaagtaagcgtatggacggtagcacttttgaggccaagctacag
ttagcagcagctaccttggatggtgagccagttacccaaattatcattcagcaaaataac
aataacagtgctgagattgctaaacgtttagcagtagctgaacgccaagatagcctaaca
ggacttaataaccgtcgcggctttgaagagcgttttgaggctttacaccaatcagtgcta
gaaggtaaggtgagggcaggcttattatatatacagctagataatatcggcaaaatcagt
agtagcttaggtttgcaaggagtagatgccactgttcagcaagtggctcgtatgctggag
cagacagtagcagatggtcatattagccgctttagtgatacggcatttaccgttctagtt
gaaggtttatcgtctcaggcacttatcgagctcgctgagagtgttcgtcagcatatcagt
gatatgctcattgaagttgatgaacgcacgactaatacaacagtcagtattggtattgtc
aaaatggacgctaacgctgccgagccgcaaatattgctcgagcgtgctattgatgcgatt
aatcatattagaattgagactgcaaaccacggtaatgcttatcatctgtatgatccaagt
gagcatgcgaacagcgatgatagtgctttagccgagtacttagtaagtgccatcactcac
aaccgctttgagcttttcttccagccaatttatgatatcaatcaagatcgcagtgacttt
tttgaagtttatctgcgcctgccattagccgacgctgataatactgtgttgacacctgac
aaatttatgacagttgcaaaaacacaccatctgcgcgaaaaaatagaccgctggatattg
atcaatgcttgtaaacagttgaatgaggtgcgcaagactcaccccgaagcgcgcatctta
gtccagttgaccagtgcctcattgatagataaaaaactgcctagtgtggccagtcagcta
attaaagcagtgggcggcgtatcaggagccttgacactgcagtttaatgagcaagatgtg
gccaatcaccttacgattgccaaatctcagtttgcagctctgagcgatattagttgtcaa
gtaggtattcataactttggcacctcggcaaaatcaattgaaattgctgaattcgtgcag
cctgatatgacacgcttggctcgtgaatatgtcaatgagatcagtaaacctgataatttg
gatgccattaaatctctgattgttcgcactaatgagcttaatattgatgtgttgatgcct
tatattgaagaggccgctacgatgtcagtgtcatggagtgtcggtgcgcgttacttgcaa
ggctattatttagagatgccaaataaaacgatgaacgttgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system