Psychrosphaera ytuae: J1N51_10060
Help
Entry
J1N51_10060 CDS
T07123
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K16088
outer-membrane receptor for ferric coprogen and ferric-rhodotorulic acid
Organism
psym
Psychrosphaera ytuae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psym00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psym02000
]
J1N51_10060
Transporters [BR:
psym02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
J1N51_10060
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTH63086
UniProt:
A0A975DB73
LinkDB
All DBs
Position
2247517..2249634
Genome browser
AA seq
705 aa
AA seq
DB search
MQAFKINAVCAATIFAMSNSVYASETVDTDKIEKIEVKGSYIEGYGADDVNGASRLDLKM
VEIPQSVSVISSTQLKDFQLNDINSALDTATGVRVERIETDRTYYTARGFDITNFQVDGV
GLPLISGNNHADEDTAIYQRIEVIRGANGLMTGVGNPSATVNFIRKRPTAQQDIDLNITK
GSWNKTRVEADFSTPVTDNVAFRVVAVKQRNDSYLDRYSQDKTVAYGFLEVNLSKDTQLS
FSHTINDNDATGNNWGANPLFYTDGTATNYDVGTNTSANWAYWDVKRSNTVVEFTHFINN
NWDLRATYSRKETDEDSELFYVYGTPDKTTELGLMGYASEYDHNDDHNLFDVYAKGNFQL
FGRDHQVVVGLSHADMEYEDISLYDYSTPYGFPAVPALPTWDGNTPRPTFNDGLTGAEIE
TTQKAAYFTARLNLAEGLHTIVGGRFNDWDVQGQSYGVVQDRGDNVFIPYVGAVYQVTPT
VSAYASYTETFLSQTELDINDKVLDPITGESAEIGAKAELFEGRLIASVAYFDVKQTNVA
KLDPATAALGPDDQRYIGTDGISSTGYELELAGQIGDSTNISFGVTDFEVDGDETVKGYT
PDTLIKLAITHDVTAIEGLTLGANANFQSDISRIQGALPNGASIVTEQDAYTLVNLMASY
QINDKISVALNANNVTDEKYINSLYWAQGYYGAPSNYSATVSLSF
NT seq
2118 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagcttttaaaatcaatgcagtgtgtgctgcgacgatttttgcgatgtcaaattcg
gtatatgcatcagaaacagtcgatacagacaagattgaaaaaatcgaagttaaaggcagt
tatatcgaaggttatggtgcagatgacgtaaacggcgcgtcgcgattagacctcaaaatg
gtcgaaatcccgcagtcagtatcggtaattagctctacacagcttaaagatttccaatta
aatgatattaattcggcactcgataccgcaacgggtgtcagagttgaacgtatcgaaacc
gaccgtacttactacactgcgcgtggttttgatattactaactttcaggttgatggtgtt
ggcttgccattgatttcaggtaacaaccacgcggatgaagataccgctatttaccagcgt
atcgaagtaatccgtggcgcaaatggtttgatgactggggtaggtaacccttcagcaacg
gttaactttatccgtaagcgccctaccgctcagcaagacattgatttaaatatcactaaa
ggttcttggaacaaaactcgagtagaagcggatttctctaccccagtcactgataatgtt
gcgtttcgtgttgtagctgtaaaacagcgcaatgattcatatttggatcgctactcgcaa
gataaaacggtcgcatatggctttttagaggtaaacctttcaaaagatactcaattatct
tttagccacaccatcaatgacaatgacgcgactggcaataactggggcgcaaacccactg
ttttacacagatggtacggctacgaactatgatgtgggcacaaacacatcagccaattgg
gcgtattgggacgttaagcgtagcaatactgtcgtagagtttactcattttattaataat
aactgggatttacgtgcaacttactcacgtaaagagacagacgaagactcagagttgttt
tacgtatacggcactccagataaaacaactgagttgggtttaatgggttatgccagtgaa
tatgaccacaacgatgatcacaacttatttgacgtttatgccaaaggaaacttccagttg
ttcggtcgcgatcaccaagttgttgtcggtcttagtcatgctgatatggaatacgaagat
atttcgttatatgactactcaacgccttatggctttccagctgttcctgctttacctaca
tgggatggaaatacacctagaccaacttttaacgatgggctgactggtgcagaaatcgaa
actactcaaaaagcagcgtatttcacagctcgattaaacttagcggaaggtttgcacact
atcgttggtggtcgttttaacgattgggatgttcaaggtcaaagctatggggttgtccaa
gaccgcggtgataatgtattcattccttatgtaggtgcggtttatcaagtaacaccaact
gtatctgcatatgcgagctacacagaaaccttcttatcacagaccgaactcgacattaac
gataaagtactagacccaattactggtgagagtgctgaaatcggagcaaaagcagagtta
tttgaaggtcgtttgattgcttcagtagcgtacttcgatgttaaacaaaccaatgttgcc
aaattagaccctgcaactgctgcattaggcccagatgatcaacgttacattggtacagat
ggtatcagtagcacgggttatgagcttgaattagctggtcaaattggtgatagcacaaac
atcagttttggcgtgaccgactttgaagtggacggtgatgagactgtaaaaggttacacc
ccagacacattgattaaactagcgatcactcatgacgttactgccatcgaaggcttgacg
ttaggtgctaatgcaaactttcaaagtgacattagccgaatccaaggtgccttaccaaac
ggtgcaagtattgtcacagagcaagacgcttacacacttgttaatttgatggctagctat
caaatcaatgacaagatcagtgttgccctaaatgccaataatgtgacagatgaaaagtac
attaacagcttgtactgggcacaagggtattacggtgcaccatctaattactctgcaacg
gttagcctttctttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
