Psychroserpens sp. NJDZ02: E9099_01675
Help
Entry
E9099_01675 CDS
T05945
Name
(GenBank) LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
Organism
psyn
Psychroserpens sp. NJDZ02
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
ANF_receptor
LysM2_NFP
HTH_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCE40183
UniProt:
A0A4P7WSW0
LinkDB
All DBs
Position
complement(344348..346291)
Genome browser
AA seq
647 aa
AA seq
DB search
MRKLIYILSLVALFGCVSAKAQNYKTHKVQVGETIEQIATKYSVTKSQIYALNPDARKDI
KPDSVLIIPNDSVVPNRPSVSEVKALEGFKKHKVKRKETLYSLAKKYNVDQEDIKKHNPD
LYANNLRKGDKIKIPIYKVTKEVVEAEGVTTSYTVKPKEGKWRIAYQYGITVQELESLNP
DMEDVLQPGSVITVPNLKVEEVKDFDEKYSYHTVLKSEGFYRLKVKTGLTQEELEKLNPD
LLTTGLKEGMVLKIPYDANIRSINEGSGPLTIGEDLPSSDLTSRDLDSETKHIAIMLPFK
LNEINSESAYDTKKFITDDPYSSISLDFYSGVKIALDSLSTLGVNLKVDVYDTENRESQV
TSLLQSNAFDDVHAVIGPIMPKLFNIASASLKSKNIPLISPITKTINLSDNVFQSIPSED
LIEQALLNYFKADSTANFIIISDMKNKERATELKKTFPKAALVMSRKVKKTGADSYYILD
GDMVRVLKSGKNVVFLETANPGFISNVSSILNSKIKPNIEIVLTTSDKNKAFEDDEVRNT
HLSNLSFTYGSINKSFSEDDNNSFGKRYKALYSETPNKYAVRGFDLTMDVVLRLVTSEDL
YLSAIESPLTTYVENKFAYKKKLFGGYFNNTVYLVKYQDLKVVEVEK
NT seq
1944 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaattaatatatatcttaagtctagtcgcattgttcggctgtgtttccgcgaaa
gcgcagaactacaagacgcacaaagtacaagtaggagaaactatagagcagattgccact
aaatatagtgttacaaaatcacagatttatgctttaaatccagatgctagaaaggatatt
aaaccagattcggttttaataattccaaacgattcagttgttcctaatagaccttctgtt
tcagaagttaaagctttagaagggtttaaaaagcataaagtaaagcgtaaggaaacgctt
tatagtttagctaaaaagtataatgtagaccaagaggatattaaaaagcataatccagat
ttatacgctaataacttgcgtaagggcgataagattaaaattcctatttacaaagtgact
aaggaagtggtcgaggcagaaggagtaacaacgtcttacaccgttaaacctaaagaaggt
aaatggcgtatagcgtatcaatacggaattacggttcaggagttagaatctttaaatcct
gatatggaagacgttttacaaccaggatctgttattacagtgcctaatttaaaggttgaa
gaagttaaagattttgacgaaaaatatagctatcataccgttttaaaatcagaaggtttt
tatagattaaaagtaaaaacaggtttgactcaagaggagttagaaaagttaaatccagac
ttattaactacaggtttaaaggaaggtatggttttaaaaataccatatgatgctaatata
aggtccatcaacgaaggttctggacctttaactatcggagaggatttaccttcttcagat
ttgacctctcgtgatttggattcagaaactaagcatatagcaataatgctaccgtttaag
ttaaatgaaattaattcggaatctgcttatgatactaaaaagtttattacagatgatcct
tattccagtatatcgttagatttttattctggtgttaaaattgctttagatagcttatca
actttgggtgttaacttaaaagtagatgtatatgatacagaaaacagagaaagtcaggta
acctctttattgcagtcaaatgcttttgatgatgtacatgcggttataggacctataatg
ccaaaattatttaatatagcatcggcctctttaaaaagcaaaaacattcctttaatttct
ccaattacaaagacgattaatttaagtgataatgtgtttcaatcaataccatcagaagat
ttaatagaacaagcattacttaattattttaaagcagatagtaccgcaaattttattatc
atttctgatatgaaaaataaagagagagctacagagcttaaaaaaacatttcctaaagcc
gctttggtaatgtctaggaaagttaagaaaacaggggccgattcgtattatattttagat
ggtgatatggttcgtgtgttaaaatcaggtaaaaatgtagtgtttttagaaactgctaat
ccaggatttatatctaatgtctctagtattttaaattctaaaattaaaccaaatattgaa
attgttttaacaacttcagataaaaacaaggcatttgaggatgatgaggttagaaatacg
catttatctaatttaagttttacttacggatctattaataagtcatttagtgaggatgat
aataatagttttggtaaacgttacaaggcattgtatagtgaaacaccaaacaagtatgct
gttagaggatttgatttgacaatggatgtagtactaagattggtaacatcagaggattta
tatttgtcagcaatcgaatctccattaacgacttatgttgaaaataaatttgcttataaa
aagaaattgttcggaggatattttaataacactgtttatttagtgaagtatcaagacttg
aaggtagtcgaagtagaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
