Psychroserpens sp. NJDZ02: E9099_13640
Help
Entry
E9099_13640 CDS
T05945
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
psyn
Psychroserpens sp. NJDZ02
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
AAA_30
AAA_19
Viral_helicase1
SLFN-g3_helicase
UvrD-helicase
NAT10_TcmA_helicase
ResIII
AAA_16
TPR_DENND3
AAA_22
AAA
SRP54
AAA_28
PhoH
AAA_5
AAA_18
NPHP3_N
bpMoxR
RNA_helicase
Mg_chelatase
nSTAND3
Thioredoxin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCE42403
LinkDB
All DBs
Position
3101557..3104754
Genome browser
AA seq
1065 aa
AA seq
DB search
MRIQDIFKGKKEEINLRLKPSIKSESFTKNNNLSVKIKYSQNTYWLFLNEDRFEVEGLTS
KDNKELERIASSNSLNLLITSQGTKAEIKSKLLTDTINLPDGIEIGLTDIIIDDINKRHS
KKRKGKKHTDWLTNELIIEDGDEKQVLLDNAPNSGGFRIFGKSIVIDVKINEDNIYEIVR
IVNWKNSFNPTFLLKGEIEIKDISEAGKLRADTELKLNRINSNQRYINTWEKYQEKEKES
NIKEVESRGFLTITEIKRVSEGKYKLVFDKNENTNNWLEIETGTYVDLNSNQELPNFNSY
EDKNSAKTICKLISKESNDLMVTSENEIPQTTTEIYYASLSLLGNVIMNSRRTRSLDAIR
NNTTPMPVLSAVLEGVDYNSVTRRKIKPLTSKVKREFGEFGPNEMQELALDVALNSPDIT
IIQGPPGTGKTKVISALATRLTEVYKDNGEAPEMNILLTAFQHDAVENMASRTEVLGLPA
IKFSKAQNQSVDVIEKWINKQSEKIEAVQIEIEPNEAELIYNDTISYYLTYIKTLDTEKA
KSDLLKLRKENISILPDELLNDISSLTKKEVNTDDDLKNRIIDNISNIRTNKISYEDDGV
INLRRYLKNYSRYKEELPVVDISLIEELKVVLKTEDIDDIDFLMLEDIKLKLLEPIKSID
INKKIKQSNAKIESVFKKMIAFLSDQIKSDGSVYSVLSEFQNDLNSNKDRVKETVQNYVA
LAAATVQGSKAKQLTEVKPDPFDTVIVDEAARANPLDLLIPLTSAKRRIVLVGDHRQLPH
IIDSAIQKELEADENAAEKLKEYLKDSLFERFYNILKELNKKDHILRVVTLNTQYRMHPV
IGDFISRTFYEKYGDPKIDSGTPAEKLTHTIEEYNNKVAVSINIPLIKGEEKKKNGSTYR
DVEAKETIRRAKEILDSDPSISVGVITFYSRQVTELFMEAEKLGLAEKNESGDYMITKGY
QKTMNGDERFRIGSVDAFQGKEFDVVILSLVRSNKLPAKTGNDIRSKYGFLTSYNRLNVA
MSRAKKLIIAVGDEDMFKTKEAEEHIFGLSAFYNELINSDYGVSI
NT seq
3198 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaatacaggatatattcaaaggcaaaaaggaggagattaatttaagattgaaacca
tctattaaaagtgaatcatttacaaaaaacaataatctgtctgtaaaaattaagtattcg
cagaatacatattggctttttttaaatgaagatcgctttgaagtggaaggattaacttca
aaagataataaggaattagaaagaatagctagtagcaatagtcttaatttattgattact
tcacaaggaacgaaagcggaaataaaatctaaattacttacagatactataaacttgcca
gatggtatcgaaatagggcttacagatataattattgatgatatcaataaaagacactca
aaaaaaaggaaaggaaaaaaacatacagattggttaactaatgaattaattattgaagat
ggtgatgagaagcaagttcttttagataatgctcctaattctggtggatttcgaatattt
ggtaaatctatagttatcgacgttaagattaatgaagataatatttatgagattgtaaga
atagtaaattggaaaaatagtttcaatcccacttttttattgaaaggagaaattgaaata
aaagatatttcagaagctggaaaattgagagcagatacggagttaaaactaaatagaatt
aattctaatcagagatatatcaatacttgggagaaataccaagaaaaagaaaaggaaagt
aatataaaagaagttgaaagtagaggctttttaacaattactgaaattaaaagagtttct
gaaggtaaatataaattggtgtttgataaaaatgaaaacaccaataattggttagaaata
gaaacaggtacttatgtagacttaaatagcaaccaagagcttcctaattttaattcatat
gaagataaaaatagtgcgaaaactatttgtaagttaatatctaaagagagtaacgaccta
atggttacatctgaaaatgaaataccgcagactactactgaaatttattatgctagcttg
tcattattaggaaatgtaataatgaattcaagaagaacaaggtctttagatgcaattaga
aataacacaaccccaatgcccgtactctcagcggttttagaaggtgtagattataattcg
gtaactagaagaaaaataaaacctttaacttctaaagttaaaagagaatttggagagttt
ggtcccaatgaaatgcaagaattagctttagatgttgctttaaactcaccagacataaca
attatacaagggcctccaggaacaggaaaaacaaaagttataagtgctttagctacacgt
ttaacagaggtttataaagacaatggtgaagcaccagaaatgaatattttactaacggca
tttcagcatgacgctgttgaaaatatggcttctcgtacagaagttcttggtttacctgct
ataaagtttagtaaagcacaaaaccagtctgttgatgttattgaaaaatggattaataaa
caatcagaaaaaattgaagccgttcaaattgagattgaacctaatgaagcggaattaatt
tataatgatacaatctcctattatttaacttatataaaaacattagatacagaaaaggcg
aaaagtgatcttttaaaactacgtaaagaaaatatttccattttaccagacgaattactt
aatgatatcagtagcttaacaaaaaaagaagtcaatacggatgatgatcttaaaaataga
ataatagataatatttctaatattagaacaaataaaataagctatgaagatgatggtgta
ataaatttaagaagatatttaaaaaactattcaagatataaagaggaactgccagttgta
gatattagtttaattgaggaattaaaagttgttttaaaaacggaagacatagatgatatt
gactttttaatgttagaagacattaaactaaaactattagaacctataaaatccattgat
attaataaaaagattaaacagtctaatgctaaaatagaaagtgtttttaaaaaaatgata
gcatttttatcagatcaaattaaatcggatggttctgtgtattctgtgctttctgaattt
caaaatgatttaaatagtaataaagatagagttaaagaaacggtacaaaattatgtagca
ttggctgcagcaactgttcagggtagtaaagcaaaacaacttacagaagtaaaaccagat
ccatttgataccgttatagtggatgaagctgcaagagcaaatccgttagatttattaatt
cctttaacatccgctaaaagacgcatagtattagttggagatcatagacaattacctcat
ataattgatagtgctattcaaaaagaattagaggcagatgaaaatgcggcagaaaaacta
aaggagtatttaaaagatagtttgtttgagcgtttctataatattttaaaagaattaaat
aaaaaagatcatattctaagagtagtaaccttaaatacccaatatagaatgcatcctgtt
attggtgattttataagtagaacgttctatgaaaaatatggagatcctaaaattgattca
ggaacgcctgcagaaaaattgacacacacgattgaagaatacaacaataaggtagctgta
agtattaatataccacttataaaaggggaagaaaaaaagaaaaacggtagtacttataga
gatgttgaagctaaagaaactattcgtcgtgcaaaggagattttagacagtgacccatcc
atatctgtcggtgttattactttttacagtagacaggttacagagttgtttatggaagca
gaaaaattaggactagcggagaaaaatgaaagtggagattatatgataacaaagggatat
caaaaaacaatgaatggtgacgaacgctttagaataggttctgtagatgcttttcaaggt
aaagagtttgatgttgtgatattatcacttgttcgttctaataaacttcctgctaaaaca
ggtaatgatattcgaagtaaatatggctttttaacttcttataacagattgaatgttgct
atgagtagagctaaaaaactaattattgcggttggagacgaagacatgtttaaaacaaaa
gaagcagaggaacatatttttggacttagtgcattttataacgaattaataaactcagat
tatggcgttagtatttga
DBGET
integrated database retrieval system
