Psychroserpens sp. NJDZ02: E9099_13685
Help
Entry
E9099_13685 CDS
T05945
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
psyn
Psychroserpens sp. NJDZ02
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS
PAS_4
PAS_9
PAS_3
PAS_8
HATPase_c
HisKA
PAS_7
PAS_11
Peptidase_S10
WSN
HATPase_c_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCE42412
UniProt:
A0A4P7X023
LinkDB
All DBs
Position
3116499..3120770
Genome browser
AA seq
1423 aa
AA seq
DB search
MSKLNNHLIKELQEIYGFSRSFIESLQDGLLIINLEGEIIIGNTAISQITGFDKDEIIGA
NVPFPFWPEECHDKYKGLFKDLSQGEIKKENIVVYKHKDQTRFKASMFFASIKNNQNQVM
AYIAVVEDISKREIYTPNAESYNQDIFSVLNYKKKYLEILSEKKITFQLENTLDSISDGF
ISLDTNWCYTYINKSAAKFLGKTPEMLIGKHIWTEFPEGVGQSFYKAYYKAFETQETVYF
NDYYEPLEKWFENKIYPSPAGIAIYFNDITALKKTEALLDKSEKNLENIINNIGDPVFVK
DDQSRMLIINDAFCKMFKISRDQLLKKSMPHDVFSEDWEKFIAIDKKVLETGVENLSEES
FALEGHEKQIISTKKVRFIDDQGAKFVIGTIRNITKEKKADANSQMLLSLIETNNDFIGL
ATLEGDPLYLNTSGRQLMGLEKDEKMPESIAQFFPEAYRDIIANEHMPSIFENNRWSGET
NFKNFITGDFIPIEMSGFLIRDTTTNKPIALGVVAKDITTRKEAEQKLIKSEQLFKRLTS
KAPAGIFQTNTEGSCNYVNQRWADYAGLSYQDAMGYGWATTVHPDDKERIVVEWEKYMLS
EENELETEFRFLHKNQKVTWVSVKTVGTYDADNKLYGYIGMALDITERKEAEAKLIKSEQ
LFRRLSSNAPVAIFQTDKEGACNYVNEEWMRFSGLTFAEALDFGWSEAIHPEDKERVISE
WQKSVATESEFILDYRFLHKNGKETYLSAKTTGLYDVNNQLYGYVGMLMDITERRVAEQK
LIKSEKYLNNIINAIGDPVFVKDDKSQLILVNDVFCSIFGLSKADVIGKTLLGNRSTDAR
KRVLDNEKELLLTGIESITEETINLNTNKDDIRIISTKKTRFIDSSGAKFIIGVIRDLTE
SKKVDEEIRMAHQRLTTHLNNSPLAIVEWDKDFVISSWSEQAKKIFGWDASEAIGKQLID
LNLVYKEDIPSTDVISEQLRSGKVKSNTIINRNNTKEGKVIYCQWYNSVLQSSDGKVETV
LSLIQDVTDSKIAEEKLINSEQLFKRLSSHAPVAIYQSDKDGVCNYVNEEWLKYSGQTFN
ESLGFGWSNAIHPQDQDRVMEEWKQAVATETDLISDFKLLNKNGETLWLSARTTSLYDLN
NKLYGYIGTLVDISDRKNSEMELEKYRNNLEQLVRSRTSDLEKEKIKAQSADLMKSAFLA
TMSHELRTPMNSIIGFTGILLKELAGPLNNEQKKQIKMVKNSGEHLLRLINDVLDISKIE
AGKLKVTFNPFNYLESLEKITAFLLPQVSGKGLTLTTHISEMEVILDSDQGRVEQVLLNL
LSNAIKFSNEGTIIIKVAVVNQLLVTQIVDQGIGIQSKDINKLFIPFAQLETGSNSKQEG
TGLGLSICKNLVEKLGGTIEVQSEIGKGSNFTFKLPLSYSNNK
NT seq
4272 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaattgaacaatcacttaataaaagaactacaagaaatatatggtttttcacgc
agttttatagagtcattgcaagatggtttattgattattaaccttgaaggggaaataata
atagggaataccgctataagtcaaatcacaggttttgataaggatgaaattataggagct
aatgttccttttcctttttggccagaagagtgtcatgataaatacaaggggctttttaaa
gatctatcccaaggtgaaataaaaaaagagaatattgtagtttacaagcataaagatcaa
acgcgttttaaggcgtccatgttttttgcgagtattaaaaataaccagaatcaagttatg
gcctacatagctgttgtagaagatatttctaaaagggaaatatatacacctaacgcagag
tcttataatcaggatattttttcggttttaaattataaaaaaaaatatctagagatttta
agtgaaaaaaaaataacatttcaattagagaacacattagatagtatttctgatggcttt
atttctttagatactaattggtgttacacctatataaataaaagcgcagcaaaattttta
ggaaaaacgccagagatgttaataggtaaacatatttggacggagttccctgaaggggta
gggcagtctttttataaagcgtattataaagcttttgaaactcaggaaacagtctacttt
aatgattattatgagcctttagagaaatggtttgagaataaaatatatccatctcctgca
ggaatagcgatttattttaatgatattactgctctaaaaaaaacagaagcacttttagat
aaaagcgaaaaaaacttagaaaatataattaataatattggagatcctgtttttgtaaaa
gatgatcaaagtaggatgcttattattaatgatgctttttgtaaaatgtttaaaatttct
agagatcaacttttaaaaaagtctatgcctcatgatgtgttttcggaagattgggagaaa
tttatagctatcgataaaaaagtacttgaaaccggcgttgaaaatttatcagaagaaagt
tttgcattagaaggacatgaaaagcaaataatttctactaaaaaagttagatttattgat
gatcaaggcgctaagtttgtaattggtacgatacgaaatattacaaaagagaaaaaagca
gacgctaatagtcaaatgttattgtccttgatagaaactaataatgattttattggctta
gcgacattagaaggtgatcctctctatttaaacacgagtggtaggcaattaatgggttta
gaaaaggatgaaaaaatgccagagtctattgctcagttttttcctgaagcgtatagggat
ataattgcaaatgaacatatgcctagtatttttgaaaataatagatggagcggagagaca
aactttaaaaattttatcacgggagattttattcctattgaaatgtctggttttttaatt
agagatactacaacaaataagccaatagcattaggtgttgttgcaaaggatattacaaca
cgtaaagaggctgaacagaaattaataaaaagtgaacagttatttaagcgattaacgtct
aaagccccagcagggatttttcaaacaaataccgaggggtcttgtaattatgtaaatcaa
agatgggctgattatgcaggactatcgtatcaagacgctatgggttatggatgggcaaca
acagtacatccagacgataaagaacggattgtagtggagtgggagaaatacatgttgtca
gaagagaatgaacttgaaacggaatttagatttttacataaaaatcaaaaggtaacgtgg
gtatcggtaaaaacggtaggaacttacgatgccgacaacaagttgtatgggtatattgga
atggctcttgatattacagagcgtaaagaagcagaagcaaaattaataaaaagtgaacaa
ttatttagacgactatcttccaatgcaccagtagccatttttcaaacagacaaagaaggt
gcttgtaactatgttaatgaagaatggatgcgattttctgggcttacttttgctgaagcc
ttagattttggatggtcagaggctatacatccagaagataaagagcgagttatttctgaa
tggcagaagtctgttgctacagaatcggagtttatattggattatagatttcttcataaa
aatggtaaggaaacctatttatctgcaaaaacgacaggtttgtacgatgttaataatcag
ttatatggttatgtaggaatgcttatggatatcacagaacgtagggtggcagaacaaaaa
ttaatcaagagcgaaaagtatttaaataatattattaatgctattggagatcctgttttt
gttaaagatgataagagtcaattaatacttgttaatgatgtgttttgttccatttttggt
ttgtctaaggctgatgttataggaaaaacactcttgggaaataggtccacggatgccaga
aaaagagtgttggataatgaaaaggaattgctgctgacaggtattgaaagtattacggaa
gaaactataaatttgaatacaaataaggacgatattcgaattatttctacaaaaaaaaca
cgatttatagatagtagtggtgctaaatttataataggagtcatcagagatcttactgaa
agtaaaaaagtagatgaagaaattaggatggcgcatcaacgtcttacaacacatttaaat
aattcacctttagctattgtagagtgggataaggattttgttattagcagttggtctgaa
caggctaaaaaaatatttggttgggacgcgtcagaagcgatagggaaacaattgattgat
ttaaatttagtttataaagaagacatcccttctacagatgttatttctgagcaattaagg
agcggtaaagttaaaagcaatacgattattaaccgcaataacactaaagaaggtaaggtt
atttattgccagtggtataattctgttttacaatctagcgatggtaaagtagaaacagta
ttatctttgatacaagatgttacagacagtaagatagccgaagaaaagttaataaatagc
gaacaattatttaaacgattatcatctcacgcaccagttgccatttatcaatcagataaa
gatggtgtgtgtaattatgtgaatgaagaatggttaaaatattctggtcaaacatttaat
gagtctttaggttttggatggtcaaatgcaatacatccacaggatcaagaccgcgttatg
gaagagtggaaacaagcagttgctacagagacggatttgatttcagactttaagctatta
aataaaaacggggaaacattatggttgtctgctagaacaactagtttgtatgatcttaac
aataaattatatggttatatagggacacttgttgatatttctgatcgtaaaaattcagaa
atggaattagaaaaatacagaaataatttagaacagttagtaagatctagaacatcagat
ttagaaaaagaaaagattaaagcgcaatctgcagacttaatgaaatcagcctttttagca
actatgtcacatgagttaagaacaccaatgaattctattataggctttacaggaatctta
ttaaaagaattggcaggaccattaaataacgagcaaaaaaagcaaattaaaatggttaaa
aacagtggagagcatttactacgtttgataaatgacgttttggatatttctaaaatagaa
gcaggtaaattaaaggtgacttttaatccgtttaattatttagaatctttagaaaaaatt
acggcatttttgttaccccaagtctcaggaaaaggactaacgttaacaacgcatatttca
gaaatggaagtgatacttgatagtgatcaaggaagagtagagcaagtattattaaattta
ctctctaacgctattaagttttcaaatgaaggtacaattattataaaagttgcagtagta
aatcagttgcttgtgacacaaattgtcgatcaaggaattggtatacaatcaaaagatatt
aataaattatttataccttttgctcaacttgaaacagggtccaatagtaaacaagaagga
acagggcttggattgtctatctgtaaaaatttggttgaaaaactaggaggaaccattgaa
gtgcaaagcgaaataggaaaaggaagtaattttacatttaaattaccactatcatattct
aataataaataa
DBGET
integrated database retrieval system