Psychroserpens sp. NJDZ02: E9099_14135
Help
Entry
E9099_14135 CDS
T05945
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
psyn
Psychroserpens sp. NJDZ02
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psyn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psyn02000
]
E9099_14135
Transporters [BR:
psyn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
E9099_14135
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
PEGA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCE42492
LinkDB
All DBs
Position
complement(3211196..3213904)
Genome browser
AA seq
902 aa
AA seq
DB search
MFIPLKQYISCLFLLCFYLNTFAQDRATITGLVSDQFGTLPGAKISIEGTNLNTSTDVNG
IYTINLEEGDYVVTANFVMYNSVSKSITVKVGETATLDFILETGFSIDQPVSLGSRAQPK
SSLRTTAPVDIISPQDLTNATQIELSHILHYLVPSFHSTNQTISDGTDHIDPATLRGLGP
DQVLVLVNGKRRHNSALLNVNGTVGRGTVGTDFNAIPVASVERIEILRDGATSQYGSDAI
AGVVNIILKKQVEVIDIVGRVGVNSEGDGQTSYFSANFGFDIGDKGFINITGEYRSTEAT
NRAGNYTGPIYSNTPSEDALLINNNNFFSTTGYDKQQIMEIGSAKTQNLAISFNGELPIS
ETTSFYFNGGRNYREGKAKGFYRLPKDEDRVVLELFPNGFSPQILTDIQDDAVTAGFKGV
KNNWDIDFSHSIGKNALDYTVNNSNNASLGIASPKTFYSGGFMYQQSTSNLDISRTYDWL
HGINIAFGAELRVENYQIIAGEEASYIDGGSTYVDAFGDEQPSIPGAQVFPGFQPENELS
RFRTNSAGYIDIETNVSEKLLIKTAARYESYNDFGGQLIWKVSGRYRVNDALGIRSGIST
GFRAPSLHQVYFQNISSQFINGEIIQVGTFNNESAVAQEAFKIQNLKPELSRHYSLGVNG
KLQDNFSFTLDYYYIKIKDRIVLSGRFDEGYETILEPFNVGAAQFFTNAIDSRTTGLDAA
VQYKTTLSSGKLDASLAANFNKTKVIGDIKVSESLVGQEDVLFNREEIARVESAQPNYKF
NNLLSYEFDNYKIVLGNTFFGDVTFMHPEDGNPDNWVLNEFSGQVETRDQKFTPKLVTDL
AFSYKVSSTLEFTLGGNNIFNVYPDKHTHSANIDNGNFVYSRRVQQFGVDGSNFYLRAFL
KL
NT seq
2709 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttatcccattaaaacagtacattagttgcctatttctattgtgcttttatttaaat
acttttgcgcaagacagagcaacaataacgggattagtttctgatcaatttggcacatta
cctggtgctaaaataagtattgaaggtaccaaccttaatacatcaacagatgtcaatggt
atctatactattaatttagaagaaggcgattatgtcgtcaccgcaaattttgtaatgtac
aattctgtgtcaaagagtataaccgtcaaagtaggagaaacagcaaccctagattttatc
ctagaaactggtttttcaatagatcaacccgtatctttaggttctagagctcaaccaaaa
tcttctttaaggacgactgcccctgtcgacattatatctccacaagatttaactaatgct
acacaaatagagttaagtcatatattacattatctagtgccttcctttcattcaacaaat
caaaccatttctgatggtacagaccacatagaccctgcaaccttaagaggtttaggtcca
gaccaagtccttgttttagtaaatggaaaacgacgtcataatagtgcgttgttaaatgtt
aatggtaccgttggacgtggtactgttggaacagattttaatgccattcctgttgcttct
gtagaacgcatcgaaatactacgcgatggtgctacctctcaatatggatcagatgctatt
gccggtgtggtaaatattatattaaaaaaacaggtagaagttattgatattgttggtcgc
gtaggtgttaatagcgaaggagacggtcaaacaagttattttagtgccaattttggtttt
gatattggcgataaaggttttattaatattaccggagaatatcgtagcacagaagcgacc
aatagagctggaaattatactggtcccatatattctaatacaccaagcgaagacgcacta
ctaattaataacaataatttttttagtactacaggttatgataagcaacaaataatggaa
atcgggtctgctaaaacacaaaatttagcaatctcttttaatggagagctccctatctct
gaaacaacttctttttattttaatggtggtagaaactatagagaaggaaaagcaaaaggc
ttttatagattaccaaaagacgaagaccgtgtggtattggaattatttcctaatgggttt
tctccacaaattttaacagacatacaagatgatgctgtaacagctggatttaaaggtgtt
aaaaacaattgggacatcgattttagtcactctattggtaaaaatgctttagattatact
gtaaataactctaataatgcgtctcttggtattgcctctcctaaaactttttattctgga
ggatttatgtaccaacaaagtacttccaatttagatatctcaagaacatacgattggtta
catggtataaatattgcttttggtgcagaactaagagtcgaaaattatcaaattatagca
ggagaagaagcttcttatatcgatggaggcagcacctatgtagatgcttttggagacgag
cagccaagtattcctggagctcaagtattcccaggatttcaaccagaaaatgaattgagt
cgttttagaacaaatagtgccggttatattgatatcgaaactaatgtctctgaaaaacta
ttaatcaaaacggctgcgagatatgaatcttataatgactttggaggacaattaatttgg
aaagtttctggtcgttatagagtcaatgacgccttaggtattagaagtggaatttcaact
ggatttagagccccttccctacaccaagtttattttcaaaatataagttctcaatttatt
aatggcgaaataatacaagtaggaacatttaataacgaaagtgctgtcgcacaagaagct
tttaaaattcaaaacctgaaacctgagctatctagacattatagtttaggggttaatggt
aaattacaagataatttttcttttacattggattattattacataaaaattaaagatcgt
attgtactatctggtcgttttgacgaaggttacgaaacgatattagaaccttttaatgtt
ggtgctgctcagtttttcaccaatgcaatagactccaggactaccggtttagatgctgct
gtacaatacaaaacgactcttagttcaggaaaattagatgcatctctagctgccaatttt
aataaaacgaaagtcatcggagatattaaagtgtccgaatcgttagttggtcaagaggat
gtcttatttaatagagaagaaattgcacgagtagaatctgcacaacctaattataagttt
aataatctactttcttacgaatttgataactataaaatagttttaggaaacacctttttt
ggagatgtcacttttatgcatccggaagacgggaatcctgacaactgggttttaaacgag
ttttcaggccaggtagaaactagagatcaaaaatttacacctaaactagttacagattta
gcattttcctataaagttagcagcactctcgagtttacattaggtggtaataatattttt
aatgtctatccagataagcatacacactctgctaatatagataatggaaattttgtttac
agcagacgtgtacaacagtttggcgtagatggttctaatttttatttaagagccttttta
aaactataa
DBGET
integrated database retrieval system