Psychroserpens sp. NJDZ02: E9099_14540
Help
Entry
E9099_14540 CDS
T05945
Name
(GenBank) AraC family transcriptional regulator
Organism
psyn
Psychroserpens sp. NJDZ02
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AraC_N
HTH_18
HTH_AraC
ExsA_N
RHD_DNA_bind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCE42568
LinkDB
All DBs
Position
complement(3287984..3288904)
Genome browser
AA seq
306 aa
AA seq
DB search
MHSLLNQHQNHRKLTTLIENRTTYNADYAELNIFETHAFAEKVSLTFNFPVIASMLTGKK
VMHIEGFDPFDFCPGESVVMPTNKEMVIDFPIATTKMPTQCLALGIDAFKIDEVVQKFNQ
HVAIENENNTWDLDETSSHLINNTDVNHLIERLTYTFTNNNKSKDVLLDLMIQELIIRLL
QTKAKSLIINDPNQIFNDTRIGTVVKYIKDNLTNKDISVAILAKKAYMSTSHFHKQFKNT
LGVSPIDYINSEKIKFSKKLIKDSKDFRMSDIAFKSGFNNTSYFNRQFKKMELMTPQQFK
ASINKG
NT seq
921 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcattcgctattaaatcaacatcaaaaccatagaaaactaactactttaatagaaaac
agaacgacctataatgccgactatgcagaacttaatatttttgaaacgcacgctttcgcg
gaaaaagtgtcgttgacctttaacttccctgttatagctagtatgcttactggtaaaaaa
gtaatgcatatagagggttttgacccttttgatttttgtcctggtgaatctgtagtgatg
cccaccaataaggaaatggttattgactttcctattgccacaacaaaaatgccaacacaa
tgtcttgctttaggtattgacgcttttaaaattgatgaagttgttcaaaagtttaatcag
cacgttgctattgaaaacgaaaataatacttgggacctagacgagacttcatcacattta
ataaataacacagatgttaatcatttaatagaacgtctaacctacacttttacaaacaat
aataaatctaaggatgtgctactggatttaatgatacaggaattaattattaggctatta
caaaccaaagccaagtctttaattattaatgaccctaatcaaatttttaatgataccaga
ataggaacagtggttaaatacataaaagacaatttaactaataaagatattagcgtggct
atattagcaaaaaaagcttatatgagcacatcgcacttccataagcaatttaaaaacacc
ttaggcgtctctcctattgactacattaactctgaaaaaattaaattttctaaaaaacta
atcaaagactccaaagattttagaatgtctgacattgcctttaaatccggttttaataat
acgagttactttaatagacaatttaaaaaaatggaattaatgacgcctcaacaatttaag
gcgtcaattaataaaggataa
DBGET
integrated database retrieval system