KEGG   Psychroserpens sp. NJDZ02: E9099_16770
Entry
E9099_16770       CDS       T05945                                 
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
psyn  Psychroserpens sp. NJDZ02
Pathway
psyn03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:psyn00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    E9099_16770
SSDB
Motif
Pfam: DEAD Helicase_C ResIII NAT10_TcmA_helicase CMS1
Other DBs
NCBI-ProteinID: QCE42998
LinkDB
Position
complement(3802741..3803859)
AA seq 372 aa
MMTFKDLGLDKNYIKALKELGIKNPTEIQSQAIPVLLKKSTDLIGLAQTGTGKTAAFGLP
LLHKINPKKDTVQALIIAPTRELVQQIKKQLFKYIKYNDAKIFLEGVYGGEKIDIQLKNV
ARTTHIIVATPGRLVDLVERGAVNLADVKTIVLDEADEMLSMGFKPDLTTILKSVTGPKN
TWLFSATMSDALKDIVKRYIADEAIRLEIDRTSIVNQNISHYFVETSVHEKASTIIRLLE
DREDQRGIIFTKTKAGAQALRHQLETEGFNVGALEGDMQQRDRDKVMRAFKNTTLQLLIS
TDVSARGIDVNDLAFVMHHQLPEHIEYYTHRSGRTARAGKKGESIALVLSSERNDLKKVE
STLGIKFKQLSV
NT seq 1119 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
attatgacttttaaagacttaggtttagataaaaattatataaaagcactaaaggaatta
gggattaaaaatcctactgaaattcaatctcaggccatacctgtgttacttaaaaagtca
accgatttaattggtttggctcaaacgggaacaggtaaaaccgctgcttttggattacct
ttattacataaaattaatcctaaaaaggataccgttcaggcgcttatcattgcacctaca
agagaattggtacaacaaataaagaagcagttatttaagtatatcaagtataacgatgct
aaaatatttttagaaggggtttatggaggtgaaaaaattgatattcaacttaaaaatgta
gccagaacaacacatattatagtggcaactccgggtcgtttggtcgatttagtagagcgc
ggtgctgtaaacttggcggatgttaaaacaattgttttagatgaagctgatgaaatgtta
agtatggggtttaaacctgatttgacaacaattttaaaatcagtaacaggaccaaaaaac
acgtggttattcagtgcaaccatgtctgatgctttaaaagatattgtaaagcgttatatc
gcagatgaagctattcgtttagagattgatagaacaagtattgttaatcaaaatatctcg
cattattttgtagaaacttcagtgcatgagaaagcttcaacgatcattcgattattagaa
gatagagaagaccaacgtggtattattttcactaaaacaaaagcaggtgcgcaagcatta
agacatcaattagaaaccgaaggattcaacgttggtgctttagaaggggatatgcaacaa
agggatcgagataaagtaatgcgtgcgtttaaaaacactacgttacagttgttaatctct
actgatgtatctgcaagaggaattgatgttaacgatttagcttttgtaatgcaccatcag
ttaccagagcatatagagtattatacacacagaagtggacgtacagccagagctggtaaa
aaaggagaatctatcgctcttgttttgagtagtgagcgtaatgaccttaaaaaggttgaa
tctactttaggtattaaatttaaacaattatcggtttaa

DBGET integrated database retrieval system