Psychrobacter sp. PAMC27889: E5677_06140
Help
Entry
E5677_06140 CDS
T06076
Name
(GenBank) phosphodiesterase
Organism
psyp
Psychrobacter sp. PAMC27889
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS
PAS_4
PAS_9
GGDEF_GdpP
PAS_8
PAS_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCB30609
LinkDB
All DBs
Position
complement(1451429..1453150)
Genome browser
AA seq
573 aa
AA seq
DB search
MSSIMTDFTPISIADKQQLLATLCEQLEDAVFILDADLRYLAVNASYEMIIGYSETFILG
RPLGIYAAEFLSEEERVVLKDIIQQLDINGFYENDFSIPNRYGQVIECHMTYRKICIEQR
VYYACMVRDMSSIVKDRKQVAHLLNYDQITGLPNRKVFLSQTSDLLLDSYQEVVIVRLNI
DRYRNLASLLGPDDINTLVEDFVSRVKDLKLDNLHCFSHFGGDDFALLFECTDANLIRHQ
LDSLMQMCERPFSLNGNTTTDTNIYCHISVGVSYFPENGDDLKELLAKAEKALHYVKQQG
GDDICWYEATINEATDDGLRLEAELRDAFNEGQFIPYYQPKFELKTGIITGFEALVRWQH
PTRGLLKPHHFINAIINNRLSFELFSQMAIQIAKQLAIWRQKGFCQHICVNADAAEFSHP
DFFDMVNRLLKEYAISSHQFHIEVTESSLIQRHSNIRQKLNLLKELGVFLALDDFGTGYA
SLSYLQEYPFDFIKIDKSFISNITTDHIQRAIVKAILDLATALDMQVIAEGIEAEEQRDV
LLDMGCQQGQGYWFGKPVAANVATEMLVKQYAS
NT seq
1722 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttccattatgactgatttcacgcctatttctatcgcagacaagcagcaactactc
gccacattgtgcgagcaactagaagatgctgtttttattttagatgcagatttgcgttat
ctggccgttaatgccagctatgagatgattattggttatagtgagacgtttatactaggg
cggccactgggtatttacgcagcagaatttttatcagaagaagaaagagttgtcttaaaa
gacattatccagcaattagatatcaatggtttttatgaaaatgacttctcaataccaaac
cgttacggacaggtcattgaatgtcatatgacgtatcgtaaaatctgtattgagcagaga
gtgtattatgcttgcatggtacgtgatatgtcttcaatcgttaaagaccgaaaacaagtc
gcacacttgctcaattatgaccagattactggcttaccaaaccgcaaagtatttttgagt
caaaccagcgatctattgttagacagctatcaagaagtggtcattgttcgtctaaacatc
gaccgctatcgcaaccttgccagcttactgggtcccgatgacattaacaccttggttgaa
gattttgtcagtcgtgtcaaagatcttaaattggacaacttacactgtttttctcacttt
ggtggtgatgattttgctttattgtttgagtgtactgacgccaatttgatacggcatcag
ctagacagcttaatgcaaatgtgtgaacgccctttttcattaaacggaaatactacgact
gataccaatatctactgtcatatttctgtcggagtcagttattttcctgaaaacggcgac
gacttaaaagagctgctggccaaagccgaaaaagcgctgcactatgtcaaacagcaaggt
ggtgatgacatttgctggtatgaagcaactatcaatgaggcaactgatgacggtttacga
ctagaagcagagctaagagatgcttttaatgaaggtcagtttatcccttattatcaacca
aagtttgaactaaaaacaggtatcattacaggttttgaagcccttgtacgttggcagcat
ccaacgcgtggactgctaaaaccccaccattttatcaatgccattatcaataatcggcta
tcgtttgagctgttctcacagatggccattcaaattgctaaacagctcgctatctggcga
caaaaaggcttttgtcagcacatttgcgtcaatgctgatgccgccgaatttagtcatcct
gatttttttgacatggtaaatcgtttgctcaaagagtacgccatttcttctcatcaattt
catattgaagtcactgaatcctctttgattcagcgccactctaatatcagacaaaaactt
aatctgctcaaagagctgggcgtttttttggccttagatgactttggtacgggctatgcc
tctttaagctatcttcaagaatatccatttgattttatcaaaattgataagagttttatc
tctaatatcacaactgatcatatccagcgtgcaattgtaaaagccatcttagacttggct
actgcccttgacatgcaagtaattgccgaaggtatcgaggctgaagaacagcgtgatgtt
ttgttagacatgggttgtcaacaaggacaaggctattggtttggcaaacctgtggcggcg
aacgtggcaactgaaatgctggttaagcaatacgcttcttaa
DBGET
integrated database retrieval system