Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum: DSAG12_01164
Help
Entry
DSAG12_01164 CDS
T06555
Symbol
amyA
Name
(GenBank) Alpha-amylase
Organism
psyt
Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_57
Glyco_hydro_38N
Polysacc_deac_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEE15339
UniProt:
A0A5B9D840
LinkDB
All DBs
Position
1251141..1252391
Genome browser
AA seq
416 aa
AA seq
DB search
MTIFWAPLLHVYQPPWQDLEILKEIYKECYVPLLTMLERHENVKLTLNVQGCLLDLLTRM
GLEDAREILRKLIHNGKVELIGSAKFHPILPLIPQDEIIHQIKLNESTLNHHFPGCSLKG
FFPPEMAISTNLCQIIKKSGYSWTILDGIANSDKWPQDYIQKTESGLITFFRDSFISNMI
SFSKIDADGFVEKISQMHDKNSKNDYYIITAQDAETFGHHIKFYETRFLGKVFSLIEDRN
DIEISLISNLVDHFPIHKAKKPIKSSSWSTTTSDIASRVPYPLWASPLNPVHKYQYRMLK
ALYKLMATVEKYNKFNGKNSEFQNYYKTARYFYDQSMHSCWLWWASMKPMWSPNLIYKGA
DLIMKAALNAQLALINLKVGVADEDYGIIMDNVEKLMTEIIDQEAAGQKVRTYGDF
NT seq
1251 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaattttttgggcacctctattacacgtttatcaaccaccatggcaagatctcgaa
atactaaaggaaatttacaaagaatgttatgttccccttttaacgatgttggaaaggcat
gaaaatgtaaaattaacactaaatgttcaaggatgtttattggatttattgacccgcatg
ggtttggaagatgctcgagaaattttgagaaaattaatacacaacggaaaggtcgagctt
ataggatctgcaaaatttcacccaattctacctttaattcctcaagatgaaatcattcat
caaatcaaattaaatgaatcaaccttgaatcatcattttcctggctgttctttaaaaggt
ttttttccacctgagatggctatttctacaaatttatgccaaataataaaaaaatccggt
tattcttggacaattttggacggtatagcaaattcagataaatggcctcaagattatatt
caaaaaactgaatctggattaattacttttttccgagattcatttatttccaatatgatt
tctttttcaaaaattgatgctgatggatttgtagaaaagatatcccaaatgcatgacaaa
aattctaaaaatgattattatatcattacagcgcaagatgctgaaacatttggccaccat
ataaaattttatgaaacaagatttttgggaaaagtattttcattaatcgaggatcgtaat
gatattgaaataagtcttatatcaaatttagtagatcatttcccaattcataaagcaaaa
aaacctattaaatcttcatcttggagcactactacttcagatattgcaagtcgtgtaccc
tatccattatgggcatcccctttaaatcctgttcacaagtatcaatacagaatgttaaaa
gctttgtacaaattaatggctactgtcgaaaaatataataaatttaatggaaaaaactcg
gagtttcaaaattattataaaacagcccgttatttttatgatcagtcaatgcattcgtgt
tggttatggtgggcatcaatgaagccgatgtggagtccaaatttaatttataagggcgct
gatttaattatgaaagcagcattaaacgctcaattagcacttataaatctgaaagtaggt
gtagcagatgaagattatggaataattatggataatgttgaaaaattgatgacagaaatc
attgatcaagaagcagctggtcaaaaagttagaacatatggtgatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system