Promethearchaeum syntrophicum: DSAG12_02451
Help
Entry
DSAG12_02451 CDS
T06555
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
psyt
Promethearchaeum syntrophicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS
PAS_9
PAS_4
HATPase_c
HisKA
PAS_3
GAF_2
GAF
PAS_8
PAS_10
Diguanyl_cycl_sensor
GAF_3
ParE_like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEE16621
UniProt:
A0A5B9DC53
LinkDB
All DBs
Position
complement(2085747..2088932)
Genome browser
AA seq
1061 aa
AA seq
DB search
MIGNDRKYLNIIDAIVLQLDRKGKILYINVKGNKILGYRENEILGKNWFKTCIPHSKREE
MERVFNKVINGEKEVDYFENAVQTKKGLEKIIRWHNSNVYNKKGNIEGVLSLGTDITRQR
KIEKLTFIQGQTNFLISNAKNEMGMFQEFCEEIIQFKNYQFCWIGLVQYDEEKSIKPVAL
AGYNIFDNSKYDGKKLKFTWSESVKDQSPSGTAIRTRKNYIINDLSAEKKFKNWKTVFDG
SGFLSSISIPIIIENIVIGVLGIYSGNKNTFDEDDVELISKMVNNLSLGIAKMRYYKIQK
KNEKNLRNSLKKFTTIFQAIPDLFLLLSKKGDVLEFHGDKNLLHVPLDNLLGKDLFIGFP
NKISKLIEEKSLEVFKTKKPQVVEFPLKQQNEIIEIFEARLFFYDENKIAVFVRNITESK
SRENKLKETEFRLRNLNLDLDQKVELRTRELENSKNQLNIILNTLNYPVFVISEDYEILF
HNRSSSKIYDGILDGKICYKILRGREQPCDDMCPLRNKSLSQNIKSLKFEDKLFLSKFDE
ERDFEISSTKIENFNGKPALLEIFEDITDRKKKEKQILESELMLQVRIKGLKCLYGISSL
LVVPDITIKELLYGVLPLIRSSWQYPEITMVKIIYGENQAQTTSFKESEWKLTISDKIND
IPLKIEVVYEINKEFLDEEKRLLKEILTRIKLGIISIEYKLETKRLASIVGTSSDSIVSM
DKEGMIKSWNKGAERIYGYALEEVLEKSISMLIPPDRMEEIPNLIEKVVQGESYKLFETK
RLRKDGKVLSVNVTISPILDLKGDIVGISSISRDVTESLEQQKQYQDQLIKSSQFKSDFM
ASMSHELRTPLNSIIGFTDILIEKFYGDVNEKQDHYLNNVRTSAEHLLNLINDILDISKI
EAGKVELKYRDFDLLNLVSQIEIEVKPLYKKKGLNFELVGFEKGTIINADPIRFKEILLN
LLSNAIKYTEKGGIKLDFMEDEKNWKFKIIDTGIGIAPEDFGIIFQEFKRVESDYVESIE
GTGLGLMLTKKLIELHGGHITFTSVLGEGSSFSFTLPKKLI
NT seq
3186 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattggaaacgatagaaaatatttgaacattattgatgcgatagttctacaattagat
agaaaagggaaaatactttatattaacgtaaagggtaacaaaatacttggatatagagaa
aatgaaatattgggtaaaaattggttcaaaacttgtattcctcattctaaaagggaagaa
atggagagagtttttaataaggtgataaatggtgaaaaagaagtagattattttgaaaat
gctgtacaaactaaaaaaggattagaaaaaatcattagatggcataattctaatgtatat
aataaaaaagggaatattgaaggtgttcttagcttaggaactgacataacgcgacagaga
aagattgagaaattaacctttattcaaggtcaaactaactttctaatttcaaatgcaaaa
aatgaaatgggaatgtttcaagaattttgtgaagagattattcaatttaaaaattaccaa
ttttgttggattgggttagtccaatatgatgaagaaaaatcaataaaaccagttgcttta
gctggatataatatctttgataattctaaatatgatggaaaaaaattgaaatttacatgg
tccgaatctgtaaaagatcaaagtcctagcggaacagcgataagaacaagaaaaaattat
attattaacgatttaagtgcagaaaaaaaatttaaaaattggaaaactgttttcgatgga
tcaggttttctatcatcaatttcaatcccaatcattatagagaatattgtaattggtgtg
ttaggcatatattcaggaaataaaaacacattcgatgaagatgatgtggaattaatatca
aaaatggtgaataatctctccttaggaatcgcaaaaatgcgttattataagattcagaaa
aaaaatgagaaaaatttaagaaattcacttaaaaaatttacaaccatttttcaagctatt
cctgatttatttttattactctctaaaaagggagatgtcttggaatttcacggagataaa
aatttacttcacgttcctttagataatttattgggaaaagatctttttattggttttcca
aataagatttcaaaattgattgaagaaaaatctttagaagtatttaaaacaaaaaaacca
caggtagttgaatttcctttaaaacaacaaaatgagataattgaaatttttgaggcgaga
ttgtttttctatgatgagaataaaattgctgtttttgtcagaaatattactgaaagtaaa
tcacgggagaataaattaaaggaaacagaattcagattacgaaatttaaatttggattta
gatcaaaaggtagaattaaggactagggagctggaaaattcaaaaaatcaattaaatatt
atattaaatactctaaattatcccgtttttgtaatatctgaagattatgaaattttattc
cataatagaagctcttctaaaatatatgacggaattcttgacgggaagatatgttataaa
attttaagaggcagagagcaaccatgtgatgatatgtgtccactgagaaacaaatcactc
agtcagaatattaaatctttaaaatttgaggacaaattatttttgtcaaaatttgacgaa
gaacgagattttgagattagttccacaaaaattgaaaatttcaatggaaaaccggcactt
ttagaaatatttgaagatattactgaccggaaaaaaaaagaaaaacaaattttggaatcc
gaattaatgcttcaagtcaggattaaaggattaaaatgtttatatggaatttccagtctt
ttagttgtaccagacattaccatcaaggaattgctctatggagttctacctctgattcgt
tcatcatggcaatatccagaaataactatggtaaaaataatttatggagaaaatcaagcc
caaacaacaagttttaaagaatccgaatggaaattaaccatttctgataaaattaatgat
attccattgaaaattgaggtagtttatgaaattaataaggaatttttagatgaagaaaaa
agattattaaaagaaattttaacacgaattaaattaggaataatcagtatagaatataaa
ttagaaacgaagagattagcaagtattgttggaacttcatcagattcgattgtaagcatg
gataaagagggaatgattaaatcatggaataagggtgctgaaagaatatatggttatgca
ttggaggaagttttagaaaaatcaataagcatgttgattccacctgatcgcatggaagag
attcccaacttaatagaaaaagttgttcaaggtgaatcctacaaattgtttgaaactaaa
cgtcttagaaaagatggaaaggtattaagtgttaatgtgacaatttccccaattttagat
ttaaagggagatattgttggaatttcctcgatttctcgtgatgttactgaatcattagag
cagcaaaaacaatatcaagatcaacttattaaatcttcccaatttaaatctgattttatg
gcatcaatgtctcatgaactaagaactccattaaatagtatcattggctttacagatatt
ttgattgagaaattctatggagatgtgaacgaaaaacaagatcattatcttaataacgtc
agaacatcggcagaacacttattaaatctaataaatgatattttagatatttcaaaaata
gaagcaggaaaagtagaattaaagtacagagattttgatttattgaatttggtttctcaa
attgaaatcgaagtaaaaccactttataaaaaaaaaggattgaattttgagttagttggg
tttgaaaaaggcacaattattaatgcagatccgataaggtttaaagaaatacttctaaat
ctcttaagtaatgctatcaaatatactgaaaaaggcggaataaaattagattttatggaa
gatgaaaagaattggaaatttaaaataattgatactggaattgggattgcaccagaggat
tttggaattatttttcaagaatttaagagagttgaatcagattatgtggaatctattgaa
ggaactggattggggttgatgttgacaaaaaagttaattgaacttcacggaggacatatc
acatttaccagtgtattgggtgaaggttcatccttttcatttacattacccaagaaatta
atttag
DBGET
integrated database retrieval system
