Promethearchaeum syntrophicum: DSAG12_03519
Help
Entry
DSAG12_03519 CDS
T06555
Name
(GenBank) ABC transporter substrate-binding protein
KO
K02035
peptide/nickel transport system substrate-binding protein
Organism
psyt
Promethearchaeum syntrophicum
Pathway
psyt02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psyt00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
DSAG12_03519
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psyt02000
]
DSAG12_03519
Transporters [BR:
psyt02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Peptide and nickel transporters
Peptides/nickel transporter
DSAG12_03519
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEE17682
UniProt:
A0A5B9DF00
LinkDB
All DBs
Position
3336613..3338430
Genome browser
AA seq
605 aa
AA seq
DB search
MQRNNFLIAIIFLFSIFSIYIPTVNAMRYMPFIVRISDTPQNADPADANDIVSYNILNQV
YEGLYTYNLSSPSTEVIPQLASKMGEWNENMTELTIELRDDVTFHDGSAFNATVVKWNFD
RINYFAANNISNPAISYLNNNDELIVKETVIVNNTAIKFILNRPFSIWEQILAFTGSYII
KPNDDFREKFLSLSDEAIGTGPFKMGEITPDSSTLYGDQHYGSVYFKRYEDYYNGPANIT
DMVYIVIKDEEVGSTAMLNHELHYGRIVPEHVNQADEDLETTIESRRTNIVNFLTLSVRN
IPYEIRRAMAFGWNYTYYLKETLMDENYELHTPIPAGMQYYNPNIEGLPYFNKTIARQYM
LNCPNITAEVTASRLGINSTDAEWEAVTTSETPLFEANFTRYTSSSSEKIMQQLVYDFAY
IGIKVLDAHAGTWNGWEEEEPVDPKFMQISTGRNIVGIWGMPGYDYNDAISMIEPLYKTN
ATYNTAQLNNNTLDDIISENYLLTGEARAESFDNIVYKVMVENCPSMYLFQRGDLITYNN
KFVSNINDLLNILGRWYWYNIKYIPQKDLRILRGTLATIIVVFAGFVSASLIRYRIKIKN
LQFTS
NT seq
1818 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaagaaataactttttaatagcgataattttcttgttttccattttctccatatat
ataccaactgtaaatgcaatgagatacatgcctttcatcgttagaatatctgatacacca
caaaacgcagatcctgcagatgctaatgatattgtttcttataatattttaaatcaagtt
tatgaaggattatatacctataatctttcatcccctagtacagaagttatccctcaacta
gcttcaaaaatgggggaatggaatgaaaatatgactgaattgacaattgaattgagagat
gatgtaacgttccatgatggaagtgcctttaatgctacagtagttaaatggaatttcgat
cgaattaactattttgctgcaaataatataagtaatccagcaatatcgtacttaaataat
aatgatgaattaattgttaaagaaactgtgattgtgaataatactgcaatcaaatttatc
ttaaacagaccattttcaatatgggaacagattttagctttcactggctcttatataatt
aaaccgaatgatgatttcagagaaaaattcttaagcctctcagatgaagccatcggaacc
ggaccatttaaaatgggagaaataacaccagacagctctactttgtatggagatcagcat
tatggatcggtttattttaaacggtatgaggactattataatggacctgcaaacattacc
gatatggtttacatagtaattaaagatgaagaagtcggatccactgcaatgttgaaccac
gaattgcactatggtagaatagtgcccgagcatgtaaaccaagctgatgaggatcttgag
actaccattgagagtagaagaaccaatatagtgaattttttaactttaagcgtaagaaac
attccttatgagatacgacgggcaatggcttttggatggaactatacatattatctcaaa
gaaacgcttatggatgaaaattatgaattgcacactccaatccctgctggaatgcaatat
tataatcctaatattgaaggtttaccctattttaacaaaactatcgcccgccagtacatg
ttaaattgtcctaatattacagctgaagttacagcaagtagattgggcataaatagtaca
gatgccgaatgggaagccgttactacaagtgagacacctctttttgaagccaatttcact
cgttatacatcaagttccagtgaaaaaatcatgcaacaattagtatacgactttgcatac
atcgggattaaagtattagatgctcatgctggcacttggaacggatgggaagaggaagaa
ccagtagatccaaaatttatgcaaatctcaacggggagaaatattgtaggaatttggggt
atgccaggttatgattataatgacgctatcagcatgattgaaccattatacaaaacaaat
gcgacttataatacagcgcaattaaataataatactctcgatgatataatttctgaaaat
tatctattaactggagaagcccgtgcggaatcatttgataatatcgtctataaagtgatg
gtcgaaaattgcccatctatgtatcttttccaacgtggggatctaattacctataacaac
aaatttgttagtaatattaatgatctcctcaatatattgggcagatggtattggtataat
attaaatatattccacaaaaggatcttagaatccttagaggtactttagccactattata
gtagtttttgcaggttttgtttctgcttccttaattcggtacaggattaaaataaaaaat
ctacagttcacttcgtga
DBGET
integrated database retrieval system
