Psychrobacter sp. YP14: DLE54_05855
Help
Entry
DLE54_05855 CDS
T05488
Name
(GenBank) ABC transporter
Organism
psyy
Psychrobacter sp. YP14
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC_membrane
SMC_N
AAA_21
RsgA_GTPase
AAA_29
AAA_22
AAA_15
AAA_30
APS_kinase
AAA_23
MMR_HSR1
AAA_14
Rad17
HUTI_composite_bact
AAA_16
DUF5906
RuvX
ABC_membrane_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWT49096
LinkDB
All DBs
Position
1394165..1396018
Genome browser
AA seq
617 aa
AA seq
DB search
MASPPKRVPLDIKPPTKKTERGALLWSILKRLGEFARPYRGLFILTLILTVLGSFTAQVN
AFVLQYTIDTLTGIVGLPDPWIKGLKLLTLISSILLAKEVLNVFITFGQRYFGERIRINL
SRDLSQKVVDRILSYKMSFYTSDENASGKLQTRIDLGVSSLTQLVQNFFIDMLPLFASAI
VSLVIMFNANFWVGMVGLIIVPIYFFVSQQQANRLQGFRKQMRQYRETKSGLVISIIDSI
TVIKSFVREPIESDKHWEIQKDMTTNQLRIRSIAFMYNAGKSFIEQIGVVVIIVLTSYFV
LNGQMTIGAIMFHILLFQNVAAPIRELHRIYDQINNALTYAEGFFDILDDDDAIERAGEI
ECTDLKGHIELKDVNFSYPNGKQALKDVSFEIHPNRITALVGLSGAGKSTIINLLVKFYD
PSSGTICLDGQSLDNYNTHNLREQIGLVLQKNHIFSGTIADNIRYGNMQATDDEIMEAAK
QASIHEQIMGMPEGYDSEAKMLSGGQQQRIALARMFLKNPPIVFLDEPTASLDAIATQQI
KHSLDLIKKDRTVIIVSHNISQIIDADDLIVIDNGRVVETGTHEELYAQHGAYYDIFNAM
SDSLNLDKISHTLKSDV
NT seq
1854 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcctcacctccaaaacgtgtccccctagatatcaaaccgcccaccaaaaaaaccgaa
cggggggcattgctgtggtcgatattaaaacgactgggtgagtttgctcgcccttatcgt
ggcctgtttatcctaaccttaattttgacggtattggggtcgtttaccgctcaggttaac
gcattcgtgctgcagtacaccattgatactttaacgggtatcgtgggtttacctgacccg
tggattaaaggcctgaagctattaaccttaattagtagtattttattggctaaagaggtg
ctcaacgtttttatcaccttcggtcagcgctattttggtgagcgtattcgtattaactta
tcgcgcgatttatcacaaaaagtcgtcgatcgtattttgtcctacaaaatgtcgttttat
accagtgatgagaatgccagcggtaagctgcagacccgtattgacttgggcgttagcagt
ttgacgcagctggtacaaaacttctttatcgacatgctgcctctattcgccagtgccatt
gtgtccttggtgattatgtttaatgccaacttttgggtgggcatggtcggcctaattatt
gtgccgatttatttctttgttagtcaacagcaggccaaccgcttacaagggtttcgtaag
caaatgcgccaatatcgagagaccaaaagcggcctggtgatctcaattattgactctatc
accgtgattaagtcctttgtgcgtgagccgattgagtcggataagcactgggaaattcaa
aaagacatgaccaccaatcagctacgcatccgcagtattgcgtttatgtataatgccggc
aagagctttatcgagcaaatcggggtggtggttattatcgtcttgacttcatattttgtg
cttaatggccagatgaccattggtgcgattatgtttcatattttgctgtttcaaaacgtc
gctgcacctattcgcgaattacaccgtatttatgaccaaatcaacaacgccctaacctac
gctgaaggcttctttgatattttagatgatgatgacgccattgaacgtgctggtgaaatt
gagtgtacggatttaaaaggccatattgagcttaaagatgtcaatttctcctatcctaat
ggcaagcaggcgttaaaagatgtcagctttgagattcatcccaatcgcatcaccgcattg
gtcggcttaagtggcgctggtaaaagcaccattattaatctactggtgaagttttatgac
cccagcagcggtactatttgtctagatggtcaaagcctagataactacaatacgcataat
ttgcgcgaacaaattggattggtactgcaaaagaaccatattttttcgggtaccattgct
gataatattcgttatggtaatatgcaggccaccgatgatgagattatggaggcggccaag
caggcgtctattcatgagcagattatggggatgcctgagggctatgatagcgaagcaaaa
atgctttcaggaggacagcagcagcggattgcgctggcacgaatgttcctaaagaacccg
cctattgtgttcttagatgagcctacagcaagccttgatgccattgcgacccagcagatc
aaacacagcttggacttaatcaaaaaagaccgtacggtaattattgtctcacacaatatt
tcccaaattatcgatgctgatgatttgattgtgattgataatggccgcgtggtcgaaacc
ggtacccatgaagagctgtatgcccagcatggcgcgtattatgatatctttaacgccatg
tcagacagcttaaatttagataaaataagccacactctcaaaagcgatgtctaa
DBGET
integrated database retrieval system