Psychrobacter sp. YP14: DLE54_10335
Help
Entry
DLE54_10335 CDS
T05488
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
psyy
Psychrobacter sp. YP14
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Hpt
Response_reg
HATPase_c
CheW
PDE8A_N
VpsR
HATPase_c_3
cREC_REC
GPR128_GAIN_subdomA
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWT49859
LinkDB
All DBs
Position
complement(2523254..2528047)
Genome browser
AA seq
1597 aa
AA seq
DB search
MSDQPNALFTARWMLPLLKQQLLELHNKQLKQPATADNLAQICHGYQQVFEKLHSADLVD
FANVAQAIYNTTCAVSSQQLNPQVLPSVVTASKQLLQELSYYVEIGTYQPDILHQCEQHL
QQLSTGAVKGHLKKNSKHKPEHDIKPAQVKQEDNSTEDDRVIIALPARYDTELSLDQTLT
SSQPKQTDFATDSALYDKRGYKRLSHSKTYPTKPDSSIQHSQSLASLHSTKAAGLSELLK
STVDEVHLPSDDPDCDVEIKQIFVEEAQEVLQAITEAMAQLTPRLQDKVQLGEVGRGFHT
LKGSGRMVGAHTIAELAWAIENMLNRLLDDSIEPTTGIWQLLTEVVAQYPALVAIFAEPA
SADKPPLYPSKIVDQIAAANLYANNKHTEFDDWQLLQPQLSKAIEAINDDQAHLPQRLPL
SLDAAAPAQSTALRNSVDNAIDEADLAQVFIAEATELLQSIDAMLAQHQDSSSFEVDDKL
LRAFHTLRGAASSQSLTTISQLSAAVEQDLEQLQQSDQLITPSYADTLRQSIELIKSHLQ
QQYPHPYLEQTRDNDTQHHVGLKDAPIDAPIAEHHDDVKEVDSDIGSHVALSVAELIDGI
DDLLDAEWRLLPLAHTTNEPIEDNEAEQSSEQSLSQQSLQGYVDDMLQQIKQLSLRVGHS
AKFISVLNCLQLVYQAFSNDIELAQKWLHDRRRLALLIAVHEQLTGLFDALAGRMTLKVD
DTLLAQLGDELNKAQASRPLINRFSADPKSKQGLSDDNEQQNTEADAELLAIFIEEAQQL
DTDSQEQLRLWQQNPADLAPVNVLLRYLHTLKGGARMAGIDSLAELTHEAETLYEYLLDQ
QIVPDANWVALMQSVQDTLSAQVDSLVRQGQSFFVPELVAKLQTIVRSKRLPESDVKPIQ
LYTEGDTAADHDKVSVKATIMAENKAPKAQSTENVDHKQSTHDISQMPPSLLRSESGATQ
DSSNEMIRVPAKLMEQMIDLSAESAIRRSSIELNMSSVAGTLSEMESTVQRLAEQLRRMD
IELEAQIRSQIEDHVLQADQSFDPLEIDQYSALNQLSKSLSESASDLLEIRTSLRSKTRE
TESLLLQLSQTQTQMQEGLMSSRMAPFSRLLPRLQRTLRQTANEVGKEAKLELITDIDEI
DRTVLERLTAPLEHMVRNAIDHGLETPDQREALGKPRTGHIIIEMDRKGSEIVIRVKDDG
QGIDVNSVRKKAIACRLMDAQDNTLSDLEVMQYIFHAGLSTASSLTQISGRGVGMDVVLN
EVRQLGGNVTVHSSANQGTEFTLTLPLTLAVIEALVVRAGDQTYAVPLLQIERIERIAAQ
RLSSLYDSKRNRNQNGSPNTVGGHESAQLNVGGKPYRVRYLTQLLSGETVDVKVFDTQDS
LPVLLIKHHAGQSFALHVDEIIGSRSEVVVKPLGRPLSSIAGLSAATITAEGSVMLILDV
QTLIRKASLPISAQSRLSGGTQPERVIQNPAPATKSIKPQILIVDDSVTVRKVTARMLQR
QGYQAHVARDGVEAVEMLQTLRPDLMLLDIEMPRMDGFEVATHVRHNQAISHLPIIMITS
RSGDKHRQRALKIGVNAYLGKPFQEAKLVALIQNLIS
NT seq
4794 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcgatcagccaaatgccttattcaccgcccgctggatgctaccgctactaaaacag
caactgcttgaactgcataataaacagcttaagcagcctgccaccgctgacaacttggcg
cagatttgtcacggctatcagcaagtttttgaaaagctgcacagtgctgatttggttgat
tttgcgaatgtggcacaggctatttataacacgacttgtgctgtaagctcccaacagctt
aaccctcaagtattgccttcggtggttactgccagtaagcagctgttacaagagctgagc
tattatgtagaaattggtacgtatcagcctgatattttgcatcaatgtgaacagcattta
cagcagcttagtacaggcgctgtaaaaggccatctgaaaaaaaatagcaaacacaaacct
gagcacgatattaaaccagctcaggttaagcaagaggataacagcactgaggacgaccgg
gtaattattgcgctgcctgcccgctatgatactgagctgagcttagatcaaaccctaacg
agcagtcagccaaaacagacggactttgccactgacagcgcgctttatgataagcgcggt
tacaaacgtctgtcccattctaaaacttaccccaccaagcctgactcaagcattcagcac
agccaatctttggcatctttacacagcactaaagccgctggtctatctgagttattaaaa
agcaccgtcgatgaggtgcatttgccaagcgatgaccccgactgtgatgttgaaataaag
caaatcttcgttgaggaagcacaagaggtgctacaagcgataaccgaagcaatggctcag
cttacacctcgcttgcaggacaaagtgcagctcggtgaggtgggccgcggttttcatacg
ctaaaggggtcggggcgtatggttggagcacataccatcgctgagctggcttgggccatt
gaaaacatgcttaatcggctcttagatgacagtattgagccgacgacaggcatctggcag
ttactcacagaagtggtggcacaatacccagcgctggtagcgatattcgctgagcctgct
tctgcagacaagccgccgctttatccctcaaagatagtagatcagatagccgctgctaac
ttatatgccaacaacaaacacacagagtttgatgattggcagctgcttcagccacagctt
tctaaagctatcgaagctataaatgacgaccaggctcatctgcctcagcgcctaccgctg
tctttagacgccgctgcaccggcacagagtactgcgcttagaaacagtgtagataatgcc
attgatgaggcagatctggcgcaggtgtttattgcagaggccactgaactgctgcaaagt
atcgacgctatgctggcacaacaccaagactcatcaagctttgaggtggatgacaagctg
ctgcgcgccttccataccttgcgaggggcagccagtagccaatctttaaccaccattagc
cagttaagtgccgcagtagagcaagatctagagcagctgcaacaaagcgatcagctgatc
actccaagctatgcggacaccttgaggcaatcaattgaactgataaaaagtcacttacag
cagcagtatccgcacccgtatttagagcagacacgcgataatgacacccagcaccatgtt
ggcctaaaagatgcgccgatagatgcaccaatagctgagcatcatgatgatgtcaaagag
gtagatagcgatattggtagtcatgtggctcttagtgtggctgagctgattgacggcatc
gatgacctattagatgcagaatggcgtctgttgccgttggcacatacaacaaatgagccg
atagaggataatgaagctgaacaaagcagtgagcagtctttatcgcagcaaagccttcaa
ggttatgtggacgatatgcttcagcaaattaagcagctgagcttacgtgtgggtcattct
gccaaatttatcagtgtcctaaattgtttgcagttggtatatcaagcatttagtaatgac
attgaacttgctcaaaaatggctgcacgaccgccgaaggcttgctcttttgattgccgtg
cacgagcagttgactggcttatttgacgctttggcaggtcgcatgacgctcaaagtggat
gacacattattggctcagctcggtgatgagttaaataaagctcaggccagccgacctttg
ataaaccgattcagtgctgaccctaaaagcaaacagggtttaagcgatgataacgaacaa
caaaacaccgaggcagatgctgagctgcttgccatctttatagaagaagcacagcagctt
gatacagatagccaagagcagttgcgcttatggcaacaaaacccagcggatttagcaccg
gttaacgttttgctgcgttatctacacaccttaaaaggtggggcacgcatggctggtata
gatagcttagctgagctgacacatgaagcggagacgttatacgagtatttgttagatcag
caaattgtgcctgatgctaattgggtggcactgatgcagtcagtacaagataccttgtcc
gctcaagtagacagtttggtgcgtcaagggcagtcattttttgtgcctgagctggtggcc
aaactgcagaccatagtacgtagcaagcgactaccggagtctgatgttaagccgattcag
ctttacacagagggggatactgcggctgaccatgataaagtgtctgttaaagctactata
atggctgaaaataaggcgccaaaggctcaaagtactgaaaacgttgaccacaaacagagc
acccatgatatcagtcagatgccacctagcttgctaagatctgagagtggtgcgacgcaa
gatagcagcaacgagatgattcgggtgcctgccaagctgatggagcagatgattgattta
tcggcagagtcggctattcgtcgttcaagtattgagctcaatatgagcagcgtggcaggt
acgttaagtgagatggagtctaccgtacagcgtctggcagagcagttgcggcgtatggat
attgagcttgaggctcagatacgctctcagattgaggaccacgtcttacaagctgatcaa
agctttgatccgcttgagatagatcagtactcagcgcttaatcagttgtccaagtctttg
tccgaatcggcgtcagacttattggagattagaaccagcttgcgcagcaagacccgtgag
acggagagcttattgctgcagctgtcacagactcagacccagatgcaagaggggctgatg
agctcaaggatggcgcctttttcgcggctactgcccagattgcagcgtacgcttcgacag
accgcaaatgaggtgggtaaagaggccaagcttgagctcatcaccgatatagatgagata
gatagaactgtgcttgagcgcctcactgcaccacttgagcatatggttcgcaacgccatc
gatcatggcttagagacaccagatcagcgcgaagcgttaggcaagccgcgcacaggtcat
atcatcattgagatggaccgaaaaggcagcgaaattgtcattcgtgttaaagatgacggt
caaggtattgatgtcaattctgtgcgtaaaaaagcaatcgcttgcaggcttatggatgcc
caagacaataccttaagtgatctggaagtgatgcaatatatcttccatgcagggctgtcg
accgccagtagcctcactcagatatcagggcgcggtgtgggcatggatgtggtgctcaat
gaagtacgccagctggggggtaatgtcaccgtgcactccagtgctaatcaagggacagag
ttcaccctcacattaccactgacccttgcggtgattgaggctctggtggttcgggcaggg
gatcaaacttatgccgtgcctttattacaaattgaacggattgagcgaatagcggcacaa
cgtttgagcagtttgtatgattctaagcgtaatcgcaatcaaaatggatcgccaaatacc
gtgggcggtcatgagtcggcacagcttaatgtggggggtaaaccgtatcgagtacgctat
ctgacccagctgctatccggtgagacggtggatgttaaagtattcgatacgcaagacagc
ttaccggtgctgttaattaaacatcacgctggacaaagctttgcactacatgtcgatgag
attataggctcacgctctgaggtggtggttaagccattaggccgtccgctatcaagcatc
gctggcttatcggctgccaccattacggctgaaggctcggtcatgcttattttagatgtg
cagaccttgatacgtaaagcatcgcttcccataagtgctcagagtcgattaagtggcggt
acacaacctgagcgggtcattcaaaacccagcgcctgctaccaaatccattaagccacaa
atcttgattgttgatgactcggtaacggtgcgcaaggtaaccgcacgcatgctacagcga
cagggttatcaagctcatgttgctcgtgacggggtagaggcagtcgagatgctacaaacc
ttgcgccctgatttaatgctacttgatattgagatgccacgtatggatggctttgaggtg
gctacccatgtgcgtcacaatcaggctatcagtcatctgccaatcattatgattacttcg
cgtagcggtgataagcaccgtcagcgggcgctaaaaataggggttaatgcctacctgggc
aagccattccaagaagcgaaactggtggcgcttattcaaaatctcatcagctaa
DBGET
integrated database retrieval system