Paenibacillus taichungensis: ACJYJG_20615
Help
Entry
ACJYJG_20615 CDS
T11411
Name
(GenBank) BclA C-terminal domain-containing protein
Organism
ptac Paenibacillus taichungensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
BclA_C
CBM_5_12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XLM63608
LinkDB
All DBs
Position
complement(4590053..4595497)
Genome browser
AA seq
1814 aa
AA seq
DB search
MSDERKRVNIKAFLEGRSFRAGSPFIPITSSEVEQFESILKALAVTIPSAVSQPTATNII
ALQNSLRSLLNFVNTSGFRAGVKAELQSVLELTIAGSEVVPVAVINLAGNLQNLLDDLLS
VTLLLEVPPTEKDKLVGLIRSISVSLSRATSSFGTSGAPGPPGPPGVPGVPGVPGVPGPA
GPGGAAGPVGPVGPVGPQGVPGPQGLPGAGLYDISVFDPAQAPSYVLGQVVSYNGSLYVV
DLNSPTGVPGSSPDYTLFLSGGTTGATGAGLSGSVPFDPALSQGYPAGQIVTFGGSTYIT
NVASPTGTPGSSTDYTLLAAAGATGATGATGVGLGGSVPFDPAVAPTYPAGQVVTFNGST
YITNVASPTGTPGTSPDYTLLAGAGPTGPTGVTGATGVGLSGIVPFDPAVAPTYPAGQIV
TFDGSTYITNVAPPTGTPGTSPDYTLLAGAGATGSTGATGVGLNGAVPFDPAVAPTYPAG
QVVTFDGSTYITNVASPTGTPGTSPDYTLIAGAGPTGPTGVTGATGVGLSGIVPFDPAVA
PTYPAGQVVTFDGSTYITNVASPTGTPGTSPDYTLLAGAGVTGATGATGVGLNGVVPFDP
AVAPTYPAGQVVTFDGSTYITNVASPTGTPGTSPDYTLLAGAGPTGPTGVTGATGVGLSG
IVPFDPAVAPTYPAGQVVTFDGSTYITNVASPTGTPGTSPDYTLLAGAGATGSTGATGIG
VTGATGDPGATGATGAGLTGVVPFDPAVAPTYPAGQVVTFDGSTYITNVASPTGTPGTSP
DYTLLAGAGATGATGATGIGVTGATGDPGATGATGAGLTGVVPFDPAVAPTYPAGQVVTF
DGSTYITNVASPTGTPGTSPDYTLLAGAGATGVTGATGIGVTGATGDPGATGATGAGLTG
VVPFDPAVAPTYPASQVVTFDGSTYIANVASPTGTPGTSPDYTLLAGAGATGVTGATGVG
VTGATGDPGATGATGAGLTGVVPFNPAVAPTYPAGQVVTFDGSTYIANVASPTGTPGTSP
DYTLLAGAGATGVTGATGIGVTGATGDPGATGATGAGLTGVVPFDPAVAPTYPAGQVVTF
DGSTYITNVASPTGTPGTSPDYTLLAGAGATGVTGATGIGVTGATGDTGASGATGAAGIT
GTTGVTGITGATGIGVTGPTGATGITGITGATGVSVTGSTGATGVTGITGATGVSVTGPT
GATGITGVTGETGITGVTGITGATGIGVTGSTGATGVTGITGATGVSVTGSTGATGVTGI
TGATGVSVTGSTGATGITGETGVTGVTGITGATGIGVTGSTGATGITGVTGETGVTGVTG
ITGATGIGVTGSTGATGITGVTGETGITGVTGITGATGIGVTGSTGATGVTGITGATGVS
VTGSTGATGVTGITGATGVSVTGSTGATGITGETGVTGVTGITGATGIGVTGSTGATGIT
GVTGETGVTGVTGITGATGIGVTGSTGATGITGVTGETGITGVTGITGATGIGVTGSTGA
TGVTGITGATGVSVTGSTGATGVTGITGATGVSVTGSTGATGVTGTTGATGVGVTGSTGA
TGVTGLTGATGVAIGITGATGVTGITGTTGVSGTTGVTGATGASVTGGTGATGASGGTGT
TGATGATGATGATGASVTGSTGSTGFSGATGATGVTGATGATGVSVTGATGATGATGATG
TSVTSNSAYSENTSGTILVLLGGTLIPLPNNQNIGTGITINGANDTFTLANAGRYYISYK
INLTAALAIQSRILLNGTAIPASVVSPLLSLSQLQSDFIVTVTAGSTIQFQLFGLAATAV
LSPPGATINIIQLA
NT seq
5445 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgatgaaagaaaacgggtcaatattaaagcttttctggaaggaagatcgtttcgg
gcaggatcaccctttattccaataacatcgagtgaagtggagcagtttgaatcgatttta
aaagcgttggcagtgactattccttcagctgtcagtcagcctactgcgactaatataatt
gcgttgcaaaacagtttacggagcttgctcaactttgttaatacctctggtttccgagct
ggagtgaaagcggagttgcaatccgttctggaactaaccattgcaggttctgaagttgtg
cctgtagctgttattaatctagcaggcaacttgcaaaatttactcgatgatttattaagt
gtgacgttacttttggaagttcctcctacggaaaaagacaaactggtcgggctgattcga
tccatatccgtatcattgagtcgtgctaccagttcatttggtacatcgggagcccctggt
cctccaggtccccctggagttccaggagttccgggtgtacctggagtgccaggtccagcc
gggccaggaggagcagctggacccgtaggacctgtaggacctgtaggtcctcaaggcgta
ccaggaccgcaggggttgccaggagctggactatatgatatttccgtgtttgatcccgct
caggcacctagctatgtgctaggtcaagttgtttcgtataatggcagtctttatgttgta
gatctcaatagccccacgggtgtgccgggaagttctccagactacacgttgtttttgtca
ggcggaacaactggagcaacaggggcaggtttatcaggctctgttccgtttgatccggcg
ctctcacaaggttatccggcaggacaaattgtaacctttggcggtagtacctacattact
aatgtggcatcgccaacgggaacaccaggcagttcaacagattatactttgctagcagcg
gccggagctactggagctactggggcaacgggtgtgggactgggtggttctgttccgttt
gatcccgcagttgcaccaacgtatcctgcgggtcaggtcgtaacatttaacggcagtacg
tatataacaaatgtggcatcgccaacgggaacgccgggaacatccccggattatacattg
cttgcaggcgcagggccaacggggcctacgggtgtaacgggagcgactggagtaggtttg
agcgggattgtaccgtttgatccggcggtagcaccaacctatccagcgggtcaaatagtg
acgtttgacggtagtacctatattactaatgtagctccaccaactggaaccccaggtaca
tcaccagactacacattgcttgcaggcgcaggagccaccggttcaaccggagcaacaggc
gtgggcttgaatggagcagttccgtttgacccagcagtagcaccaacgtatcctgcaggt
caagttgtaactttcgatggcagtacgtatataacaaatgtggcatcgccaacgggaacg
ccgggaacatccccggattatacgttgattgcaggcgcagggccaacagggcctacgggt
gtaacgggagcgactggagtaggtttgagcgggattgtaccttttgatccagcagtagcg
ccaacgtatccagcgggtcaagtggttacgtttgatggcagtacgtacattaccaatgtt
gcatcgccaacagggacgccgggaacatccccagattacactttgcttgcaggtgcaggt
gttacaggtgcaaccggagcaacaggcgtaggcttgaatggagtagtaccgtttgatccc
gcagtagcaccaacgtatcctgcgggtcaagttgtaactttcgatggcagtacgtatata
acaaatgtggcatcgccaacgggaacgccgggaacatccccggattatacgttgcttgca
ggcgcagggccaacggggcctacgggtgtaacgggagcaactggagtaggtctgagcggg
attgtaccgtttgatccagcagtagcgccaacctacccagcgggtcaagtcgtgacgttt
gatggcagtacgtatattaccaatgtggcatcgccaacaggtacaccgggaacatcgccg
gattacacattattggcgggtgcaggagccacgggttcgacaggggcaacgggcatcggt
gtaacgggcgcaactggagatcctggtgcaacgggcgccacaggtgcgggcctgacaggc
gtcgtcccattcgacccagcagtagctccaacgtatccagcgggtcaagtggttacgttt
gatggcagcacgtatattaccaatgtggcatcgccaacaggcaccccaggaacatcgccg
gattacacattattggcgggtgcaggagccacgggtgccacaggggcaaccggtattggt
gtaacaggcgcaaccggagatcctggtgcaacgggcgccacaggtgcgggcctgacaggc
gtcgtcccattcgacccagcagtagctccaacgtatccagcaggtcaagtggttacgttt
gatggcagcacgtatattaccaatgtggcatcgccaacaggcaccccaggaacatcgccg
gattacacattattggcgggtgcaggagctacgggtgtaacaggggcaaccggcatcggt
gtaacgggtgcaaccggagatcccggtgcaacgggagccactggtgcgggcctgacaggc
gtcgtcccattcgacccagcagtagcgccaacgtatccagcgagtcaagtcgtgacgttt
gatggcagtacgtatatcgcgaatgtggcatcgccaacaggcaccccaggaacatcgccg
gattacacattattagcgggtgcgggagctacgggtgtaacaggggcaacgggagtaggc
gtaacgggcgcaaccggagatcccggtgcaacgggagccaccggtgcaggcctgacaggc
gtcgtcccattcaacccggcagtagccccaacgtatccagcgggtcaagtggttacgttt
gatggcagtacgtatatcgcgaatgtggcatcgccaacaggcacaccgggaacatcgccg
gattacacattattggcgggtgcaggagccacgggtgtaacaggggcaaccggcatcggt
gtaacgggtgcaaccggagatcccggtgcaacgggcgccaccggtgcgggcctgacaggc
gtcgtcccattcgacccagcagtagccccaacgtatccagcgggtcaagtggttacgttt
gatggcagcacgtatattaccaatgtggcatcgccaacaggcaccccaggaacatcaccg
gattacacattattggcgggtgcaggagccacgggtgtaacaggggcaacgggcatcggt
gtaacgggtgcaaccggagataccggtgcaagcggagccactggagcagcgggaataacc
ggaaccaccggggttacaggaataacgggagccacaggaatcggtgttacgggaccgaca
ggagccaccggaataacaggaataacgggagccacgggtgtcagtgtcacgggatcgaca
ggagccaccggagtaacgggaataacgggagccacgggtgtcagtgtcacgggaccgaca
ggagccaccggaataacaggagtgacgggagagaccggaataaccggggttacaggaata
acgggagccacaggaatcggtgttacgggatcgacaggagccaccggagtaacgggaata
acgggagccacgggtgtcagtgtcacgggatcgacaggagccaccggagtaacgggaata
acgggagccacgggtgtcagtgttacgggatcgacaggagctactggaataacgggagag
acaggagtaaccggggttacaggaataacgggagccacaggaatcggtgttacgggatcg
acaggagctactggaataacaggagtgacaggagagacaggagtaaccggggttacagga
ataacgggagccacaggaatcggtgttacgggatcgacaggagctactggaataacagga
gtgacaggagagactggaataaccggggttacaggaataacgggagccacaggaatcggt
gttacgggatcgacaggagccaccggagtaacgggaataacgggagccacgggtgtcagt
gtcacgggatcgacaggagccaccggagtaacgggaataacgggagccacgggtgtcagt
gttacgggatcgacaggagctactggaataacgggagagacaggagtaaccggggttaca
ggaataacgggagccacaggaatcggtgttacgggatcgacaggagctactggaataaca
ggagtgacaggagagacaggagtaaccggggttacaggaataacgggagccacaggaatc
ggtgttacgggatcgacaggagctactggaataacaggagtgacaggagagactggaata
accggggttacaggaataacgggagccacaggaatcggtgttacgggatcgacaggagcc
accggagtaacgggaataacgggagccacgggtgtcagtgtcacgggatcgacaggagcc
accggagtaacgggaataacgggagccacgggtgtcagtgtcacgggatcgacaggagcc
accggggttacaggaacaacgggagctacaggagtcggtgttacgggatcgacaggagcc
accggggtaacgggattaacgggtgcaacgggcgttgcgattggaatcactggagccacg
ggtgtgactggaattacagggactacaggagttagtggaacaactggggttacaggagct
acaggggccagtgtaactggaggaacaggcgcgacaggagcaagcggaggaactggtact
acaggggcaacaggagcaacaggagcaacaggagcaacaggagctagtgtaactggaagc
acaggatcgactggatttagtggagccacaggagctactggagtaacaggagcaacaggt
gctaccggagtgagcgtcacaggagccacaggcgcgacaggagccaccggagccacagga
acctctgtaacatctaactcggcatacagtgagaacacaagtggtaccattcttgtactt
ttgggtggaacactgattccattgccgaataaccaaaatatcggcactggcataaccatc
aatggagcgaatgatactttcactcttgccaatgcagggcgttactatatctcttataaa
ataaatttaacagccgcacttgctattcaatcccgtattttactaaacggaacagcaatt
ccggcgagtgtagtttcgccattactttccctcagtcagttgcagtctgactttattgtg
acggtaactgctggatcaacaatccagttccaattatttgggctagctgctacagctgtt
ctctcccctccaggagcgacaataaacattattcaattagcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
