Candidatus Phycorickettsia trachydisci: phytr_5370
Help
Entry
phytr_5370 CDS
T05372
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ptc
Candidatus Phycorickettsia trachydisci
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PQQ_2
Beta-prop_ACSF4
PQQ
Proteasome_A_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVP87482
UniProt:
A0A2P1P888
LinkDB
All DBs
Position
complement(599236..600489)
Genome browser
AA seq
417 aa
AA seq
DB search
MMNKLFGLLLIGIMISSCGSKGNKLHPIPSFTPSLSKEVSNFVPKFPKSVEVNKWTGIGF
MNDVSGNIRVRSIDFKFGKSPFKIKAEIATAPFIIDDKLFILDKQNNAYCFDLAGNKKIW
QTNLSLTNKNNLIFSGGITVDKDRVYVTNNTKELIILEKDTGYEVSRIKLTNIIFNPAVC
DEKNVYVIVGGNQIFAFDKENLSLNWQVGGVENNISVASNNFTQPIALKNSLIVPSITGD
VISVNKNDGSLIWHFAALEGNILAPKNLYSNPSAQMLIDSHAITVPYVHGIFVKLDISKG
TPVWQKSIYDVLSLNRLGNFTVFNNNAQQVVGLSDKTGQVIWTVDLLEPKQKKSYNLLTP
IMFNDVINVFSSQGKLYQISPEGSLLKEIKVPKDASFYAVWGQNVYLFAGKHIWINR
NT seq
1254 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaataaactttttggtttgttgttaattggaattatgattagcagctgtggtagc
aaaggtaataaattacacccaataccatcttttacacctagccttagtaaagaagtttct
aattttgttcctaaatttcctaaatcagttgaggtaaataaatggactggaattggtttc
atgaacgacgttagtggtaacataagggttcgaagtattgattttaaatttggaaaatct
ccttttaaaataaaggcagaaattgcaacagctccattcataattgatgataagttattt
attttagataaacaaaataatgcatattgttttgatttagctggaaataaaaaaatatgg
caaacaaacttaagcctaacgaataaaaataatcttatatttagtgggggtataactgtc
gataaagacagggtatacgtcactaataataccaaagaattgattattttagaaaaggat
acaggttacgaagtttcaagaataaagcttacaaatattatcttcaatccagcggtatgt
gatgaaaaaaatgtttatgttatcgttggagggaatcaaatttttgcttttgataaggag
aatctttcacttaattggcaagttggtggtgttgaaaataacataagtgttgcaagcaat
aacttcactcagcccatagctttgaaaaactcgttaatagtgccatccattacgggtgat
gttataagtgtaaataaaaatgatggttcgcttatatggcattttgcagctctggaaggt
aatattttagctccaaaaaatctttactcaaacccttcagctcaaatgttgatcgactct
catgcgataactgtgccttatgttcatggaatatttgtaaagcttgatatttctaagggt
actccagtttggcaaaaatctatatacgatgttctatctttaaatcgtttaggtaatttt
acggtgtttaacaataatgctcaacaggttgtaggattatctgataaaacggggcaagtt
atatggactgtggacttgctagaacctaaacagaaaaaaagttataatttgttaactccg
ataatgtttaatgacgttattaatgtatttagttctcaaggcaagttgtatcaaattagt
ccagaaggatctctgttaaaagagatcaaggttccaaaggatgcttcattttatgctgtt
tggggacaaaatgtatatctttttgctggtaaacatatttggattaatagatag
DBGET
integrated database retrieval system