Candidatus Phycorickettsia trachydisci: phytr_5540
Help
Entry
phytr_5540 CDS
T05372
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ptc
Candidatus Phycorickettsia trachydisci
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVP87499
UniProt:
A0A2P1P899
LinkDB
All DBs
Position
complement(615307..617544)
Genome browser
AA seq
745 aa
AA seq
DB search
MDKLPGNKFINLNLLKNYYIDGSFGDVLILMFIHAGHNPQYLEAAQYIYEHFKSEPGSEE
SMKVIFKIVLMNICHMVNHCSDEGHPKRITLERFTEIFNFLCGKYDVEAESFLELIKPCK
VEFRDICLEKARKAQKYLGEPAEVVFIPLNHLIDFDHVANIMYKFIACQSLSTDEIDELL
TKRIDLVGFKFITHEAKRMVKRNSIVMTVDFFAQLADNKTFKWFIENIKMRPIYVDCKLR
LQTRIAKDLFTEGHFSDCQKAVAKMDSLLEDLEFDGIDDMRSKLTTFNALNFKAEYYFAC
NNILEGIYSLLASYKLSPEDAFTNTHTWVLNLRFLDPLKRKEVLDQFKINWPIPGELKMK
LLRFFKKGYELFEEPSNQNFKEYEKIKERLGEFSEFRLNEAINQIFITHSLYFYASCNKM
KEVYDLLGILKSRSYILDQEYSLTILDILYNIPTDQKLFNMLEKSNFFSLEVLPNILAWE
VYLKLSQQTLDVRYWNKAMYYLDKANSIFYANSEVLKNFKNLIISSNKITVIEANKVGIK
CYKFFNLISKISSYEDFKKFEEYLNGLHQKVLEKDTDRDEFTIYRDERDAYYGELVRENA
SLTRNLRVIKNNVSHWRIGDKLVSSKDLDSLKIADNKIFVLIDSALSSKEIAKLYKALEA
GMSLDTTSLKLSLSKDILEKINVAKIYTDYSTGDELIYLATSKSPDTPSSDIETDASNQK
IESSVDEIIAEKLGDSVTKDFDAYY
NT seq
2238 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacaaattaccgggaaataaatttataaatttaaatttattaaagaattactacata
gacggatcttttggtgacgttttaattttgatgttcattcatgctgggcataatccccag
tatttagaagcagcacaatatatatatgaacatttcaaatcagagccgggttctgaagag
agtatgaaagtgatattcaagatagtgctcatgaatatatgtcatatggttaaccattgt
tcggatgaaggtcatccaaaaaggataaccttagagagatttactgaaatattcaatttt
ttgtgcggcaagtatgatgtagaagctgagtcttttttagagctaattaaaccatgtaaa
gtagaatttcgcgacatatgtttggaaaaggctagaaaagcgcaaaaatacttaggagaa
ccagctgaggtggtgttcattccactgaatcatttaattgattttgatcacgtggctaac
ataatgtacaaatttatagcctgccagtctttatctacagatgaaattgatgaacttctt
actaaaagaatagacttagttggatttaaattcataacacatgaggcaaaacgaatggtc
aaaagaaatagtatagttatgaccgtagattttttcgctcaacttgcagataataaaact
tttaagtggtttatagaaaatattaagatgcgtcctatttatgttgattgtaaattgaga
ctccagactcgtattgcaaaggatttgttcactgaaggtcattttagtgattgtcaaaaa
gctgtagctaaaatggacagtttattagaagatcttgaatttgatggaatagatgatatg
agaagcaaacttactacctttaatgctttgaattttaaagcagaatattactttgcttgt
aacaatattcttgaaggtatttattcactattagcgagttataagttaagtcctgaggat
gctttcactaatacgcatacctgggttttaaatctaagatttttagatcccttaaaaaga
aaggaggtgcttgatcaatttaagattaactggcctattccaggagaattaaaaatgaag
cttttaaggttttttaaaaaaggttatgaactttttgaagagcctagtaatcaaaatttt
aaagaatatgaaaaaataaaagaaagattaggagaattttctgaatttagactgaacgaa
gctattaatcaaatatttataactcattctctctatttttatgcatcttgtaataaaatg
aaagaggtttatgatttacttggcatactgaagtcaagaagttatatacttgatcaagaa
tattctttaactattttggatattttgtacaatattccaactgatcaaaagttgtttaat
atgctagaaaagtccaacttttttagcttagaggtactacctaatattttggcatgggag
gtttatttaaaattatctcaacaaactttagacgttaggtattggaataaagctatgtat
tacctcgataaagctaattcaatattttatgcaaattcagaggtattaaaaaactttaaa
aatttaatcatatcaagcaataaaataactgttattgaggctaataaagttggtataaaa
tgttacaaattttttaatttaatatcgaagatatcttcttatgaagattttaaaaaattt
gaagaatatcttaatggattgcatcaaaaagttttagaaaaagatacagatagggatgaa
tttacaatatatcgagatgaaagggatgcttattatggagaattagtaagagaaaatgcg
tcactaacacgtaatttaagagttattaaaaataatgtatctcattggcgtataggtgat
aagttagtaagttcaaaggatttagattctttgaagatagctgataataagatttttgtg
ttgattgattctgctttatcgtcaaaagaaattgcaaaactatacaaggccttagaagct
ggtatgtcattagatacaacaagtttaaaattatccttaagtaaagatatactagaaaaa
attaatgtagctaaaatatacaccgattactcaacgggtgatgaattgatatacttagct
acttctaaaagtcctgatactccaagttcagatattgaaacagatgcatctaatcagaaa
attgaatcgagtgttgatgaaattattgcagaaaaattaggtgattctgtaacaaaggat
tttgatgcatattattaa
DBGET
integrated database retrieval system