Pseudoalteromonas tetraodonis: PTET_a1989
Help
Entry
PTET_a1989 CDS
T05282
Name
(GenBank) iron complex outermembrane recepter protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
ptd
Pseudoalteromonas tetraodonis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ptd02000
]
PTET_a1989
Transporters [BR:
ptd02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PTET_a1989
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
DUF6666
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATD03371
LinkDB
All DBs
Position
I:1916936..1919491
Genome browser
AA seq
851 aa
AA seq
DB search
MQLKQLFTAKKTITLSVAAALLGSWSVNAAQQETQAEENIEQISVIGSRRLGRTVEDSPV
PIDIISGDALKSSGQTETNALLSTLLPSFNFPQPSITDGSDHVRPAQLRGLAPDHTLVLV
NGKRRHSNALLNLNGSTGRGSSSVDLNAIPANAIERIEVLRDGAAAQYGSDAIAGVINIV
LKSNSSGGSLGAVYGANITEMQGVPQLESVSEDANGNLAFNEGSDRSLTDGHTLTLQGNM
GFELGDNGFLSISTEYRDRSSTNRSDYDQRENYARLPDGSLDPREFTWDRYNHNFGNGTV
EDFALFYNAGYQLTNDAELYSFGSYSKREGEGGGFYRRAQDSRNVTDIYPDGFLPVITSD
IDDFSLALGVKGFANEWNYDASAVYGQDAFNFGVIDSLNTSYGPSSQTSFDAGTLTYDQL
TINLDFSREIDADFLASGINVAVGAEYRREGYEIQAGEEASYAQGTFGPGGAVTDPVNGP
FGSAGSQVFPGFTPESAGDNSRHNVSLYIDLEAFITDNWNVAVAARYEDYSDFGDTLNGK
IATRYTLTEDLALRGSVSTGFRAPSLQQQYFTSVATVFVDGIPTQTGTFAPSSDVAVALG
SPGLDAEEATNYGVGFTWSTDFNFSLSVDYYQILIDDRIVLSNNLSGAGVASLLEGTGAN
QGRFFLNAIDSKTRGVDVVASYNLMTDNYGDVAFNLGYNYGKNEVTNIIAPPAELQSVGV
EQDNLFSGNELRRFEVSTPRNKYNLSATWTLNEWRTTLRSTRYGETQDPSEIPERNEVLK
PKWITDLDVAYALNNNITLSLGANNVFDVYPDPTRDLVSDVTTFSRLFSYSGFSPFGFNG
RYVYGKVEMKF
NT seq
2556 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaactaaaacagctatttacagcaaaaaaaaccattacactcagtgttgccgctgca
ctacttggctcgtggtcggtaaatgccgcacagcaagaaacacaagcagaagaaaatatt
gaacaaattagtgtaattggctctcgccgactcggccgcacagttgaagacagcccagtt
ccgattgatatcattagcggtgatgccctaaaaagttcagggcaaactgaaaccaatgca
ctactgagcactttattaccaagctttaatttccctcagccatcaatcaccgatggcagc
gaccatgtgcgccccgctcaactgcgtggcttagcacctgatcacaccttagtgctcgta
aatggtaaacgtcgccatagtaatgcactgcttaatttaaatggttcaaccggtcgtggg
tcatcatcggttgatttaaacgctattccagccaatgccattgagcgaatagaagtattg
cgcgatggtgccgctgcgcaatatggctcagacgccattgccggtgtgattaatattgtc
cttaaaagtaatagcagtggcggcagcctaggtgctgtatatggagcaaacatcaccgaa
atgcagggtgtgcctcaactagaatccgtttctgaagatgccaatggcaacttagccttt
aatgaaggcagcgaccgttcgcttaccgacggccacaccttaaccctgcaaggtaatatg
gggtttgaattgggcgataacggctttttaagtatttctactgaatatcgcgaccgtagc
tcaacgaatcgctctgattatgaccagcgcgaaaattacgcccgcctacctgatggctct
cttgatccgcgtgagttcacatgggatcgttacaatcataactttggtaatggcaccgtt
gaagacttcgcgctgttttataatgccggttatcagttaactaacgatgccgagctttac
tcgtttggctcttacagcaagcgtgaaggcgaaggcggtggtttttatcgtcgcgcacaa
gacagccgtaacgtaacagatatttatcctgatggctttttaccggtgatcacctcagat
attgacgatttttcattagcacttggcgtaaaaggttttgctaatgaatggaattacgac
gcttctgctgtatacggccaagatgcctttaactttggtgttattgatagcttaaacacc
tcatatggacctagcagtcaaaccagttttgatgccggtacacttacctacgatcagctg
actattaatcttgattttagccgcgagattgatgcagactttttagctagcggaattaac
gtcgcagtgggcgctgagtatcgtcgtgaaggctacgaaattcaggcaggcgaagaagcc
tcatacgcacaaggcacttttggccctggtggcgcagtaaccgacccagttaatggccca
tttggctctgcaggttcgcaagtattcccaggtttcacacctgagtctgcgggtgataac
agccgccataatgttagcctttacattgatttagaagcctttattacagataactggaac
gttgccgtcgctgcgcgttacgaagactactctgattttggcgatacgcttaatggtaaa
attgccacacgttatacgctaacagaagatttagcattacgcggctctgtatcaaccggc
tttagagcgccctctctgcaacagcaatattttacttcagtggccaccgtgtttgttgat
ggtattccaacacaaacagggacgtttgccccaagtagtgatgtagccgttgcattggga
tcaccgggcttagatgcagaagaagccaccaactacggggtaggttttacctggtcaacc
gactttaatttcagcttatctgtggattattaccaaatattaattgatgaccgtattgtg
ttatcaaataacctgtcgggtgcaggtgtagcaagcttacttgagggcactggagctaac
caagggcggtttttcttaaacgcgattgatagcaaaacccgtggcgttgatgtggttgcc
tcttacaacctaatgaccgataactacggtgatgtagcatttaatttaggctataactac
ggcaaaaacgaagtgactaatattattgccccacccgctgagctacaaagcgtaggtgtt
gaacaagataatttgttctcgggtaatgaactgcgtcgttttgaagtaagtaccccgcgt
aacaaatacaacctaagcgctacatggacactaaacgaatggcgtaccacacttcgcagc
actcgctatggtgaaacacaagacccatcagaaattccagagcgtaacgaagtgctcaag
ccaaagtggatcaccgacttagatgttgcttatgcacttaataacaacattactctgagc
ttaggcgcgaataatgtgtttgatgtatacccagatccaactcgggatttagtgagcgat
gtaaccactttctctcgtttgttctcttactcgggcttttcgccatttggttttaatggc
cgctatgtttacggcaaagttgaaatgaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
