Pseudoalteromonas tetraodonis: PTET_a3156
Help
Entry
PTET_a3156 CDS
T05282
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
ptd
Pseudoalteromonas tetraodonis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ptd02000
]
PTET_a3156
Transporters [BR:
ptd02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PTET_a3156
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
DUF7781
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATD04390
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(3023712..3026732)
Genome browser
AA seq
1006 aa
AA seq
DB search
MSNISTKKCALALAITASLSGHAIANDEAIARQSTAKASEEVVQEAPEKITVTGSRLKRD
SFSVTTPLVTMDRASIQDTGLGNLSDVLIDNMPALSESIGNTTSQSSISGTGLSTVQLRD
LGANRTLTLIDGRRVVSNSYGGNYVSLNTIPSGMVERVEIISGGASATYGADAVAGVVNI
ITQSKKEGFEFQARGGETTDGGGREFTLDLNYGTSFADDRGYVFVSSNWDRDFGMTFYDR
DRAKIEAAHSYDDELMCNQMYTADGYQCMSGITQADWASKSDGTLGGVFLESSRNDTQFW
YDGQTLRDDWKGNEEIYGINSSQYVMLDVPSDNFSTAIKVDYDVTDDIMSYFQIQYSKSG
SFNDKSPEDEYEGAYVPRYDPVTGDPIDDIEPGYIPIDNPYVPQEIIDSNPYKDRIYWDR
RFGEVGNISTDNDRTTIRTWAGLQGMMFDDTWDWDISAGYGQFKQHQIRSNELNTVRVNQ
ALQAEKLADGTIQCKDAEARAQGCVPLNLFGEGSITPEMADWIRTNPIIDTEIQQYTVMG
YITGDLYELPAGNVSAVFGAEYRKDSQSLDTSDDMKAGGITFNVVPSFYGEVEVYEAFAE
LAVPLLKDAPFAKSLSAETSLRLANYSIDNISTVASYKLGLLWQPIDGYMLRANYARAQR
APTITELLSPPRGDFDSFDDICDGLTATSTNPGHDNCRLEPTLAQKLADDPNFEFESEDN
NYSPNTGNPNLKEETADTYTFGITVSPEFLDGFNLAVDYYDIAIVDAIDEISNENIMREC
YDSEAAWGSDNEYCNDITRNDEGNIVKILQREYNLDELTARGYDVVATYKYDIGSYGNLS
FKLDYNHIIENSQTYEGLDGNSVTSQYAGYGRSKDKAAMSIVWKIDDLRIRWRTNYVGAF
KASQEDEKDYLEYVAANDERCAAGDAGCIANPEPLAYQDYGSFLKHSLSASYTLALTDKS
DLRVFGGINNVFDDKGAFYPSGRGNFYSGYGGGAGRYVYLGAQYSF
NT seq
3021 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagtaatatatcaacaaaaaaatgcgctttagcactggctataacagcgagtttatct
ggacatgcaatagcaaatgacgaggctattgctcgtcaatcaaccgctaaagcaagcgaa
gaagtggtacaagaagcaccagaaaaaataaccgtaacgggttcgcgtttaaagcgtgat
agtttttctgtaacgaccccgctggtaaccatggatagagcgtcgattcaggatacaggc
ctaggcaacctttcagatgtattaatcgataacatgcctgcactgagcgaaagtattggt
aatacaaccagccaatcaagtatttcgggtaccggtttatcaacggtgcagcttcgcgac
ttaggcgctaatagaacgctaacgcttattgatggccgccgtgtggtatcaaatagttat
ggtggtaactatgtgagtttaaatactattccaagtggcatggtggagcgcgttgaaatt
ataagtggtggtgcgtcggccacttatggagctgatgcggtagccggtgtagtgaatatt
attacccagtcaaaaaaagaaggctttgaatttcaagcccgtggcggtgaaacaacagat
ggtggcggtcgcgagtttacgcttgatttaaactacggaacgtcatttgctgatgatcgc
ggttatgtatttgtcagctcaaactgggatcgtgattttggcatgaccttttacgaccgt
gaccgcgcaaaaatagaagcggcgcatagttatgatgatgagttaatgtgtaatcaaatg
tacactgctgatggttatcagtgtatgagtggtattacacaagctgattgggcaagcaaa
agcgatggtaccttaggcggtgtatttttagaaagcagccgaaacgatacccagttttgg
tacgacgggcaaacgctgcgtgatgactggaaaggtaatgaagaaatttatggtataaat
tcgtcacaatacgtcatgcttgatgtacctagcgataacttttcgaccgcgataaaagta
gattatgatgtaacagacgacattatgagttacttccaaattcaatatagtaagagtggc
tcgttcaacgataagtcaccagaagatgaatacgaaggggcttacgtacctcgctacgac
ccagtgactggcgaccctatcgatgatattgagcccggttacattcctattgataaccca
tacgtgccacaagaaattattgacagcaacccatacaaagaccgcatttattgggatcgt
cgttttggtgaagtaggtaatatcagcactgataacgaccgtacgaccatccgaacttgg
gcaggcctgcaaggtatgatgtttgatgatacatgggattgggatatctctgctggatac
gggcaattcaagcaacatcaaattcgtagtaacgagttaaacacggtacgtgttaatcaa
gcactgcaagctgaaaagctagccgatggcactattcaatgtaaagacgccgaagcgcga
gcgcaaggatgtgtcccgcttaatctatttggtgaagggtctattacccctgaaatggct
gactggatccgtacaaacccaattattgatactgagattcaacagtacacggtaatgggt
tatatcaccggcgacctatacgaattaccagcaggtaatgtgtctgcagtatttggtgca
gagtaccgtaaagactcacaaagcctagataccagtgatgatatgaaagcgggcggtatt
acgtttaatgttgtgccttctttttacggtgaagtagaagtgtatgaggcatttgctgaa
cttgcagtgccactacttaaagatgcgccatttgctaaaagcttgtcggcagaaacgtcg
ctgcgtttagcaaattacagcattgataatatcagcactgttgccagttataagctaggc
cttttatggcaaccaattgatgggtacatgttacgtgccaattatgcacgtgcacagcgt
gcgccgactatcacggaattattatcaccccctcgcggcgattttgattcatttgatgat
atttgtgatggtctaacagcaacatcaacaaacccaggacacgataactgtcgtttagag
ccaaccttggcacaaaagctagctgatgatcctaactttgaatttgaaagtgaagacaat
aactactcgccaaatacaggtaatccaaacttaaaagaagaaacagccgatacctatacc
tttggtattactgtatctcctgagtttttagatggctttaacttagcggtggattactac
gatattgctattgttgatgccattgatgaaataagtaacgaaaacatcatgcgcgaatgt
tatgactcagaggctgcgtggggcagtgataacgaatactgtaacgatattacccgtaac
gacgaaggtaacattgtaaaaattctacagcgtgaatataacttggatgagttaactgcg
cgcggttacgatgtcgttgcaacttacaaatatgacatcggcagctatggcaacttgtca
tttaagcttgattacaatcacattattgaaaactcgcaaacctatgaaggcttagatggt
aacagtgttacttcacagtatgcaggttatgggcgctcaaaagataaagccgctatgtcg
attgtatggaaaatagatgatttacgtattcgctggcgtacaaattacgtaggcgcgttt
aaagcaagccaagaagatgagaaagactaccttgagtatgttgctgcaaacgatgagcgc
tgtgctgcgggcgatgccggttgtattgcaaacccagagccacttgcgtatcaagattat
ggctcatttttaaagcatagtttatcagcgtcttacactctggcactgactgataaaagt
gacttacgtgtatttggcggtattaacaatgtatttgacgacaaaggggcattttaccca
agtggtcgtggtaacttttatagtggctacggcggcggtgccggtcgttatgtttatcta
ggtgcacaatatagcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system