Parasteatoda tepidariorum (common house spider): 107449725
Help
Entry
107449725 CDS
T06106
Name
(RefSeq) fibrillin-1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
ptep
Parasteatoda tepidariorum (common house spider)
Pathway
ptep04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptep00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
107449725
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ptep00536
]
107449725
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ptep00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
107449725
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
EGF_3
hEGF
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
EGF_FBN_1st
Fibulin_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107449725
NCBI-ProteinID:
XP_042895517
LinkDB
All DBs
Position
7:16520918..16806718
Genome browser
AA seq
2902 aa
AA seq
DB search
MEVCRIWVLLLLQVAVILVGRQVRGEDTATSPVTVPSGGPNVCGRGPRSQCCPGWTKRSG
NGLCLVPLCRSSCGEGRCIRPNICYCGNRQVGPSCDGFGGGTSLPGVGGKVPDGGGGTNG
GSKLHPIGPGNVIHPGQGGGLCQEPCLNGGRCIGPDRCACVYGFTGRRCERDYRTGPCFR
KVRNQFCAGQLTGVVCTRQLCCATVGVAWGHPCEQCPSKLDCDRGYITNINSRTCQDVDE
CEAIPGICEKGKCVNSMGSFRCDCDEGYLYNEDAGECEDVNECEGNLDLCTHGRCVNTEG
SFNCLCDYGYVPAQNQQACLDTRQGFCYVDVSSGQCKNPLAVRLSKVECCCGENMGKGWG
EQPCEACPLPGSKSYRQLCTAASLLDINECDLRRDFCENGRCINTPSSYRCECNKGFRAV
MNDKKCDDIDECQNATLCQGGRCINSIGNFDCICPTGYDLTSDGTKCTDQDECSITGMCA
NGECVNGDGSFTCRCKPGFSLSPTRQSCIDIDECKENGRICLRGRCQNLPGSYKCDCQEG
FILSPQGDFCLDRNECEEKGMCRHGTCVNGDGSFKCICDPGYKLSPDGHFCIDINECLEL
PDSCVNGRCENTDGSFHCSCTDGMTMSPNGRICQDTRRDYCFSNYKNGECSSPSSMVVTK
SACCCANRGAMTPAWGIQCVPCPAPGSKEFLQLCPRGPGSGQEDDINECVVFPNICPNGA
CENLKGSYRCICNPGYQVDSTGKICSDVNECAVNLLLCDNGQCRNTPGSFQCTCPIGYRH
NIQTNTCDDVDECKERGSEICIGGTCFNTLGSYQCECEPGSALDASRNTCIDNRRGSCWM
SVKNGRCENDIKFPMLKSECCGTVGKAWGSPCQLCTGIENRCPKGYAMLDGSTCTDVNEC
EVFPGICQGGGLCVNVEGSYRCNCPPGLTLDSTGSKCFDLREEVCYMQYEKGRCLKPFDG
SHQKMLCCCSLGRAWGHTCEPCPRPGTEAFNELCVKGFGYAFDNRGRHEPGLITDINECG
QFPFICQNGRCRNTAGSFSCQCNPGFALDSDGLNCTDINECTIAHGICANGTCRNTPGSF
RCDCDEGFEDMMMMQMCMDINECTRIRGLCRGGTCINTPGSFRCECPEGHELTPNGRACK
DVDECSRTSGICSHGVCENMMGSYQCTCNDGYKQTSQHTSCEDIDECTDKKGGCQSRCDN
SAGSYKCGCDDGYKLMPDGTSCEDIDECKDIPNICSGGKCTNHAGSHTCHCTGGLRPSGD
GKSCIDIDECALNPNVCLNGRCENNLGSYICHCDPGYSIKDREQGCTDDNECESGLSECH
EHAECINTLGSYECTCTDGFRGDGYVCRDVNECLRDNGGCDPDAACVNAMGSFECACDSG
FTGDGHTCRDIDECSLNPNLCENGQCLNYGGSYRCECDMGFEPEDSERTCVDVDECALFQ
NNCAYGRCENIFGMFRCICNTGYQLDPTGGNCTDINECENPQICQYGTCINTPGSFVCEC
PPNYSLAPNGAGCVDVREGQCFLDVVGAYNGRGICNTELGERLTKATCCCSVGKGWGPTC
EVCPTLNTTEYRNLCPGGKGFRPNQITVVLEDIDECREMTGVCKGGRCSNTFGSFMCICP
DGYTLDDTQRNCVDVNECVLRPDICGAGTCVNGEGSYTCICPPDFVLVPGGTCVDMRRAN
CFRQAYTSAAIPARLVCEHPMMTNETKVMCCCSIGRGWGDPCEPCPVQGTDDYRKLCSFS
PGTYVDPMTGEKGDMDECKTGVCENGYCTNTIGSFVCECYNGYRYNSFINKCEDINECIE
TPNVCQGSSTCVNTIGSFECKCPDGYKLAPSQRDCLDVNECSKTGMCDNGVCKNLDGSFV
CTCNNGYYLSPSGEHCIDIDECTRSPGICSDGVCTNVPGSYHCKCNPGFTLSPNGDCFDI
DECRGQFGICQNGRCRNTIGSFTCQCQNGYSLSPDGRNCIDINECSDNICTQGNCRNSEG
SFQCTCDDGYKLTPNKRDCEDIDECRSVPGICEGGTCTNTQGGFKCTCSKGHKLSSDGKT
CIDTRQSFCFQEFINGVCANPRLSNMTRKECCCMKGSVGWGSTACERCPDPRGEAFKQMC
PDGFGYVIVDGMMEDINECMMDPTLCENGICVNMDGSYRCECQDGFKIDSTGTKCIDVDE
CREVGSPCGNGTCTNVIGGFECDCREGYISGPRQTCEDVNECEDMGSLCAFRCQNMPGGF
KCTCPYGYTLAADGRHCEDLDECQTPANDCRFQCKNLIGSFMCICPDGYRQVGMADDCVD
IDECRTIPDVCSNGRCINTRGSYRCECFDGFEPSRTQKECVDVRAGYCFKLPSCSAQTRD
VREMTRVDCCCGMGAAWGPRCERCPQRGTQTYNDLCPHGVGFDKDGRDVDECSLMRHLCQ
NGRCINTMGSYRCICNKGYKPDSSGTNCIDVNECDHVPTPCKFTCENTEGSFRCSCPVGY
NLGVDGITCLDIDECKTGRHTCQNQCINTQGSYQCACQKGYSQDGGQCLDVNECTDEPSL
CGPSGTCMNMPGSFKCLCPRGFNIDPSGRFCIDNDECLDDSRCQHGCENLAGSYRCGCPD
GYRQHSYWNHCIDDNECTSGSACGSASCENTPGSFSCSCPPGYIFDGTHMACIELGGGGG
GCSNAPCSFGCLPTGSHGYSCGCPDGYQRIGQGHCVSAIPTSPYGGGYYPPGQFNNVLDN
SISQLGNLRGAGGGDGTYTIPGEKVISTEGCYSCKLNSNNRQKRDLTRQRQHNLGHIGRH
NLRRLDKKVPNRIQHGHHRRSKQDYHFTKAANSTKNKIWKSGMHLTVLVPVKSFLQDIDL
LKIQPAFTYLKNNEHFNIVDGNRENLFQISMRDGVAVLSNREKIQEPGLHILKILGTVDS
ANFKSSTEEEEPFHLTVHIVIK
NT seq
8709 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagtgtgccgtatttgggtgctcttactgttacaagtggcggtgattctcgtgggg
cggcaagtcaggggcgaagatacggcaacatcccccgtcacagtgccgagtggaggacct
aatgtgtgtggccgaggtccaagaagccagtgttgcccaggatggacaaaaagaagcggc
aacggtctctgccttgtcccactatgtcgctcttcgtgtggtgaaggtcggtgtattcga
ccaaacatatgttactgtggcaacagacaagttggaccctcgtgtgatggtttcggtggt
ggaacatcattaccaggagttggtgggaaagtacctgatggaggtggaggtactaatgga
ggttcgaagttacatccgattggaccaggaaatgtaatccatccaggacaaggtggagga
ttatgccaagaaccctgtctgaatggaggacggtgcataggacctgatcgatgtgcctgt
gtttatggttttactggaaggagatgtgaaagagattatcgcactggaccctgcttccgt
aaagttagaaatcaattttgtgctggtcaattaacgggggtggtctgcacccgacaactg
tgctgtgctaccgtaggtgttgcgtggggacatccatgcgaacagtgtccgtccaaacta
gactgtgatagaggatatattactaatattaattccagaacttgtcaagatgttgacgaa
tgtgaagccattcctggcatttgtgagaaaggaaaatgtgtcaattccatgggatcattt
cgctgcgactgcgatgaaggttatttgtataatgaagacgccggagaatgtgaagatgtt
aatgaatgcgaaggaaatcttgatctgtgtactcatggtcgttgtgtcaacacagaagga
agttttaactgtctgtgtgattacggatacgtacctgctcaaaatcaacaagcttgtcta
gatacaaggcaaggcttctgttatgtggatgtatccagtggtcaatgcaaaaatcctctg
gctgtacgcttatcaaaagttgagtgctgctgcggggaaaacatgggtaaaggttgggga
gaacaaccatgtgaggcgtgtcccctcccaggttctaaaagttacagacagttgtgcacc
gccgcatccttgcttgacatcaacgaatgtgacttgcgacgtgatttttgtgaaaatggt
cgatgcatcaatacaccatcttcctatcgttgtgaatgcaataaaggattcagagcagtg
atgaatgataagaaatgtgatgatatcgatgagtgtcaaaacgcgactctttgccaggga
ggtcgctgcataaattctataggaaactttgactgtatttgtcctacgggatatgatctc
acatctgatggaactaaatgcacagatcaggacgaatgctccattacgggaatgtgtgcg
aatggcgagtgcgtgaatggcgacggatcatttacctgcagatgtaaacctggattttca
ctgtctccaacgagacagtcttgtatagatatcgatgaatgcaaagaaaatggccgaatc
tgtttgagaggccgttgccaaaacttacctggaagttataaatgtgattgtcaggaagga
tttatcctttcaccccagggagacttttgcttagatagaaatgaatgtgaagaaaaaggc
atgtgcaggcatggaacttgtgttaatggagatggcagcttcaaatgcatctgcgatcct
ggttacaaattgtcacctgatggacatttttgcattgacatcaatgaatgtttggaattg
ccagattcatgtgttaacggaagatgtgaaaatactgatggaagtttccactgcagttgt
acagatggaatgactatgagtccaaatggaagaatatgtcaagacaccagaagagactac
tgtttttcgaactacaagaatggtgaatgtagcagtccatcttcaatggttgtcacaaaa
tctgcttgttgttgcgctaatagaggtgccatgactcctgcctggggaatacaatgtgtg
ccctgtcctgcaccaggctcaaaagaattcttacaactgtgtcctagaggccctggatct
ggtcaagaagatgatatcaacgaatgtgttgtatttccaaacatctgccctaatggagcc
tgcgaaaacttaaaaggaagttatagatgtatttgcaatccagggtaccaagtcgattct
actggcaaaatttgctcagatgtaaatgagtgtgctgtcaacttacttctgtgtgataat
ggccaatgcagaaatactccaggaagttttcaatgcacctgtcccatcggttatcgtcac
aatatccaaactaatacatgcgacgatgttgatgaatgtaaggaaaggggttctgaaata
tgtataggaggcacttgttttaatactttaggaagttaccaatgtgaatgtgaacctggg
tctgctttggatgcttccagaaacacctgcatagataatagacgaggatcgtgttggatg
tccgtaaaaaatggccgatgtgagaatgacattaagttcccgatgttgaagtctgaatgt
tgtggaactgttggcaaagcttggggtagtccttgtcaattatgcactggaatagagaac
cgatgccccaaaggttacgcaatgctggatggttcaacatgcacagatgtaaatgaatgt
gaagtatttcctggaatctgccaaggtggtggattatgcgtcaatgttgaaggatcctat
cgttgtaactgtcccccagggctgactctagactccactggaagcaaatgctttgatctg
cgagaggaagtttgttacatgcagtacgaaaaaggaagatgtctcaaaccttttgacggt
tcccaccagaagatgctgtgctgttgctctcttggaagagcctggggtcatacttgtgaa
ccatgtcccagaccaggaacagaggctttcaacgagctgtgtgttaaaggttttggatat
gcttttgataacagagggcggcacgagcctggtttaattactgatatcaatgagtgtgga
cagtttccttttatctgccaaaatggaagatgcagaaatacggctggcagctttagttgc
caatgcaatcccggatttgcactcgattctgatggtttaaactgcactgacataaacgaa
tgcacaattgctcatggtatctgtgcaaatgggacttgccggaacacaccaggatctttt
agatgcgactgtgatgaaggattcgaagacatgatgatgatgcaaatgtgcatggacatc
aatgaatgtactcgaatcagaggcttgtgtcgtggtggaacatgtattaacacaccagga
tcatttcgatgcgagtgccccgaaggtcatgaactgacacccaatggaagagcttgtaaa
gatgtggatgaatgcagccggaccagtggcatatgctctcacggagtgtgtgaaaacatg
atgggctcgtatcagtgtacctgtaacgacggatataaacaaacatcccaacatactagc
tgtgaagatattgatgagtgcactgacaaaaaagggggttgtcaatcaagatgtgataac
agcgctggtagttacaagtgtggctgcgatgatggatataaattaatgcctgatggaact
agttgcgaagatattgatgagtgtaaagatattcccaatatttgcagtggtggaaagtgt
actaaccatgccggatctcacacttgccactgtacaggaggtctaaggccatctggagat
ggaaaatcttgcatcgatatcgatgaatgcgctttaaatccaaatgtctgtctcaatgga
cgatgtgaaaataatttgggatcttacatttgtcattgcgatcctggttactctattaaa
gatcgcgaacaaggttgcacagacgataatgaatgcgagagcggcctgagtgaatgccac
gaacacgccgaatgcatcaacactctcggatcttatgaatgcacgtgcacggatggattc
aggggagatggatatgtttgccgagatgtgaatgagtgcttgagagacaatggaggttgt
gatccggatgctgcctgtgttaatgcaatgggatcttttgaatgtgcctgcgactcagga
ttcaccggagatgggcacacttgtcgtgatattgacgaatgcagcctaaacccaaatctt
tgtgaaaacggccagtgtttgaattacggtggtagttacagatgcgagtgtgacatgggt
ttcgaaccagaagacagtgaaagaacgtgtgttgacgtggatgaatgtgctctcttccaa
aataattgtgcgtatggtcggtgtgaaaatatatttggcatgtttagatgtatttgcaat
acaggttatcaattagaccctactggcggaaactgcacagatataaatgaatgtgaaaat
cctcagatatgccagtatggaacgtgcatcaatacaccaggatcattcgtttgtgagtgt
ccaccaaattattcacttgcaccaaatggagcaggctgcgtcgatgttcgagaaggacaa
tgctttttagacgttgttggagcttataatggtcgtggaatttgtaacaccgaactgggt
gaaagactgaccaaagcaacttgctgttgctctgtaggaaaaggatggggaccgacctgt
gaagtgtgtcctacgcttaatactaccgaatataggaatctatgtcccggaggcaaaggt
tttagacccaatcaaataactgtggtgttagaagatattgatgaatgcagagaaatgacg
ggtgtttgcaaaggtgggagatgttctaatacctttggaagtttcatgtgtatctgtcct
gacggatacactttagacgatacacaacgtaattgtgttgatgtgaatgagtgtgtattg
cgacctgatatttgtggagctggtacatgtgtgaatggagaaggaagttacacatgcata
tgccctcctgattttgttttagttcctggtggaacatgcgttgacatgagaagagctaat
tgtttccgacaagcatacacctctgccgcgattcccgcacgccttgtttgtgaacatcct
atgatgaccaatgaaaccaaagtgatgtgctgttgctcaataggtcgtgggtggggtgac
ccatgtgaaccttgtccagttcaaggcacagatgattataggaagctctgtagtttttca
ccagggacatatgttgatccgatgacaggtgaaaaaggcgatatggacgaatgcaaaacg
ggtgtttgtgagaacggttattgtacaaataccattggtagttttgtttgtgagtgctac
aatggctacagatacaactcattcatcaacaaatgcgaagatatcaatgaatgcattgaa
acaccaaatgtttgccaaggaagctccacatgtgtcaatacaatcggaagcttcgaatgc
aagtgcccggatggatacaaactagcaccaagtcaacgagactgcttagatgtaaatgaa
tgctcaaagactggaatgtgtgataacggtgtttgcaagaatctagacggaagttttgtc
tgcacttgcaacaacggttattatttatctccttctggggaacactgtatagatattgat
gagtgtactcgaagtcctggtatttgctcggatggtgtttgcacaaatgtccctggatca
taccactgtaaatgcaatcctggattcactttatcaccgaatggggattgctttgatatc
gacgaatgccgtggtcagtttggtatctgtcaaaatggtcgatgtaggaatacaattgga
agctttacatgtcaatgccaaaatggttattctctcagtccagatggtcgtaactgtata
gatattaatgaatgttccgataatatatgcactcagggtaactgtagaaactctgaagga
tcatttcaatgcacttgcgatgatggttataaattgacaccaaataaaagagattgcgaa
gatattgatgaatgtcgttcagttcctggtatatgtgagggtggaacttgtacgaatacg
caaggaggttttaagtgcacatgttccaagggacacaagttatcttctgatggcaaaact
tgcattgacaccagacagagtttctgtttccaagagtttatcaatggagtctgtgccaat
cctagattatccaacatgacgaggaaggaatgttgctgtatgaagggatctgtcggatgg
ggatccactgcctgtgaacgatgtcccgatccaagaggagaggctttcaaacaaatgtgc
ccagatggtttcggatacgtcattgttgatggtatgatggaggatatcaatgaatgcatg
atggacccaactttgtgtgaaaatggaatctgtgtcaacatggatggcagttacagatgc
gaatgccaggatgggtttaagatagatagcacaggaacaaaatgcattgatgttgatgaa
tgcagagaagtaggttcaccttgtggaaatggaacgtgtacaaatgtgattggaggattt
gaatgtgactgtcgagaaggttacatttctggaccacgacaaacttgtgaagatgtcaat
gaatgtgaagatatgggttctttgtgcgcttttagatgtcaaaatatgcccggagggttt
aaatgcacctgtccatatggttacaccttggctgcagatggtagacattgtgaagatttg
gatgaatgtcagacaccagccaacgattgtcgtttccagtgcaagaatctgattggttct
ttcatgtgcatctgtccagacggttacagacaagttggcatggccgacgactgtgtagat
attgatgagtgtagaaccattccggatgtttgctctaatgggcgatgcatcaatacaagg
ggctcttaccgatgtgaatgctttgatggttttgaaccttctagaacacaaaaagaatgc
gttgatgtgagggctggttactgctttaaactaccatcatgttctgctcagacaagggat
gtaagagaaatgaccagagtggactgctgttgtggaatgggtgccgcatggggtccaaga
tgcgaacgttgtccccaaagaggaactcagacttacaatgatctttgtccacatggtgta
ggttttgacaaagatggaagagatgtagatgaatgtagtcttatgagacatctgtgtcaa
aatggaagatgcataaacacaatggggtcttatcgctgcatctgcaacaagggatacaaa
ccagattcaagtggcacaaactgtattgatgtgaatgagtgtgatcatgttccaacacct
tgtaagtttacttgtgagaacacagaaggcagctttagatgctcatgtcctgtcggatac
aacttaggcgttgatggtatcacatgcttagatattgatgaatgtaaaacgggaagacac
acatgccaaaatcaatgcatcaatacacaaggaagttaccaatgtgcttgccagaaggga
tattcacaggatggtggacagtgtttggatgtcaatgaatgtacagatgaacccagtctg
tgtggtccatcaggaacatgcatgaatatgccaggtagtttcaaatgcctgtgtccaaga
ggtttcaatattgatccttcaggaagattttgtattgataacgatgagtgtttagatgat
agtcgatgccaacatggctgcgaaaatttagcaggaagctatagatgcggatgtcctgat
ggctaccgtcaacacagttactggaaccactgtatagatgataatgaatgtacatcagga
tctgcatgtggctcagcatcttgtgaaaacacgcctggaagtttctcctgcagttgcccg
cctggatatatttttgacggcactcacatggcatgcattgaattaggtggcggcggaggt
ggatgctcgaatgccccttgcagttttggatgcttacctactggctcacatggctactcc
tgtggttgccccgacggatatcaacgaattggacaaggacactgtgtatctgctatcccc
acatccccatatggtggtggctactacccaccaggccaatttaacaatgtactggacaat
agtatttctcaacttggaaatctgcgaggagcaggaggtggcgatggtacctacacaata
cctggagagaaagtgatttctactgaaggatgttattcttgcaaattaaatagcaataac
cgacaaaaacgtgatttaacacgacagaggcaacataatctgggtcacattgggcgtcac
aatctaagaagactagacaagaaagtacccaatagaatacaacatggtcatcatcgccgt
tctaagcaagattaccattttacaaaagcagccaactcaacaaaaaataaaatttggaaa
tctggtatgcacctcacagtgttggtgccagtaaagagctttcttcaagacatagatctc
cttaaaatacagccagcatttacatatctaaaaaacaatgaacattttaacattgttgat
ggaaacagagaaaatctattccagatttctatgcgtgatggtgtggcagtgttaagcaat
agagaaaaaattcaagaaccaggacttcacattctaaaaatcctaggcactgtcgacagt
gcaaattttaaatcaagtacagaggaagaggaacctttccatctaacagtgcatatagta
attaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
