Puntigrus tetrazona (Sumatra barb): 122361448
Help
Entry
122361448 CDS
T08985
Symbol
casq1a
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: calsequestrin-1a
KO
K23468
calsequestrin 1
Organism
ptet
Puntigrus tetrazona (Sumatra barb)
Pathway
ptet04020
Calcium signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptet00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04020 Calcium signaling pathway
122361448 (casq1a)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Calsequestrin
Thioredoxin_6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122361448
NCBI-ProteinID:
XP_043118138
LinkDB
All DBs
Position
2:17723770..17734149
Genome browser
AA seq
564 aa
AA seq
DB search
MKWNLVFLGLLLTFGQLSWGQKGMDIPEYDGKDRVHDLNAKNYKSVMKKYDVMVVYYHEH
VGSSKVAQKQFQIEELALELAAQVLEDLDDEDIGLGLIDEKTDKAVAKKLGLDEADSIYI
FIEDEVIEYDGELAADTLVEFLYDVIEDPVEIIDNMRELKGFHNIEEDIKLVGFFKSQKS
EHYHEYEDAAEEFHPHIKFFATFSPKVAKSLDLKLNEVDFYEPFMDEPIVIPGKPYSEKE
LVKFIEDNDRPTLRKMQPHNMYEIWEDALDGEHIIAFAEEGDPDGFEFLEIVKDVAEDNT
ENPNLSIVWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSYPQIGVVEVDDAESIWFDMDDGDDMPTVD
ELEDWLEDVLENKIDPDEDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DGGGGDDDDGGDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDAMRXXCDDDDDDD
DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
NT seq
1695 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtggaacctagtgttccttgggctcctcctgaccttcgggcagctgtcatggggg
cagaaaggtatggacatccctgagtacgatggaaaggaccgcgttcacgacctaaatgcc
aagaattacaagtctgtgatgaagaaatatgacgtgatggtggtgtactaccatgagcac
gtaggatccagcaaagtcgcccagaaacagtttcagattgaggagctggcccttgagctt
gctgcacaagtcctggaggatcttgacgatgaagacatcggactcggcctaatcgatgag
aagacagacaaagctgttgcaaagaaattaggtctggatgaggctgacagtatctacatc
ttcattgaggacgaggtcattgaatacgatggagagcttgctgcggacacactggtggag
ttcctctatgatgtcattgaggatccagttgagatcattgacaatatgcgggagttgaaa
ggtttccataatattgaagaggatatcaagctggtgggcttcttcaagagtcagaaatct
gagcactaccatgaatatgaagacgcagcagaggagtttcatccacatattaagttcttt
gccacctttagtccaaaggttgctaagtctctagacttgaagttgaatgaagtggacttc
tatgagcccttcatggatgaacccatcgtcatccctggtaaaccctacagtgagaaggaa
cttgttaaattcattgaggacaatgacaggccaacactgaggaaaatgcagccacacaac
atgtatgagatctgggaggatgctcttgatggtgaacatataattgcttttgctgaagag
ggagacccagatggctttgaattccttgaaatcgtgaaggatgtagcagaggataacaca
gaaaatcccaacctgagcatcgtctggattgaccccgatgacttccctctgcttgtcccg
tattgggagaagaccttcgacattgacctgtcctaccctcagattggtgtagtggaggtt
gatgatgctgagagtatctggtttgatatggatgatggcgatgacatgccaacagttgat
gagctggaggattggctggaggatgtgctagagaacaaaatcgatcctgatgaggatgac
gatgatgacgacgatgatgatgacgacgacgatgatgatgacgacgacgatgatgatgac
gacgacgacgatgatgatgatgacgacgatgatgacgacgatgatgacgacgacgacgat
gatggcggcggcggcgatgatgacgacggcggcgacgatgatgatgacgatgatgatgac
gacgatgatgacgacgacgacgatgacgatgatgatgatgatgatgatgacgacgatgat
gacgatgatgatgatgatgatgcgatgcgatgatgatgcgatgacgatgacgacgacgat
gatgacgatgatgatgacgatgatgatgatgacgatgatgatgacgacgatgatgatgac
gacgacgatgatgatgatgacgacgacgatgatgatgacgacgacgacgatgatgatgac
gacgacgatgatgatgatgatgacgacgacgatgatgacgacgatgatgatgatgacgac
gatgatgatgatgacgatgatgacgacgacgacgacgatgacgacgacgatgacgatgat
gacgacgacgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
