Paramecium tetraurelia: GSPATT00000068001
Help
Entry
GSPATT00000068001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14772
U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ptm03009
]
GSPATT00000068001
Ribosome biogenesis [BR:
ptm03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
GSPATT00000068001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UTP20
PPR_long
DUF7946
ComZ
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5008834
NCBI-ProteinID:
XP_001423031
Genoscope:
GSPATT00000068001
UniProt:
Q6BFG2
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
2574 aa
AA seq
DB search
MVKYIPTKRQSKKETLQEPKQAARVIRHYHLEEKVDKRHRFKTTKQQREEIDINLQRRIE
DIHIETKSDISGCYFRDIIELKRSSLSTLMEKRYMNESYNYAQSLPQILVNLKQLLDIAY
TYLKEKSSKNLVLDTLPYLIKDTREEFYPYLETTIREILSQIDIEQVEHLEKSFLFIAYA
IKYLEKVLINQFEPFIQLMQEVCFSSKFNIIKKLASEAVGYLFRKNRTLIHRALCIVDHK
QLSYSIYISIQSIKGYLANNTFKVIDEIWKTENKELISQFYIVLVQNVVEKPHQSPKIMI
SLLEIFKDLKQRTQSLDQIILIELLKNNKRKVTPQIVNEIITFVNDSDSIGYLLRLHNIQ
IEEIIISNSTFVNKMLNQITIEEFSSIIEVILQQPTHQSSNIYKLLIAATFQQLFRQKEE
ALILLLKLDEIHCIDKLTPDQLDQLYNSELFNKLLETDNNFYILSLCKLIQMVEFPPQIK
QQIINKLQVTLNILNKKIISQDQKIDYSEIIEKIEKLSQHKLEITEEVELLYAEQHQDNK
SFEDGIMIKILQNPEIKQIELNRSIYNLFSRMNLQTKEFFTLMKNIPQNHLEIGLMSRKR
QIRLICAQQLNQIENSEQLQLMIDIDSEKINIDNERRIKNSIINLKNLVNKSTNYKQIER
YAFGLAFTKFLLVRQTIRELLSTVLSKCNIQSILRIFLITHYQYEKVNLSYLDKHCYLEQ
DEEQLESQVCFDEVFAQAIQHCELNQSIKQTIFEISTKYLQQQYDEDINCSKVEQYYKRR
YGDKTSQFHLKMLHQSSQIQLFKHWLLKDDESTQMIALNNIKFVEIQNNLQEYHGIINEF
FSSMEQMINGNTFKGEIIRFQLDLPQHLQEQYKLYILNVLYPKIFSKQKLHKKKHKNSAI
QVRRNAVFEQLSNLNLQNELITLIQANHGFHNDLNEVPIQIKIQYLKILKNLIEKFGYQI
NVEQLEKQITIIRQLLNQAYELKQNENVTSLSKELWKVGVKRLCQIVNKYHCEQTYTSMI
QNNLQFCLQDNGFIQGFEKIVIDSKSQPSGVLKLLQNICLIKDYQQFLCQNHELLLSRFF
LLYDFTYIKQIHLGQDEDGRLAHQLKQQISQKISSQRNCIQILNSILYSIYQLSEPSATI
ELEPNQLSSLFSQQYGELLLSCLLNNVRSNIESESDQIKDINMVYLIYTILMNRKEIKNS
ILNECLFLFSKQINNPKLYDSQIYNHNLMGKLLNNCIKCILDKEIVVEYQLVVDLFQSYS
KLLILVKNLTTRNLLVDVIISMAHKFKEQYPLNENDVYLLKAMNQRNQVTEEIEFEKCLE
ACLQFQKIIHNNQQTTELILQNCFYLLTSSELSIRISVLEIFKSYLSKNIQSDYIKQNYL
PQMIQIMKINEETSVKAAIQLFEQYLLCIKIDEYTQQILNNQPLNMIDEQYDSNYCEFKV
LFENENADQNVFNLLFDIQLTKRIKGVQLIQKRLSQIPILLIDSISKIMLPLLDFYIFYA
GGELNNHKHKLTDANKSHYLTLQDVSIQMYGYICSQFDFDRRISLMQQLTKKLEKSMIGN
KQQLSNALIKTITVIASNKDDNFNVIKLIKERLQMNSESKLQDYLQQYISIEDEQQNAQI
IDFEFSYRSLIQQEKDLAKVREIKDVSNQFWNQIIDITVDEIQEWQERSNILLKQIYLPL
KNLFLLDEKHRVQLCISLTELIIQLPPENFMVELNRLVGKLCRLLKSKDNDVRDETRKCL
LDLSRKIGPIFLKFIIIQMKSILIQGFENHVLSYTLGLLLEQITEIGQIDNCLEEIMEIL
LDEVFGRLCTEKDTETLPKKTKELKSKKGMQNFKMVGQLINFVNSLPKLIGTIDYYITQY
QISHNLQSKLRLIFEHLYLGLINNSSVQNLVQVIYLMICETSYKLADSLKQSHNLDFTYA
QGTYKRITKEDIMTIQLPSYGSQSISTYIKQNKLKTSSTIIYGLVNFLSIKLLHHNIQNV
EDSPLLQKMFSIILDCLSHKDMITECVSVISAMIKKFDWVTQFKKQIVQNAMQCLSTITS
TDEQFIRDSFLLLKAILDSKLNEFTLQQQKTLVHFIDLYLESNEALECLKLIIHEIWPLP
QIYDIIMKVRESMLQTTKKTQHLSQQIYINFLIKYPLSSQVLQQHYDFIIANLQYKYFGG
RQIILQCLQQIFQFFPQDTVNKLSEISYFSLIVALVKEDVDSLKEQLSNVLNILIQKTTQ
DKIMKFTQNSLIWMTNEKLKVQISGLESLYILKDHLKYYQSKFILSSNELIDKCITNWNE
WKNTIQAKNIQNKNLKNSQWANELEAISVSEFPELQESLCSLLKLLNVIDESQLILIYEQ
NTICKLFKCLSYPHQETANQAIQLFIRSKHLAIIHTQIQIQQDHIVKNMQNITKYLFLIK
FARNQIIVNQELTFQFILDYLNLLKELNQQSLIQLIFDCILKITTNLMAKQLKLNKGIEN
LMEFYKYIMSNGFESNQKMIESTLKIQSLQQDMPIIDQILKLIEKQLGPQEFISMYSVIQ
QELNKVKGERKIQTKMLAIKDPQKFQEKRQRKMKTKLMQKKNKLLMKRGKIAKE
NT seq
7725 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaaatatattcctacaaagcgtcaatcaaaaaaagaaacactataggaaccaaag
taagcagctagagttatccgacactatcatcttgaggaaaaagttgataaaagacacaga
ttcaaaaccacaaaataatagagagaagaaattgatattaatctttaacgtagaattgaa
gacattcatattgaaactaaatcagatatctctggttgttactttagagacatcattgag
ttgaagcgaagctctttatctacattaatggaaaaaaggtatatgaatgagtcatacaat
tatgcataatccttaccttaaatcttagtcaatctgaaataattacttgatattgcttat
acttacttaaaagaaaagagtagcaaaaatttagttctcgacaccttgccatatttaatt
aaggatacgagagaagaattttatccatatttagaaacaacaattagagaaattttatct
taaattgatattgaataagtagaacatttagaaaagagcttcttattcatagcttatgca
attaaatatttagaaaaagtgttaataaattaatttgaacctttcatttaactaatgtaa
gaagtctgcttctcttcaaaatttaatattatcaagaaattagcctctgaggctgtagga
tatttatttagaaaaaatagaaccttaatacatagagctttgtgtatcgtagatcataaa
tagcttagttactccatctatatttctatttaatcaatcaaaggatacttagcaaacaat
acttttaaagttattgatgaaatttggaagacagaaaataaagaacttatttcataattt
tatatagtcttggttcaaaatgtcgttgagaaacctcattaatctccaaaaatcatgatt
agtttattggaaatatttaaagatttaaaatagagaacataatctctcgattaaataatt
ttgattgaactactgaaaaataataaaaggaaggttacaccttaaatcgtaaatgaaatt
ataacatttgttaatgattctgattctattggttatttattaagactccataatatataa
attgaagagatcatcatttcaaacagtacatttgtaaataaaatgcttaactaaattaca
attgaagaattttccagcattattgaagtaattttgtaatagccaactcattaaagttcc
aatatttataaactcttaattgcagcaactttctagtagctattcagataaaaagaagaa
gcattaattttgttattgaaattagatgaaatccattgtattgataaattgacacctgat
taattagatcaattatataattcagaattatttaacaagttattggaaaccgacaacaat
ttttacatactttcattatgtaaattaattcagatggtagaatttccaccatagattaaa
taataaataattaataaattgtaagtaactctaaatattttaaataagaaaataatttct
taagatcagaaaatagattattctgaaataatagaaaaaatcgaaaaactaagccaacat
aaattagaaataacagaagaagttgaattgttatatgcagaataacattaagacaataaa
tcatttgaagatggaataatgattaaaattttgtaaaatccagaaataaaataaattgaa
ttgaatagatctatttataatttattcagtagaatgaatttataaacaaaagaattcttt
actttaatgaaaaatattccatagaatcatttagaaattggtttaatgagtagaaaaaga
taaattagattgatctgtgcataacagttaaattaaatagagaattccgaataattgcaa
ttaatgattgatatcgatagtgagaaaattaatattgataatgagaggagaattaaaaat
tcaataattaatttaaaaaacttagttaataaaagtacaaattataaataaattgaaaga
tatgcttttgggcttgcatttactaaatttttattggttagataaacaataagagagtta
ttgagcacagtattatctaaatgcaatatataaagtattttgagaatatttttgattaca
cattattaatatgaaaaagtgaatttgtcttatttggataaacactgttatttagaatag
gatgaagaataattagagtcttaagtttgttttgatgaagtatttgcgtaggctattcag
cattgtgaattgaattaatctattaaacaaactatcttcgaaatttcaacaaaatatttg
taataatagtatgacgaagatattaattgtagtaaagtagaataatattataagagaagg
tatggcgataaaacatctcaatttcatttgaaaatgttacattaatcatcttaaattcaa
ctttttaaacattggttactaaaagatgatgaatcgacatagatgatagcattaaataac
ataaaatttgtagagatctaaaataatttataagaatatcatggtattattaatgagttt
ttcagtagtatggaatagatgattaatggtaatacatttaaaggtgaaatcataaggttt
taattggatctaccttaacatttataagaataatataaattatatattcttaatgtttta
tatccaaaaatatttagtaaataaaaactacacaagaaaaagcataagaattctgccatt
taagttagaaggaatgcagtatttgaataattaagcaacctaaacttataaaatgaatta
attactttgatataagctaaccacggttttcataatgatttaaatgaagtgcctattcaa
ataaagatataatatttgaaaattttaaagaatttgattgagaaatttggttattaaatt
aatgttgaataattggagaaataaatcactataattagacaattattaaatcaagcatat
gaattaaaataaaatgaaaatgttacttccttatctaaagaattatggaaggtgggagtt
aaaaggttatgttaaatagtaaataagtatcattgtgaacaaacttatacatcgatgatc
taaaacaatttataattctgtttataagataacggattcatttaaggatttgagaaaata
gtgatagattctaaatcataaccatctggagtattaaaattactctaaaatatttgtttg
ataaaagattattaataattcctatgttaaaatcacgaattactccttagtagatttttc
ttattatatgattttacttacatcaaacaaattcatttaggttaggatgaagatggtcga
ttggctcattaacttaaacagtaaatatcacaaaagatttcatcctaaagaaattgtatt
caaattctaaatagtattttgtattcaatatatcaattgagtgaaccatcagcaacaatt
gaattagaaccaaatcaacttagctctttattttcctaacaatatggtgaactattatta
agttgtctattgaacaacgttcgttctaatattgagtcagagagtgattaaattaaagat
atcaatatggtttatctaatttatacaattttgatgaatagaaaggaaattaagaattca
attctgaatgaatgtttatttttgttcagtaaataaataaataatcctaaattgtatgat
agtcaaatatataatcacaatttaatgggtaaattattaaataactgcataaaatgcatt
ttagataaagaaatagtagttgagtactaattggtggttgatttattttagtcatattca
aaactcttaattttagttaagaatttgaccacaagaaatctattagtagacgtcataatt
tcgatggctcataaatttaaggaataataccctttaaatgaaaacgacgtttatctatta
aaggcaatgaactaaagaaatcaggtaactgaagagattgaatttgaaaagtgcttagag
gcttgtttacaattttaaaagatcatccacaataattaacaaacaactgaattaatttta
taaaattgcttttatttattaacaagttcagaattatcaattagaatttcagttttagag
atatttaagagttatttaagtaagaatatacaatctgattatataaaataaaattatcta
ccttaaatgatttaaataatgaaaatcaacgaagaaacttcagttaaagctgcaatttaa
ttatttgaataatatttattatgcataaagatagatgaatacacataataaattctgaat
aatcaaccattaaatatgattgatgaataatatgatagcaattattgtgaatttaaagtg
ttgtttgagaatgagaatgccgattaaaatgtattcaatttactatttgatatataatta
accaaaagaatcaagggtgttcaattgatttagaaaagattgtcataaattccaattctt
ttgattgattcaatatctaaaattatgttgcctcttttagatttttatatattttacgca
ggaggtgaattgaataatcataaacacaaattgacagacgctaataaatcacactattta
actttacaagatgtttctatttaaatgtatgggtacatctgtagccaatttgattttgat
agaagaataagtctcatgcaataattgactaaaaagttagagaagagcatgatagggaat
aaacaataattgtcaaatgctcttattaagacaattacagtgattgcttctaataaagat
gacaattttaatgtcatcaaattgattaaagaaagattgcaaatgaattcagaatcaaaa
ttataggattacttgcaataatacataagtattgaggatgaataataaaatgctcaaatc
atcgattttgaattcagttatagaagcttaatttaacaagagaaggatttagcaaaagtt
agagaaatcaaagatgtttctaatcaattttggaattaaattatagatattactgttgat
gaaatttaggaatggtaggaaagatcaaatatattattaaagtaaatttatttaccttta
aaaaatctatttttattggatgaaaaacatagagtgtaactatgtatatctttgacagaa
ttgattatataattgccacctgaaaacttcatggtagaattaaatagacttgttggcaaa
ttatgtaggttattgaagagtaaagataatgacgtgagagatgaaaccagaaaatgctta
ttggatttaagtagaaaaattggacctatatttttaaaattcatcatcatttaaatgaaa
tctatacttatttaaggatttgaaaatcatgttctatcttatactttaggattattatta
gaataaatcaccgaaattggtcaaattgacaattgcttagaagaaataatggaaatatta
ttagatgaggtattcggaagattatgcacagaaaaagatactgagactttacctaagaaa
actaaagaacttaaaagtaaaaaaggaatgcagaattttaaaatggttggtcaattaatt
aattttgttaattcactacctaaattaattggaactatagattattatattactcaatat
tagatttctcacaatttataaagcaaacttcgacttatctttgaacatctatatttagga
ttaattaataattcatcggttcaaaacttagtttaagtaatctatctcatgatttgcgaa
actagttataaactagcagattccttgaaataaagtcacaatttagattttacttatgct
caaggaacctataaacgaattactaaagaagatattatgacaatttaattaccatcctat
ggatcataatctatatctacttacatcaaataaaacaaattgaaaacatcaagtacaatt
atttatggccttgtaaattttcttagcatcaagcttcttcaccataatatttaaaatgtt
gaagattctcctcttttatagaagatgttctcaatcattttagattgtctaagtcataaa
gacatgattaccgaatgtgtatcagtcatttcagcaatgatcaaaaagttcgattgggtc
acctaatttaaaaaatagattgtctaaaatgctatgtaatgcttatctactataacatca
actgatgaataatttatcagggattcatttctcttattaaaagctattttagatagcaag
ctcaatgaattcactttacaataataaaaaacattagttcattttatagatctctattta
gaatccaatgaagcattagaatgcttgaaattgattattcatgaaatttggccattgcca
taaatttatgatatcattatgaaagttagagaatccatgttataaacaaccaaaaagacg
taacatctatcctaataaatttacattaattttctaataaaatatcctttatcaagttaa
gtcttataataacattatgattttataattgcaaatctatagtataaatattttggtgga
aggtaaatcatcctttaatgcttgtaataaatattctagtttttcccataagatactgtt
aataaattatcagaaatttcatatttctctttgattgtggcattggttaaagaagatgta
gattctctaaaagaacaactgagcaatgtgttaaatatattgatatagaagactacttaa
gataaaattatgaaatttactcaaaattctttgatttggatgacaaatgagaaattaaag
gtttaaatatcaggcttagagagtttatatattttaaaagatcatctgaagtattattaa
tctaaattcattttatcttcaaatgagttaattgataagtgtatcactaattggaatgaa
tggaaaaatacaatctaagccaagaatattcaaaacaaaaacctaaaaaatagtcaatgg
gctaatgaattagaggcaatatcagtctcagaatttccagagttataagaatcactctgt
tctttattaaaacttctaaatgtaattgatgaaagctaattaattttaatttatgaataa
aatactatttgtaaattattcaaatgtttatcatatccacactaagaaactgcaaatcag
gctatttaattatttataagatctaagcacttagcaattattcatactcaaatttaaatt
taacaagaccacattgtcaaaaacatgtaaaatataaccaaatatctcttcttaataaaa
tttgcaagaaatcaaattattgtaaatcaagaactaacattctaatttattttagattat
ctaaatttattaaaagaattaaaccagcaatctctaattcaattaatttttgattgtata
ttaaaaattacaacaaatttaatggcgaaataattaaaattaaataaaggaattgaaaat
ttaatggaattttacaaatacataatgagtaatggatttgaaagcaatcaaaaaatgata
gagagcacattgaaaattcaatcattataataagatatgccaataatagactagattttg
aaattgatagagaaatagctaggacctcaagaattcatatctatgtattctgtaatttaa
caagagttaaataaagtgaaaggggagaggaagatataaacgaagatgttagcaataaaa
gacccttagaaattttaggaaaaaagataaagaaagatgaaaaccaagttgatgtagaaa
aagaataaattattaatgaaaagaggcaaaattgctaaggaatga
DBGET
integrated database retrieval system