KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00000068001
Entry
GSPATT00000068001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K14772  U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ptm03009]
    GSPATT00000068001
Ribosome biogenesis [BR:ptm03009]
 Eukaryotic type
  90S particles
   U3 small nucleolar RNA-associated proteins
    GSPATT00000068001
SSDB
Motif
Pfam: UTP20 PPR_long DUF7946 ComZ
Other DBs
NCBI-GeneID: 5008834
NCBI-ProteinID: XP_001423031
Genoscope: GSPATT00000068001
UniProt: Q6BFG2
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 2574 aa
MVKYIPTKRQSKKETLQEPKQAARVIRHYHLEEKVDKRHRFKTTKQQREEIDINLQRRIE
DIHIETKSDISGCYFRDIIELKRSSLSTLMEKRYMNESYNYAQSLPQILVNLKQLLDIAY
TYLKEKSSKNLVLDTLPYLIKDTREEFYPYLETTIREILSQIDIEQVEHLEKSFLFIAYA
IKYLEKVLINQFEPFIQLMQEVCFSSKFNIIKKLASEAVGYLFRKNRTLIHRALCIVDHK
QLSYSIYISIQSIKGYLANNTFKVIDEIWKTENKELISQFYIVLVQNVVEKPHQSPKIMI
SLLEIFKDLKQRTQSLDQIILIELLKNNKRKVTPQIVNEIITFVNDSDSIGYLLRLHNIQ
IEEIIISNSTFVNKMLNQITIEEFSSIIEVILQQPTHQSSNIYKLLIAATFQQLFRQKEE
ALILLLKLDEIHCIDKLTPDQLDQLYNSELFNKLLETDNNFYILSLCKLIQMVEFPPQIK
QQIINKLQVTLNILNKKIISQDQKIDYSEIIEKIEKLSQHKLEITEEVELLYAEQHQDNK
SFEDGIMIKILQNPEIKQIELNRSIYNLFSRMNLQTKEFFTLMKNIPQNHLEIGLMSRKR
QIRLICAQQLNQIENSEQLQLMIDIDSEKINIDNERRIKNSIINLKNLVNKSTNYKQIER
YAFGLAFTKFLLVRQTIRELLSTVLSKCNIQSILRIFLITHYQYEKVNLSYLDKHCYLEQ
DEEQLESQVCFDEVFAQAIQHCELNQSIKQTIFEISTKYLQQQYDEDINCSKVEQYYKRR
YGDKTSQFHLKMLHQSSQIQLFKHWLLKDDESTQMIALNNIKFVEIQNNLQEYHGIINEF
FSSMEQMINGNTFKGEIIRFQLDLPQHLQEQYKLYILNVLYPKIFSKQKLHKKKHKNSAI
QVRRNAVFEQLSNLNLQNELITLIQANHGFHNDLNEVPIQIKIQYLKILKNLIEKFGYQI
NVEQLEKQITIIRQLLNQAYELKQNENVTSLSKELWKVGVKRLCQIVNKYHCEQTYTSMI
QNNLQFCLQDNGFIQGFEKIVIDSKSQPSGVLKLLQNICLIKDYQQFLCQNHELLLSRFF
LLYDFTYIKQIHLGQDEDGRLAHQLKQQISQKISSQRNCIQILNSILYSIYQLSEPSATI
ELEPNQLSSLFSQQYGELLLSCLLNNVRSNIESESDQIKDINMVYLIYTILMNRKEIKNS
ILNECLFLFSKQINNPKLYDSQIYNHNLMGKLLNNCIKCILDKEIVVEYQLVVDLFQSYS
KLLILVKNLTTRNLLVDVIISMAHKFKEQYPLNENDVYLLKAMNQRNQVTEEIEFEKCLE
ACLQFQKIIHNNQQTTELILQNCFYLLTSSELSIRISVLEIFKSYLSKNIQSDYIKQNYL
PQMIQIMKINEETSVKAAIQLFEQYLLCIKIDEYTQQILNNQPLNMIDEQYDSNYCEFKV
LFENENADQNVFNLLFDIQLTKRIKGVQLIQKRLSQIPILLIDSISKIMLPLLDFYIFYA
GGELNNHKHKLTDANKSHYLTLQDVSIQMYGYICSQFDFDRRISLMQQLTKKLEKSMIGN
KQQLSNALIKTITVIASNKDDNFNVIKLIKERLQMNSESKLQDYLQQYISIEDEQQNAQI
IDFEFSYRSLIQQEKDLAKVREIKDVSNQFWNQIIDITVDEIQEWQERSNILLKQIYLPL
KNLFLLDEKHRVQLCISLTELIIQLPPENFMVELNRLVGKLCRLLKSKDNDVRDETRKCL
LDLSRKIGPIFLKFIIIQMKSILIQGFENHVLSYTLGLLLEQITEIGQIDNCLEEIMEIL
LDEVFGRLCTEKDTETLPKKTKELKSKKGMQNFKMVGQLINFVNSLPKLIGTIDYYITQY
QISHNLQSKLRLIFEHLYLGLINNSSVQNLVQVIYLMICETSYKLADSLKQSHNLDFTYA
QGTYKRITKEDIMTIQLPSYGSQSISTYIKQNKLKTSSTIIYGLVNFLSIKLLHHNIQNV
EDSPLLQKMFSIILDCLSHKDMITECVSVISAMIKKFDWVTQFKKQIVQNAMQCLSTITS
TDEQFIRDSFLLLKAILDSKLNEFTLQQQKTLVHFIDLYLESNEALECLKLIIHEIWPLP
QIYDIIMKVRESMLQTTKKTQHLSQQIYINFLIKYPLSSQVLQQHYDFIIANLQYKYFGG
RQIILQCLQQIFQFFPQDTVNKLSEISYFSLIVALVKEDVDSLKEQLSNVLNILIQKTTQ
DKIMKFTQNSLIWMTNEKLKVQISGLESLYILKDHLKYYQSKFILSSNELIDKCITNWNE
WKNTIQAKNIQNKNLKNSQWANELEAISVSEFPELQESLCSLLKLLNVIDESQLILIYEQ
NTICKLFKCLSYPHQETANQAIQLFIRSKHLAIIHTQIQIQQDHIVKNMQNITKYLFLIK
FARNQIIVNQELTFQFILDYLNLLKELNQQSLIQLIFDCILKITTNLMAKQLKLNKGIEN
LMEFYKYIMSNGFESNQKMIESTLKIQSLQQDMPIIDQILKLIEKQLGPQEFISMYSVIQ
QELNKVKGERKIQTKMLAIKDPQKFQEKRQRKMKTKLMQKKNKLLMKRGKIAKE
NT seq 7725 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggttaaatatattcctacaaagcgtcaatcaaaaaaagaaacactataggaaccaaag
taagcagctagagttatccgacactatcatcttgaggaaaaagttgataaaagacacaga
ttcaaaaccacaaaataatagagagaagaaattgatattaatctttaacgtagaattgaa
gacattcatattgaaactaaatcagatatctctggttgttactttagagacatcattgag
ttgaagcgaagctctttatctacattaatggaaaaaaggtatatgaatgagtcatacaat
tatgcataatccttaccttaaatcttagtcaatctgaaataattacttgatattgcttat
acttacttaaaagaaaagagtagcaaaaatttagttctcgacaccttgccatatttaatt
aaggatacgagagaagaattttatccatatttagaaacaacaattagagaaattttatct
taaattgatattgaataagtagaacatttagaaaagagcttcttattcatagcttatgca
attaaatatttagaaaaagtgttaataaattaatttgaacctttcatttaactaatgtaa
gaagtctgcttctcttcaaaatttaatattatcaagaaattagcctctgaggctgtagga
tatttatttagaaaaaatagaaccttaatacatagagctttgtgtatcgtagatcataaa
tagcttagttactccatctatatttctatttaatcaatcaaaggatacttagcaaacaat
acttttaaagttattgatgaaatttggaagacagaaaataaagaacttatttcataattt
tatatagtcttggttcaaaatgtcgttgagaaacctcattaatctccaaaaatcatgatt
agtttattggaaatatttaaagatttaaaatagagaacataatctctcgattaaataatt
ttgattgaactactgaaaaataataaaaggaaggttacaccttaaatcgtaaatgaaatt
ataacatttgttaatgattctgattctattggttatttattaagactccataatatataa
attgaagagatcatcatttcaaacagtacatttgtaaataaaatgcttaactaaattaca
attgaagaattttccagcattattgaagtaattttgtaatagccaactcattaaagttcc
aatatttataaactcttaattgcagcaactttctagtagctattcagataaaaagaagaa
gcattaattttgttattgaaattagatgaaatccattgtattgataaattgacacctgat
taattagatcaattatataattcagaattatttaacaagttattggaaaccgacaacaat
ttttacatactttcattatgtaaattaattcagatggtagaatttccaccatagattaaa
taataaataattaataaattgtaagtaactctaaatattttaaataagaaaataatttct
taagatcagaaaatagattattctgaaataatagaaaaaatcgaaaaactaagccaacat
aaattagaaataacagaagaagttgaattgttatatgcagaataacattaagacaataaa
tcatttgaagatggaataatgattaaaattttgtaaaatccagaaataaaataaattgaa
ttgaatagatctatttataatttattcagtagaatgaatttataaacaaaagaattcttt
actttaatgaaaaatattccatagaatcatttagaaattggtttaatgagtagaaaaaga
taaattagattgatctgtgcataacagttaaattaaatagagaattccgaataattgcaa
ttaatgattgatatcgatagtgagaaaattaatattgataatgagaggagaattaaaaat
tcaataattaatttaaaaaacttagttaataaaagtacaaattataaataaattgaaaga
tatgcttttgggcttgcatttactaaatttttattggttagataaacaataagagagtta
ttgagcacagtattatctaaatgcaatatataaagtattttgagaatatttttgattaca
cattattaatatgaaaaagtgaatttgtcttatttggataaacactgttatttagaatag
gatgaagaataattagagtcttaagtttgttttgatgaagtatttgcgtaggctattcag
cattgtgaattgaattaatctattaaacaaactatcttcgaaatttcaacaaaatatttg
taataatagtatgacgaagatattaattgtagtaaagtagaataatattataagagaagg
tatggcgataaaacatctcaatttcatttgaaaatgttacattaatcatcttaaattcaa
ctttttaaacattggttactaaaagatgatgaatcgacatagatgatagcattaaataac
ataaaatttgtagagatctaaaataatttataagaatatcatggtattattaatgagttt
ttcagtagtatggaatagatgattaatggtaatacatttaaaggtgaaatcataaggttt
taattggatctaccttaacatttataagaataatataaattatatattcttaatgtttta
tatccaaaaatatttagtaaataaaaactacacaagaaaaagcataagaattctgccatt
taagttagaaggaatgcagtatttgaataattaagcaacctaaacttataaaatgaatta
attactttgatataagctaaccacggttttcataatgatttaaatgaagtgcctattcaa
ataaagatataatatttgaaaattttaaagaatttgattgagaaatttggttattaaatt
aatgttgaataattggagaaataaatcactataattagacaattattaaatcaagcatat
gaattaaaataaaatgaaaatgttacttccttatctaaagaattatggaaggtgggagtt
aaaaggttatgttaaatagtaaataagtatcattgtgaacaaacttatacatcgatgatc
taaaacaatttataattctgtttataagataacggattcatttaaggatttgagaaaata
gtgatagattctaaatcataaccatctggagtattaaaattactctaaaatatttgtttg
ataaaagattattaataattcctatgttaaaatcacgaattactccttagtagatttttc
ttattatatgattttacttacatcaaacaaattcatttaggttaggatgaagatggtcga
ttggctcattaacttaaacagtaaatatcacaaaagatttcatcctaaagaaattgtatt
caaattctaaatagtattttgtattcaatatatcaattgagtgaaccatcagcaacaatt
gaattagaaccaaatcaacttagctctttattttcctaacaatatggtgaactattatta
agttgtctattgaacaacgttcgttctaatattgagtcagagagtgattaaattaaagat
atcaatatggtttatctaatttatacaattttgatgaatagaaaggaaattaagaattca
attctgaatgaatgtttatttttgttcagtaaataaataaataatcctaaattgtatgat
agtcaaatatataatcacaatttaatgggtaaattattaaataactgcataaaatgcatt
ttagataaagaaatagtagttgagtactaattggtggttgatttattttagtcatattca
aaactcttaattttagttaagaatttgaccacaagaaatctattagtagacgtcataatt
tcgatggctcataaatttaaggaataataccctttaaatgaaaacgacgtttatctatta
aaggcaatgaactaaagaaatcaggtaactgaagagattgaatttgaaaagtgcttagag
gcttgtttacaattttaaaagatcatccacaataattaacaaacaactgaattaatttta
taaaattgcttttatttattaacaagttcagaattatcaattagaatttcagttttagag
atatttaagagttatttaagtaagaatatacaatctgattatataaaataaaattatcta
ccttaaatgatttaaataatgaaaatcaacgaagaaacttcagttaaagctgcaatttaa
ttatttgaataatatttattatgcataaagatagatgaatacacataataaattctgaat
aatcaaccattaaatatgattgatgaataatatgatagcaattattgtgaatttaaagtg
ttgtttgagaatgagaatgccgattaaaatgtattcaatttactatttgatatataatta
accaaaagaatcaagggtgttcaattgatttagaaaagattgtcataaattccaattctt
ttgattgattcaatatctaaaattatgttgcctcttttagatttttatatattttacgca
ggaggtgaattgaataatcataaacacaaattgacagacgctaataaatcacactattta
actttacaagatgtttctatttaaatgtatgggtacatctgtagccaatttgattttgat
agaagaataagtctcatgcaataattgactaaaaagttagagaagagcatgatagggaat
aaacaataattgtcaaatgctcttattaagacaattacagtgattgcttctaataaagat
gacaattttaatgtcatcaaattgattaaagaaagattgcaaatgaattcagaatcaaaa
ttataggattacttgcaataatacataagtattgaggatgaataataaaatgctcaaatc
atcgattttgaattcagttatagaagcttaatttaacaagagaaggatttagcaaaagtt
agagaaatcaaagatgtttctaatcaattttggaattaaattatagatattactgttgat
gaaatttaggaatggtaggaaagatcaaatatattattaaagtaaatttatttaccttta
aaaaatctatttttattggatgaaaaacatagagtgtaactatgtatatctttgacagaa
ttgattatataattgccacctgaaaacttcatggtagaattaaatagacttgttggcaaa
ttatgtaggttattgaagagtaaagataatgacgtgagagatgaaaccagaaaatgctta
ttggatttaagtagaaaaattggacctatatttttaaaattcatcatcatttaaatgaaa
tctatacttatttaaggatttgaaaatcatgttctatcttatactttaggattattatta
gaataaatcaccgaaattggtcaaattgacaattgcttagaagaaataatggaaatatta
ttagatgaggtattcggaagattatgcacagaaaaagatactgagactttacctaagaaa
actaaagaacttaaaagtaaaaaaggaatgcagaattttaaaatggttggtcaattaatt
aattttgttaattcactacctaaattaattggaactatagattattatattactcaatat
tagatttctcacaatttataaagcaaacttcgacttatctttgaacatctatatttagga
ttaattaataattcatcggttcaaaacttagtttaagtaatctatctcatgatttgcgaa
actagttataaactagcagattccttgaaataaagtcacaatttagattttacttatgct
caaggaacctataaacgaattactaaagaagatattatgacaatttaattaccatcctat
ggatcataatctatatctacttacatcaaataaaacaaattgaaaacatcaagtacaatt
atttatggccttgtaaattttcttagcatcaagcttcttcaccataatatttaaaatgtt
gaagattctcctcttttatagaagatgttctcaatcattttagattgtctaagtcataaa
gacatgattaccgaatgtgtatcagtcatttcagcaatgatcaaaaagttcgattgggtc
acctaatttaaaaaatagattgtctaaaatgctatgtaatgcttatctactataacatca
actgatgaataatttatcagggattcatttctcttattaaaagctattttagatagcaag
ctcaatgaattcactttacaataataaaaaacattagttcattttatagatctctattta
gaatccaatgaagcattagaatgcttgaaattgattattcatgaaatttggccattgcca
taaatttatgatatcattatgaaagttagagaatccatgttataaacaaccaaaaagacg
taacatctatcctaataaatttacattaattttctaataaaatatcctttatcaagttaa
gtcttataataacattatgattttataattgcaaatctatagtataaatattttggtgga
aggtaaatcatcctttaatgcttgtaataaatattctagtttttcccataagatactgtt
aataaattatcagaaatttcatatttctctttgattgtggcattggttaaagaagatgta
gattctctaaaagaacaactgagcaatgtgttaaatatattgatatagaagactacttaa
gataaaattatgaaatttactcaaaattctttgatttggatgacaaatgagaaattaaag
gtttaaatatcaggcttagagagtttatatattttaaaagatcatctgaagtattattaa
tctaaattcattttatcttcaaatgagttaattgataagtgtatcactaattggaatgaa
tggaaaaatacaatctaagccaagaatattcaaaacaaaaacctaaaaaatagtcaatgg
gctaatgaattagaggcaatatcagtctcagaatttccagagttataagaatcactctgt
tctttattaaaacttctaaatgtaattgatgaaagctaattaattttaatttatgaataa
aatactatttgtaaattattcaaatgtttatcatatccacactaagaaactgcaaatcag
gctatttaattatttataagatctaagcacttagcaattattcatactcaaatttaaatt
taacaagaccacattgtcaaaaacatgtaaaatataaccaaatatctcttcttaataaaa
tttgcaagaaatcaaattattgtaaatcaagaactaacattctaatttattttagattat
ctaaatttattaaaagaattaaaccagcaatctctaattcaattaatttttgattgtata
ttaaaaattacaacaaatttaatggcgaaataattaaaattaaataaaggaattgaaaat
ttaatggaattttacaaatacataatgagtaatggatttgaaagcaatcaaaaaatgata
gagagcacattgaaaattcaatcattataataagatatgccaataatagactagattttg
aaattgatagagaaatagctaggacctcaagaattcatatctatgtattctgtaatttaa
caagagttaaataaagtgaaaggggagaggaagatataaacgaagatgttagcaataaaa
gacccttagaaattttaggaaaaaagataaagaaagatgaaaaccaagttgatgtagaaa
aagaataaattattaatgaaaagaggcaaaattgctaaggaatga

DBGET integrated database retrieval system