Paramecium tetraurelia: GSPATT00000688001
Help
Entry
GSPATT00000688001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K23562
ER membrane protein complex subunit 1
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
GSPATT00000688001
Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
ER membrane protein complex
GSPATT00000688001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EMC1_C
DUF6305
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5024158
NCBI-ProteinID:
XP_001438373
Genoscope:
GSPATT00000688001
UniProt:
A0CJK9
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
891 aa
AA seq
DB search
MLLLIVSVAGIIFNNVLALQQQQAGVHDWNKRLFGELKYIQVQDQTIFYQNTNNQNGIID
KSTGQVKSRNTYTMCDSYNYVTYEPNQQIIQLFNEGYSVLAEQEISGNIDHCLIGLNGEF
IIIYGQTIFSTFNNKFNEKVDHQIIHAGYIFDVPVVLLQKQNEICIYQIRESITQSYCVE
SLNNGKIHEFGNTLIYQDAKFAYQLKEKSAKLLNFEIIKKVDKFVGFSQTLVITEKSKKQ
IVNLDGQVEYELSQDEFVIQNLENQKYYYILKQKNNELKIVSYDRDTKQTHSEVIELQTN
SLILNAFLIDQNKRQFLIQYQDLQTVLVDNKGIRWTTEQSLISIDTVFYEKYENQEQTHK
NSYYESLEKHGTSNPLYLIQNVISRVLNEVKDLQEVVTHFIDNLGKEKVQTREMEQTYGL
KQKVYFLTTYGTLLCYDTQELSLLIKLQINNQDNSFRLVAHHQIDSNLITHFDNNDAQPT
HVLFYYSKEKSRLNTFILDLQHGIIQQVASQSSKNIVWTLPYRVEGGPGQHHNIVILIDE
ENNIFTYPKNDSINTKEIILYRNDNGVLRGYKLFNNELVNLWTINMKDEILIIRSSYHVG
EENPRVAIWDDRKVIYKLIDHSNFAILTSDGDKLKLLIINAKSGKIIYQSVQSEADFNQP
INLVFDEHQVFVTYYNKAQMMFEIWTVEIYHAKIEVSFIKMLENYYFTKTPIITNYYKAD
FEAFFLQQVYGYPLGIKYLGMSRTQKSLTKKNLLIITTSGQLHSLDRNLVSTRRREKADQ
PILEYSLQSAELPPYQYQLPINFLNMLSYHQTFDIEKFSIESTNLESSALLLVYGSDIFF
TRIAPDKTYDMLLDNFNYNALIVTTVLIVVATKVLSKLVKSSKQVKQFYLN
NT seq
2676 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttattattaattgtgagtgtggctggaattatttttaataatgttcttgctttacaa
taataacaagcaggagtacacgattggaataagagactctttggtgagttaaaatacatt
caagtctaagattaaacaatattttactaaaacacgaacaatcaaaatggaattattgat
aaatctacaggctaagtcaaatcaagaaacacttatactatgtgtgattcttataattat
gtcacctatgaaccaaactaatagataatacaattatttaatgaaggatattcagtgtta
gccgaataagaaattagtggcaatattgaccattgcttaataggattaaatggagaattt
ataattatttatggataaactatcttctctacctttaataacaaattcaatgagaaggtt
gatcactaaataatacatgcaggatatatttttgatgttccagtggtccttttacaaaag
taaaatgaaatttgcatttatcaaatcagagaatcaataacataaagctactgtgtagaa
agtttgaataatggtaaaattcatgaatttggcaacaccctcatttattaagatgctaag
tttgcatatcaactaaaagaaaaatcagcaaagcttttaaactttgaaattataaagaag
gtagataaattcgttggtttttcataaaccttggtaattactgaaaaatcaaagaaacaa
atagtgaatttggatggataagttgaatatgaattaagttaagatgaatttgttatatag
aatcttgagaatcaaaaatattactatatcttaaaatagaaaaataatgaattgaagatt
gtttcatatgacagagatacaaaataaactcattcagaagtaattgaattataaacaaat
tcacttatattgaatgcttttttgatagattaaaataaaagataattcttaatttagtat
taggatttataaacagttttagttgataataaaggaattagatggactactgagtaatcc
ttaattagtattgacacagttttttatgaaaaatatgagaattaagaatagacacataaa
aactcatattatgaatcacttgagaaacacggaactagcaatcctttatatttaatataa
aatgttatctcaagagttttgaatgaagtaaaagatttataagaagttgtaactcacttt
attgataatttgggcaaggaaaaagtataaacaagagaaatggaataaacatatggattg
aaatagaaggtatacttcttgactacttatggaaccttattatgctatgatacttaagaa
ttatctttgctaattaaattacaaataaataactaagataacagctttagattggttgca
caccattagatagattccaatttaatcactcacttcgataacaatgatgcacaaccaact
catgtgttattttactattcaaaagagaaatcaagattaaatacatttatattagactta
taacatggaataatctaataagtggcctcacaatcctcaaagaacatagtatggacactt
ccatacagagttgaaggtggtcctggataacatcacaacattgttattctaatagatgaa
gaaaacaatatattcacatatcccaaaaatgattccattaacacaaaagagattatcttg
tatagaaatgacaatggtgtcttaagaggatataaactattcaataatgaattagtcaat
ttatggacaattaatatgaaagatgaaattttaataatcagatcctcttatcatgtagga
gaagaaaacccaagggttgctatttgggatgatagaaaagtcatatataaattgattgat
cactctaactttgcaatattaacctcagatggtgacaaacttaaattgcttattatcaat
gccaagtcaggcaaaataatatattaaagtgtttaaagtgaggctgattttaattaacca
atcaatttagtatttgatgaacaccaagtttttgttacttattataacaaagcataaatg
atgtttgaaatctggactgttgagatctatcatgcaaaaattgaagtttcatttattaaa
atgttggaaaactattatttcaccaaaacaccaattataacaaactattataaagctgac
tttgaagcatttttcttataataagtttatggatatcctttaggaatcaaatatcttgga
atgtcaagaactcagaaatcattaacaaaaaaaaatttattgatcataactacttctgga
taattgcattctttggacagaaatttagtttctaccagaagaagggaaaaggcagatcaa
ccaattttagaatactcattgtaatcagcagaacttcctccctattaatattaattaccc
atcaacttcttaaatatgctttcatatcattaaacatttgatattgagaaattttcaatt
gaatccacaaatttagaatcgtcagcattattattggtatatggttctgatattttcttt
acaagaatagctccagacaaaacttatgatatgttgttggataatttcaactacaatgcc
cttatagtaactacagttttgatagtcgttgccacaaaagtgttatcaaaattagtgaaa
tcaagtaaataggttaaataattttatctaaattga
DBGET
integrated database retrieval system