Paramecium tetraurelia: GSPATT00000785001
Help
Entry
GSPATT00000785001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K16478
nephrocystin-4
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
03037 Cilium and associated proteins [BR:
ptm03037
]
GSPATT00000785001
Cilium and associated proteins [BR:
ptm03037
]
Primary cilia and associated proteins
Nephronophthisis-related proteins
GSPATT00000785001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
5024255
NCBI-ProteinID:
XP_001438470
Genoscope:
GSPATT00000785001
UniProt:
A0CJV6
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1308 aa
AA seq
DB search
MSTEDINSIKKFLKFQKMHKSLPSSIPIQMGLDSKAFKLIVSRIGGLRRPQNPVLNLQFS
VAANFFIQNSQGEKCFFGRTYNSPRLNVEFGPDGVNYEHPIIPIYYHTRILNNKDMPLLI
ILEIQAFESQQDLVLKRMHLGWCELAALTITTQSTKLNFRKGSPRILLLGQQVNFESSGI
NVTCDIVQSEEFQISMHLAPENALCGLGDELPGLKKSFVAGDFELSRSKIQVLIPDTMEA
DIYRQVQRYRTYKYRTPDDYKGDIQIINKRLIVAFHNGWTFINTRGTNNFVPLGETRMLV
NEFVDQKQIQYKQLAYHGVIDINNVCSTDPTVNSGMLVAQLEYEAMFLVSNLTKETMQLT
LGWIPIYINNKFGADELIEEDFIIGPGKTLDGRPLVSFQNPDSSIKLKGSLNLSGGGFQF
QDLYMGAAQQQQQAPQQYGYQQIPQQGFQQQTNLNQHQAVQQQHQNKQEQVRGSDIDIRT
QVKLKDFEQQLLRLQEENERLRRLAIQQTSDPQKQQEYLQAIEKLREENRLLQFTQARQF
EGLEKLIKDQKTVERTAAPPVVLAEAKPQNTVIKPIDSYAYPVPSATLKPITRTDVTALV
DDPTSMDQENRLMALEMQDERKDQIIVIQPVSMKQVLGPYPICKSVQIGIIFYDLQTFKS
PFLNLEYYNDERNFKYNLENGNPLRLLYNNEIFSCKFNIETSLQRYANLDQDFARYLFNK
NLILDIWDSESLFLFGSVRIPLRGIMRGGKQNAQIMADVEIFDPQSKKAKGTLQIVIKNI
GKIGQQDMSKTVPLENTFNGLQKKKLVSEKPVNRMDVPAQAFDGNSIQDRIKKIKQQNLQ
EMIKNKQSQQRSLNEVLKYKEIKKPSLVKTIMQGFLQNEKVVHSFYGKCEIVPLYFKNTH
PKPEQFTVNIEDPESRMLEYQEFFLIGNPAEWKYWVTNNKYPEPENYDLIRMKENQGKTQ
YYFILDPNQEVTLLFKFISFRQYDYRVDDHDRTPEYIKKYMQSRHITILLQQDGKMMDGL
RIIVEPHQQPIDHVLRFYERENRQTRLIIPRLFNQPLQQQPHVHITDPDVMIEWSSDFNS
IRLNLRIGEPQSVKIFNILLYQDQYQHKIIANWKIEVYSLSTIDIEVPLGQKVCTKITFP
CDITRIIKMTSSNKMISFVKPFDSEITMLPGKINLVPINILALQDGKHLIKLNGVDIHSQ
ELIYSWLVNVHAEPQPPSATYDLRCIDGRESRHQVNYKNQVNYTTQYNIVSSSEFVKIID
QNISTGPNEIVQFKIRVLPGSEELVRIFITDIDERIFDVIALNIKYVY
NT seq
3927 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaccgaagacataaactcaataaagaagtttctaaaattttagaagatgcataag
agtctaccctcttcaatcccaatctaaatgggcttagattcaaaagcttttaagttgatt
gtgtctcgaatagggggactcagacgtccttagaatcctgttctgaatttacaattctca
gttgctgccaacttttttatttaaaactcgcaaggagaaaagtgcttttttggaagaaca
tataatagtccacgtctaaatgtggaatttggacctgatggagtaaattatgaacatcca
atcataccgatctattaccatactagaattctaaataataaggatatgcctttgttgata
attctggaaatataagcatttgaatctcaataagatttagtgttaaaacgcatgcatttg
ggttggtgtgaactagcagcattaaccattactacataatcaacaaagctcaatttcaga
aagggaagtccaagaatcttattattgggttaataggtgaactttgaatcctctggtatc
aatgtaacatgtgatattgtgcagagtgaagaatttcaaataagtatgcatttggctcca
gaaaacgcattatgtggattaggggatgaattaccaggacttaaaaagagttttgtcgct
ggggattttgaattatcgcgaagtaaaatacaagtgctgattcctgatactatggaagca
gatatatatagataagtatagagatataggacttataaatacagaactcctgatgactat
aaaggagacatttagattataaataaaagattgattgtagcatttcataatggctggaca
tttataaatactagaggaacaaataactttgtgcctcttggagaaacaagaatgctagta
aatgaatttgtcgattagaaacaaatccaatacaaataattagcatatcatggtgttatt
gatatcaataatgtttgctcaactgaccctacagttaattcaggcatgcttgtagcttaa
ttagaatatgaagctatgttcctagtatcaaatctaactaaggaaactatgtaattgaca
ctcggatggattcctatttacattaataataaatttggtgctgacgaactcattgaggaa
gactttattataggaccagggaaaacgttggatggtagaccacttgtatcattttagaac
cctgattcatcgattaaattgaaaggtagtcttaatctttctggaggtggattttaattt
caagatttatatatgggagcagcctagtaatagtaataagctccttaatagtatggatac
taataaattccttagcagggattctaatagtaaactaatttgaattaacactaagcagtt
taataataacactaaaataagtaagaataggtaagaggatcagatattgatataagaaca
taagtaaaattgaaggattttgaataataattattgagattataagaggaaaatgaaaga
ttaagaagattagcaatttagcaaacctcggatccccaaaaataataagaatacttataa
gcaattgaaaaattaagagaagagaatagattattataatttacttaagctaggtaattc
gaaggacttgagaaattgattaaagattagaaaacagttgagaggactgctgctcctcca
gtggttttggctgaggcaaaaccttaaaatactgttataaaaccaatagattcttatgca
taccctgtaccttcagccacattgaaacctataactcgcacagatgttactgctttagtt
gatgatcctacatctatggattaagaaaatagattgatggcacttgaaatgtaagatgaa
aggaaggaccaaataatagtaatataaccagtttctatgaaataagttttaggaccatat
cctatttgtaaatcagtttaaataggaattatattctatgatttatagaccttcaaatca
ccattcttaaatctggaatattataatgatgaaagaaattttaaatataatttggagaat
ggtaatcccttaagattattgtataataatgagattttcagttgtaaatttaacattgaa
acatctttataaagatatgcaaatttggattaagattttgcaagatatttattcaataaa
aacttaattttggatatttgggatagtgagagtttatttttatttggtagtgttaggata
ccattgagaggcataatgagaggaggtaaacaaaatgcctaaataatggctgatgttgaa
atttttgatcctcaatcgaagaaggctaaagggacattacagattgtcattaaaaatatc
ggcaaaattggttaataagacatgagtaaaaccgttcctttggaaaacacatttaatgga
ttatagaaaaagaaattagtatctgagaagccagtgaatagaatggatgttcctgcttaa
gcttttgatggaaatagtatttaagataggattaaaaagatcaaacaataaaatttataa
gagatgattaaaaataaatagagccaataaagatcattaaatgaagtgttaaaatataaa
gaaataaaaaagccatcattagtaaaaacaattatgtaaggattcttataaaatgagaaa
gtagttcattcattttatggtaaatgtgaaatagttccactttattttaagaatactcat
ccaaaaccagaataattcactgtaaatatagaggatccagaaagcagaatgttagaatat
taagaattctttttgattggtaatccagctgaatggaaatattgggttactaataacaaa
tacccagaacctgaaaattatgatttaattagaatgaaagaaaattaagggaaaacttaa
tattatttcatattagatcctaattaggaggttactttgttgttcaaatttataagtttt
aggtaatatgattatagagttgatgatcacgatagaacacctgaatatatcaaaaaatat
atgtaatctcgtcacataacgattttattataacaagatggtaagatgatggatggacta
cgtataattgttgagcctcattaatagccaattgatcatgtgcttagattttatgaaaga
gagaatcgttagactagacttataatacctagattattcaactaacccttacaataatag
cctcatgtacatatcactgatcctgatgtcatgattgaatggtcatctgattttaattca
attagattgaatcttaggataggagaaccatagagtgtcaagatattcaacatccttttg
tattaagattaatatcagcataaaataatagccaattggaagatagaagtttatagttta
tccacaatagacattgaagttccattgggttaaaaagtatgcactaaaataacatttcct
tgtgatattactcgtattattaaaatgacatcttccaataaaatgatatcttttgttaaa
ccttttgattctgaaatcacgatgttaccaggcaaaataaatttagttcccattaatatt
ttggctctataggatgggaaacatctaattaaattgaatggagttgacattcactctcaa
gaactaatttattcttggctagtgaatgttcatgccgagccttaacccccaagtgctact
tatgatttgagatgcatagatggaagagaatctcgtcattaagtcaattacaaaaattaa
gttaattacactacttaatataatattgtatcttcaagtgaatttgtgaaaattattgat
caaaatatctctacaggacctaatgaaattgttcagttcaaaatcagagtcttaccgggt
agtgaagaactagtacgcatcttcattactgacattgatgaaagaatatttgatgtcatt
gcactcaatatcaaatatgtttattga
DBGET
integrated database retrieval system